Elicasi del DNA

Le elicasi coinvolte nella replicazione del DNA sono note come elicasi replicative;esse contengono sei subunità che circondano un poro centrale abbastanza grande da permettere il passaggio del DNA a singolo filamento. L'elicasi subisce un cambiamento conformazionale per potersi muovere lungo il DNA usando l'energia ottenuta attraverso l'idrolisi di ATP. Ciascuna delle sei subunità di elicasi ha un sito di legame ATP ad attività ATPase, ossia la capacità di convertire l'ATP ad ADP e fosfato inorganico.

Quando l'elicasi scompone l'ATP, le subunità si muovono l'una rispetto all'altra, causando la traslocazione del DNA. Per iniziare lo svolgimento del DNA, l'elicasi si lega ad un singolo filamento del DNA, all'origine della replicazione, e scorre lungo il filamento selezionato del DNA. Una volta che l'elicasi disavvolge il DNA, le risultanti molecole di DNA separate a singolo filamento, possono formare anelli a forma di forcina per capelli mediante appaiamento intra-filamento, o DNA a doppio filamento mediante appaiamento tra i filamenti.

Questi filamenti sono anche vulnerabili ad attacchi da parte di nucleasi, capaci di digerire il DNA. Per prevenire questo fenomeno, le proteine single-stranded DNA binding o SSB, si legano al DNA a filamento singolo in modo sequenziale, dove l'SSB in entrata si lega all'adiacente SSB esistente. Questo legame cooperativo della proteina SSB rafforza e protegge il filamento del DNA genitore, impedendo la formazione di anelli a forma di forcina per capelli o il riavvolgimento del DNA nella sua 01 38.880 00 01 41.100 struttura a doppio filamento.

Le proteine SSB si attaccano strettamente alla catena dello zucchero-fosfato del DNA, e lasciano le basi azotate disponibili per il legame nucleotidico complementare, permettendo la formazione del filamento figlio.