Panoramica su trasposizione e ricombinazione

La trasposizione è una forma specializzata di ricombinazione, in cui gli elementi genetici come i segmenti cromosomici vengono ricollocati da una posizione nel genoma ad un'altra;questi elementi mobili sono chiamati transposoni o geni di salto. Ogni transposone contiene una sequenza di codifica per un enzima chiamato transposasi oltre ad altri geni, e brevi sequenze affiancate che sono complementi inversi l'una dell'altra. Esistono tre tipi di trasposizione:nel primo tipo, noto come trasposizione non replicativa o conservativa, il gene codificante la transposasi produce l'enzima diamerico che scinde a brevi sequenze invertite che affiancano un DNA transposone.

Le sequenze invertite, a questo punto, si riuniscono per formare un loop di DNA che può essere inserito in un cromosoma da bersaglio grazie a tagli mediati dalla trasposasi. Nel secondo tipo chiamato trasposizione replicativa, la trasposasi scinde sia i terminali di trasposone che il DNA bersaglio. Allora l'estremità 3 primi del transposone e del l'estremità 5 primi del DNA bersaglio sono covalentemente attaccate in una fase chiamata trasferimento del filamento.

Si crea quindi un intermedio, dove i 5 primi del transposone sono ancora attaccati al DNA donatore. Le estremità non legate sono usate come primer dalla DNA polimerasi per replicare il transposone;questo intermedio è definito cointegrato. Gli enzimi chiamati resolvasi scindono l'intermedio nel sito di risoluzione interno generando donatore e DNA bersaglio ciascuno con una copia del transposone.

Nel terzo tipo di trasposizione, l'elemento trasponibile è dapprima trascritto in un RNA intermedio noto come retrotrasposone. L'RNA viene copiato di nuovo in una sequenza di DNA mediante trascrizione inversa, e quindi inserito in un sito bersaglio. Nonostante i loro diversi meccanismi, tutti e tre questi processi possono alterare la struttura genomica e potenzialmente la funzione del DNA bersaglio.