Attivatori della trascrizione eucariotica

Gli attivatori di trascrizione sono proteine responsabili di permettere all'RNA polimerasi di iniziare la trascrizione. Hanno due domini essenziali, uno che si lega al DNA e l'altro che attiva la trascrizione. I domini di legame del DNA contengono una tra diverse caratteristiche:motivi strutturali, compresi i motivi comuni, come l'elica-giro-elica, a dita di zinco, e le strutture a cerniera di leucine Un dominio elica-giro-elica, o helix-turn-helix, è composto da due alfa-eliche, unite insieme da una catena amminoacidica che rappresenta la curva.

Un'elica è responsabile del riconoscimento della sequenza di DNA e si inserisce nel solco principale. Queste proteine si legano al DNA come dimeri. Un motivo a dita di zinco o zinc-finger, contiene un'alfa elica e un foglio beta a due filamenti, tenuti insieme da un atomo di zinco.

L'elica si lega al solco maggiore con l'aiuto di due istidine e della sua catena aminoacidica. Una cerniera di leucina, o leucine-zip, è composta da due monomeri che interagiscono tra loro nella forma di una Y che si lega al DNA. I monomeri sono costituiti da leucina ad ogni settima posizione all'estremità C-terminale, che interagisce con la leucina sul monomero opposto.

Il terminale N del monomero, che è costituito da motivi basici, si lega al DNA. Un altro dominio essenziale nell'attivatore, il dominio di attivazione della trascrizione, recluta coattivatori, ossia proteine essenziali che mediano il legame degli attivatori alla RNA polimerasi. Questi coattivatori, promuovono la trascrizione, attraverso diversi meccanismi, tra cui la modifica dell'istone, che porta ad un maggiore accesso del meccanismo trascrizionale al DNA.

Gli attivatori possono anche inviare segnali tramite i loro coattivatori per attivare la RNA polimerasi e iniziare la trascrizione. In alcuni casi, gli attivatori sono essenziali per l'allungamento del trascritto. Alcune polimerasi interrompono la trascrizione dopo alcuni nucleotidi e necessitano della presenza di un attivatore per riprendere la trascrizione.

La trascrizione di un singolo gene può essere regolata da diversi attivatori. Quando più di un attivatore è coinvolto, nella regolazione della trascrizione, possono agire sinergicamente per aumentare drasticamente la velocità di trascrizione rispetto a quella di attivatori individuali