Leaky Scanning

Durante la traduzione eucariotica, i ribosomi scansionano l'mRNA, a partire dall'estremità 5-primi, fino a quando incontrano la prima sequenza AUG, il codone di partenza, e iniziano la sintesi delle proteine. Tuttavia, un mRNA può avere due o più codoni AUG contenuti nella sua sequenza. I ribosomi a volte non riusciranno a riconoscere il primo codone AUG, e, invece, inizieranno la sintesi proteica da un codone di partenza più in basso nel filamento di mRNA.

Questo fenomeno è chiamato scansione a perdita, e permette la produzione di diversi tipi di proteine dallo stesso mRNA. Una particolare sequenza consensus, nota come sequenza di Kozak, determina se un ribosoma inizierà la sintesi proteica al primo codone di inizio o di saltarlo. In questa sequenza, la A del primo codone di partenza AUG, è numerata come più uno.

I nucleotidi seguenti, sono positivi, e i nucleotidi precedenti sono negativi. La sequenza ottimale si verifica quando una purina è presente nella posizione meno tre e una guanina è presente nella posizione più quattro. Nella posizione meno tre, l'adenina è più efficace della guanina all'inizio della traduzione.

I cambiamenti nel resto della sequenza nucleotidica hanno poca