13.6:
Divergenza e duplicazione genica
The seminal work of Ohno in 1970 popularized the idea of gene duplication and divergence. DNA sequence comparison studies reveal that a large portion of the genes in bacteria, archaebacteria, and eukaryotes was generated by gene duplication and divergence, indicating its critical role in evolution.
The duplicated copies of the gene are called Paralogs. Paralogs with similar sequences and functions form a gene family. Across several species, a large number of gene families are characterized. For example, the trypsin gene family in D. melanogaster has over 111 members; the olfactory receptor gene family in mammals has around 1000 member genes.
Gene duplication can arise due to the following four reasons. First, the unequal crossing over during meiosis can give rise to duplicated DNA segments containing a part of a gene or several genes.
The second is replication slippage. In rare instances, during DNA replication, the polymerase enzyme can dissociate from DNA and get realigned at an incorrect position, and copy the already replicated sequences again. This process can create duplicate copies of the DNA over several hundreds of bases.
The third is the retrotransposition. Here, cellular mRNA may get reverse transcribed into DNA copies called retrogenes. These retrogenes can then insert themselves back into the genome resulting in gene duplication. Since the inserted copy lacks promoters and other regulatory elements for transcription, most of these duplicates lose their function and become pseudogenes.
In addition to gene duplications, large-scale chromosome duplications or whole-genome duplications also occur. Some chromosomes may fail to segregate into daughter cells during meiosis, resulting in haploid cells with an abnormal number of chromosomes. For example, patients with Down syndrome have an additional copy of chromosome 21. In plants such as wheat, the entire genome is duplicated over six times, creating a hexaploid.
La duplicazione genica è un processo in cui una regione del DNA che codifica per un gene si duplica, creando copie aggiuntive di se stesso all’interno dello stesso genoma. Queste copie duplicate del gene, chiamate paraloghi, possono successivamente mutare e divergere in uno dei seguenti modi.
Il primo è la formazione degli pseudogeni. Qui, uno dei paraloghi genici può acquisire mutazioni deleterie e trasformarsi in una copia non funzionale chiamata pseudogene.
La seconda è la sub-funzionalizzazione in cui entrambi i paraloghi acquisiscono mutazioni in diversi domini codificanti proteine o esoni, suddividendo così la funzione genica originale tra di loro. Tuttavia, i prodotti proteici dei due geni paraloghi si completano a vicenda e mostrano la funzione genica originale.
Ad esempio, nei pesci primitivi e negli animali marini, una proteina globinica a catena singola fungeva da molecola che trasportava l’ossigeno nel sangue.
Nel corso dell’evoluzione, il gene della globina si è duplicato e subfunzionalizzato in due geni leggermente diversi che codificano per le proteine della α e della β-globina, che si associano per formare la molecola dell’emoglobina con 4 subunità presenti nella maggior parte dei vertebrati odierni.
Il terzo è la neo-funzionalizzazione. Qui, un paralogo acquisisce nuove e vantaggiose mutazioni che possono portare all’evoluzione di un nuovo gene. Al contrario, l’altro paralogo conserva la funzione originale.
Ad esempio, il gene della β-globina umana ha duplicato e acquisito mutazioni per produrre un nuovo gene chiamato β-globina fetale che è espresso esclusivamente nel feto umano. Tuttavia, subito dopo la nascita, il gene della β-globina assume la produzione delle proteine della β-globina.
L’evoluzione della visione tricolore nell’uomo è un altro interessante esempio di neofunzionalizzazione. Molto prima dell’evoluzione delle scimmie moderne, i primi primati avevano una visione dicromatica a causa della presenza dei geni dell’opsina blu e verde.
Successivamente, il gene dell’opsina verde si è duplicato e neo-funzionalizzato in un nuovo gene dell’opsina rossa.
Pertanto, le specie che si sono evolute dopo l’evento di duplicazione, come le scimmie del vecchio mondo, le scimmie e gli esseri umani, hanno tre geni opsinici che conferiscono una visione tricolore.
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