Struttura e organizzazione genica nei procarioti

I genomi procariotici sono costituiti da regioni codificanti e non codificanti.

Le regioni codificanti contengono sequenze nucleotidiche che dettano la sequenza amminoacidica per le proteine funzionali, iniziando con un codone iniziale e terminando con un codone di arresto.

I geni tRNA e rRNA codificano le sequenze per l'RNA di trasferimento e l'RNA ribosomiale. Sono organizzati come i geni codificanti le proteine, tranne per il fatto che le loro regioni codificanti rimangono non tradotte.

Al contrario, le regioni non codificanti includono promotori, sequenze regolatorie e terminatori.

I promotori si trovano a monte della regione codificante, guidando l'RNA polimerasi a legarsi e ad avviare la trascrizione.

I promotori batterici contengono le regioni -10 e -35 conservate, mentre negli archaea, le sequenze promotore conservate includono la scatola TATA, la sequenza dell'elemento di riconoscimento B e un elemento iniziatore.

Le sequenze regolatorie, come la sequenza batterica Shine-Dalgarno nella regione leader a monte del codone di inizio, assicurano il corretto allineamento dei ribosomi.

Infine, le sequenze terminatrici a valle del codone di stop segnalano la fine della trascrizione formando strutture stem-loop nell'RNA o coinvolgendo proteine come Rho.