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1: test di evitamento osmotica.
- Circa 16-24 ore prima del test, raccogliere L4 animali stadio larvale di ciascun genotipo per un piatto fresco NGM contenente OP50 E. coli che andincubate a 20 ° C. Il giorno dopo inizia l'esperimento con i giovani adulti.
- Si consiglia di effettuare il test "alla cieca". Le piastre con ogni sforzo per essere analizzati devono essere rietichettate da uno sperimentatore secondo, eseguendo il test con le piastre rietichettati che sarebbe stato smascherato quando l'esperimento è terminato.
- Il giorno del test, preparare una soluzione 4M stock di fruttosio con 1% di soluzione di Rosso Congo e sciogliere completamente a temperatura ambiente. Si consiglia di verificare la soluzione prima di ogni test in quanto il colorante potrebbe precipitare con il tempo.
- Anello anulare (1 cm di diametro) sulla piastra NGM è delineata al centro del terreno solido, con 15 microlitri della soluzione rosso fruttosio 4M. Lasciate che la soluzione di fruttosio penetrare nel agar, questo avviene di solito tra i 2 ei 5 minuti.
- Luogo singoli animali adulti giovani di ogni ceppo all'interno della circonvallazione e seguire nei prossimi 10 minuti per determinare la risposta alla barriera osmotica. Animali evitando l'anello più di sei volte di fila sono classificati come normali, quelli in uscita l'anello in meno di sei tentativi sono considerati difettosi nella sensibilità osmotica.
Nota: il ceppo di controllo deve essere utilizzato in ogni test. Animali adulti N2 giovani vengono utilizzati come controlli positivi in quanto decisamente evitare la barriera anello. Gli animali che sono stati precedentemente fame, passato attraverso Dauer larve o sono provenienti da piatti che sono troppo secche non deve essere utilizzato. All'inizio, animali di controllo devono essere valutati in duplice copia, a confermare che le piastre di analisi e la soluzione siano corretti.
2: Generazione di vermi knockdown alimentando RNAi.
- RNAi piastre: piastre NGM alimentazione RNAi contiene per litro: 17 g di agar, 2,5 g di peptone, 3,0 g NaCl, 1 ml di 5 mg di colesterolo ml -1; riempire il pallone a 1 litro con H 2 O e autoclave. Dopo agar si raffredda fino a circa 65 ° C, aggiungere 25 ml di 1 M KPO 4, pH 6.0, 1 ml di 1 M CaCl 2, 1 ml di 1M MgSO 4, carbenicillina 0,5 ml (50 mg ml -1) e 1 ml 1M IPTG. Se siete pronti a partire con NGM solide, si fondono terreno solido da microonde e successivamente posto NGM liquido in panchina per raffreddare e poi aggiungere KPO 4, pH 6.0, CaCl 2, MgSO 4, carbenicillina e IPTG come indicato in precedenza.
Aggiungere 10 ml di NGM in ogni piatto 60 millimetri Petri. Lasciare raffreddare e capovolgere le piastre mantenimento delle stesse in una notte prima dell'uso RT. Le piastre possono essere conservate in un sacchetto di plastica a 4 ° C per circa 4-5 giorni. - Preparazione batterica e induzione: Isolare le colonie di E.coli HT115 (DE3) ceppo, trasformato con L4440 vettore contenente un frammento corrispondente al gene bersaglio, su Luria-Bertani (LB) piastre di agar (17 agar g, 10 g di triptone, 5 g estratto di lievito e 10 g di NaCl per litro) contenente ampicillina (50 mg / ml) e tetraciclina (15 mg / ml).
Scegli una colonia di batteri e inoculare in LB con 50 mg / ml ampicillina, e destinata alla produzione di 6 8 ore con agitazione a 37 ° C; seme una goccia di questa cultura sulle piastre NGM preparato e asciugare i piatti accuratamente prima di essere incubazione overnight ( 12 24 h) a temperatura ambiente per permettere ai batteri di crescere e di iniziare a induzione. L'incubazione era al buio perché tetracicline è sensibile alla luce e può influenzare la variabilità dei saggi RNAi tra i piatti.
E 'necessario utilizzare un positivo e un controllo negativo per esperimenti di alimentazione RNAi. Il controllo positivo è E.coli HT115 cellule trasformate con il vettore L4440 contenente la sequenza del gene unc-22. L'atterramento di unc-22 gene produce un "fenotipo spasmi". Il controllo negativo è E.coli HT115 cellule trasformate con vuoto vettore L4440. - Gestione verme e punteggio: Il primo giorno, luogo L4 vermi palco da una piastra NGM seminato con OP50 su piastre NGM senza batteri e incubare a 20 ° C per 12 ore (a digiuno).
Il giorno dopo, il trasferimento di giovani adulti ermafroditi digiuno su un piatto seedded con i batteri che esprimono il gene bersaglio specifico RNAi. Lascia 40-48 ore a 20 ° C per generare progenie F1.
Poi inserire un paio di vermi adulti F1 su un altro piatto seminato con i batteri stessi. Dopo 24-48 ore, selezionare e isolare dalla progenie F2, i giovani adulti (completamente formato vulva sporgente con le uova pochi) e punteggio per fenotipi.
Nota: l'induzione RNAi nei neuroni hanno alcune limitazioni a causa delle proprietà refrattario del sistema nervoso C. elegans a RNAi.. Per superare i problemi di questa inefficienza nel neurone si raccomanda di utilizzare il rif-3 ceppo, uno sfondo ipersensibili agli effetti di RNAi nei neuroni 10. Nei nostri esperimenti non differences sono stati trovati tra Bristol N2 e rif-3 ceppi per i geni e il fenotipo analizzati.
3: I ceppi utilizzati.
Il C. elegans ceppi utilizzati in questo lavoro sono riportati nella tabella 1. Ceppi mutanti erano fuori incrociata contro N2 selvaggio - Tipo di almeno quattro volte per rimuovere i mutazioni casuali che avrebbero potuto essere generati durante il protocollo di mutagenesi.
. OP50 E coli ceppo è stato suppliied da Caenorhabditis Genetic Center, University of Minnesota, USA E.coli HT115 (DE3) con il plasmide pL4440 portando NRX-1 (JA: C29A12.5). NLG e-1 (JA: C40C9.5 frammenti di geni) sono stati forniti dal Dott. Peter Askjaer, Centro Andaluz de Biologia del Desarrollo (Abd), CSIC Universidad Pablo Olavide, Siviglia, Spagna.
4: I risultati rappresentativi.
Risultati illustrativo sono rappresentati nelle figure 1 e 2. Dieci animali di ogni ceppo e un minimo di tre esperimenti replica sono state effettuate.

Figura 1. Esperimenti di comportamento di evitamento osmotica.
Ceppi di controllo e NRX-1 (ok1649 e tm1961) mutantworms V carenti rispondere invertendo indietro quando incontrano una barriera osmotica (4M fruttosio). NLG-1 (ok259 e tm474) X mutanti non riescono a rilevare questa barriera. Doppi mutanti carenti di NLG-1 e NRX-1, ceppi CRR21 (ok1649; ok259) VX e CRR23 (tm1961; ok259) VX recuperato il fenotipo wild type. Il simbolo * indica differenze significative (p ≤ 0,001) da t-student test, nella risposta di ogni sforzo per la N2 Bristol wild-type da t-studente di prova

Figura 2. Gli esperimenti con i vermi knockdown alimentando RNAi.
E.coli HT115 (DE3) trasformato con vuoti vettore pL4440 o contenente un frammento corrispondente ai geni bersaglio NRX-1 o NLG-1 sono stati utilizzati per ceppi di vite senza fine alimentato diverse. Il simbolo * indica differenze significative (p ≤ 0,001) da t-student test, nella risposta del ceppo N2 alimentato con i batteri portando la pL4440 vettore con un frammento intese a promuovere l'NLG-1 gene in confronto con il ceppo N2 alimentato con vuoto pL4440 vettore .