Articolo metodologico

Agar-Block Microcosmi per decomposizione controllata tessuti vegetali da Funghi aerobica

DOI:

10.3791/2283

3 febbraio 2011

* These authors contributed equally

In questo articolo

Sommario

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Questo video dimostra un approccio controllato ambiente per studiare la degradazione dei tessuti vegetali lignocellulosici da funghi aerobico. La capacità di controllare le fonti di nutrienti e l'umidità è un vantaggio chiave di agar-block microcosmi, ma l'approccio produce spesso alterne fortune. Ci rivolgiamo insidie ​​critici cedere riproducibile, a bassa variabilità dei risultati.

Abstract

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I due metodi principali per lo studio biodegradazione fungine dei tessuti vegetali lignocellulosiche sono stati sviluppati per i test del legno (suolo-block; agar-block). E 'ben accettato che il suolo-block microcosmi rendimenti più elevati tassi di decadimento, meno problemi di umidità, bassa variabilità tra gli studi, e soglie più elevate di tossicità conservante. Suolo-block test è quindi la tecnica più utilizzata ed è stato standardizzato dalla American Society for Testing and Materials (ASTM) (metodo D 1413-07). Il terreno blocco design è inconvenienti, però, utilizzando fonti suolo localmente variabile e nel limitare il controllo delle sostanze nutritive esterna (esogena) ai tessuti in decomposizione. Questi svantaggi sono emersi come un problema per l'applicazione di questo metodo per gli altri, ha come obiettivo la ricerca sempre più popolare. Questi obiettivi includono moderni legnocellulosa degradante per la ricerca per la bioenergia, il collaudo biorisanamento di co-metabolizzata sostanze tossiche, valutando i meccanismi ossidativi e il monitoraggio elementi traslocato lungo le reti ifale. Suolo blocchi non prestano abbastanza controllo in queste applicazioni. Un raffinato agar-block approccio è necessario.

Qui usiamo il marciume bruno legno degradanti fungo lacrymans Serpula a degradare legno in agar-blocco microcosmi, con profondo Petri con basso contenuto di calcio agar. Testiamo il ruolo di esogeni gesso su decadimento in una serie temporale, per dimostrare l'utilità e la variabilità attesa. Isolati da una singola scheda rip (taglio longitudinale) sono condizionati, pesato, in autoclave, e introdotto in modo asettico in cima a una rete di plastica. Vaccinazioni fungine sono in ogni faccia del blocco, con esogena gesso aggiunti alle interfacce. Raccolti sono asettiche fino al raccolto finale distruttivo. Questi microcosmi sono progettati per evitare il contatto blocco con agar o pareti piastra di Petri. Condensa è ridotto al minimo durante piatto versa e durante l'incubazione. Infine, l'inoculo / gesso / legno spazio è ridotto al minimo, ma senza permettere contatto. Questi aspetti meno tecnici di agar-block design sono anche le cause più comuni di fallimento e la principale fonte di variabilità tra gli studi. Pubblicazione del video è quindi utile in questo caso, e dimostriamo a bassa variabilità, risultati di alta qualità.

Protocollo

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Questo protocollo si applica a substrati legnosi e non legnosi, come indicato, oltre al materiale forno o aria secca. Leggere il primo protocollo, tuttavia, prima di set-up. Ci sono diversi punti sollevati che potrebbero valere per il vostro studio, e questi punti (sottolineato) richiedono una pianificazione. Si noti inoltre che ci sono due pubblicati agar-block metodi che sono a volte utilizzati, uno dei British Standard 838 e un altro a seguito di un gruppo di ricerca internazionale per la protezione del legno (IRG-WP) documento presentato da Bravery (1978). Il nostro metodo assomiglia a 838, con modifiche soprattutto nella progettazione microcosmo e il controllo d....

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Discussione

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Utilizzando il nostro agar-block set-up (Figura 1) lacrymans Serpula cresciuto a diretto contatto con le superfici in gesso e in blocchi di legno (Figura 2), portando a oltre il 60% di perdita di peso nel marrone-decomporsi controllo blocchi di pino (Figura 3 ). Questo soddisfa facilmente l'obiettivo standard ASTM di decadimento> 50% e il coefficiente medio di variazione (C V) nel decadimento in era 0,055 alla settimana 16. Questi dati vengono pubblicati in Schilling 7. Ancora una v.......

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Dichiarazioni

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Nessun conflitto di interessi dichiarati.

Materiali

Elenco dei materiali utilizzati in questo articolo
NomeAziendaNumero di catalogoCommenti
Piastre di PetriNalge Nunc international401425 x 150 mm
Agar, Tipo ASigma-AldrichA4550
Nitrato di ammonio, NH4NO3Millinckrodt3436-12
Fosfato di potassio, KH2PO4JT Baker3246-01
Solfato di magnesio 7-idrato, MgSO4• 7H2OSigma-Aldrich230391
D-(+)-glucosioSigma-AldrichG8270Destrosio
acido borico, H3BO4Mallinckrodt Baker Inc.2549-04
Solfato di zinco 7-idrato, ZnSO4• 7H2OMallinckrodt Baker Inc.8880-12
Cloruro manganoso 4-idrato, MnCl2• 4H2OJT Baker2540-04
Solfato di rame(II) 5-idrato, CuSO4• 5H2OSigma-Aldrich209198
Eptamolibdato di ammonio 4-idrato, (NH4)6Mo7O24• 4H2OSigma-Aldrich431346
Cloruro di calcio diidrato, CaCl2• 2H2OMallinckrodt Baker Inc.4160-12
Cloruro di sodio, NaClMallinckrodt Baker Inc.7581-12
Solfato ferroso 7-idrato, FeSO4• 7H2OMallinckrodt Baker Inc.5056-12
Pipet-aidDrummond Scientific4-000-110Cordless
EtOH la superficie
10 ml pipetta sterile in polistireneBD Biosciences357551
Gutter GuardThermwell Products Co.VX620Pre-strofinato con sapone
Ferramenta
Solfato di calcio emiidrato, CaSO4• 0.5H2OAcros Organics385355000
#4 trivella da sugheroBoekel Scientific1601
Parafilm "M"Pechiney Imballaggio in plasticaPM-996

Riferimenti

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  1. ASTM D1413-07. Standard test method for testing wood preservatives by laboratory soil-block cultures. . Annual Book of ASTM Standards. , 185-192 (2007).
  2. Bravery, A. F. A miniaturized wood block for the rapid evaluation of wood preservative fungicides. , International Research Group on Wood Protection (IRG/WP 2113). (1978).
  3. Low, G. A., Young, M.....

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Agar Block MicrocosmsFungal BiodegradationWood DecompositionAerobic FungiExogenous SubstratesMass Loss MeasurementsMycelial MorphologyElemental AnalysisGypsum TreatmentPlastic Mesh Grids

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