Method Article

Proteine ​​di membrana Overlay saggio: un protocollo di prova interazione tra proteine ​​solubili e insolubili In vitro

DOI:

10.3791/2961

August 14th, 2011

In This Article

Summary

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Test interazione proteina-proteina è indispensabile per la dissezione di funzionalità delle proteine. Qui, introdurre un In vitro Proteina-proteina saggio vincolante per sondare una membrana-proteina immobilizzato con una proteina solubile. Questa analisi fornisce un metodo affidabile per verificare l'interazione tra una proteina insolubile e una proteina in soluzione.

Abstract

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Convalida interazioni tra proteine ​​diverse è fondamentale per l'esame delle loro funzioni biologiche a livello molecolare. Ci sono diversi metodi, sia in vitro che in vivo, per valutare legame con le proteine, e almeno due metodi che integrano le carenze di ogni altro dovrebbe essere condotta di acquisire le conoscenze affidabili.

Per un test in vivo, la complementazione bimolecolare fluorescenza (BiFC) saggio rappresenta l'approccio più popolare e meno invasivo che permette di rilevare l'interazione proteina-proteina all'interno delle cellule viventi, così come individuare la localizzazione intracellulare del 1,2 interagendo proteine. In questo saggio, non fluorescente metà N-e C-terminale della GFP o di sue varianti si fondono alle proteine ​​testate, e quando le due proteine ​​di fusione sono riuniti a causa delle interazioni delle proteine ​​testate ', il segnale fluorescente viene ricostituito 3-6 . Perché il suo segnale è facilmente rilevabile mediante microscopia in epifluorescenza e confocale, BiFC è emersa come un potente strumento di scelta tra i biologi cellulari per lo studio di interazioni proteina-proteina nelle cellule viventi 3. Questo test, tuttavia, possono a volte produrre risultati falsi positivi. Per esempio, il segnale fluorescente può essere ricostituito da due frammenti GFP disposte, per quanto 7 nm l'una dall'altra a causa di chiudere imballaggio in un piccolo vano subcellulare, piuttosto che a causa di interazioni specifiche 7.

A causa di queste limitazioni, i risultati ottenuti dalle tecnologie di imaging cellulare dal vivo deve essere confermata da un approccio indipendente, basato su un principio diverso per rilevare le interazioni delle proteine. Co-immunoprecipitazione (Co-IP) o glutatione transferasi (GST) pull-down test rappresentano tali metodi alternativi che sono comunemente utilizzati per analizzare interazioni proteina-proteina in vitro. Tuttavia, iIn questi test, però, le proteine ​​testato deve essere facilmente solubile nel buffer che supportsused per la reazione di legame. Pertanto, le interazioni specifiche che coinvolgono una proteina insolubile che non può essere valutata da queste tecniche.

Qui, ci illustrano il protocollo per il saggio sovrapposizione proteina di membrana vincolante, che aggira questa difficoltà. In questa tecnica, l'interazione tra proteine ​​solubili e insolubili in modo attendibile testato perché una delle proteine ​​è immobilizzato su una matrice di membrana. Questo metodo, in combinazione con esperimenti in vivo, come BiFC, fornisce un approccio affidabile per studiare e caratterizzare le interazioni tra fedelmente proteine ​​solubili e insolubili. In questo articolo, vincolante tra virus del mosaico del tabacco (TMV) proteina movimento (MP), che esercita funzioni multiple durante virale cellula-cellula trasporto 8-14, e un impianto di Interactor recentemente identificato cellulari, tabacco ankyrin ripetuta contenenti proteine ​​(ANK ) 15, si dimostra con questa tecnica.

Protocol

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1. Espressione e l'estrazione delle proteine

  1. Differenziale tag le proteine ​​da testare per la loro rilevazione. Etichetta la proteina di essere immobilizzato sulla membrana (ProIM) con un tag di dimensioni più grandi (ad esempio, GST), e il tag non condensato può essere utilizzato come controllo negativo immobilizzato (ProIMnc). Etichetta la proteina da usare come una sonda solubile (ProSol) sia con un grande o un tag di piccole dimensioni. Fusibile lo stesso tag di una proteina solubile appropriato controllo negativo (ProSOLnc) e includono nel test di interazione per confermare la specificità del legame rilevato.
  2. Scegliere il sistema di espress....

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Discussion

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Questo approccio è adatto per testare interazioni proteina-proteina tra le combinazioni di proteine, quando almeno uno dei quali le proteine ​​è facilmente solubile nel buffer vincolante, ed è stato applicato con successo ad altra combinazione di proteine ​​17,18. Il iInteractions tra le proteine ​​che sono sia insolubile in queste condizioni non possono essere testati da questo protocollo.

Inoltre, il successo di ripiegamento ProIM è fondamentale per l'analisi. Risciacquo del.......

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Disclosures

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Nessun conflitto di interessi dichiarati.

Acknowledgements

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Il lavoro nel nostro laboratorio è sostenuto anche da finanziamenti del NIH, USDA Istituto Nazionale di Alimentazione e l'Agricoltura, NSF, BARD, DOE, e BSF a VC

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Materials

List of materials used in this article
NameCompanyCatalog NumberComments
Nome del reagente Azienda Numero di catalogo
Proteine ​​test kit Bio-Rad 500-0001
Inibitore della proteasi cocktail SIGMA S8820
Mini-PROTEAN sistema Bio-Rad 165-8000
Semi-secco western blotting SD electrotransfer sistema Bio-Rad 170-3940
Anti-IgG di coniglio coniugato con perossidasi di rafano GenScript A00098
Anti-GST coniglio anticorpo policlonale GenScript A00097
Anti-strepII GenScript A00626
Biotrace, NT nitrocellulosa membrana trasferimento Pall scientifico 27377-000
Immobilon occidentale HRP substrato chemiluminescente Millipore WBKL S0 050

References

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  1. Hu, C. D., Chinenov, Y., Kerppola, T. K. Visualization of interactions among bZIP and Rel family proteins in living cells using bimolecular fluorescence complementation. Mol Cell. 9, 789-798 (2002).
  2. Citovsky, V.

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Tags

Protein Membrane Overlay AssayProtein Protein InteractionSoluble Protein BindingInsoluble Protein DetectionNitrocellulose Membrane ImmobilizationGST Tagged ProteinsWestern Blot DetectionStrep Tag ProbeIn Vitro Binding AssayBiFC Validation

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