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Articolo metodologico

Integrazione genica mirata mediata da TALEN: utilizzo di nucleasi specifiche per sequenza ingegnerizzate per l'inserimento preciso del gene della proteina fluorescente nelle hiPSC

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8 luglio 2025

In questo articolo

Abstract

Fonte: Cerbini, T. et al. Trasfezione, selezione e selezione di colonie di cellule staminali pluripotenti indotte umane mirate a TALEN con un gene GFP nel porto sicuro AAVS1. J. Vis. Exp. (2015)

Questo video descrive una precisa tecnica di editing del genoma in cellule staminali pluripotenti indotte umane, o hiPSC, utilizzando TALEN per creare rotture a doppio filamento in un locus mirato, inducendo la riparazione diretta dall'omologia per l'integrazione genica della proteina di fluorescenza.

Protocollo

1. Preparazione della matrice della membrana basale e rivestimento della plastica

  1. Posizionare il brodo di matrice della membrana del basamento congelato da -20 °C sul ghiaccio e scongelare per una notte a 4 °C.
  2. Dopo lo scongelamento, pipettare 2 mg di aliquote di matrice della membrana basale in provette Eppendorf pre-raffreddate. Conservarli a -20 °C fino al momento del bisogno.
  3. Per preparare le piastre rivestite di matrice a membrana basale, scongelare un'aliquota di ghiaccio fino a quando l'ultimo pezzo di ghiaccio nella provetta di Eppendorf scompare (di solito entro ~2 ore).
  4. Dopo lo scongelamento, aggiungere la matrice della membrana basale a 12 ml di DMEM/F12 freddo (4 °C) per ottenere la soluzione di rivestimento della matrice della membrana basale.
  5. Aggiungere la soluzione della matrice della membrana basale al recipiente di coltura appropriato. Per una piastra a 6 pozzetti, erogare 1 ml per pozzetto. Agitare la piastra per assicurarsi che la soluzione della matrice della membrana basale copra completamente ogni pozzetto.
  6. Il parafilm sigilla la piastra/piastra rivestita di matrice a membrana basale e incuba a temperatura ambiente per 1 ora prima dell'uso. In alternativa, conservare le piastre/piastre rivestite a matrice di membrana del basamento a 4 °C e utilizzarle entro 2 settimane dal rivestimento.
    nota: Aggiungere ulteriore DMEM/F12 alla piastra/piastra rivestita a matrice di membrana del basamento per evitare l'essiccazione. Prima di utilizzare una piastra/piastra rivestita di matrice a membrana per seminterrato conservata a 4 °C, collocarla in una cabina di sicurezza biologica e lasciarla a temperatura ambiente per almeno 30 minuti.
  7. Aspirare completamente la matrice della membrana basale prima dell'aggiunta del terreno e delle cellule.

2. Preparazione di E8 medium

  1. Preparare il terreno di coltura E8 scongelando l'integratore E8 per una notte a 4 °C.
  2. Rimuovere 10 ml di terreno basale E8 dal brodo da 500 ml e gettarlo.
  3. Pipettare l'intero flaconcino da 10 ml di integratore E8 direttamente in 490 ml di terreno basale E8. Non riscaldare il fluido E8 completo in un bagno d'acqua a 37 °C, poiché ripetute fluttuazioni di temperatura possono degradare il bFGF nel mezzo E8 completo.
  4. Utilizzare il terreno E8 completo entro 2 settimane dall'aggiunta dell'integratore.

3. Scongelamento delle iPSC

  1. Rimuovere una fiala di iPSC congelate dall'azoto liquido e metterla su ghiaccio secco.
  2. Scongelare rapidamente la fiala in un bagno d'acqua a 37 °C; agitare la fiala nel bagnomaria fino a quando non rimane solo un minuscolo frammento di ghiaccio.
  3. Spruzzare la fiala con etanolo al 70% e trasferirla in una cabina di sicurezza biologica.
  4. Aggiungere 1 ml di E8 medium a temperatura ambiente goccia per goccia direttamente nel flaconcino.
  5. Utilizzando una pipetta da 2 ml, trasferire la sospensione cellulare goccia a goccia in 9 ml di terreno E8 in una provetta conica da 15 ml. Agitare frequentemente la provetta per assicurarsi che le cellule e il terreno si mescolino bene rapidamente.
  6. Centrifugare le celle a 200 x g per 5 min.
  7. Aspirare il surnatante e risospendere il pellet cellulare in un volume appropriato di E8 integrato con 10 μM di Y-27632.
  8. Aggiungere le cellule a un numero appropriato di pozzetti rivestiti di matrice di membrana basale e collocarle in un incubatore a 37 °C, CO₂ al 5% per una notte. Si consiglia di piastrare almeno 0,2 x 10⁶ iPSC per pozzetto di una piastra a 6 pozzetti per consentire un rapido recupero dopo lo scongelamento.

4. Manutenzione e Passaggio di Routine delle iPSC

  1. Aggiorna E8 medio ogni giorno.
  2. Monitora la morfologia e la confluenza delle cellule con un microscopio invertito. Le iPSC di alta qualità crescono in colonie piatte con bordi distinti; le singole colonie possiedono un aspetto "simile a un ciottolo".
  3. Passaggio delle cellule iPSC quando raggiungono la confluenza del ~70%.
  4. Preparare una soluzione per il passaggio dell'EDTA aggiungendo 0,9 g di NaCl e 500 μl di EDTA 0,5 M a 500 ml di DPBS. Mescolare bene per sciogliere NaCl e filtrare sottovuoto per sterilizzare. Scaldare un'aliquota della soluzione di passaggio in un bagno d'acqua a 37 °C prima del passaggio.
  5. Per il passaggio, aspirare il terreno di coltura esaurito e lavare le cellule una volta con un volume uguale di soluzione calda per il passaggio. Aspirare e pipettare una quantità sufficiente di soluzione di passaggio di EDTA per rivestire le cellule (1 ml per pozzetto di una piastra a 6 pozzetti).
  6. Posizionare le cellule al microscopio invertito e osservare le colonie di iPSC. La comparsa di buchi all'interno delle colonie e bordi rialzati dovrebbe diventare evidente entro 2-5 minuti.
  7. Aspirare con cautela la soluzione di passaggio dell'EDTA.
  8. Utilizzando una pipetta da 10 ml, erogare 4 ml di terreno E8 (se si utilizza una piastra a 6 pozzetti) ad alta pressione direttamente in ciascun pozzetto da far passare.
  9. Raccogliere i grumi di iPSC e dividerli in un numero appropriato di pozzetti a seconda del rapporto di divisione da 1:8 a 1:12. Non sovraccaricare le pipette, poiché la disgregazione dei grumi cellulari comporterà una scarsa vitalità.
  10. Posizionare la piastra in un'incubatrice e farla oscillare avanti e indietro e da un lato all'altro più volte per disperdere le cellule.

5. Preparazione di MEF e iPSC per la trasfezione

  1. 48 ore prima della trasfezione, far passare le iPSC a ~1:6 in quattro o più pozzetti di una piastra a 6 pozzetti rivestita con matrice di membrana basale, in modo che siano confluenti al 70% tra due giorni.
  2. Il giorno successivo, scongelare i MEF DR4 in un terreno MEF costituito da DMEM (glucosio alto) integrato con il 10% di FBS e 1x MEM-NEAA.
  3. Piastra i MEF DR4 in due piastre da 10 cm a ~ 2 celle da 10⁴/cm² e incubazione notturna a 37 °C.
  4. Il giorno della trasfezione, cambiare il terreno MEF in E8 integrato con 10 μM di Y-27632 30 minuti prima di eseguire la trasfezione su iPSC.
  5. Facoltativo: 4 ore prima della trasfezione, integrare la coltura iPSC pre-trasfezione con Y-27632 alla concentrazione finale di 10 μM.

6. Trattamento delicato del reagente di dissociazione cellulare e trasfezione di iPSC utilizzando un sistema di elettroporazione

  1. Rimuovere la soluzione di trasfezione di cellule primarie P3 da 4 °C e lasciarla a temperatura ambiente per ~30 minuti. Aggiungere l'intero integratore da 100 μl alla soluzione di trasfezione prima dell'uso.
  2. Reagente caldo per la dissociazione cellulare delicata in un bagno d'acqua a 37 °C.
  3. Ottenere i TALEN AAVS1 (pZT-AAVS1-L1 e pZT-AAVS1-R1) e il donatore AAVS1-CAG-EGFP a partire da -20 °C.
  4. Rimuovere le iPSC dall'incubatrice e lavarle una volta con DPBS.
  5. Aggiungere 1 ml di reagente di dissociazione cellulare delicata per pozzetto e incubare le iPSC a 37 °C per 5 minuti, o fino a quando più del 50% delle cellule si è dissociato dal recipiente di coltura.
  6. Pipettare le cellule su e giù alcune volte utilizzando una pipetta p1000 per dissociare le cellule rimanenti dal recipiente di coltura e rompere i grumi di iPSC.
  7. Aggiungere 2 ml di terreno E8 a ciascun pozzetto e pipettare su e giù più volte utilizzando una pipetta da 10 ml per disaggregare ulteriormente i grumi cellulari in singole cellule.
    nota: L'efficienza della trasfezione diminuisce significativamente se i grumi cellulari non sono sufficientemente disaggregati.
  8. Raccogliere le iPSC in una provetta conica da 15 ml e centrifugare a 100 x g per 3 minuti.
  9. Aspirare il surnatante e risospendere le cellule in una quantità minima di terreno E8.
  10. Contare le cellule utilizzando un emocitometro dopo l'applicazione di un colorante vitale come il blu di tripano allo 0,4%. Assicurarsi che le cellule siano sufficientemente dissociate durante il conteggio (1-3 cellule per "grumo").
  11. Erogare 3 celle da 10⁶ in ciascuna delle due provette coniche da 15 ml e centrifugare nuovamente a 100 x g per 3 min.
    nota: La centrifugazione a bassa velocità riduce lo stress cellulare e consente una facile risospensione delle iPSC prima dell'elettroporazione.
  12. Impostare il sistema di elettroporazione sul programma specifico per il tipo di cellula per la linea di cellule staminali embrionali umane H9 (Programma CB-150).
  13. Dopo la centrifugazione, aspirare il surnatante dai pellet cellulari. A un pellet, aggiungere 10 μg del donatore HR come campione di controllo. All'altro pellet aggiungere 10 μg del donatore HR, insieme a 5 μg di ciascun TALEN (pZT-AAVS1-L1 e pZT-AAVS1-R1) come campione sperimentale.
  14. Risospendere ogni pellet di cellula in 100 μl di soluzione di trasfezione di cellule primarie P3 e trasferirlo in una cuvetta.
  15. Eseguire la trasfezione e aggiungere immediatamente 500 μl di terreno E8 a temperatura ambiente a ciascuna cuvetta.
  16. Trasferire le iPSC trasfettate goccia a goccia in una piastra da 10 cm contenente i MEF DR4 preparati al punto 5.4.

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Dichiarazioni

Nessun conflitto di interessi dichiarato.

Materiali

Elenco dei materiali utilizzati in questo articolo
NomeAziendaNumero di catalogoCommenti
Matrice di membrana basale con fattore di crescita ridotto (GFR) Matrigel, *Senza LDEV, 10 mlCorningCodice 354230Conservare a -20 °C.
DMEM/F-12Tecnologie per la vitaCodice 11320-033Conservare a 4 °C.
Costar Piastre a pozzetti multipli con trattamento TC trasparente a 6 pozzettiCorning3506
Essential 8 MedioTecnologie per la vitaA1517001Conservare il terreno basale a 4 °C. Conservare l'integratore a -20 °C.
Y-27632 dicloridratoTocrisOre 1254Conservare a temperatura ambiente. Una volta sciolto in H2O, conservare a -20 °C.
cloruro di sodiosigmaCodice S5886-500G
UltraPure 0,5 M EDTA, pH 8,0Tecnologie per la vitaCodice 15575-020
DPBS, senza calcio, senza magnesioTecnologie per la vitaCodice 14190-250
Piatto di coltura trattato TC da 100 mmCorning430167
DR4 MEF 2M IRR - AccademicoStelo globaleGSC-6204GConservare in azoto liquido.
DMEM, glucosio alto, piruvatoTecnologie per la vitaCodice 11995-040Conservare a 4 °C.
Siero fetale bovino definito, origine statunitenseHyCloneSH30070.03Conservare a -20 °C. Scongelare a 4 °C per una notte e aliquotare. Conservare le aliquote a -20 °C fino al momento del bisogno.
MEM Soluzione di Aminoacidi Non Essenziali (100X)Tecnologie per la vitaCodice 11140-050Conservare a 4 °C.
Unità centrale 4D-NucleofectorLonzaCodice AAF-1001BParte del sistema di elettroporazione.
Unità X 4D-NucleofectorLonzaCodice AAF-1001XParte del sistema di elettroporazione.
P3 Cellula primaria 4D-Nucleofector X L (24 RCT)LonzaV4XP-3024All'arrivo, rimuovere la soluzione cellulare primaria e integrare e conservare a 4 °C.
Reagente per dissociazione cellulare StemPro AccutaseTecnologie per la vitaA1110501Conservare a -20 °C. Scongelare per una notte a 4 °C e scaldare un'aliquota in un bagnomaria a 37 °C prima dell'uso.
Terreno di coltura NutriStem XF/FFStemgent01-2005Conservare a -20 °C. Scongelare per una notte a 4 °C
TALENI AAVS1 (pZT-AAVS1-L1 e pZT-AAVS1-R1)Addgene52637 e 52638
AAVS1-CAG-EGFP Donatore di ricombinazione omologaAddgeneCodice 22212
Puromicina dicloridratoTecnologie per la vitaCodice A11138-03Conservare a -20 °C. Preparare aliquote di lavoro da 1 mg/ml in ddH2O.
Pipette monouso in vetro borosilicato PasteurFisher Scientifico13-678-20A
Sorvall Legend XTR (refrigerato), 120 V 60 HzTermo Scientifico75-004-521
TX-750 Rotore a secchiello oscillante da 4 × 750 mlTermo Scientifico75003607
Soluzione di blu di tripano, 0,4%Tecnologie per la vitaCodice 15250-061
Kit

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