1. Immunolocalizzazione
NOTA: La procedura di immunolocalizzazione fluorescente si basa sull'uso sequenziale di due anticorpi. L'anticorpo primario viene sollevato contro uno specifico antigene bersaglio. L'anticorpo secondario viene sollevato specificamente contro l'anticorpo primario e per le tecniche fluorescenti viene coniugato a un fluoroforo (FITC [isotiocianato di fluoresceina] in questo protocollo specifico). L'anticorpo primario sarà utilizzato per rilevare l'antigene bersaglio nel campione e l'anticorpo secondario sarà utilizzato per contrassegnare la posizione in cui l'anticorpo primario si è collegato al campione dopo aver lavato via l'eccesso di anticorpo primario. I controlli sono una parte importante di questo test e devono essere sempre eseguiti per assicurare l'accuratezza delle osservazioni. Un pozzetto sul vetrino deve essere riservato per l'uso come controllo negativo, dove il trattamento con anticorpi primari verrà saltato, e quindi non deve essere osservato alcun segnale alla fine dell'esperimento. Un controllo positivo deve essere incluso nell'esperimento trattando un pozzetto con un anticorpo la cui marcatura è già nota e certa. Il controllo positivo viene utilizzato per confermare l'efficacia della marcatura degli anticorpi secondari e le condizioni di reazione, mentre il controllo negativo verifica la specificità degli anticorpi secondari.
- Preparare una camera di incubazione posizionando alcuni tovaglioli di carta inumiditi sul fondo di una scatola di puntali per pipette e avvolgendola con carta stagnola (Figura 1B-1E). Posizionare i vetrini nella camera di incubazione.
- Pipettare una goccia da 50 μl per 8 mm di pozzetto di soluzione bloccante (5% di latte scremato in polvere (p/v) in soluzione salina tamponata con fosfato 1 M [PBS]) e incubare per 10 minuti. Rimuovere la soluzione bloccante e lavare tutti i pozzetti due volte con PBS per 10 minuti.
- Preparare le soluzioni anticorpali primarie (vedere la Tabella 1), anticorpo 1:5 (v/v) in soluzione bloccante; fare una stima di circa 40 μl per pozzetto da 8 mm.
nota: La concentrazione dell'anticorpo deve essere regolata secondo il protocollo del produttore.
- Eseguire un lavaggio finale con acqua bidistillata (ddH2O) per 5 min, non lasciare mai asciugare completamente i pozzetti.
- Pipettare la soluzione di anticorpi primari nei pozzetti di reazione. Pipettare la soluzione bloccante nei pozzetti di controllo.
- Chiudere la camera di incubazione e lasciar riposare per 2 ore a temperatura ambiente, seguite da una notte a 4 °C. Preparare la soluzione di anticorpi secondari, all'1% in soluzione bloccante (v/v) a circa 40 μL per pozzetto. Tenetelo coperto con carta stagnola.
- Lavare tutti i pozzetti due volte con PBS per 10 minuti, seguiti da altri 10 minuti con ddH2O. Assicurarsi che non siano visibili tracce della soluzione bloccante o depositi sui pozzetti.
- Pipettare la soluzione di anticorpi secondari in tutti i pozzetti. D'ora in poi, proteggi le guide dalla luce.
- Incubare per 3–4 ore al buio a temperatura ambiente.
- Lavare tutti i pozzetti due volte per 10 minuti con PBS seguito da un altro lavaggio di 10 minuti con ddH2O.
- Applicare una goccia di calcofluor (1:10.000 (p/v) fluorescente più luminoso di 28 in PBS) su ciascun pozzetto. Senza lavare, applicare una goccia di mezzo di montaggio (vedi Tabella dei materiali) su ciascun pozzetto e posizionare un vetrino coprioggetti (Figura 2H).
- Osservare con un microscopio a fluorescenza, dotato di lenti 10x/0,45, 20x/0,75, 40x/0,95 e 100x/1,40, utilizzare filtri UV (per la colorazione del calcofluor) e FITC, per rilevare rispettivamente la parete cellulare e l'immunolocalizzazione (Figura 2I). Utilizzare le seguenti lunghezze d'onda: eccitazione/emissione (nm) 358/461 per UV e 485/530 per FITC.
- Per una migliore visualizzazione dei risultati, sovrapporre entrambe le immagini con ImageJ o simili.
Tabella 1: Elenco di anticorpi monoclonali utili. La tabella sopra rappresenta un esempio di anticorpi disponibili, con informazioni sui loro bersagli e dove possono essere acquistati.
Visualizzazione del materiale
Visualizzazione del materiale
| nome | affinità | Disponibile all'indirizzo |
| Testo della LM2 | Proteina arabinogalattano | Sonde per impianti (Leeds, Regno Unito) |
| Motore LM5 | pectine |
| Motore LM6 | Arabinan |
| Motore LM7 | Omogalatturico |
| Visualizzazione del materiale LM8 | Xilogalacturonan |
| Pannello LM13 | (1-5)-a-L-ARABINAN |
| Pannello LM14 | Proteina arabinogalattano |
| LM16 | Arabinan Lavorato - RG-I |
| LM18 | Omogalatturico |
| LM19 | Omogalatturico |
| Pannello LM20 | Omogalatturico |
| Pannello LM26 | GALATTANO RAMIFICATO |
| Pannello LM30 | Proteina arabinogalattano |
| JIM5 | Omogalatturonano a basso estere metilico | CCRC (Georgia, Stati Uniti) |
| JIM7 | Omogalatturonano altamente esterificato metilico |
| JIM4 | Proteina arabinogalattano |
| JIM8 | Proteina arabinogalattano |
| JIM13 | Proteina arabinogalattano |
| JIM15 | Proteina arabinogalattano |
| JIM16 | Proteina arabinogalattano |
| JIM20 | Estensina |
| MAC207 | Proteina arabinogalattano |