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Maze-Suite si compone di tre applicazioni principali: un programma di editing per la costruzione di ambienti labirinto (MazeMaker), una visualizzazione / rendering modulo (MazeWalker), ed infine l'analisi e la visualizzazione del percorso utensile (MazeAnalyzer). Le sezioni seguenti descrivono l'utilizzo di MazeSuite e maggiori dettagli sono disponibili nelle tre video supplementari, uno per ogni modulo MazeSuite.
1. Labirinti progettazione
L'applicazione MazeMaker all'interno Maze-Suite, permette di creare tridimensionale (3D) da ambienti semplicemente disegnando su una bidimensionale (2D) tela dalla prospettiva degli uccelli '. Pareti e pavimenti possono essere tratte dal clic del mouse per indicare le coordinate, e gli utenti possono importare i file oggetto 3D o modificare le proprietà di oggetti all'interno del labirinto come la posizione, orientamento, colore, texture e luci.
Regioni inizio Maze e alla fine possono essere assegnati oltre ai criteri di uscita diversa, come un periodo di timeout. Messaggi di testo separato può essere visualizzato per informare un partecipante per ogni condizione di uscita. Durante la fase di progettazione, labirinti può essere verificato utilizzando la funzione 'corsa veloce' all'interno MazeMaker.
Per gli studi di imaging funzionale, i partecipanti sono solitamente chiesto di eseguire una serie di compiti con prove ripetute. Per facilitare questo test di prove ripetute, MazeMaker possibile creare file lista labirinto, che vengono ordinati in liste di labirinti e messaggi di testo per una sessione sperimentale. E 'fondamentale che il file elenco labirinto per l'esperimento è preparato e accuratamente testati pilota prima del giorno dell'esperimento.
Un tutorial superficiale per l'uso e lo sviluppo di ambienti con MazeMaker viene fornita in 'supplementare il video II - MazeMaker'.
2. fNIR installazione e posizionare il sensore fNIR-pad
Preparazione del Box fNIR
- Ci sono due connettori del cavo dietro la scatola fNIR. Uno degli slot per il collegamento USB e l'altro collegamento è per il cavo di alimentazione.
- Collegare la casella di dispositivo fNIR attraverso il cavo USB ad un PC o laptop che verrà utilizzato per l'acquisizione dei dati.
- Collegare l'adattatore di alimentazione al dispositivo e accendere l'interruttore.
- Il cavo a nastro viene utilizzato per collegare il pad del sensore con la scatola fNIR.
- Il sensore pad case sorgente di luce (LED) e rilevatori di foto.
- I LED emettono luce a lunghezze d'onda infrarossa 730nm e 850nm che vengono assorbite principalmente da deossigenato-e-emoglobina ossigenata, rispettivamente, e quindi in grado di penetrare attraverso i tessuti biologici.
Posizionamento del sensore-pad
- Chiedere al partecipante di sollevare i capelli fuori della fronte prima di posizionamento del sensore. Posizionare la striscia sensore appena sopra le sopracciglia. Far corrispondere il centro del sensore con l'asse verticale di simmetria che passa anche attraverso il naso
- Premete il pad del sensore con fermezza contro la fronte e l'uso di una clip per tenere insieme i cavi nella parte posteriore della testa. Anche se non strettamente necessario, testa-wrap o bandana da tennis si consiglia di fissare il pad del sensore.
- Contestualmente all'invio degli pad sensore sulla fronte, collegare le due estremità del cavo a nastro alla scatola fNIR. I cavi a nastro deve essere collegato confrontando la 'I' e 'II' i lati del cavo a nastro con il corrispondente 'io' e 'II' connettori sul dispositivo.
Avvio del software Studio COBI per la raccolta dati
- Clicca sul Brain Imaging cognitiva (Optical COBI) Studio13 icona sul desktop per aprire la finestra principale.
- Il programma sarà disponibile con alcune impostazioni predefinite per la raccolta e visualizzazione dei dati.
- E 'importante verificare e confermare i parametri di acquisizione dati e scatenanti (sincronizzazione marcatore) in dialogo dispositivo impostazioni, se necessario.
- COBI Studio può automaticamente nome di tutti i file di dati correlati se "Modalità Esperimento" viene attivata utilizzando il "New Experiment" wizard.
- Nella cartella dati, 3 tipi di file verranno creati: (*. NIR) per i dati fNIR, (*. MRK) per i dati e marcatori (*. txt) per un registro della sessione di esperimento.
3. L'esecuzione dell'esperimento: Rendering i labirinti
Dispositivo di regolazione e di partenza fNIR acquisizione dati
- Corrente di pilotaggio LED definisce ogni splende luminoso LED. Il valore predefinito per unità di corrente LED 20mA. Questo valore può cambiare in base alla pigmentazione della pelle e altre caratteristiche del partecipante. Intervallo consigliato per la corrente del LED è compresa tra 5 mA a 20 mA
- Il valore predefinito per guadagno iniziale per tutti i canali è di 20. I valori suggeriti per il guadagno sono 1,5,10,15,20.
- Clicca sul link 'dispositivo di avvio corrente', ed esaminare la qualità del segnale. Se i valori di intensità mostrato in prime approccio COBI 4000 o sono al di sotto 1000, fare clic su 'Dispositivo Stop', e regolare il LED dell'unità di corrente e dispositiviGuadagno fino a valori adatti si ottengono. In caso di segnale basso, aumentare unità LED Corrente prima del guadagno del dispositivo in aumento. In circostanze segnale saturato ridurre il guadagno del dispositivo prima di ridurre la corrente del LED Drive. Una volta che la qualità del segnale è accettabile, passare alla Fase 4.
- Avvio di base. Questo raccoglierà 10 secondi di dati e utilizzarla come base di una versione modificata di Beer-Lambert equazione impostata per calcolare variazioni di concentrazione di ossi-e deossi-emoglobina 8.
- Lasciate che i Baseline completo (potrebbe richiedere 10-20 secondi)
- Fare clic su 'Avvia registrazione'. Questo farà partire il salvataggio di tutti i dati. Protocollo di sperimentazione dovrebbe iniziare dopo questo.
- Sperimentatore può scegliere di aggiungere i marcatori manuale per tutta la sessione esperimento per indicare certi eventi premendo i pulsanti 'marcatore manuale add' utilizzando il menu manuale marcatore trova nell'angolo in basso a sinistra dello schermo.
- Avviare la Suite Maze di presentare stimoli visivi.
Utilizzando MazeWalker rendere labirinti
- Esegui MazeWalker dal menu in Start> Suite Maze> MazeWalker
- Accendere la sincronizzazione marcatore selezionando 'Abilita porta seriale' dal nel menù in Avanzate> Opzioni porta seriale. Garantire che il corretto indirizzo della porta COM è selezionata.
- Selezionare il file di elenco labirinto (che è stato creato da MazeMaker), e selezionare anche il nome del nuovo file di registro per questa sessione. Nome o il numero dei partecipanti può essere registrata all'interno del campo camminatore. Opzionalmente il AutoLog può essere utilizzato per registrare automaticamente per una durata timbrato file di log, invece di specificare manualmente il file di log.
- Fare clic su 'Start' per avviare il processo. A seconda delle impostazioni video, il protocollo può essere eseguito a schermo intero o in modalità finestra.
4. Visualizzare il percorso del soggetto
Utilizzando MazeAnalyzer, il ricercatore può visualizzare il labirinto e il percorso del partecipante dal labirinto e file di log. Inoltre, una relazione di sintesi tra cui lunghezza totale del percorso e il tempo per il completamento del labirinto ciascuna sono prodotti come superficiale misure comportamentali. I file di log contengono informazioni in risoluzione temporale millisecondo circa il percorso che un soggetto viaggiato così come vettore di vista del soggetto e le interazioni con gli oggetti.
Un video tutorial è fornito in 'video supplementare I - MazeAnalyzer' e descrive l'utilizzo di funzionalità di base MazeAnalyzer, lungo con i metodi per produrre le metriche del comportamento descritto nella sezione risultati.
5. L'elaborazione dei dati e analisi fNIR
Rimozione del rumore è il primo passo per l'elaborazione dei dati. Fonti di rumore sono 1) il movimento della testa 2) segnali fisiologici come la frequenza cardiaca e la respirazione e 3) strumenti e l'ambiente legati rumore.
Movimento della testa può causare i rivelatori fNIR a cambiare e perdere il contatto con la pelle, esponendoli a: 1) la luce ambientale, 2) la luce emessa direttamente dalle fonti fNIR, o 3) la luce riflessa dalla pelle, invece di essere riflessa dal tessuto nella corteccia. Questo tipo di artefatti da movimento è facilmente riconoscibile perché provoca improvvisi, i picchi di grandi dimensioni nei dati fNIR. Un artefatto più sottile di movimento della testa è dovuto agli effetti della gravità sul sangue cerebrale. Rapido movimento della testa può causare il sangue a muoversi verso (o dalla) l'area che viene monitorato, in rapido aumento (o diminuzione) volume di sangue con una inclinazione concomitante dei dati. Dal momento che le dinamiche di questo tipo di artefatti da movimento sono più lenti di un LED "pop" che possono essere confusi con la reale risposta emodinamica a causa di attivazione cerebrale. Quindi, la rimozione di artefatti da movimento a partire dai dati fNIR è un passo importante e necessario se fNIR deve essere lanciato come una tecnologia di monitoraggio cerebrale in ambienti naturali 16.
Segnali fisiologici come la frequenza cardiaca (oltre 0,5 Hz) e la respirazione (oltre 0,2 Hz) sono gamme di frequenza superiore a quella delle risposte emodinamiche, quindi, possono essere eliminate con fase lineare filtro FIR passa-basso con frequenza di taglio tra 0,1 e 0,15 Hz 9.
Strumento e rumore ambientale possono avere origine a causa della luce ambiente, come luce diurna (DC) e la luce della stanza (60Hz) o la luce da un monitor di computer (60-75Hz). Si suggerisce che il modo migliore per eliminare questo tipo di rumore è quello di preparare l'ambiente sperimentale e acquisizione dei dati di conseguenza. Un passaggio analogico a bassa filtro (filtro anti-aliasing) è stato implementato nella casella fNIR per eliminare pieghevole di rumore ad alta frequenza sulla gamma di frequenza di campionamento.
Ci sono molti avanzati algoritmi di riduzione del rumore disponibili che utilizzano diverse caratteristiche del segnale di 17-20. Tuttavia, se un soggetto o di una sessione può essere esclusa se i dati sono irrecuperabile (cioè saturi).

Figura 1.
I segnali fNIR prime sono le misurazioni dell'intensità della luce (vedi figura 1). Misurando la densità ottica (OD) cambia a due lunghezze d'onda, la variazione relativa di ossi-emoglobina e deossi-Hb in funzione del tempo può essere ottenuto utilizzando la modifica di Beer-Lambert Legge 21-23. DO ad una lunghezza d'onda di ingresso specifico (λ) è il rapporto logaritmico di intensità della luce in ingresso (I a) e uscite (rilevato) l'intensità luminosa (I out). OD è anche legato alla concentrazione (c) e del coefficiente di estinzione (e) di cromofori, la distanza corretta (d) tra la sorgente luminosa e rivelatore, oltre a un fattore di attenuazione costante (G).

Avendo lo stesso io in due casi a orari diversi e rilevato l'intensità della luce durante basale (riposo I) e durante l'esecuzione del compito (test di I), la differenza di diametro per lunghezza d'onda λ è

Misurare la densità ottica a due lunghezze d'onda differenti dà

Questo set di equazioni può essere risolto per concentrazioni se la matrice 2x2 non è singolare. Tipicamente, le due lunghezze d'onda sono i scelto) in 700-900nm, dove l'assorbimento di ossi-emoglobina e deossi-Hb sono dominanti rispetto ai cromofori di altri tessuti, e ii) sopra e sotto il punto di isosbestic (~ 805nm dove spettri di assorbimento di desossi - e di ossi-emoglobina si incrociano) mettere a fuoco i cambiamenti di assorbimento a due deossi-Hb o ossi-emoglobina, rispettivamente. Lo strumento fNIR utilizzati in questo studio impiega lunghezze d'onda 730nm e 850nm.
Infine, utilizzando i marcatori (segnali di sincronizzazione di tempo), i periodi di riferimento / riposo e le attività vengono etichettati e selezionare le funzioni di ossigenazione dati sono estratti, come dire, valori minimi e massimi. COBI Studio consente di risparmiare prime misure di intensità della luce e l'ossigenazione dei valori calcolati (modificato con legge di Lambert birra) in file di testo base così come il tempo di sincronizzazione (marker) file. COBI Studio può essere utilizzato anche per applicare i metodi di soppressione del rumore, come risposta all'impulso finita passa-basso e filtri passa-banda. I file di output possono essere esportati in software di analisi comuni quali (Matlab, Excel e SPSS SPM) o software di analisi dedicato, come fnirSoft 24 per ulteriori elaborazioni.
6. Rappresentante Risultati
fNIR segnale Esempi
Figure 2-5 segnali fNIR preset prime da una postazione singola misura con due componenti lunghezza d'onda (730nm e 850nm) indicate separatamente. La figura 2 rappresenta un'epoca segnale valido e accettabile, mentre la Figura 3 e 4 sono inaccettabili e deve essere scartato. La Figura 5 presenta segnale grezzo che è stato contaminato con artefatti da movimento e necessita di essere pulito o scartato.

Figura 2. FNIR Un buon esempio di segnale grezzo

Figura 3. Un cattivo esempio di segnale fNIR prime in cui il canale 850 nm è saturo.

Figura 4. FNIR Un brutto esempio di segnale grezzo dove c'è problema hardware o problema di connettività via cavo.

Figura 5. Un brutto esempio di segnale fNIR crudo dove ci sono artefatti da movimento.
Protocollo di studio
Valutazione delle conoscenze sono meglio esemplificato dalla ritenzione (cioè, memoria) e trasferimento (cioè generalizzabilità) le prove. Nel nostro studio, tre labirinti (maze1, maze2 e maze3) sono state praticate durante la fase di acquisizione, per un totale di 105 prove ciascuno in tre giorni. Le due condizioni, per la pratica casuale (RND) e per la pratica bloccata (BLK) sono sintetizzati nella Figura 6. Due soggetti volontari per lo studio quattro giorni. Il giorno 4 °, 10 studi di ritenzione sono stati condotti per ogni labirinto e labirinti sono stati presentati in un ordine casuale. Due labirinti romanzo (maze4 e maze5) sono stati creati che aveva corridoi aggiuntivi e diversi punti di partenza e di arrivo rispetto alla labirinti originariamente praticato. Soggetti ha completato dieci prove per ciascuna delle due labirinti nuovo. Questi labirinti costituito una fase di trasferimento, e sono stati presentati in un ordine casuale a tutti. I labirinti fase di trasferimento sono stati utilizzati per determinare la misura in cui ciascun soggetto è stato in grado di generalizzare il loro apprendimento e la pratica con labirinti di acquisizione.

Figura 6. Rappresentante schema protocollo di sperimentazione.
Risultati dello studio del comportamento
Le seguenti figure da 7 a 9, visualizzare i valori medi caratteristica (lunghezza del percorso, il tempo totale di completamento, e velocità) di soggetti in tutto ogni giorno. In primo luogo, i risultati di maze1, maze2 e maze3 sono elencati sia per RND e la pratica BLK. Successivamente, maze4 e maze5 risultati sono elencati per confrontare i risultati casuali pratica contro bloccato. Tutte le barre di errore sono errori standard della media (SEM).

Figura 7. RND pratica sintesi comportamentali per l'acquisizione delle prestazioni e dei compiti tra cui la ritenzione lunghezza totale del percorso, il tempo totale di completamento e velocità media.

Figura 8. BLK pratica comportamentale riepilogo delle prestazioni per l'acquisizione e la conservazione compiti tra cui lunghezza totale del percorso, il tempo totale di completamento e velocità media.

Figura 9. Confronto delle prestazioni comportamentali di BLK vs RND pratica per le attività di trasferimento tra cui lunghezza totale del percorso, il tempo totale di completamento e velocità media.
Studio fNIR Risultati
Concentrazione di emoglobina ossigenata cambiamenti dal basale sono stati in media nel corso del tempo ogni labirinto singoli marcatori utilizzando i dati ricevuti da MazeWalker (indica l'inizio e la fine di ogni labirinto). Grandi variazioni di concentrazione grandezza sono presi a rappresentare più alti livelli di attivazione cerebrale regionale. Un più alto livello di attivazione è stata osservata sia durante le attività di conservazione e di trasferimento per la pratica BLK rispetto alla pratica RND. Durante il trasferimento di compiti, un più alto livello di attivazione è stato visto in pratica BLK rispetto RND pratica (vedi figura 10).
Per il soggetto pratica BLK, le prove di trasferimento richieste di attivazione superiore rispetto ai processi di conservazione. Per la RND pratica soggetta, livello di attivazione non differivano per le attività di trasferimento e mantenimento in contrasto con la pratica soggetto BLK (vedi Figura 11).

Figura 10. Confronto di media ossi-Hb variazioni di concentrazione per BLK vs RND prassi da parte dei compiti di conservazione (a sinistra) e attività di trasferimento (a destra).

Figura 11. Confronto di media ossi-Hb variazioni di concentrazione per le attività di mantenimento vs trasferimento sia per i BLK (a sinistra) e RND (a destra) la pratica.