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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
Erin Hussey, Brandon Ally
Dipartimento di Neurologia, Vanderbilt University
Viene rivista la metodologia per la raccolta di dati potenziali correlati a eventi ad alta densità mentre i pazienti con malattia di Alzheimer eseguono un compito di memoria di riconoscimento. Questo protocollo includerà la preparazione del soggetto, la garanzia della qualità, l'acquisizione e l'analisi dei dati.
Joseph R. Loverde1, 2, Rosa E. Tolentino1, 2, Bryan J. Pfister1
1Dipartimenti di Ingegneria Biomedica, New Jersey Institute of Technology, 2Scuola di Specializzazione in Scienze Biomediche, Università di Medicina e Odontoiatria del New Jersey
Un metodo unico di ingegneria tissutale è stato sviluppato per allungare numerose fibre nervose in coltura ricapitolando la crescita dell'allungamento degli assoni; una forma di crescita del sistema nervoso in cui i nervi si allungano in concomitanza con la crescita del corpo che si ingrandisce.
John Y. Takekawa1, Nichola J. Collina1, 2, Annie K. Schultz1, Samuel A. Iverson1, Carol J. Cardona3, 4, Walter M. Boyce2, Joseph P. Dudley5
1USGS Western Ecological Research Center, 2Wildlife Health Center, Università della California, Davis, 3Dipartimento di Salute e Riproduzione della Popolazione, Università della California, Davis, 4Dipartimento di Scienze Veterinarie e Biomediche, Università del Minnesota , 5Science Applications International Corporation
Questo studio descrive la diagnosi dell'influenza aviaria negli uccelli selvatici utilizzando un sistema portatile di rRT-PCR. Il metodo sfrutta i reagenti liofilizzati per lo screening degli uccelli selvatici in un ambiente non di laboratorio, tipico di uno scenario di epidemia. L'uso di strumenti molecolari fornisce alternative accurate e sensibili per una diagnosi rapida.
Robert H.S. Kraus1, Pim van Hooft1, Jonas Waldenström2, Neus Latorre-Margalef2, Ronald C. Ydenberg1, 3, Herbert H.T. Prins1
1Gruppo di Ecologia delle Risorse, Università di Wageningen, 2Sezione di Ecologia Zoonotica ed Epidemiologia, Scuola di Scienze Naturali, Università di Linneo, 3Centro per l'Ecologia della Fauna Selvatica, Università Simon Fraser
Un metodo per conservare, rilevare e sequenziare l'RNA dei virus dell'influenza aviaria è stato convalidato ed esteso utilizzando campioni fecali naturali di uccelli. Questa tecnica elimina la necessità di mantenere una catena del freddo e la gestione dei virus infettivi e può essere applicata in una configurazione ad alto rendimento a 96 pozzetti.
Lynn Boyd1, Connie Hajjar1, Kevin O'Connell2
1Dipartimento di Scienze Biologiche, Università dell'Alabama a Huntsville, 2NIDDK-National Institutes of Health
Questo articolo descrive una tecnica per la visualizzazione degli eventi precoci dell'embriogenesi nel nematode Caenorhabditis elegans.
Xiquan Gao1, Robert C. Britt Jr.1, Libo Shan2, Ping He1
1Dipartimento di Biochimica e Biofisica, Istituto di Genomica e Biotecnologia Vegetale, Texas A&M University, 2Dipartimento di Patologia Vegetale e Microbiologia, Istituto di Genomica e Biotecnologia Vegetale, Texas A&M University
Presentiamo il protocollo dettagliato per il saggio di silenziamento genico indotto da virus (VIGS) mediato da Agrobacterium nel cotone. I vettori VIGS derivati dal virus del sonaglio del tabacco (TRV) sono stati utilizzati per indurre il silenziamento dell'RNA del gene del cotone GrCLA1, Cloroplastos alterados 1. Il fenotipo albino causato dal silenziamento di GrCLA1 è stato osservato allo stadio di plantula entro 2 settimane dall'inoculazione.
Dietmar Plenz, Craig V. Stewart, Woodrow Shew, Hongdian Yang, Andreas Klaus, Tim Bellay
Section on Critical Brain Dynamics, National Institute of Mental Health
Un modo robusto per studiare le valanghe neuronali, cioè esplosioni di attività spazio-temporale invarianti in scala, indicative delle dinamiche di stato critico nella corteccia. Le valanghe emergono spontaneamente nello sviluppo di strati superficiali di corteccia coltivata, il che consente misurazioni a lungo termine dell'attività con array multi-elettrodi integrati planari (MEA) in condizioni controllate con precisione.
Ian Sharp1, James Patton1, Molly Listenberger2, Emily Case2
1Dipartimento di Bioingegneria, Università dell'Illinois a Chicago e Istituto di Riabilitazione di Chicago, 2Programma di Performance Motoria Sensoriale, Istituto di Riabilitazione di Chicago
Recentemente, una grande quantità di prospettive sono diventate disponibili per i sistemi interattivi uomo-robot. In questo articolo descriviamo l'integrazione di un nuovo dispositivo robotico con software open source che può rendere rapidamente possibile una libreria di funzionalità interattive. Delineiamo quindi un'applicazione clinica per un'applicazione di neuroriabilitazione.
John D. Chan, Jonathan S. Dipartimento di Farmacologia Marchant
e Istituto di Cellule Staminali, Scuola di Medicina dell'Università del Minnesota
Un modello interessante per studiare la differenziazione delle cellule staminali all'interno di un animale vivo è il verme piatto planario. La rigenerazione viene studiata mediante semplici esperimenti di amputazione che possono essere facilmente eseguiti in un laboratorio di base e sono suscettibili di manipolazione farmacologica e genetica (RNAi in vivo), come descritto nei protocolli in questo articolo.