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1. Preparare freschi soluzioni di lavoro
- TBS: 0,05 M Tris Buffered Saline, pH 7.8 (TBS). Preparare 60 ml TBS / micropiastra.
- PPE: elastasi pancreatica suina, di tipo 1 (PPE) viene fornito come sospensione. Agitare bene e diluire DPI in TBS a circa 0,01 U / ml. Preparare 6 ml soluzione di lavoro / micropiastra).
- SA 3 NA: succinil-L-Ala-L-Ala-L-Ala-p-nitroanilide (SA 3 NA). Preparare 0,1 M magazzino SA 3 soluzione NA in dimetilsolfossido (DMSO) e utilizzare immediatamente o conservare a -20 ° C. Preparare 6 ml di soluzione di lavoro / micropiastra diluendo magazzino SA 3 soluzione NA 1/100 in TBS.
- Coomassie Blue: Preparare una soluzione stock del 10% Coomassie Brilliant Blue R-250 (Coomassie Blue) in TBS e utilizzare immediatamente o conservare a -20 ° C. Preparare 6 ml di soluzione di lavoro diluendo la soluzione stock 1/1000 in TBS.
2. Preparare Saliva
- Prelievo della saliva: Nella posizione eretta, stimolare essudazione siero in saliva inserendo un sialogogue come acido citrico o gomma da masticare in bocca. A sugar-free goccia di limone è utile per i pazienti HIV-1 che sono spesso edentulo e incapaci di masticare gomma. Ingoiare come necessario per i primi 3 min, e raccogliere la saliva tutta la bocca in una tazza con tappo per il prossimo 3 min. Ciò fornirà circa 2 ml di saliva. Utilizzare immediatamente o conservare a -80 ° C.
- MANIPOLAZIONE SALIVA: Se congelato, campione scongelare a 37 ° C e il luogo su ghiaccio. Conservare campione fresco o scongelato a 2-4 ° C non più di 3 giorni. Sei la saliva non vortex ed evitare pipettaggio mucina che non contiene essudato siero. Usate Precauzioni standard quando si maneggia saliva http://www.cdc.gov/hicpac/pdf/isolation/Isolation2007.pdf .
3. Microplate Set-up
- BUFFER: Le misure vengono effettuate in triplice copia. A ciascun pozzetto di una piastra microtitolo viene aggiunto 130 pl TBS.
- CAMPIONI: a ciascun pozzetto, si aggiungono 20 pl saliva per un volume finale di 150 pl / pozzetto. Mescolare pipettando senza introdurre bolle.
- CONTROLLI: Il controllo positivo contiene PPE, ma non saliva. Il controllo negativo contiene saliva, ma non PPE.To controllo positivo viene aggiunto 20 pl TBS. Per il controllo negativo si aggiunge saliva 20 pl.
- INCUBAZIONE PPE: Agitare la soluzione PPE funziona bene. Aggiungere 50 microlitri soluzione di lavoro DPI ad ogni pozzetto esclusi i pozzetti di controllo negativi. Ai pozzetti di controllo negativo, aggiungere 50 ul TBS. Incubare 10 minuti a 23 ° C.
- INCUBAZIONE SUBSTRATO: Aggiungere 50 microlitri SA 3 soluzione NA lavorando per ciascun pozzetto. Incubare 45 minuti a 23 ° C.
- Coomassie Blue:. Aggiungere 50 microlitri soluzione di Coomassie Blu di lavoro
- READ-OUT: Leggere l'assorbanza in lettore di micropiastre, A 405 nm per rivelare SA 3 scissione NA che rappresenta attiva α 1 PI e A 595 nm per rivelare Coomassie blu che rappresenta il contenuto proteico.
4. Calcolare α 1 Indice PI
- NORMALIZE DELLA MEDIA A 405 nm e 595 nm: per ogni triplice copia, calcolare la media. Sottrarre la media di controllo negativo dalla media del campione. Per ridurre al minimo piastra-to-plate variazione, normalizzare le medie dividendo ogni media per la media del campione di controllo positivo come segue:

- CALCOLA IL α 1 PI INEX: Dividere la normalizzato A 405 nm dai normalizzati A 595 nm:

5. Risultati rappresentativi
Per determinare se l'α-test potrebbe essere adatto per l'utilizzo come point-of-care test di screening per monitorare la conta CD4 in endemiche, risorse limitate regioni, saliva stimolata è stato raccolto da 20 femmine e 11 maschi HIV-1 ambulatorio per i soggetti partecipanti trattamento di routine in Camerun. Coerentemente con le osservazioni preliminari durante lo sviluppo del α-test con saliva raccolti in New York City, l'α 1 Indice PI nella saliva raccolti in Camerun correlato con conta dei CD4 (R 2 = 0,91, p <0,0001. N = 31). Il rapporto è stato definito da un 3-parametro curva sigmoidale che è coerente con una relazione dose-risposta (Figura 2A). La fiducia del 95% e intervalli di previsione sono rappresentati con linee blu e rosse, rispettivamente (Figura 2B).
Inuno studio precedente, abbiamo determinato che cellule T CD4 + mostrano ciclismo sinusoidale con frequenza di 23 ± 3,5 giorni in soggetti HIV-1 e nei soggetti con la versione ereditata della α 1 PI deficit (PIZZ) 3. Qui raffigurato è un esempio rappresentativo di computer-generated analisi della curva sinusoidale di CD4 in bicicletta in un non-HIV-1 di controllo sano espone periodicità 27 giorni (Figura 3A).
Computer-generated analisi curva sinusoidale delle CD4 + cambiamenti cellule T in 6 soggetti ha prodotto valori di picco-picco di ampiezza e l'asse di oscillazione 3. Come sarebbe previsto, l'asse di oscillazione è stata correlata con ampiezza (r 2 = 0,96, p = 0,009, n = 6) (Figura 3B). Nei pazienti a basso T CD4 + conta cellulare, i cambiamenti ciclici della conta delle cellule T CD4 erano piccoli, e nei pazienti con CD4 + alta conta di cellule T, i cambiamenti ciclici erano grandi.
Poiché l'linea di regressione illustrato nella figura 2 stima l'asse di oscillazione e l'asse di oscillazione è correlata con ampiezza, ampiezza può essere calcolato per la linea di regressione quindi stimare quanto sopra e sotto le CD4 + linea di regressione cellule T ci si aspetterebbe per variare a causa ciclismo (Figura 3C). Sovrapponendo l'ampiezza calcolato in Figura 3C e l'intervallo di confidenza calcolato nella figura 2B, è stato constatato che ampiezza (linea verde) si trova all'interno del 95% dell'intervallo di confidenza (linea blu) (Figura 3D).

Figura 1. Procedura sommaria: acido citrico Luogo in bocca e raccogliere la saliva. Aggiungi saliva diluito nei pozzetti di una micropiastra in triplice copia. Aggiungi PPE a ciascun pozzetto e incubare per 15 min a 23 ° C. Aggiungere il substrato PPE in ogni pozzetto e incubare per 45 min a 23 ° C. Aggiungere Coomassie Blue e letta a 405 nm per rilevare l'attività di PPE e a 595 nm per rivelare proteina.

Figura 2. Confronto della α-test con il metodo standard di enumerazione CD4. A) L'α-test è stato eseguito quantificare la α 1 Index PI in stimolato saliva intera bocca. Conta dei CD4 sono stati eseguiti da un laboratorio indipendente medica che utilizza standard di citometria a flusso. Sangue per citometria a flusso e saliva sono stati raccolti durante la visita stessa clinica. Il rapporto tra l'indice α 1 PI e conta dei CD4 è stato definito da una curva a 3 parametri sigmoidale (r 2 = 0.91, p <0.0001, n = 31). B) La fiducia del 95% e intervalli di previsione sono raffigurati in blu e rosso linee, rispettivamente.

Figura 3. Precisione di calcolo CD4 counts utilizzando il Index.A α1PI) cellule CD4 + T esposto ciclismo sinusoidale con periodicità 27 giorni in un non-HIV-1 di controllo sano. L'asse di oscillazione è raffigurato (rosso linea tratteggiata). B) calcolatore generati analisi sinusoide di CD4 è stato usato bicicletta cellule T per calcolare il picco-picco di ampiezza e l'asse di oscillazione in 4 soggetti HIV-1, 1 non-HIV -1 Pizz soggetto, e la non-HIV-1 di controllo sano raffigurato nella parte A. Il rapporto tra T CD4 + ampiezza delle cellule e l'asse di oscillazione è stato definito da 3-parametro curva sigmoidale (r 2 = 0,96, p = 0,009, n = 6). C) Il rapporto tra ampiezza e sigmoidale asse di oscillazione derivato in parte B) è stato utilizzato per calcolare l'ampiezza atteso (linea verde) di punti lungo la linea di regressione (linea nera) dalla Figura 2. D) L'ampiezza prevista intervallo (linee verdi) è stata significativamente diversa da l'intervallo di confidenza al 95% (linee blu) come determinato dalla somma di Mann-Whitney Rank Test (basato su un confronto tra la differenza mediana tra l'intervallo di confidenza 95% e la linea di regressione (63 cellule / mL) e la differenza tra la linea mediana ampiezza e la linea di regressione (37 cellule / pl); p = 0,001).