$$\rightleftharpoonup{xx}$$
$$\longleftharp{xx}$$,
$$\longrightharp{xx}$$,
1. Ottenere embrioni per il test di fotoconversione
Dopo l'incrocio di zebrafish transgenico che esprime un PCFP, vengono scelti gli embrioni omozigoti più brillanti e cresciuti a 28,5 °C fino allo stadio embrionale desiderato15.
Nota 1: Questa preselezione consentirà di scansionare embrioni con bassa potenza laser, prevenendo così la fototossicità e il fotosbiancamento.
Nota 2: Suggeriamo di utilizzare una luce a bassa intensità quando si visualizzano gli embrioni e di mantenerli in condizioni di oscurità a causa dell'elevata sensibilità dei PCFP, come Kaede e KikGR, all'esposizione alla luce, compresa la luce diurna.
2. Incorporamento
- In un contenitore di vetro con acqua d'uovo, dechorionato gli embrioni al microscopio stereoscopico utilizzando una pinza.
- Anestetizzare gli embrioni trasferendo un embrione dechorionato in una soluzione 0,16 mg/ml di tricaina (3-amminobenzoico acido benzoico, estere etilico, Sigma-Aldrich) (40 μl di soluzione madre 4 mg/ml in 1 ml di terreno E3 1X).
Nota 1: Trasferisci gli embrioni con una pipetta di vetro o una punta tagliata (P1000) per ridurre al minimo il rischio di danneggiare gli embrioni.
Nota 2: I giovani embrioni decorionati non devono essere esposti all'aria o sollevati fino all'interfaccia acqua/aria, poiché gli ovuli si rompono facilmente se sottoposti a stress meccanico.
- Trasferire l'embrione anestetizzato sul coperchio di una piastra di coltura e mantenere l'embrione entro il volume più piccolo possibile di terreno.
- Trasferire l'embrione nell'agarosio pipettandolo con agarosio all'1% a bassa temperatura di fusione (LMA, Lonza) a 30 °C contenente 0,16 mg/ml di tricaina e posizionarlo sul vetro di copertura di una capsula di coltura con fondo di vetro di copertura (MatTek Corp., Ashland, MA, USA). Successivamente, orientare l'embrione con l'aiuto di una punta di plastica liscia (ad es. una punta per pipette Microloader tagliata, Eppendorf) e, quando l'LMA si è polimerizzato, coprire l'agarosio con una soluzione di tricaina 0,16 mg/ml.
Nota 1: Fondere l'1% di LMA a 60 °C e mantenere l'agarosio fuso a 30 °C.
3. Fotoconversione
- Su un microscopio confocale invertito dotato di una sorgente laser da 405 nm, 488 nm e 561 nm, come lo Zeiss LSM 710, è possibile visualizzare il campione mediante una scansione z-Stack che copre l'intera struttura del campione da fotoconvertire e tracciare successivamente utilizzando il laser a 488 nm (cioè un laser Ar da 30 mW, a un'intensità del 5-7 %, un rivelatore impostato a 493-540 nm) e il laser a 561 nm (ad es., laser DPSS 561 da 10 mW, al 7-9 % di intensità, rivelatore impostato su 587-651) per scansionare il tessuto/organo alla ricerca della fluorescenza verde e rossa delle proteine fotoconvertibili, rispettivamente.
Nota 1: Per la scansione prima della fotoconversione, abbiamo utilizzato un obiettivo Plan Apochromat 20x/NA 0.8.
Nota 2: Scansiona sempre la fluorescenza rossa prima dell'esperimento per escludere che sia presente qualsiasi PCFP convertito in rosso generato accidentalmente.
- Selezionare lo strumento Serie temporali e impostare per 2 cicli senza intervallo (uno per la pre e uno per la post fotoconversione).
- Seleziona lo strumento Regioni e definisci una o più regioni di interesse (ROI) per la fotoconversione.
Nota 1: Raccomandiamo di determinare prima la precisione con cui la regione effettivamente foto-convertita dal laser di scansione nella ROI corrisponde alla ROI selezionata nel software misurando l'area di tessuto/cellule fotoconvertite in tutte e tre (direzione xy e z) in un campione fisso dove non è previsto alcun movimento di cellule o proteine. Per le impostazioni descritte in questa applicazione, il ROI corrispondeva alla regione fotoconvertita con grande precisione, ma questo dipende dall'obiettivo utilizzato e dalla quantità di laser applicata per la fotoconversione. La dimensione del ROI può essere ridotta alla dimensione di una singola cella a seconda dell'apertura numerica dell'obiettivo, del fattore di zoom e della quantità di luce laser utilizzata per la fotoconversione.
- Selezionare lo strumento Decolorazione e impostare per avviare la decolorazione dopo la scansione 1 di 2. Abbiamo utilizzato un laser a diodi da 30 mW 405 nm per la fotoconversione e abbiamo accuratamente ottimizzato la quantità minima di luce laser necessaria per la fotoconversione completa, che si ottiene principalmente variando l'intensità della luce laser, le iterazioni di scansione del ROI e il tempo di pixel (cioè la velocità di scansione).
Nota 1: Per la fotoconversione abbiamo utilizzato un obiettivo Plan Apochromat 20x/NA 0.8.
Nota 2: La potenza del laser e il numero di iterazioni devono essere determinati empiricamente per ogni impostazione sperimentale e dovrebbero garantire la completa fotoconversione da PCFP verde a rosso entro il ROI con la quantità minima necessaria di luce laser per ridurre la fototossicità. Si consiglia di iniziare i test utilizzando una bassa potenza laser (ad es. 3 %, corrispondente a 0,03 mW nel piano obiettivo) combinata con un basso numero di iterazioni (ad es. 20), e di aumentare successivamente la potenza laser fino a raggiungere la completa fotoconversione che nelle nostre mani era al 10% della potenza laser (corrispondente a 0,1 mW nel piano obiettivo). In queste condizioni, tutti gli embrioni testati sono sopravvissuti al piano di trattamento. Tuttavia, abbiamo osservato che la membrana del tuorlo è sensibile agli impulsi laser e può essere facilmente danneggiata causando la morte dell'embrione. Per questo motivo, la letalità dell'embrione dopo la fotoconversione può essere causata se la posizione del tessuto bersaglio è vicina al corpo del tuorlo.
- Scansiona il campione con uno z-Stack utilizzando laser per 488 nm e 561 nm per visualizzare l'eventuale verde rimanente e la fluorescenza rossa fotoconvertita del PCFP.
Nota 1: Per la scansione dopo la fotoconversione, abbiamo utilizzato un Plan Apochromat 20x/NA 0.8.
4. Rimuovi l'embrione dall'agarosio
- Scartare la soluzione e rimuovere con cura l'embrione dall'LMA all'1% con l'aiuto di un ago o di una punta di plastica liscia.
- Mantenere l'embrione in acqua d'uovo al buio a 28,5 °C fino allo stadio di sviluppo desiderato.
Nota 1: È importante che gli embrioni continuino il loro sviluppo nell'acqua d'uovo, in particolare durante i primi giorni di sviluppo durante l'estensione del corpo embrionale. Infatti, alcuni tessuti/organi embrionali cambiano posizione durante lo sviluppo e quindi richiedono orientamenti specifici durante l'inclusione che dipendono dal particolare tessuto/organo di interesse e dallo stadio di sviluppo desiderato dell'analisi.
5. Re-incorporamento
- Procedere come indicato al punto 2.) del presente protocollo.
6. Monitoraggio del tessuto fotoconvertito nelle fasi embrionali successive
- Scansione della regione di interesse (z-Stack) utilizzando laser per segnali fluorescenti verdi e rossi rispettivamente per 488 nm e 561 nm.
Nota 1: Per la scansione x ore dopo la fotoconversione, abbiamo utilizzato un Plan Apochromat 20x/NA 0.8.
Nota 2: Poiché questo protocollo non influisce sul normale sviluppo dell'embrione, è possibile osservare l'embrione fotoconvertito nelle fasi successive dello sviluppo (per questo, procedere come indicato ai punti 4 - 6).
7. Risultati rappresentativi
Un esempio di saggio di fotoconversione è mostrato nella Figura 1. Abbiamo monitorato le cellule endoteliali durante lo sviluppo del pesce zebra (per una revisione dell'anatomia vascolare del pesce zebra in via di sviluppo vedi16). Di conseguenza, abbiamo utilizzato una linea reporter Tg(kdrl:nlsKikGR)hsc7 di zebrafish che esprime KikGR all'interno dei nuclei endoteliali17. Gli embrioni omozigoti e con un'espressione brillante sono stati allevati a 28,5 °C fino a 48 ore dopo la fecondazione (hpf). Dopo la decorioizzazione, gli embrioni sono stati anestetizzati e incorporati in LMA posizionando il lato antero-dorsale dell'embrione verso il vetro di copertura per una migliore visualizzazione dei vasi della testa. Utilizziamo un microscopio confocale invertito (Zeiss LSM 710 Meta) dotato di laser operanti a 405 nm, 488 nm e 561 nm, e un obiettivo Plan Apochromat 20x/NA 0.8 per il saggio di fotoconversione e l'ulteriore tracciamento della proteina fotoconvertita. Come mostrato nella Figura 1A, prima della fotoconversione, KikGR era espresso all'interno del tessuto endoteliale ed era rilevabile solo come fluorescenza verde utilizzando un laser ad argon da 488 nm. Le scansioni di controllo con un laser DPSS 561-10 da 561 nm per la fluorescenza rossa non hanno rilevato alcun KikGR fotoconvertito prima della fotoconversione (Figura 1A). Successivamente, la ROI è stata completamente fotoconvertita utilizzando un laser a diodi da 405 nm (al 10% di intensità, 20 iterazioni) e i vasi di testa sono stati nuovamente scansionati utilizzando i laser a 488 nm e 561 nm (Figura 1B). Come mostrato nella Figura 1B, il KikGR verde era completamente passato al rosso all'interno del ROI. Dopo il test di fotoconversione, l'embrione è stato rimosso dall'agarosio e sollevato a 28,5 °C in acqua d'uovo. Infine, l'embrione è stato nuovamente osservato 24 ore dopo la fotoconversione, circa 72 hpf, per tracciare le cellule endoteliali fotoconvertite nelle fasi successive (Figura 1C). Pertanto, l'embrione è stato incorporato in LMA e il campione è stato nuovamente scansionato utilizzando i laser a 488 nm e 561 nm. Come mostrato nella Figura 1C, all'interno del tessuto endoteliale derivante dalla ROI fotoconvertita, sono state osservate sia proteine KikGR non convertite che fotoconvertite a causa della stabilità del KikGR fotoconvertito fluorescente rosso e della risintesi di nuovi KikGR verdi non fotoconvertiti.

Figura 1. Fotoconversione di KikGR durante lo sviluppo del pesce zebra. (A,B) Una regione specifica del sistema vascolare endoteliale della testa è stata fotoconvertita a 48 hpf in embrioni transgenici Tg(kdrl:nlsKikGR)hsc7 e (C) osservata nuovamente 24 ore dopo la fotoconversione (circa 72 hpf). Sono mostrati la fluorescenza del KikGR (verde), del KikGR fotoconvertito (rosso) e dei canali uniti. I cerchi tratteggiati mostrano il ROI prima, dopo e 24 ore dopo la fotoconversione. Le immagini sono viste dorsali dell'embrione di pesce zebra, anteriormente al fondo. Barre di scala: 50 μm.
Proteina (acronimo)
Ex (nm)
Em (nm)
Ce
QUALITÀ
Struttura quaternaria
luminosità
applicazione
Ref
Kaede_G
508
518
99
0,9
Tetramero
259
Tracciamento delle celle
2,6
Kaede_R
572
580
60
0,3
Tetramero
59
KikGR_G
507
517
54
0,7
Tetramero
112
Tracciamento delle celle
3,6,8-10
KikGR_R
583
593
35
0,6
Tetramero
68
mKikGR_G
505
515
49
0,7
monomero
101
Tracciamento dinamico Immagini a superrisoluzione
13
mKikGR_R
580
591
28
0,6
monomero
53
EosFP_G
506
516
72
0,7
Tetramero
150
Tracciamento delle celle
5,20
EosFP_R
571
581
41
0,5
Tetramero
67
tdEos_G
506
516
34
0,7
dimero tandem
165
Immagini in superrisoluzione
12,14,21
tdEos_R
569
581
33
0,6
dimero tandem
59
mEos2_G
506
519
56
0,7
monomero
140
Tracciamento dinamico Immagini a superrisoluzione
11,18
mEos2_R
573
584
46
0,7
monomero
90
Dendra2_G
490
507
45
0,5
monomero
67
Tracciamento dinamico Immagini a superrisoluzione
4,11
Dendra2_R
553
573
35
0,55
monomero
57
Tabella I. Proprietà delle proteine fluorescenti fotoconvertibili. Insieme al nome comune e/o all'acronimo per ciascun PCFP, nella tabella sono mostrate le lunghezze d'onda di eccitazione di picco (Ex) e di emissione (Em), i coefficienti di estinzione molare (EC, 10-3 M-1 cm-1), la resa quantica (QY), la struttura quaternaria fisiologicamente rilevante, la luminosità relativa (come % di EGFP), l'applicazione e i riferimenti. Tabella adattata da Day e Davidson, 20101.
PCFP
Linee transgeniche di pesce zebra
fonte
Kaede
Tg(elavl3:Kaede)
rw0130a
Laboratorio di Okamoto
Tg(EPV. TP1-Mmu.Hbb:Kaede)
Tg(ins:Kaede)
Tg(isl1:Gal4-VP16,14xUAS:Kaede)
Tg(lhx5:Kaede)
b1204/+
ZIRC
Tg(myl7:kaede)
Tg(olig2:Kaede)
Tg(UAS-E1b:Kaede)
s1999t
ZIRC
Tg(UAS:Kaede)
rk8
ZIRC
Tg(vsx2:Kaede)
nns2
Laboratorio Higashijima
KikGR
Tg(kdrl:nlsKikGR)
Tg(krt4:NTR-KikGR)
Tg(myl7:nlsKikGR)
Tg(sox10:KikGR)
Tg(UAS:KikGR)
EosFP
Tg(sox10:EosFP)
Tg(sox10:nlsEosFP)
Dendra
Tg(-8mpx:Dendra2)
Tg(UAS:Dendra-kras)
Tabella II. Linee transgeniche di zebrafish che esprimono PCFPs. Dati ottenuti nel database degli organismi modello di pesce zebra (ZFIN, http://zfin.org/). È indicata la disponibilità di linee nel Zebrafish International Resource Center (ZIRC, http://zebrafish.org/zirc/).