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L'embriogenesi è un processo dinamico che viene studiato al meglio utilizzando tecniche che consentono la documentazione dei cambiamenti dello sviluppo in vivo. L'uso di proteine fluorescenti geneticamente codificate si è dimostrato una strategia preziosa per chiarire i processi morfogenetici dinamici che si verificano nell'organismo intatto. Durante l'ultimo decennio, lo sviluppo di proteine fluorescenti fotoattivabili e fotoconvertibili ha aperto la possibilità di studiare il destino di sottopopolazioni discrete di proteine marcate1. A differenza delle proteine fotoattivabili, le proteine fluorescenti fotoconvertibili (PCFP) sono facilmente tracciabili e visualizzate nel loro stato di emissione nativo prima della fotoconversione, facilitando l'identificazione e la selezione delle regioni mediante ispezione ottica. I PCFP, come Kaede2, KikGR3, Dendra4 e EosFP5, possono essere spostati dal verde al rosso dopo l'esposizione ai raggi UV o alla luce blu a causa di una sequenza di tripeptide His-Tyr-Gly che forma un cromoforo verde che può essere fotoconvertito in uno rosso mediante una β-eliminazione catalizzata dalla luce e la successiva estensione di un sistema π-coniugato3. I PCFP e le loro varianti monomeriche sono strumenti utili per tracciare le cellule6-10 e studiare la dinamica delle proteine11-14, rispettivamente. Negli ultimi anni, i PCFP sono stati espressi in diversi modelli animali, come il pesce zebra6, il pollo7,8 e il topo9,10 per il monitoraggio del destino cellulare. Qui riportiamo un protocollo per la fotoconversione cellulo-specifica di PCFP nell'embrione vivente di zebrafish e un ulteriore monitoraggio delle proteine fotoconvertite nelle fasi successive dello sviluppo. Questa metodologia consente di studiare, in modo tessuto-specifico, gli eventi biologici cellulari alla base della morfogenesi nel modello animale di zebrafish.