Method Article

Un chip microfluidica per la Versatile analisi chimica di singole cellule

DOI:

10.3791/50618

October 15th, 2013

In This Article

Summary

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In questo articolo vi presentiamo un chip microfluidica per l'analisi singola cellula. Esso consente la quantificazione delle proteine ​​intracellulari, enzimi, cofattori, e secondi messaggeri per mezzo di saggi fluorescenti o immunologici.

Abstract

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Presentiamo un dispositivo microfluidico che consente la determinazione quantitativa di biomolecole intracellulari in più celle singole in parallelo. A questo scopo, le cellule sono passivamente intrappolati nel mezzo di una microcamera. All'attivazione del livello di controllo, la cella è isolato dal volume circostante in una piccola camera. Il volume circostante può quindi essere scambiati senza compromettere la cellula isolata. Tuttavia, dopo breve apertura e la chiusura della camera, la soluzione nella camera può essere sostituito entro poche centinaia di millisecondi. A causa della reversibilità delle camere, le cellule possono essere esposti a soluzioni diverse sequenzialmente in un modo altamente controllabile, ad esempio per incubazione, lavaggio, infine, lisi cellulare. I microchambers ermeticamente chiusi consentono il mantenimento del lisato, minimizzare e controllare la diluizione dopo lisi cellulare. Poiché lisi e analisi avvengono nello stesso luogo, l'alta sensibilità viene mantenuta perché senza ulteriori dilution o la perdita degli analiti avviene durante il trasporto. Il design microcamera consente pertanto l'analisi affidabile e riproducibile di piccolissimi numeri di copie di molecole intracellulari (attomoli, zeptomoles) rilasciate dalle cellule singole. Inoltre, molti microchambers possono essere organizzati in un formato matrice, consentendo l'analisi di molte celle contemporaneamente, dato che gli strumenti ottici adatti vengono utilizzati per il monitoraggio. Abbiamo già utilizzato la piattaforma per proof-of-concept studi per analizzare le proteine ​​intracellulari, enzimi, cofattori e secondi messaggeri in maniera quantificabile sia relativo o assoluto.

Introduction

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Molti studi in passato hanno rivelato cellula-cellula differenze all'interno di una vasta popolazione di cellule 1-3, in particolare segnalazione elabora 4 o la quantità di biomolecole come proteine ​​intracellulari 5,6, metaboliti e cofattori 7,8. Queste eterogeneità sono considerati di fondamentale importanza per l'adattamento delle cellule e l'evoluzione 9, ma anche svolgere un ruolo chiave nella nascita e nel trattamento di malattie come il cancro 10-13. Pertanto, studi sul livello di singola cellula sono di grande interesse nella ricerca biologica e farmacologica, soprattutto se questi....

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Protocol

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1. SU-8 master Fabrication

Preparare entrambe stampi principali per i canali (fluidici e di controllo, per schemi e dimensioni vedere Figura 2) con il seguente protocollo ma con differenti modelli di maschera. Il processo è mostrato nella figura 3a.

  1. Inizia riscaldando un wafer di silicio da 4 pollici per 10 min a 180 ° C. Caricare il wafer disidratato in uno spin-torre di verniciatura e utilizzare il seguente protocollo per spin-coating SU-8 2015:
    1. Spin wafer a 100 rpm per 20 sec (coperchio aperto di spin-coater, dispensare SU-8 durante questa fase, chiudere il coperchio dopo la dispensazi....

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Results

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La nostra piattaforma è in grado di analizzare una varietà di intracellulare nonché molecole secrete o produce da singole cellule. Ecco, vorremmo presentare diversi studi di esempio per sottolineare la varietà di possibili saggi. Daremo un esempio di un enzima secreto (Figura 5a), così come un enzima intracellulare (Figura 5b) e proteine ​​(figure 5c e d). Per altri esempi, come cofattori o piccole molecole, consultare Eyer et al. (2012) e Eyer.......

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Discussion

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La tecnologia microfluidica ha aperto nuove e affascinanti possibilità per l'analisi singola cellula. In particolare, la possibilità di intrappolare e immobilizzare le cellule singolarmente dagli strumenti di microfluidica ha permesso studi sistematici a breve e lungo termine sulle proprietà monocellulari e la risposta. Inoltre, incapsulamento di cellule in microgocce alta frequenza, generati su un microchip, ha consentito studi di secrezione di cellule singole, che non possono essere eseguite con dispositivi citome.......

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Disclosures

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Gli autori dichiarano di non avere interessi finanziari in competizione.

Acknowledgements

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Gli autori ringraziano Tom Robinson per la lettura delle bozze del manoscritto, C. Bärtschi e H. Benz per la realizzazione del sistema di controllo della pressione custom-built. Vorremmo inoltre ringraziare l'uso della funzione stanza pulita prima e la microscopia ottica Center (LMC), sia presso l'ETH di Zurigo. Il lavoro è stato finanziato dalla Merck Serono e dal Consiglio europeo della ricerca (CER) nell'ambito del 7 ° Programma Quadro (ERC Starting Grant, progetto n. 203.428, nμLIPIDs).

....

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Materials

List of materials used in this article
NameCompanyCatalog NumberComments
REAGENTS:
Nome del reagenteAziendaNumero di catalogoCommenti (opzionale)
SU-8 2015MicroChem Corp. (Netwon, MA)
ABCR (Karlsruhe, Germania)AB103608
4-Methylumbelliferyl β-D-N,N′-diacetilchitobioside idratoSigma AldrichM9763
AcetoneMerck VWR (Darmstadt, Germania)100014
AvidinAppliChem (Axon Lab AG)A-2568
AZ 1518AZ Electronic Materials (Wiesbaden, Germania)n.a.AZ
726 sviluppatoreAZ Electronic Materials (Wiesbaden, Germania)n.a.
Albumina sierica bovinaSigma AldrichA-4503
Albumina sierica bovina, biotinaSigma AldrichA-8549
Tampone di dissociazione cellulareInvitrogen13151-014
Esametiltililazano (HDMS)Sigma Aldrich40215
Acido cloridricoFluka84422
IsopropanoloMerck VWR (Darmstadt, Germania)109634
Cloruro di magnesio esaidratoFluka63068
MR developer 600Microresist technology GmbH (Berlino, Germania)n.a.PBS
Invitrogen10010-031
PLL-g-PEG innestatoSuSoS, (Dü bendorf, Svizzera)n.a.PLL-g-PEG
biotina innestataSuSoS, (Dü bendorf, Svizzera)n.a.Cloruro
potassioFluka60132
Proteina G, biotinaSigma Fine Chemicals41624
Wafer di silicioSi-Mat (Kaufering, Germania)n.a.Sylgard
184 Silicone Elastomer Kit (PDMS)Dow Corning39100000
Tris(idrossimetil)-amminomethanBiorad
Tween 20Biorad1706531
ATTREZZATURA:
Materiale NomeAziendaNumerodi catalogo Commenti (opzionale)
0.22 &; m Filtro per siringa in PESTRP99722
Perforatore per biopsia da 1/1,5 mmMiltex, York PA33-31AA/33-31A
Filtro Trics cellulare 20 &; mPartec04-004-2325
Centrifuga Sigma 3-18KKuehnern.a.Piastra
riscaldante HP 160 III BMSawatec, Sax, Svizzeran.a.MA-6
allineatore mascheraKarl Suessn.a.Multizoom
AZ100M microscopioNikon Corporationn.a.Photomask
Microlitho, Essex, U.K.n.a
Pulitore al plasma PDC-32GHarrickn.a.Spin
coater Modell WS-400 BZ-6NPP/LITELaurelln.a.Moduli
di centrifuga SM 180 BMSawatec, Sax, Svizzeran.d.Step
profiler Dektak XT AdvancedBrukern.a.Pompa
a siringa neMESYSCetonin.a.
n.a.1H,1H,2H,2H-Perfluorodecyl-dimethylchloro-silano di 1610716

References

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  1. Walling, M. A., Shepard, J. R. E. Cellular heterogeneity and live cell arrays. Chem. Soc. Rev. 40 (7), 4049-4076 (2011).
  2. Schmid, A., Kortmann, H., Dittrich, P. S., Blank, L. M. Chemical and biological single cell analysis. Curr. Opin. Biotechnol. 20 (1), 12-20 (2010).
  3. Lecault, V....

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Microfluidic ChipSingle Cell AnalysisCell LysisFluorescence MicroscopyImmunoassay DetectionFluidic ControlPDMS FabricationChamber TrappingSolution ExchangeBiomolecule Quantification

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