I vertebrati sono parassitati da quattro gruppi principali di elminti (vermi). Due dei gruppi, i trematodi, o trematodi, e i cestodi, o tenie, rientrano nel Phylum Platyhelminthes. Gli altri due gruppi sono i nematodi, o nematodi, (Nematoda) e gli acantocefali, o vermi dalla testa spinosa (Acanthocephala). Molti di questi parassiti sono stati documentati come cause di morbilità e mortalità negli uccelli selvatici e nei mammiferi1,2.
La maggior parte degli elminti ha cicli di vita complessi che coinvolgono più di un ospite1,2 . Ad esempio, i trematodi hanno uno o due ospiti intermedi (di solito invertebrati) e un ospite finale. Tutte le ostie devono essere disponibili per il completamento del ciclo e quindi per gli elminti adulti che devono essere presenti nelle ostie finali (che sono l'argomento di questo manoscritto). Quindi è importante tenere presente che possono verificarsi fluttuazioni stagionali nella prevalenza e nell'intensità di alcune specie di elminti e il monitoraggio a lungo termine è auspicabile per catturare l'intero elminto di auna di un particolare ospite.
Il metodo ottimale per raccogliere elminti è esaminare un ospite che è stato soppresso. Ciò consente la raccolta degli elminti mentre sono ancora vivi e il loro corretto rilassamento e fissaggio. Il materiale proveniente da ospiti che sono stati morti per più di 24 ore, o che sono stati congelati e scongelati per l'esame, è spesso inferiore e difficile da identificare. I trematodi e i cestodi provenienti da ospiti congelati o formalizzati sono spesso mal contratti e hanno perso strutture cruciali per l'identificazione, come le spine orali sui trematodi o gli uncini sullo scolice delle tenie. Tuttavia, la realtà è che la maggior parte del materiale disponibile dagli ospiti vertebrati in questi giorni è congelato o conservato.
I database contenenti informazioni sulla sequenza del DNA per gli elminti stanno crescendo rapidamente e quindi l'identificazione tassonomica è già possibile per molte specie. Pertanto, gli elminti dovrebbero essere conservati il più possibile per potenziali analisi del DNA. Tuttavia, il DNA di buona qualità non è possibile se i campioni sono fissati in formalina. I metodi qui descritti per la raccolta e l'uccisione degli elminti produrranno materiale adatto per l'estrazione del DNA e le analisi genetiche.
Di seguito, descriviamo metodi dettagliati su come eseguire l'necroscopia dei vertebrati (anfibi, rettili, uccelli e mammiferi; i trematodi monogenei dei pesci non sono inclusi) per la raccolta di elminti, seguiti dalle procedure su come conservarli ed elaborarli per l'identificazione tassonomica.