I protocolli descritti qui misurano rilevamento delle cellule T con infezione da HIV-1 virus GFP-tagged che differiscono solo per la capacità di esprimere Vpu, come descritto nella nostra recente relazione 18. Tuttavia, questi metodi possono essere facilmente modificati per studiare rilevamento di virus senza tag e virus privi altri geni virali che potrebbero potenzialmente modulare sensing innata. Se i virus usati non esprimono GFP, la percentuale di cellule bersaglio infette devono essere determinati da un altro mezzo prima di co-coltura, come il p24 (capside) colorazione intracellulare e citometria a flusso o p24 ELISA. Inoltre, questi protocolli possono essere usati con differenti cellule bersaglio T, tra cui una varietà di linee cellulari disponibili e cellule primarie.
I metodi descritti in questo manoscritto hanno un numero di vantaggi rispetto ai primi metodologie utilizzate per studiare HIV-1 sensing. Innanzitutto è stato stabilito da una serie di gruppi che libera HIV-1 pgli articoli sono poveri induttori di tipo I IFN 2,13,14. Inoltre, i primi studi invocato più vecchi metodi basati-ELISA IFNα per quantificare la quantità di tipo I IFN prodotto. Un limite di questa tecnica di rilevamento è che la maggior parte dei vecchi kit ELISA IFNα misurare un solo tipo di IFNα, mentre si affaccia gli altri tipi di IFNα e Interferone beta. L'utilizzo delle linee cellulari giornalista descritte supera questa limitazione come la concentrazione di tutte le forme bioattive di IFN di tipo I umano può essere misurato in una volta. La tecnica è molto sensibile, meno costoso di una nuova generazione di kit ELISA IFN e per molti donatori grandi quantità di IFN di tipo I possono essere facilmente individuati. Tuttavia, questo protocollo può essere facilmente adattato per l'uso con altri di tipo I-IFN metodi di read-out, come ELISA.
Passaggi critici: E 'importante che la qualità di tutti i componenti cellulari (sia di obiettivi che effettori) essere controllati strettamente. Potenziale contaminazione, anche quando asymptomatica, deve essere monitorato e controllato. Come abbiamo accennato in precedenza, antibiotico-controllato contaminazione batterica asintomatica, e potenzialmente di altri agenti patogeni intracellulari come micoplasma, in grado di generare risposte immunitarie simili a quelli osservati dopo da HIV-1, vale a dire la produzione di tipo I IFN. Inoltre, tutti i reagenti devono essere liberi di LPS o altri potenziali endotossine. Allo stesso modo, il monitoraggio di PBMC e pDCs è anche importante dal momento che i campioni umani possono spesso essere trattate da infezioni in corso sottostanti, che possono influenzare il rilevamento normale. Si consiglia sempre inclusi i controlli negativi proposte, quali l'assenza di cellule bersaglio, nonché co-colture con cellule mock-infettate. La vitalità delle cellule infettate è importante anche per il corretto rilevamento pDC dal tipo I IFN non è prodotto a seguito della co-coltura con cellule apoptotiche 2,14.
Una importante limitazione della tecnica è la necessità di cellule primarie appena isolate. Questa procedura non è statatestato con PBMC o pDCs che erano o precedentemente congelati o tenuti in coltura. L'isolamento delle PBMC è laborioso e queste cellule hanno una durata di vita molto limitata. Inoltre, dovrebbero essere utilizzati protocolli standard per la protezione contro i patogeni ematica mentre si lavora con sangue umano. Ci sono spesso diverse fonti di variabilità associati con il lavoro che coinvolgono le cellule umane appena isolate. Tra loro ci sono le diverse procedure adottate per isolare queste cellule, e la variabilità ereditata incontrate dal donatore a donatore. Mentre è impossibile evitare variabilità tra donatore, l'uso dei controlli positivi proposti, come la misurazione risposta agli agonisti conosciuti di TLR7 e TLR9 percorsi, fornirebbe un importante controllo interno per questi esperimenti. Abbiamo osservato che una risposta forte agli agonisti del percorso TLR9 potrebbe essere correlato con una risposta pDC sano, mentre è previsto un percorso reattivo TLR7 una risposta adeguata contro l'HIV-1 3.
Sulla base di osservazioni fatte da noi e altri 2, spesso non è necessario un arricchimento di pDCs da PBMC. Tuttavia, se il disegno sperimentale richiede (ad esempio nel contesto in cui è necessaria la deplezione di specifici marcatori di superficie PDC) selezione negativa è preferibile rispetto selezione positiva, come cellule restano liberi di anticorpo dopo il processo di selezione. Isolato pDCs subiscono una rapida apoptosi in coltura. Per gli esperimenti che richiedono queste cellule siano coltivate per lungo periodo di tempo, terreni di coltura possono essere integrati con IL-3. Questa citochina induce pDC proliferazione e inibisce la loro apoptosi 16. Tuttavia, IL-3 utilizzo deve essere strettamente controllato in quanto può portare a maturazione pDC o differenziazione.
Il metodo qui descritto combina bersaglio da HIV-1 le cellule infettate con PBMC o pDCs appena isolate al fine di ricreare le fasi iniziali coinvolte durante il rilevamento innata. Questo metodo sarà senza dubbio utile per Explore eventi precoci immunitarie innate associate all'infezione da HIV. Anche se i protocolli associati sono finalizzati a misurare tipo I IFN, potrebbero facilmente essere modificati per misurare altre molecole bioattive rilasciate da pDCs al momento della rilevazione delle cellule infette. Questi possono includere: Tipo III-IFN (IFN-λ), citochine pro-infiammatorie (TNF-come α e IL-6) e chemochine CXCL10, CCL4, e CCL5 17.