La parete cellulare vegetale in possesso di una pletora di informazioni nelle sue varie componenti: la lignina, cellulosa, emicellulosa (silano, glucuronoxylan, xyloglucan, arabinoxilano collegamento misto glucano, o glucomannano), e pectina. Tecniche istologiche forniscono importanti indicazioni visive a studiare le differenze all'interno delle pareti cellulari secondarie a livello organizzativo e cellulari. Varie tecniche istologiche sono stati sviluppati e sono disponibili in letteratura, ma queste tecniche può essere difficile e per principianti richiede tempo perché i protocolli molto dettagliate con semplici istruzioni visive sono quasi mai disponibili. L'obiettivo di questo studio è quello di fornire semplici linee guida per tecniche di colorazione istologiche di ottenere immagini di alta qualità.
Sezionare il tessuto stelo è il primo passo nella visualizzazione delle pareti cellulari e forme cellulari. Anche se le sezioni tagliate a mano sono poco costosi e richiedono meno tempo per preparare, l'uso di un vibratome offre coerenza eproduce immagini di alta qualità. Utilizzando una vibratome permette di produrre una migliore qualità dei dati generando anche sezioni con lo stesso spessore, che aiuta a produrre immagini nitide e riduce significativamente il rischio di produrre differenze inesatti tra campioni che deriverebbe semplicemente da una cattiva preparazione del campione. Utilizzando resine di fissare campioni freschi può essere una sfida per principianti e può essere ancora molto tempo, anche per gli esperti quando l'analisi deve essere fatto in fretta. Inoltre, diventa impossibile misurare qualsiasi attività biologica con il campione quando è stato incorporato in una resina. Una semplice tecnica che impiega uno stampo agarosio e fatta in casa è utile per l'incorporamento tessuti dello stelo, e può anche essere utilizzato in altre applicazioni che richiedono dissezione dei tessuti molli. Rispetto al incorporamento esemplari in resina, questo metodo ha il vantaggio di mantenere i tessuti vivi e riducendo la manipolazione dei campioni. Sezionamento dei tessuti attraverso un vibratome è molto preciso e genera homogensezioni unità organizzative, che, a seconda della porta dello studio, possono poi essere utilizzati con diverse tecniche di colorazione diverse.
I metodi più semplici per visualizzare lignina e altri aromatici impiegano raggi ultravioletti (UV). Eccitazione delle molecole aromatiche basate sulla luce UV è una vecchia tecnica, ma è ancora uno dei metodi più veloci per la visualizzazione di lignina. Tuttavia, la visualizzazione UV in realtà non è l'ideale per il rilevamento della lignina, perché la luce UV ecciterà altri aromatici. La lignina è costituito principalmente da tre blocchi, i monolignols (alcoli hydroxycinnamyl: alcool coniferilico, alcol sinapyl, e alcool p-coumaryl) 1-3. Macchia Phloroglucinol può fornire indizi per la misura di cinnamaldehydes presenti nello xilema, fibre e tessuti tracheali 4. Phloroglucinol è un buon indicatore di cinnamaldehydes generali e può distinguere tra cinnamaldehydes e altri composti aromatici. I monomeri alcol sinapyl possono essere rilevatie differenziato dall'uso di macchia Maule. Blu di toluidina O è un colorante policromatico e quindi ha la capacità di macchiare diversi elementi della parete cellulare in diversi colori 5,6. L'uso primario di blu di toluidina O è rilevare pectina e lignina 5,6. Il vantaggio di usare blu di toluidina O è che molti elementi della parete cellulare possono essere visualizzati in un unico passaggio. Sia calcofluor bianco e congo rosso sono facili da lavorare e può essere utilizzato per visualizzare cellulosa. Macchie bianche calcofluor cellulosa, callosio, e altri β-glucani non sostituiti o debolmente sostituiti 6-9, mentre congo macchie rosse direttamente al β-(1 → 4)-glucani e in particolare alla cellulosa 10,11. L'obiettivo di questo studio è fornire semplici linee guida per l'utilizzo delle tecniche di colorazione di cui sopra per ottenere immagini di alta qualità da A. thaliana steli.