Helicobacter pylori è un batterio gram negativo di forma elicoidale che colonizza la nicchia gastrica umana di metà della popolazione umana1,2. H. pylori è la causa primaria di cancro gastrico, la seconda causa di decessi correlati al cancro in tutto il mondo3. Un fattore di virulenza che è stato associato ad un aumentato rischio di malattia gastrica è l'isola di patogenicità Cag, una regione di 40 kb all'interno del cromosoma di H. pylori che codifica per un sistema di secrezione di tipo IV e la molecola effettrice affine, CagA4,5. Il Cag-T4SS è responsabile della traslocazione di CagA e peptidoglicano nelle cellule epiteliali dell'ospite5,6. L'attività del Cag-T4SS provoca numerosi cambiamenti nella biologia delle cellule ospiti, tra cui la sovraregolazione dell'espressione delle citochine, l'attivazione delle vie proinfiammatorie, il rimodellamento del citoscheletro e l'induzione di reti di segnalazione cellulare oncogenica5-8. Il Cag-T4SS è una macchina macromolecolare composta da componenti di sottoassemblaggio che coprono la membrana interna ed esterna e si estendono verso l'esterno dalla cellula nello spazio extracellulare. La porzione extracellulare del Cag-T4SS è indicata come "pilus"5. Numerosi studi hanno dimostrato che i pili Cag-T4SS si formano all'interfaccia ospite-patogeno9,10. Tuttavia, le caratteristiche ambientali che regolano la biogenesi di questo importante organello rimangono in gran parte oscure. Recentemente, abbiamo riportato che condizioni di bassa disponibilità di ferro aumentano l'attività di Cag-T4SS e la biogenesi del pilus. Qui presentiamo un protocollo ottimizzato per far crescere H. pylori in condizioni variabili di disponibilità di ferro prima della co-coltura con cellule epiteliali gastriche umane. Inoltre, presentiamo il protocollo completo per la visualizzazione del fenotipo iperpiliato esibito in condizioni di restrizione del ferro mediante analisi di microscopia elettronica a scansione ad alta risoluzione.