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Research Article
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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
Descriviamo come fornire proteine e piccole molecole impermeabili alle cellule di mammifero in coltura mediante un semplice protocollo di co-incubazione con un reagente che causa la perdita di organelli endocitici.
Strategie di consegna macromolecolari in genere utilizzano il percorso endocitica come una via di ingresso cellulare. Tuttavia, endosomal intrappolamento limita fortemente l'efficienza con cui macromolecole penetrare il locale citosolico di cellule. Recentemente, abbiamo aggirato il problema individuando il reagente dfTAT, un dimero legame disolfuro della TAT peptide marcato con il fluoroforo tetrametilrodamina. Abbiamo generato un dimero fluorescente della cellula-penetrante peptide (CPP) TAT prototipo, dfTAT, che penetra cellule vive e raggiunge lo spazio citosolico di cellule con una particolarmente alta efficienza. Consegna citosolico di dfTAT è raggiunto in linee cellulari multiple, comprese le cellule primarie. Inoltre, la consegna non influisce notevolmente la vitalità cellulare, la proliferazione e l'espressione genica. dfTAT in grado di fornire piccole molecole, peptidi, anticorpi, enzimi biologicamente attivi e un fattore di trascrizione. In questo rapporto, si descrivono i protocolli coinvolti nella DFTASintesi T e consegna cellulare. Il manoscritto descrive come controllare la quantità di proteine consegnato allo spazio citosolico di cellule variando la quantità di proteina somministrata extracellulare. Infine, gli attuali limiti di questa nuova tecnologia e passaggi necessari per la validazione di consegna sono discussi. I protocolli descritti devono essere estremamente utili per saggi cellulari e per la manipolazione ex vivo e riprogrammazione delle cellule.
La consegna di proteine, peptidi o piccole molecole cellulari impermeabili in cellule vive è spesso desiderabile in molte applicazioni biologiche o biotecnologiche (di imaging cellulare, test funzionali, riprogrammazione cellulare, ecc.) 1-4. Molti approcci di consegna sono già stati segnalati, tra cui la microiniezione, elettroporazione, o l'uso di agenti portanti (ad es., Peptidi cellule penetrante, come TAT, lipidi) 5-7. Ogni tecnica ha tipicamente pro e contro specifici che potrebbero rendere questi approcci adeguati per determinate applicazioni, ma non per gli altri. Problemi comuni riguardano l'efficienza di consegna poveri e / o la mancanza di controllo di quanto materiale viene consegnato 8,9, tossicità o impatto fisiologico deleterio 10,11, la mancanza di controllo temporale, consegna in poche cellule, ma non in un intero popolo (ad es., microiniezione) 12, e complessi coniugazione chimica o formulazione regimi 11.
s = "jove_content"> Di recente, abbiamo sviluppato una strategia di consegna romanzo che elude queste limitazioni. Questa strategia si basa su un peptide chiamato dfTAT (dimero TAT fluorescente) 13. dfTAT deriva dal peptide ben sanno cellule penetrante (CPP) TAT. dfTAT contiene due copie disolfuro incollato di TAT etichettati con il tetrametilrodamina fluoroforo. Nonostante le loro somiglianze, TAT e dfTAT differiscono in modo significativo in attività. TAT è tipicamente internalizzato nelle cellule per endocitosi. Questo CPP rimane tuttavia per lo più intrappolato dentro endosomi (questo di solito porta ad una distribuzione puntiformi del peptide all'interno delle cellule, se esaminato al microscopio a fluorescenza). Come TAT, dfTAT è efficacemente endocitato dalle cellule. Tuttavia, dfTAT non rimane intrappolato all'interno endosomi. Invece, essa media perdite endosomal in un modo che è estremamente efficiente. L'attività di endosomolytic dfTAT può essere sfruttata per fornire macromolecole da un semplice saggio di incubazione.
S copi "> L'attuale comprensione del processo di consegna è il seguente. dfTAT induce macropinocitosi. Di conseguenza, le cellule incubate con dfTAT occupano proteine solubili, peptidi, o piccole molecole (molecole di interesse, MOI) presenti in media da parte di fase fluida endocitosi (vedi Figura 1). Interazioni tra dfTAT e MOI non sono necessari fino a quando sia il traffico entità insieme all'interno del percorso endocitico. Come dfTAT raggiunge una determinata soglia all'interno del lume di organelli endocitiche, esprime la sua attività perdite endosomal (i dettagli molecolari restano essere pienamente caratterizzato). Il contenuto del lume di organelli dispersioni, e quindi il MOI, viene poi rilasciato nelle cellule. Questo approccio è quindi molto conveniente come non sono richieste coniugazione o formulazione regimi con MOI. Inoltre, perché dfTAT è Non modificare direttamente una MOI, non dovrebbe interferire con la funzione MOI volta consegna intracellulare è raggiunto. Inoltre, la concentrazione didfTAT utilizzato consegna è indipendente da quello del MOI in media. Ad esempio, la concentrazione dfTAT può essere mantenuta costante tra i diversi esperimenti per garantire l'efficienza riproducibili in perdite endosomal. Al contrario, la concentrazione di MOI nei media può essere gradualmente modificata per raggiungere livelli desiderati di MOI consegnato nel citoplasma.L'alta efficienza di dispersione endosomal realizzato con dfTAT è notevolmente innocuo a molte delle cellule esaminate fino ad oggi. Si tratta di una sorpresa perché organelli endocytic sono componente importante delle cellule e ci si aspetterebbe che la perdita drammatica mediata da dfTAT sarebbe stato accompagnato da risposte cellulari deleteri. Eppure, cellule trattate proliferano alla stessa velocità come cellule non trattate e non visualizzano i cambiamenti significativi nella loro trascrittoma. Inoltre, la consegna può essere ripetuto in pochi minuti con l'efficienza di consegna riproducibili, indicando che le cellule possono sia tollerare o recuperare dal processo di consegna, senza perderela loro capacità di endocitosi o perdite endosomal. Risposte cellulari sottili potrebbero aver luogo durante la consegna dfTAT e i dettagli molecolari di ciò che queste risposte potrebbero essere ancora essere esplorate. Tuttavia, combinando ad alta efficienza, la convenienza di protocolli, e la mancanza di tossicità, questo approccio consegna risulti immediatamente utili in molte applicazioni basati su celle. I protocolli qui presentati hanno lo scopo di rendere questa tecnologia accessibile alla comunità di ricerca.
1. SPPS: CK (TMR) TATG (fTAT) Sintesi
Nota: dfTAT viene prodotta in due fasi: sintesi del monomero da fTAT solida sintesi del peptide fase seguita da disolfuro dimerizzazione legame per formare dfTAT.
2. Ossidazione Reazione: dfTAT Generation
3. Misurare dfTAT Concentrazione
4. cellulari Esperimenti di consegna
5. Controling Concentrazione di MOI Consegnato
Per valutare la differenza tra fTAT e dfTAT, cellule HeLa sono incubate per 1 ora con ogni peptide per determinare la differenza nella loro localizzazione cellulare. L'internalizzazione dei due CPP del è stata valutata utilizzando la microscopia a fluorescenza. La figura 2 mostra che fTAT (20 micron) localizza in una distribuzione puntata. Questa distribuzione è coerente con il peptide rimanendo intrappolata all'interno endosomi. Al contrario, il segnale di fluorescenza di dfTAT (5 mM) mostra una distribuzione omogenea in tutto il citosol e nucleo. Figura 3 mostra che la distribuzione citosolico di dfTAT è osservata in un certo numero di linee cellulari differenti compreso COLO 316, NIH 3T3, HaCaT, la difficile trasfettare Neuro-2a, MCH58, la linea cellulare primario HDF, DRG-F11 e NCL-H1299. Le immagini 20X mostra che una percentuale molto elevata (> 80%) in un piatto visualizzare una distribuzione citosolico di dfTAT senza tossicità cellulare (senza Sytox stainin nucleare blug).
Per determinare se dfTAT mediata perdite endosomal offre grandi proteine nel citoplasma delle cellule. EGFP (26 kDa) è scelto come proteina modello. Questo perché la sua fluorescenza può essere utilizzata per rilevare sua consegna nelle cellule osservando la localizzazione della fluorescenza verde (piegato se correttamente). Per fare questo test, e EGFP dTAT sono state incubate per 1 ora con le cellule, come mostrato nella Figura 4, EGFP visualizzato un citosolica e distribuzione fluorescente verde nucleare simile a quello osservato per dfTAT in più del 90% delle cellule senza tossicità osservabile.

Figura 1. Schema Proiezione Principio di consegna Molecolare dfTAT-mediata. Da sinistra a destra. Schematico mostra consegna cellulare dfTAT insieme a una cella di carico impermeabile. Prima dfTAT induce endocitosi che si traduce nella uptake di dfTAT insieme con il carico in vescicole endocitiche. Nella seconda fase dfTAT fuoriesce dalle vescicole endocitiche che provoca il rilascio di dfTAT e la cellula molecola impermeabile nel citosol delle cellule. Citoplasma di cellule di mammifero è un ambiente riduttivo, quindi nel citoplasma dfTAT si riduce alla sua controparte monomero fTAT. Clicca qui per vedere una versione più grande di questa figura.

Figura 2. fluorescenza e Bright campo Immagini Sia le cellule HeLa incubate con 20 mM fTAT (pannello di sinistra) e 5 micron dfTAT (pannello di destra) con un obiettivo 100X. Immagini monocromatiche fTAT mostrano le cellule che presentano una distribuzione della fluorescenza puntata mentre le immagini mostrano dfTAT cellule la visualizzazione di un citosolico omogenea e fluorescenc nucleare e la distribuzione. Scala bar:. 10 micron Cliccate qui per vedere una versione più grande di questa figura.

Figura 3. Consegna efficiente di dfTAT in cellule vive è stato raggiunto in più linee cellulari. Le linee cellulari testate sono stati i seguenti: HeLa, NIH 3T3, COLO 316 e HaCaT, Neuro-2a, MCH58, HDF, DRG-F11 e NCL- H1299. Le cellule sono state incubate con 5 mM dfTAT per 1 ora seguito da una fase di lavaggio in base al protocollo e ripreso. Il segnale di fluorescenza rilevato era nel citoplasma e nel nucleo delle cellule (pannello superiore: obiettivo 20X, pannello inferiore: obiettivo 100X). La macchia di nuclei di cellule-impermeabile Sytox Blu è stato utilizzato per valutare la vitalità cellulare dopo il trattamento dfTAT. Bar Scala, 20X oggettivi: 50 micron; 100X Obiettivo: 10 micron.jove.com/files/ftp_upload/53175/53175fig3large.jpg "target =" _ blank "> Clicca qui per vedere una versione più grande di questa figura.

Figura 4. dfTAT Offre EGFP Intact in diverse linee cellulari. (A) HeLa (pannello superiore) e NIH 3T3 (pannello inferiore), le cellule sono state incubate con EGFP (10 micron) e dfTAT (5 micron) per 1 ora e passo successivo sono stati eseguiti secondo il protocollo. Le immagini mostrano una omogenea distribuzione della fluorescenza citoplasmatica di EGFP in entrambe le linee cellulari. Bar Scala, 10 micron. (B) e le cellule HeLa HDF primarie sono state incubate con EGFP (10 micron) e dfTAT (5 micron) secondo il protocollo. Immagini 20X mostrano una omogenea distribuzione della fluorescenza citoplasmatica di EGFP e dfTAT in HeLa e cellule HDF primarie. Overlay (pseudocolore: bianco) indicano la presenza di dfTAT (pseudocolore: viola), EGFP (pseudocolo: verde) nello spazio citosolico di entrambe le cellule HeLa e HDF. Sytox blu (in blu) è stato utilizzato per asini per la vitalità cellulare. Bar Scala:. 50 micron Cliccate qui per vedere una versione più grande di questa figura.
Gli autori non hanno nulla da rivelare.
Descriviamo come fornire proteine e piccole molecole impermeabili alle cellule di mammifero in coltura mediante un semplice protocollo di co-incubazione con un reagente che causa la perdita di organelli endocitici.
Questo articolo è stato supportato dal premio numero R01GM087227 dal National Institute of General Medical Sciences, dal Norman Ackerman Advanced Research Program e dalla fondazione Robert A. Welch (Grant A-1769).
| Eparina | Sigma | CAS 9041-08-1 | |
| SYTOX Blu | Invitrogen | S11348 | |
| SYTOX Verde | Invitrogen | S7020 | |
| nrL15 L-15 (–) cisteina | Hyclone | Ordine speciale | |
| Aminoacidi protetti da Fmoc | Novabiochem | ||
| dfTAT | I campioni saranno forniti su richiesta (contatto: pellois@tamu.edu) | ||
| Cabina di | Biosicurezza | ||
| Microscopio a epifluorescenza invertita | Olympus | modello IXB1 | dotato di un tavolino di riscaldamento mantenuto a 37 gradi C e con una telecamera Rolera-MGI Plus retroilluminata con dispositivo ad accoppiamento di carica a moltiplicazione di elettroni (EMCCD) (Qimaging). |
| 37 gradi C umidificato, 5% CO2 incubatore | |||
| Sintetizzatore di peptidi o recipiente per preformare la sintesi | manuale di peptidi |