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Research Article
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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
Viene presentato un protocollo per l'estrazione e la pre-concentrazione di estradiolo da campioni d'acqua utilizzando un sistema automatizzato e miniaturizzato.
Si propone un nuovo metodo per l'estrazione in fase solida (SPE) di campioni di acqua ambientale. Il prototipo sviluppato è conveniente e facile da usare, e consente di eseguire un rapido, automatizzato e semplice SPE. La soluzione pre-concentrata è compatibile con l'analisi mediante immunodosaggio, con un basso contenuto di solvente organico. Un metodo è descritto per l'estrazione e pre-concentrazione di ormone naturale 17β-estradiolo in 100 ml campioni di acqua. Fase inversa SPE viene eseguita con sorbente ottadecil-silice e eluizione avviene con 200 ml di metanolo al 50% v / v. Eluente viene diluito con l'aggiunta di acqua per abbassare la quantità di metanolo. Dopo aver preparato manualmente colonna SPE, la procedura generale viene eseguita automaticamente entro 1 ora. Al termine del processo, la concentrazione di estradiolo è misurato utilizzando un commerciale immuno-adsorbente assay enzimatico (ELISA). 100 volte pre-concentrazione si ottiene e il contenuto di metanolo in solo il 10% v / v. Recuperi completi della molecolavengono raggiunti con 1 ng / L spillo campioni deionizzata e sintetici acqua di mare.
La preparazione del campione è un passo importante in ogni processo di analisi. In particolare, la rimozione degli effetti matrice, diminuzione delle interferenze e arricchimento dell'analita sono necessari per ottenere risultati precisi e raggiungere limiti di rilevabilità. Sistema endocrino composti (IE) sono di particolare interesse per la loro azione su organismi viventi, anche quando presenti a livelli molto bassi per l'ambiente. L'ormone naturale 17β-estradiolo è presente sul inquinamento delle acque dell'UE selezione e soggetto ad essere aggiunto alla lista delle sostanze prioritarie disciplinati dalla direttiva quadro sulle acque europee. Estrazione in fase solida (SPE) è comunemente applicato per l'analisi di piccole inquinanti in acqua, sia chimica 1-5 (cromatografia, spettrometria di massa) e immunologici 6-9 metodi di rilevamento. Quest'ultimo ha guadagnato interesse nel campo del monitoraggio ambientale, come saggi immunologici sono disponibili in un'ampia varietà di formati, sono specifici per la taanalita rget, e raggiungere limiti di rilevabilità. 6, 7, 10, 11 Vari Enzyme Linked immunoassorbimento (ELISA) sono commercialmente disponibili e consentono di analizzare più campioni contemporaneamente su una piastra multi-pozzo. La procedura consiste in fasi successive di reazione che possono prendere un paio d'ore. Il prodotto finale di reazione può essere rilevato otticamente per determinare la concentrazione della molecola bersaglio sulla base di una curva di calibrazione.
Procedure SPE Classical includono sorbente pre-condizionamento, dell'estrazione del campione, lavaggio, eluizione e concentrazione per evaporazione dell'eluente. Il solvente utilizzato per la diluizione di questo estratto è scelto in funzione del metodo di rilevamento. Per i metodi immunologici, la quantità di solvente organico influenze fortemente la sensibilità del metodo. 12
Oltre al recupero e le prestazioni pre-concentrazione, il metodo deve anche essere semplice ed economicamente conveniente. Automazione dei SEGUIRE IL PROCEDIMENTOe aiuta a ridurre gli errori umani legati. Nel nostro lavoro precedente 13 abbiamo introdotto il nostro prototipo per SPE automatizzata, e il nostro metodo è stato applicato all'analisi della ormone naturale 17β-estradiolo in campioni di acqua di mare. Con la presente il video che vorremmo evidenziare i vantaggi tecnici del nostro metodo rispetto alle tradizionali off-line e on-line SPE, e la sua particolare compatibilità con rilevamento da immuno-reazioni. Descriviamo il protocollo applicato ai campioni di acqua per la rilevazione di 17β-estradiolo. SPE viene eseguita con octadecil-silice (C18) Fase sorbente e eluizione viene eseguita con metanolo diluito.
Nota: Il protocollo seguente descrive la SPE effettuato su 100 ml del campione d'acqua con C18 sorbente e eluizione con 50% v / v di metanolo. Il campione arricchito viene diluita a raggiungere il 10% v / v di metanolo prima analisi con un enzima linked immunosorbent assay (ELISA) Kit.
1. Preparazione dei reagenti
2. Preparazione della colonna SPE
3. Preparazione del sistema
4. SPE con il Prototype
5. Individuazione di Estradiolo Concentrazione con ELISA
Riproducibilità dell'imballaggio sorbente è stata valutata con l'essiccazione e la ponderazione del sorbente pipettato in flaconcini di vetro ed il risultato è mostrato in Figura 1. Riproducibilità del tempo di iniezione è stato testato per 100 ml di campioni, come mostrato nella Figura 2. Concentrazione iniziale e pre concentrato spillo campioni sono stati determinati utilizzando un kit ELISA commerciale per 17β-estradiolo e sono mostrati in figura 3.
La procedura proposta comporta l'utente per la preparazione della fase sorbente (Figura 1). Le particelle assorbenti si svolgono tra due membrane per la stabilità meccanica e sono densamente dalla pressione applicata con la siringa mentre pipettando sospensione nella colonna. La colonna risultante contiene una quantità ottimale di 6 mg del sorbente scelto con errore solo il 6% da questo valore. Questo passo agisce anchecome assorbente condizionata, come la sospensione viene preparata in condizioni appropriate solvente.
Dopo la preparazione e l'installazione della colonna SPE sul sistema, e caricando le soluzioni nei serbatoi appropriati, il procedimento di pre-concentrazione è completamente automatizzato e richiede in totale meno di 1 ora per 100 ml di campione (Figura 2). L'estrazione viene eseguita in 40 ± 8 min. Solo due parametri sono ancora influenzati dall'utente, la preparazione del sorbente imballato e la regolazione della portata. Il primo sarebbe essere risolti mediante l'applicazione di metodi su larga scala per la colonna fabbricazione. Il secondo è legato alla regolazione manuale del regolatore di pressione, che determina il valore di pressione utilizzato per guidare le soluzioni attraverso il sistema. Questa fonte di errore verrebbe eliminato implementando un regolatore di pressione elettronico.
Per quanto riguarda le prestazioni, il prFattore e-concentrazione ottenuta è 100. In primo luogo, di 500 volte preconcentrazione avviene eluendo l'estratto del sorbente con il 50% v / v di metanolo. Poi una diluizione 5 volte viene eseguito aggiungendo acqua demineralizzata. Questa diluizione riduce il contenuto di solvente e preserva la sensibilità immunodosaggio. Osservando le curve di calibrazione del ELISA (Figura 3A), è evidente che il rapporto di metanolo nel campione arricchito non influenza la sensibilità del saggio immunologico. Un risultato rappresentativo di pre-concentrazione è illustrata in figura 3. Il metodo è stato applicato ai campioni di-acqua e acqua di mare artificiale addizionato di 1 ng / L di 17β-estradiolo. Mentre le concentrazioni di campione sono inferiori al limite di rivelazione, il metodo di pre-concentrazione porta con successo tali campioni nell'intervallo di dosaggio (30 - 30.000 ng / L). I recuperi sono stati ottenuti confrontando la concentrazione finale di concentrazione teorica spillo. Recuperi di 128% ± 22% e il 107% ±6% sono stati calcolati per di-acqua e acqua di mare artificiale rispettivamente (Figura 3B).

Figura 1. Illustrazione e riproducibilità del metodo per l'imballaggio sorbente. Ci sono tre fasi: fissaggio della prima membrana di nylon con il primo connettore, iniettando la sospensione assorbente, e chiusura colonna inserendo la seconda membrana e il connettore. La colonna risultante contiene 6 mg di assorbente con il 6% deviazione standard (n = 6 preparato e colonne ponderata). Clicca qui per vedere una versione più grande di questa figura.

Figura 2. Step-by-stepillustrazione della procedura con riproducibilità del tempo di iniezione del campione. Gli ingressi soluzione vengono caricati nei serbatoi o bottiglia. Le due uscite sono il campione trattato (rifiuti) e il campione arricchito, che è compatibile per l'analisi mediante immunodosaggio a basso contenuto di solvente. La procedura generale è automatizzato e richiede poco meno di 1 ora (n = 31 con deviazione standard). L'influenza degli utenti sulla portata è evidenziata con caratteri blu. Clicca qui per vedere una versione più grande di questa figura.

Figura 3. Risultati del pre-concentrazione di E2 e analisi mediante ELISA. (A) Le curve di calibrazione della ELISA e punti misurati per 1 ng / L spillo di-acqua (i) e acqua di mare artificiale (ii) dopo enrichment. (B) recuperi ottenuti per 1 ng / L spillo di-acqua (i) e acqua di mare artificiale (ii) campioni dopo arricchimento (n = 4). Le barre di errore sono deviazioni standard derivanti dal numero di repliche e le 3 pozzetti della piastra ELISA che sono stati utilizzati per determinare la concentrazione di ciascun campione. Questo dato è stato modificato da (13). Clicca qui per vedere una versione più grande di questa figura.
Gli autori non hanno nulla da rivelare.
Viene presentato un protocollo per l'estrazione e la pre-concentrazione di estradiolo da campioni d'acqua utilizzando un sistema automatizzato e miniaturizzato.
Questo lavoro è stato finanziato dal Settimo Programma Quadro dell'Unione Europea FP7/2007-2013 nell'ambito dell'accordo di sovvenzione n. 265721. Gli autori ringraziano l'Istituto RIKILT per la Sicurezza Alimentare (NL) per il loro sostegno in questo progetto.
| Membrana filtrante 0,2 μ m dimensione dei pori | Merck Millipore | GNWP04700 | Per la filtrazione del campione |
| Membrana in nylon 11 μ m dimensione dei pori | Merck Millipore | NY1104700 | per colonna SPE |
| Punzone per biopsia monouso 5 mm | Budget medico | 39302439 | |
| Nucleodur C18 ec | Macherey Nagel | 713550.01 | 50 μ m diametro delle particelle |
| Acqua di mare sintetica | Sigma Aldrich | SSWS500-500ML | |
| Metanolo | VWR | ||
| 17beta-estradiolo standard | Enzo Life Science | 300 ng/ml | |
| 17beta-estradiolo Kit ELISA | Enzo Life Science | ADI-900-008 | 96 pozzetti, intervallo 30 - 3.000 ng/L |