fibre lunghe che scendono verso il midollo spinale sono essenziali per la locomozione, percezione del dolore, e altri comportamenti. Il modello terminazione in fibra nel midollo spinale della maggior parte di questi sistemi in fibra non sono state esaminate a fondo in qualsiasi specie. fibre serotoninergici, che proiettano al midollo spinale, sono stati studiati nei ratti e opossum su sezioni istologiche e il loro significato funzionale è stata dedotta in base al loro modello di terminazione in fibra nel midollo spinale. Con lo sviluppo della chiarezza e tecniche cubica, è possibile studiare questo sistema di fibre e la sua distribuzione nel midollo spinale, che rischia di rivelare caratteristiche precedentemente sconosciuti di percorsi supraspinal serotoninergici. Qui, forniamo un protocollo dettagliato per l'imaging delle fibre serotoninergici nel topo midollo spinale utilizzando la nitidezza, associato e le tecniche cubi. Il metodo prevede la perfusione di un mouse con una soluzione idrogel e chiarificazione del tessuto con una combinzione di compensazione reagenti. tessuto del midollo spinale è stato eliminato in poco meno di due settimane, e la conseguente colorazione immunofluorescenza contro la serotonina è stata completata in meno di dieci giorni. Con un microscopio a fluorescenza multi-fotone, il tessuto è stato digitalizzato e l'immagine 3D è stata ricostruita utilizzando il software OsiriX.