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Research Article
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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
Descriviamo un semplice test su cellule-base per la rilevazione, la quantificazione e il monitoraggio dell'attività dei membri della famiglia endoteliale vascolare del fattore di crescita dei leganti. Il saggio utilizza recettori chimerici espressi in una linea cellulare fattore dipendente per fornire una valutazione semiquantitativa o quantitativa di legame recettoriale e reticolazione del legante.
L'analisi del recettore tirosina chinasi e loro ligandi interagiscono coinvolti nella biologia vascolare è spesso difficile a causa l'espressione costitutiva di famiglie di recettori correlati, una vasta gamma di ligandi correlate e la difficoltà di trattare con colture primarie di cellule endoteliali specializzate. Qui si descrive un saggio biologico per la rivelazione di ligandi per il fattore di crescita vascolare endoteliale receptor-2 (VEGFR-2), un trasduttore chiave di segnali che promuovono l'angiogenesi e lymphangiogenesis. Un cDNA codificante una fusione della regione extracellulare (ligando vincolante) di VEGFR-2 con l'transmembrana e citoplasmatici regioni del recettore dell'eritropoietina (EpoR) è espressa nella linea cellulare fattore dipendente Ba / F3. Questa linea cellulare cresce in presenza di interleuchina-3 (IL-3) e il ritiro di questo fattore risultati nella morte delle cellule entro 24 ore. L'espressione della / EpoR di fusione del recettore VEGFR-2 fornisce un meccanismo alternativo per promuovere la sopravvivenza e potentially proliferazione delle cellule Ba / F3 trasfettate stabilmente in presenza di un legante capace di legare e reticolazione della porzione extracellulare della proteina di fusione (ad esempio, uno che può attraversare-link regione extracellulare VEGFR-2). L'analisi può essere eseguita in due modi: un approccio semi-quantitativo, in cui piccoli volumi di ligando e cellule permettono un rapido risultato in 24 ore, e un approccio quantitativo coinvolge indicatori surrogati di un numero di cellule vitali. Il saggio è relativamente facile da eseguire, è altamente sensibile alle note VEGFR-2 leganti e può ospitare inibitori extracellulari di VEGFR-2 segnalazione come gli anticorpi monoclonali per il recettore o leganti e trappole ligando solubile.
Il fattore di crescita vascolare endoteliale (VEGF) famiglia di fattori di crescita proteina secreta e le loro cognate recettori della superficie cellulare è un gruppo importante e diversificata di ligandi solubili e recettori di membrana-embedded, rispettivamente, tale funzione in trasduzione dei segnali attraverso le membrane cellulari. Essi funzionano principalmente nelle cellule endoteliali, ma anche in cellule di origine epiteliale e quelli del 1,2 sistema immunitario. Vie di segnalazione impegnati dai recettori ligando-attivato VEGF (VEGFRs) sono fondamentali in importanti patologie, come la degenerazione maculare senile e il cancro, e terapeutica loro rivolte sono in uso clinico frequente (per esempio, il bevacizumab anticorpo monoclonale che ha come bersaglio il VEGF-A) 3,4.
Una delle complessità della famiglia VEGF è la diversità di ligandi solubili presenti in natura (VEGF-A, VEGF-B, VEGF-C, VEGF-D, proteine VEGF codificate dal ORF famiglia di virus parapox e veleno di serpente VEGF, più altri inibitorioisoforme di VEGF-A) 2.
Questi ligandi interagiscono con tre membri della famiglia dei recettori tirosin-chinasi, cioè VEGFR-1, VEGFR-2 e VEGFR-3. Questi recettori sono variabilmente espressi su differenti tipi cellulari, ma sono spesso co-espressi sulla superficie delle cellule endoteliali che rivestono sanguigni e linfatici navi di tutte le dimensioni 5. VEGFR-2 può legare l'mammiferi ligandi VEGF-A 6, VEGF-C 7 e VEGF-D 8,9, così come virus orf VEGF 10 e veleno di serpente VEGF 11. VEGFR-2 svolge un ruolo importante nel guidare l'angiogenesi (la crescita di nuovi vasi sanguigni da vasi preesistenti) nello sviluppo embrionale, la guarigione delle ferite, il cancro e le malattie degli occhi. In questi contesti, leganti quali VEGF-A, -C e -D legano e attivano il recettore sulla sangue vascolare cellule endoteliali 12-15. Sulle cellule endoteliali linfatiche, VEGFR-2 svolge un ruolo nella linfangiogenesi, la formazione di nuovi vasi linfatici 16. VEGFR-2 può anche promuovere la dilatazione e l'espansione delle grandi arterie e vasi linfatici nei tessuti sani e malattie 17. Una comprensione completa di VEGFR-2: interazioni ligando è quindi importante per lo sviluppo di inibitori per l'uso nel trattamento di malattie angiogenesi-dipendenti 18. Mentre la maggior parte isoforme di VEGF-A si legano a VEGFR-2, taglio proteolitico di VEGF-C e VEGF-D è necessario per rilasciare un frammento consistente del dominio VEGF-omologia che presenta alta affinità di legame al VEGFR-2 19,20.
Abbiamo sviluppato un saggio biologico per monitorare ligandi di VEGFR-2 che è stato progettato per aggirare la necessità di cellule primarie endoteliali, che sono tecnicamente difficili da passare, costoso per l'acquisto e la cultura (che richiede media specializzati) 21 e di esprimere molteplici VEGFRs e co-associato recettori 22. Eterodimerizzazione di VEGFR-2 con altri recettori del VEGF o co-recettori può causare complessità indesiderate quando si punta a pernointerazioni y binari recettore-ligando, valutando l'attività attribuibili a uno specifico recettore, o valutare l'effetto dei reagenti inibitori. 23. Il saggio biologico mantiene la mobilità del recettore rilevante nella membrana cellulare e permette la valutazione della capacità di un ligando di legare e cross-link regione extracellulare VEGFR-2.
Il saggio biologico si basa sulla creazione di un recettore chimerico in cui la regione extracellulare di un recettore VEGF (in questo caso VEGFR-2) è fuso al transmembrana e regioni intracellulari del recettore dell'eritropoietina (EpoR), un membro della famiglia dei recettori delle citochine 8,24. Questa proteina di fusione viene poi espressa nella linea cellulare pro-B fattore dipendente Ba / F3, su cui stimolazione con un ligando capace di legare e reticolare il dominio extracellulare del recettore provoca l'attivazione della regione effettore citoplasmatica, capace di trasduzione un segnale di sopravvivenza via Janus chinasi (JAK) per la promozione delle cellulesopravvivenza e / o proliferazione. In contrasto, l'espressione di full-length VEGFR-2 nello stesso tipo cellulare, e stimolazione con ligando, non promuovono la sopravvivenza e la proliferazione cellulare, indicando che gli effettori segnalazione prossimali del pathway VEGFR-2 non sono disponibili in questo tipo cellulare.
Abbiamo usato il test in una varietà di contesti di esplorare vincolante di nuove VEGFR-2 ligandi 10,19,20,24-29. In combinazione con un saggio / F3 VEGFR-3-EpoR-Ba, abbiamo confrontato le relative attività di VEGF-C e fattori di crescita VEGF-D per legare e reticolazione VEGFR-2 e VEGFR-3 30. Il test è stato utilizzato per caratterizzare l'attività inibitoria di anticorpi neutralizzanti monoclonali di VEGFR-2 o VEGF-D, solubili VEGFR-2 trappola e peptidomimetici rivolte alla famiglia del VEGF 31. Il dosaggio è stato utilizzato anche per mostrare la capacità di VEGF da diversi ceppi di virus orf di legare e cross-link VEGFR-2 prima della prova in cellule endoteliali primarie 25 o quando i protocolli valutare per la crescita purificante fattori 27.
Il test che descriviamo è facile da eseguire, e la versione semi-quantitativa permette determinazioni veloci che a volte sono necessari quando il monitoraggio della produzione o purificazione di fattori di crescita, anticorpi o domini recettore solubile per altri esperimenti. La facilità d'uso del test lo rende un complemento ideale per studi ulteriori e più complete eseguite con le cellule endoteliali primarie derivate da sangue o vasi linfatici da specifici tessuti o organi.
Media Fonte di IL-3 e preparazione di WEHI-3D-condizionata
Nota: La linea cellulare di leucemia granulocitica topo WEHI-3D è coltura per generare un mezzo condizionato contenente IL-3.
2. Cultura e valutazione di VEGFR-2-EpoR-Ba / F3 e Controllo Ba / F3 linee cellulari
3. Assay semi-quantitativa
4. Quantitative Bioassay
In questa sezione, mostriamo i risultati di un esperimento che dimostrano le caratteristiche essenziali di un saggio biologico VEGFR-2-EpoR-Ba / F3 (vedere Figura 1 dei principi del saggio). Altri studi pubblicati dimostrano le applicazioni più ampie del saggio per alternative VEGFR-2 ligandi, molecole VEGF mutanti e gli anticorpi monoclonali inibitori 8,10,19,24-30.
I dati presentati qui rappresentano un saggio in cui il / F3 saggio biologico VEGFR-2-EpoR-Ba viene utilizzato per quantificare l'attività dei tre ligandi umane ricombinanti (VEGF-A165, VEGF-C e VEGF-D) con specificità per VEGFR -2 in presenza di un anticorpo monoclonale inibitorio (bevacizumab) di VEGF-a 165. I dati sono stati normalizzati rispetto alla risposta a VEGF-a 165 alone (Figura 2). Come previsto, bevacizumab bloccato l'effetto di VEGF-A 165 nel saggio, maavuto alcun effetto sull'attività di VEGF-C e VEGF-D.
Nella versione semi-quantitativa del dosaggio o quando osservando il dosaggio durante il suo sviluppo, la visualizzazione del test utilizzando un microscopio invertito trifase standard possono fornire informazioni preziose sullo stato di avanzamento del dosaggio. L'analisi di un test (Figura 3) mostra la buona vitalità di VEGFR-2-EpoR-Ba / F3 cellule biodosaggio quando incubate con terreno contenente IL-3 o ligando per VEGFR-2, ad esempio, VEGF-A. Queste cellule sono grandi e traslucido, e non vi è nessuna o minima evidenza di granularità nel citoplasma cellulare o detriti cellulari in coltura. Nel pozzo senza fattori di crescita aggiuntivi vi è già la prova di numero di cellule ridotti e poche cellule sane. Le cellule presenti hanno una significativa granularità nel loro citoplasma e detriti cellulari è una caratteristica costante della cultura. Dopo 48 ore non vi è alcun segno di cellule vitali.
Figura 1. Schema Descrivendo i principi del VEGFR-2-EpoR-Ba / F3 Bioassay. (A) cellule Ba / F3 sono fattore-dipendente e richiedono un fattore di crescita esogena, come IL-3 per stimolare la crescita delle cellule / la vitalità via endogeni iL-3 recettori e il percorso di segnalazione JAK. Se EpoR è espresso in queste cellule salvataggio può avvenire anche attraverso la via JAK. L'espressione di un full-length del recettore tirosin-chinasi, come VEGFR-2 risultati in segnalazione minima come bersagli a valle di VEGFR-2 di attivazione non impegnano la via JAK. Un recettore chimerico con la regione extracellulare di VEGFR-2 fuse alle transmembrana e citoplasmatici regioni EpoR, quando trasfettati in cellule Ba / F3 e stimolate con specifici VEGFR-2 ligandi, è in grado di attivare il pathway JAK e cellule di guidala sopravvivenza e la proliferazione. (B), le cellule / F3 VEGFR-2-EpoR-Ba esprimono livelli significativi del recettore chimerico VEGFR-2-EpoR che può essere quantificata mediante citometria a flusso. Una volta lavato su IL-3 terreno contenente le cellule sono posti in una varietà di condizioni di coltura che guidano sia la sopravvivenza / proliferazione delle cellule. Cellule Ba / F3 untransfected o VEGFR-2-EpoR-Ba / F3 cellule senza specifici fattori di crescita non riescono a crescere / sopravvivere. Clicca qui per vedere una versione più grande di questa figura.

Figura 2. La valutazione di VEGFR-2 ligandi nella / F3 analisi biologico. IL-3-dipendente cellule / F3 VEGFR-2-EpoR-Ba Ba che esprimono un mouse VEGFR-2-EpoR chimera sono state seminate in mezzo senza IL-3 (ad eccezione perl'+ IL-3 sottoinsieme, come indicato) più VEGF-A umana 165, VEGF-CΔNΔC (VC) (questa è una forma di VEGF-C che consiste nella regione centrale ed esclude le N e C-terminali propeptidi), o VEGF-DΔNΔC (questa è una forma di VEGF-D che comprende la regione centrale ed esclude le N e C-terminali propeptidi (VD)) a 100 neutralizzazione anticorpo monoclonale bevacizumab ng / ml e umanizzato (che lega e inibisce VEGF-a, ma non VEGF-C o VEGF-D), o controllare non-anticorpi neutralizzanti trastuzumab, come indicato in 0,75 mM. NF = medio che non contiene fattori di crescita aggiuntivi. Quarantotto ore dopo, relativo numero di cellulare dal vivo è stata quantificata mediante il rilevamento bioluminescenza di ATP cellulare. Le barre verticali rappresentano mezzi (normalizzato rispetto alla risposta al VEGF-A 165 da solo, prima barra) e l'errore standard della media di tre esperimenti indipendenti. Clicca qui per view una versione più grande di questa figura.

Figura 3. Cellule VEGFR-2-EpoR-Ba / F3 sono dipendenti da fattori di crescita esterna per la sopravvivenza. Esempi di VEGFR-2-EpoR-Ba / F3 prova biologica in cui IL-3-dipendente cellule Ba / F3 esprimono un mouse VEGFR- 2-EpoR chimera sono state seminate in terreno (a) contenente 10% WEHI-3D mezzo che fornisce IL-3, (B) 100 ng / a VEGF-(senza IL-3), o (C) medium ml umana 165 con condizionato no IL-3 o fattori di crescita aggiuntivi. La cultura è raffigurato 24 ore nel test mostra cellule altamente vitali in presenza di IL-3 (A) o VEGF-A 165 (B), mentre nella cultura senza (C) morte cellulare IL-3 o fattori di crescita addizionali e rossouced vitalità sono chiaramente evidenti. Bilance bar sono 100 micron. Cliccate qui per vedere una versione più grande di questa figura.
Steven A. Stacker e Marc M. Achen sono azionisti di circadiano Technologies Ltd., una società di sviluppo di terapie di mira la famiglia dei fattori di crescita VEGF.
Descriviamo un semplice test su cellule-base per la rilevazione, la quantificazione e il monitoraggio dell'attività dei membri della famiglia endoteliale vascolare del fattore di crescita dei leganti. Il saggio utilizza recettori chimerici espressi in una linea cellulare fattore dipendente per fornire una valutazione semiquantitativa o quantitativa di legame recettoriale e reticolazione del legante.
SAS e MGA sono supportati da sovvenzioni per progetti, sovvenzioni per programmi e borse di ricerca dal National Health and Medical Research Council of Australia (NHMRC) e da fondi del programma di supporto alle infrastrutture operative fornito dal governo del Victoria, Australia. MMH ha il sostegno di una sovvenzione della Peter MacCallum Foundation.
| La soluzione Trypan Blue | Sigma-Aldrich | T8154 | allo 0,4% in PBS viene utilizzata 1:1 con sospensioni cellulari per misurare le cellule vitali. Pericolo-può causare il cancro |
| G418 Solfato (Geneticina) | Invivogen | ant-gn-5 | Agente per la selezione di cellule eucariotiche trasfettate. Pericolo: può causare sintomi di allergia o asma o difficoltà respiratorie. |
| 3H-Timidina | PerkinElmer | NET-027 | Questo nucleoside radioattivo viene incorporato nel DNA cromosomico durante la mitosi. Hazard-radiation |
| Vialight Plus Kit | Lonza | LT07-221 | Rilevamento bioluminescente dell'ATP cellulare per quantificare la vitalità, utilizzando il reagente per il monitoraggio dell'ATP |
| Prestoblue Cell Viability Reagent | Invitrogen | A13261 | Indicatore di vitalità cellulare a base di resazurina. Diventa di colore rosso nell'ambiente riducente della cellula |
| Minivassoio Nunc con superficie Nunclon Delta (72 pozzetti) | Thermo Scientific | 136528 | Piccola piastra per microtitolazione |
| 96 pozzetti Piastra per coltura tissutale | Falcon, Corning Inc. | 353072 | |
| DMEM (1X) | Gibco | 11965-92 | |
| GlutaMAX (100X) | Gibco | 35050-061 | |
| Siero fetale bovino | Gibco | 10099-141 | |
| Raccoglitore di celle | Tomtec Life Sciences | Tomtec Harvester, 96 Mach 3M Cell Harvester | |
| Contatore di scintillazione liquida | LKB Wallac | 1205 | LKB Wallac 1205 Contatore di scintillazione Betaplate |
| UniFilter-96 GF/B | Perkin Elmer | 6005177 | Micropiastra Barex bianca a 96 pozzetti con filtro GF/B di 1 & micro; m poro |
| Gentamicina | Gibco, Life Technologies | 15750-060 | |
| Penicillina/Streptomicina | Gibco, Life Technologies | 15140-122 | |
| 0,22 um poro acetato di cellulosa centrifuga tubo unità filtro | Costar, Corning Inc. | I filtri per provette da centrifuga8160 | hanno un valore di 0,22 µ m pore CA contenente un'unità filtrante all'interno di un 500 µ Provetta per microcentrifuga in polipropilene con capacità L. |
| Lettore a fluorescenza | BioTek | BioTek Synergy 4 Lettore ibrido di micropiastre |