Tridimensionale (3D) cultura è un metodo più fisiologicamente rilevanti per modellare il comportamento delle cellule in vitro di due coltura dimensionale. I carcinomi, tra carcinomi mammari, sono tessuti 3D complessi composti da cellule epiteliali cancro e componenti stromali, tra cui fibroblasti e la matrice extracellulare (ECM). Tuttavia la maggior parte modelli in vitro di carcinoma mammario costituiti solo da cellule epiteliali cancerose, omettendo lo stroma e, di conseguenza, l'architettura 3D di un tumore in vivo. Appropriata modellazione 3D del carcinoma è importante per la comprensione accurata della biologia del tumore, il comportamento e la risposta alla terapia. Tuttavia, la durata della cultura e volume di modelli 3D è limitata dalla disponibilità di ossigeno e nutrienti all'interno della cultura. Qui, dimostriamo un metodo in cui le cellule di carcinoma mammario epiteliali e fibroblasti stromali sono incorporati in ECM per generare un surrogato cancro al seno 3D che include stroma e possono essere coltivate comestruttura 3D solido o utilizzando un sistema di bioreattore perfusione di fornire ossigeno e nutrienti. Dopo l'installazione e un periodo di crescita iniziale, surrogati possono essere utilizzati per il test della droga preclinica. In alternativa, i componenti cellulari e matrice della surrogata possono essere modificati per risolvere una varietà di questioni biologiche. Dopo coltura, surrogati sono fissi ed elaborati per paraffina, in modo simile al trattamento di campioni di carcinoma mammario clinica, per la valutazione dei parametri di interesse. La valutazione di un tale parametro, la densità di cellule presenti, è spiegato, dove sono applicati ai microfotografie di sezioni istologiche di surrogati sistemi software di analisi di immagine ImageJ e CellProfiler di quantificare il numero di cellule nucleate per area. Questo può essere usato come un indicatore della variazione del numero di cellule nel tempo o la variazione del numero di cellule risultanti da diverse condizioni di crescita e trattamenti.