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Tradizionalmente, la visualizzazione dei tessuti ha richiesto che il tessuto di interesse fosse sezionato in serie e visualizzato, sottoponendo ogni sezione di tessuto a deformazioni non lineari uniche, ostacolando drasticamente la capacità di valutare la morfologia, la distribuzione e la connettività cellulare nel sistema nervoso centrale (SNC). Tuttavia, le tecniche di pulizia ottica stanno cambiando il modo in cui i tessuti vengono visualizzati. Questi approcci consentono di sondare in profondità le preparazioni di organi intatti, fornendo un'enorme comprensione dell'organizzazione strutturale dei tessuti in salute e malattia. Tecniche come CLARITY (Clear Lipid-exchanged Apilamide-hybridized Rigid Imaging-compatible Tissue-hYdrogel) raggiungono questo obiettivo fornendo una matrice che lega importanti biomolecole consentendo ai lipidi a diffusione di luce di diffondersi liberamente. La rimozione dei lipidi, seguita dalla corrispondenza dell'indice di rifrazione, rende il tessuto trasparente e facilmente visualizzabile in 3 dimensioni (3D). Ciononostante, la pulizia elettroforetica dei tessuti (ETC) utilizzata nel protocollo CLARITY originale può essere difficile da implementare con successo e l'uso di una soluzione proprietaria di corrispondenza dell'indice di rifrazione rende costoso l'uso di routine della tecnica. Questo rapporto dimostra l'implementazione di un protocollo di chiarificazione ottica semplice ed economico che combina CLARITY passivo per una migliore integrità dei tessuti e 2,2'-tiodietanolo (TDE), una soluzione di corrispondenza dell'indice di rifrazione precedentemente descritta.