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Research Article
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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
Descriviamo una configurazione sperimentale per visualizzare con un'alta risoluzione senza precedenti la formazione e la chiusura di fagosomi in tre dimensioni in macrofagi viventi, utilizzando la microscopia a fluorescenza a riflessione interna totale. Consente il monitoraggio della base della coppa fagocitica, degli pseudopodi estensibili e del sito preciso della scissione fagosomiale.
La fagocitosi è un meccanismo utilizzato da cellule specializzate per internalizzare ed eliminare microrganismi o detriti cellulari. Si basa su profondi riarrangiamenti del citoscheletro di actina che è la forza trainante per l'estensione della membrana plasmatica attorno alla particella. Inoltre, l'inghiottimento efficiente di materiale di grandi dimensioni si basa sull'esocitosi focale dei compartimenti intracellulari. Questo processo è altamente dinamico e numerosi attori molecolari sono stati descritti per avere un ruolo durante la formazione della coppa fagocitica. La regolazione precisa nel tempo e nello spazio di tutte queste molecole, tuttavia, rimane sfuggente. Inoltre, l'ultima fase della chiusura dei fagosomi è stata molto difficile da osservare perché l'inibizione da parte dell'interferenza dell'RNA o dei mutanti negativi dominanti spesso provoca lo stallo della formazione di coppe fagocitiche.
Abbiamo messo a punto un approccio sperimentale dedicato utilizzando la microscopia a fluorescenza a riflessione interna totale (TIRFM) combinata con l'epifluorescenza per monitorare passo dopo passo l'estensione degli pseudopodi e delle loro punte in un fagosoma che cresce attorno a una particella debolmente legata a un vetrino coprioggetti. Questo metodo ci permette di osservare, ad alta risoluzione, le punte stesse degli pseudopodi e la loro fusione durante la chiusura del fagosoma in cellule viventi per due diverse proteine marcate in fluorescenza allo stesso tempo.
La fagocitosi è una funzione delle cellule importante che inizia con il riconoscimento e vincolante di materiale alla superficie recettori, che poi porta alla internalizzazione e la degradazione del materiale ingerito. Mentre eucarioti unicellulari come il Dictyostelium discoideum e amebe stampo utilizzano fagocitosi per l'alimentazione di batteri, organismi superiori si sono evoluti con le cellule professionali. I macrofagi o cellule dendritiche sono la prima linea di difesa contro gli agenti patogeni in vari tessuti e organi, e sono cruciali per attivare il sistema immunitario adattativo attraverso presentazione dell'antigene e produzione di citochine 1-4. In determinate circostanze fagocitosi può essere eseguita da fagociti non professionali, ad esempio, endoteliali e cellule epiteliali. Questo processo è importante per mantenere l'omeostasi durante lo sviluppo e in età adulta per fatturato tessuto normale e rimodellamento. fagociti Infine, specializzati come le cellule di Sertoli nel testicolo o della retinale cellule epiteliali del pigmento sono estremamente potenti fagociti 5.
La formazione di un phagosome cui il degrado di microrganismi o detriti cellulari verifica inizia con il raggruppamento dei recettori fagocitiche sulla superficie della cellula fagocitaria. eventi di segnalazione a valle di seguito il clustering dei recettori opsonic quali recettori Fc (CFR) o integrano recettori (CRS) sono stati ben caratterizzati. Tuttavia, ci sono anche numerosi recettori non opsonic tra cui i recettori Toll-like (TLR), lectine, i recettori del mannosio e recettori scavenger. Questi recettori riconoscono determinanti sulla superficie delle particelle come mannosio o fucosio residui, fosfatidilserina e lipopolisaccaridi 1,6-9.
Patogeno o detriti cellulari riconoscimento comporta legandosi e il clustering dei diversi tipi di recettore fagocitosi, che poi portano alla intensa e transitorie rimodellamento actina. In parallelo, esocitosi focale di comparti intracellularits contribuisce al rilascio di tensione della membrana ed è importante per efficiente fagocitosi di particelle più grandi. Gli eventi di segnalazione che portano alla polimerizzazione e la membrana deformazione sono stati sezionati in modelli sperimentali che hanno innescato un singolo recettore fagocitaria. Durante la fagocitosi FCR-mediato, non vi è intenso polimerizzazione actina che viene regolato da piccole GTPasi (Rac, Cdc42). Tra i loro effettori a valle, la proteina sindrome di Wiskott-Aldrich (WASP) porta all'attivazione della proteina actina-Related 2/3 complesso (Arp2 / 3) che nucleates filamenti di actina 1,2,4,10. La produzione locale di fosfatidilinositolo-4, 5-difosfato (PI (4,5) P2) è di fondamentale importanza per la polimerizzazione di actina iniziale che guida la formazione pseudopodio. La sua conversione al PI (3,4,5) P 3 è richiesto per l'estensione e la chiusura pseudopodo phagosome 11. Diversi percorsi contribuiscono alla scomparsa di PI (4,5) P 2. In primo luogo il distacco di fosfatidilinositolo fosfato KinaSES (PIPKIs) dal PI arresti phagosome (4,5) P 2 sintesi. In secondo luogo, può essere fosforilata e consumata per classe I PI3K chinasi (PI3K) e convertito in PI (3,4,5) P 3 12. Un ruolo per fosfatasi e fosfolipasi è stato anche implicato nel PI (4,5) P2 idrolisi e la rimozione di F-actina durante la fagocitosi in cellule di mammifero e in Dictyostelium 13,14. La fosfolipasi C (PLC) δ idrolizza PI (4,5) P2 in diacilglicerolo e inositolo-1,4,5- tris di fosfato. Il OCRL PI (4,5) P2 e PI (3,4,5) P 3 fosfatasi (sindrome oculocerebrorenal di Lowe) è stato anche coinvolto nella formazione phagosome. formazione locale precisa di F-actina e la sua depolimerizzazione è strettamente regolata nello spazio e nel tempo e abbiamo dimostrato che l'assunzione di compartimenti intracellulari è importante per fornire localmente la fosfatasi OCRL, contribuendo così alla depolimerizzazione actina locale alla base della coppa fagocitica I giocatori di meccanismo e molecolari necessari per la chiusura phagosome e scissione membrana rimangono poco definiti a causa delle difficoltà di visualizzazione e il monitoraggio del sito di chiusura phagosome. Fino a poco tempo, fagocitosi è stata osservata su cellule fisse o viventi che internalizzano particelle sulla loro faccia dorsale o sui loro lati, rendendo la visualizzazione tempestiva del sito di chiusura phagosome difficile. Inoltre, i metodi di fissaggio potrebbero causare retrazione delle membrane e dei pregiudizi i risultati sul prolungamento pseudopodi e la chiusura. Per contro, il saggio che abbiamo creato e descrivere qui ci permette di visualizzare estensione pseudopodo e la fase di chiusura della fagocitosi in cellule viventi 13, basato sulla microscopia totale interno riflessione (TIRFM) 16. Questa tecnica ottico utilizza un onda evanescente per eccitare fluorofori in un'area sottile all'interfaccia tra un trasparente cosìcoperchio (vetrino) e un liquido (mezzo di coltura cellulare). Lo spessore della profondità eccitazione è circa 100 nm dalla superficie solida, consentendo la visualizzazione di eventi molecolari vicino alla membrana plasmatica. TIRFM permette un alto rapporto segnale-background, e limita la fluorescenza out-of-focus raccolta e la citotossicità a causa di illuminazione di cellule. Approfittando di TIRFM, abbiamo sviluppato il "saggio di chiusura phagosome", in cui lamelle sono attivati con poli-lisina e poi ricoperto con globuli rossi IgG-opsonizzati (IgG-GRP che). I macrofagi che esprimono proteine fluorescenti transitoriamente tag di interesse sono quindi autorizzati a fagocitare le IgG-GRP che. Mentre le cellule si staccano le particelle di destinazione che non sono a legame covalente alla superficie del vetro, le punte delle pseudopodi possono essere osservati e registrati in modalità TIRF. acquisizioni TIRF sono combinati con acquisizioni in modalità epifluorescenza, dopo aver spostato il micron fase 3 di cui sopra, che consenta la visualization della base della coppa fagocitaria. L'aggiunta di farmaci farmacologici come quelli inibire actina o dynamin durante il processo è anche possibile sezionare ulteriormente il processo a livello molecolare. Il protocollo descritto in dettaglio qui è una linea cellulare di macrofagi murini RAW264.7 e particelle opsonizzati, ma praticamente, può essere adattato a qualsiasi altra cellula fagocitica e con altri obiettivi come perline. Questo metodo consentirà una migliore caratterizzazione del regolamento nel tempo e nello spazio degli attori molecolari coinvolti in estensione pseudopodo e chiusura phagosome durante i vari processi di fagocitosi.
Nota: Il plasmide utilizzato Lifeact-mCherry è un gentile dono del Dr. Guillaume Montagnac, Institut Curie, Parigi, generato dopo il 17.
1. Cellule e Trasfezione
Nota: i macrofagi RAW264.7 coltivati a sub confluenza in terreno completo (RPMI (Roswell Park Memorial Institute) 1640, 10 mM HEPES, 1 mM di sodio piruvato, 50 mM β-mercaptoetanolo, 2 mM L-glutammina e 10% FCS ( Fetal Calf Serum)) in una piastra a 100 mm. Sono trasfettate con plasmidi che codificano per proteine fluorescenti tag mediante elettroporazione. Ordinariamente circa 5 - 6 x 10 6 cellule vengono trasfettate rispettivamente con 20 mg o 10 mg di plasmide per ogni trasfezione o co-trasfezione. Notare che altri mezzi di trasfezione basato su elettroporazione o lipofezione possono essere utilizzati come approcci alternativi.
2. Opsonizzazione di globuli rossi
Nota: Come modello di destinazione di particelle per i macrofagi, le cellule vengono utilizzati pecore sangue rosso (GRP che). Di solito, circa 7 x 10 6 GRP che per 35 millimetri piatto fondo di vetro viene utilizzato.
Coating 3. Poli-lisina di vetrini
4. Fissaggio non covalente di GRP che su piatti di vetro di fondo
5. fagocitosi visualizzati tramite TIRFM
Il sistema sperimentale descritto in questo manoscritto è schematicamente rappresentata in figura 1. Macrofagi transfettati RAW264.7 esprimono le proteine di interesse fusa a un tag fluorescenti vengono posti a contatto con eritrociti di pecora IgG-opsonizzati (GRP che) che erano non covalentemente fissa sul vetrino. I macrofagi possono staccare il SRBC dal vetrino di inghiottire esso. Il microscopio TIRF utilizzata permette l'acquisizione contemporanea di segnali dalla zona TIRF corrispondenti alle punte delle pseudopodi e segnali nella modalità epifluorescenza dopo uno spostamento Z 3 micron sopra.
È essenziale per determinare l'angolo critico per totale fluorescenza riflessione interna come descritto in Figura 2. Questo assicura un segnale pulito TIRF da una regione 100 nm sotto la membrana plasmatica. Figura 3 rappresenta lo sviluppo della acquisitisui parametri attraverso un modulo chiamato "Protocollo Editor" incluso nel software di acquisizione dal vivo. Questo modulo permette agli utenti di creare e gestire i flussi di lavoro prima di essere inviati al microscopio, che eseguirà il processo. Al termine dell'acquisizione, l'utente preleva un flusso TIFF.
Figura 4 mostra, un rappresentante live-cell TIRFM film di un "saggio di chiusura phagosome" nei macrofagi RAW264.7 trasfettate con il plasmide (ad esempio, Lifeact-mCherry, un gentile dono del Dr. Guillaume Montagnac, Institut Curie, Parigi, generato dopo 17) per seguire la polimerizzazione di actina. I macrofagi transitoriamente plasmide che esprimono sono stati autorizzati a fagocitare IgG-GRP che legati al vetrino. Come le punte delle pseudopodi sono stati apposto al vetrino di vetro circa un SRBC, un anello F-actina è stato rilevato nella zona TIRF (pannello superiore) che hanno progressivamente ridotto fino alla sua chiusura. In parallelo, la sfocata F-actinasegnale rilevato dal epifluorescenza dopo spostando la fase 3 micron sopra (pannello inferiore) corrispondeva alla depolimerizzazione alla base della coppa fagocitaria. Dopo 3 minuti di acquisizione, il GRP è stato completamente interiorizzato, come confermato a luce trasmessa (pannello a destra).
Pertanto, questo metodo può essere usato per distinguere correttamente gli eventi molecolari che si svolgono proprio alle estremità dei pseudopodi e gli eventi molecolari che si verificano alla base della coppa fagocitaria.

Figura 1. Rappresentazione schematica del "phagosome chiusura Assay" analizzato da TIRFM. Il saggio di chiusura phagosome viene eseguita utilizzando macrofagi che esprimono transitoriamente uno o due fluorescente tag-proteina. I macrofagi sono depositati su GRP che IgG-opsonizzati non covalentemente fissati su coa poli-lisinaTed lamelle. Le immagini vengono registrate in modalità TIRF per rilevare il sito di chiusura phagosome e in modalità epifluorescenza per rilevare la base della coppa fagocitaria. Clicca qui per vedere una versione più grande di questa figura.

Figura 2: Determinazione del angolo critico per TIRFM. (A) Uso di "acquisizione Live", una cellula che esprimono proteine fluorescenti tag è collocato al centro del campo (regione 1 in rosso). Con l'opzione TIRF Stack, immagini sono state acquisite ad una lunghezza d'onda di eccitazione, con angoli diversi a partire da 0 ° a 5 °, con un incremento di 0,01 ° (regione 2 in rosso). (B) La sequenza di immagini viene aperto utilizzando ImageJ software color Profiler e l'intensità media di fluorescenza di arEgion di interesse (ROI) è tracciato con la funzione degli angoli sull'asse X utilizzando "stack" e "PLÖTZ asse profilo" (regione 1 in rosso). (C) La posizione x del picco della fluorescenza del terreno corrisponde l'angolo critico: 1.98 ° (linea tratteggiata nera). Qualsiasi valore dopo questo angolo può essere utilizzato. A titolo di esempio, 2.00 ° possono essere scelti (linea rossa). Si prega di cliccare qui per vedere una versione più grande di questa figura.

Figura 3. Processo del flusso di lavoro utilizzando Live Modulo di acquisizione: "Protocollo Editor". (A) Nella finestra "Protocollo Editor", si crea una tela del flusso di lavoro. (B) Questo protocollo comprende un "loop" di azioni che il microscopio deve ripetere il numero di volte decisodall'utente. Come esempio: 750 (1). Un ciclo comprendeva: acquisizione "Multi Channels" con eccitazione laser di proteine fluorescenti di interesse in modalità TIRF. A titolo di esempio: laser 491 nm intensità del 50% angolo -TIRF 2.00 (2); "Z mossa" dell'obiettivo 3 micron (3); acquisizione "Multi Channels" in modalità epifluorescenza (4); "Z spostare" l'obiettivo torna alla regione TIRF (5) e una "istantanea" a luce trasmessa (6). Clicca qui per vedere una versione più grande di questa figura.

Figura 4. F-actina è accumulato come un punto al sito di test chiusura phagosome chiusura. Phagosome è stata effettuata utilizzando i macrofagi RAW264.7 che esprimono transitoriamente il plasmide Lifeact-mCherry (un gentile dono del Dr. Guillaume Montagnac, Institut Curie, Parigi, generato dopo il 17). Il segnale plasmide è stato acquisito nel TIRF zona (in alto) e in modalità epifluorescenza (in basso). La freccia rossa indica l'accumulo di actina nella regione TIRF. Trasmesso immagine luce in 3 minuti è presentato, indicando un SRBC interiorizzato. Barra della scala, 10 micron. Cliccate qui per vedere una versione più grande di questa figura.

Film 1: F-actina è accumulato nelle punte delle pseudopodi e nel sito di phagosome di chiusura, mentre viene cancellato dalla base del saggio di chiusura fagocitaria Coppa phagosome è stata effettuata utilizzando i macrofagi RAW264.7 che esprimono transitoriamente il plasmide.. Imaging plasmidi in TIRF zona (in alto) e in modalità epifluorescenza (in basso) usando l'TIRFM stata eseguita alternativamente ogni 50 ms per 3 minuti a 37 ° C. Cliccate qui per vedere il video.
Gli autori non hanno nulla da rivelare.
Descriviamo una configurazione sperimentale per visualizzare con un'alta risoluzione senza precedenti la formazione e la chiusura di fagosomi in tre dimensioni in macrofagi viventi, utilizzando la microscopia a fluorescenza a riflessione interna totale. Consente il monitoraggio della base della coppa fagocitica, degli pseudopodi estensibili e del sito preciso della scissione fagosomiale.
Ringraziamo il Dr. Alexandre Benmerah (Institut Imagine Necker, Parigi, Francia) per le discussioni iniziali sull'approccio sperimentale e il Dr. Jamil Jubrail per aver letto il manoscritto. Nadège Kambou e Susanna Borreill sono riconosciute per aver condotto esperimenti con il metodo nel nostro laboratorio. Questo lavoro è stato sostenuto da sovvenzioni del CNRS (Programma ATIP), della Ville de Paris e dell'Agence Nationale de la Recherche (2011 BSV3 025 02), della Fondation pour la Recherche Médicale (FRM INE20041102865, FRM DEQ20130326518 inclusa una borsa di dottorato per FMA) a FN, e dell'Agence Nationale de Recherche sur le SIDA et les hépatites virales" (ANRS) inclusa una borsa di dottorato per JM.
| Globuli rossi anti-pecora IgG | MP Biomedicals | 55806 | |
| Frazione di shock termico dell'albumina sierica bovina, pH 7, ≥ 98% | Sigma | A7906 | |
| Sollevatore di celle | Corning | 3008 | |
| Cuvette da 4 mm | Progetto cella | EP104 | |
| DPBS, senza calcio, senza magnesio | Thermo Fischer Scientific | 14190-094 | |
| Kit elettrotampone | a temperatura ambienteProgetto cella | EB110 | |
| Piatto per coltura cellulare trattato TC da 100 mm Corning | 353003 | ||
| Gene X-cell pulser | Biorad | 165-2661 | |
| Soluzione di gentamicina | Sigma | G1397 | |
| Piatti con fondo in vetro 35 mm non rivestiti 1.5 | MatTek corporation | P35G-1.5-14-C Custodia | |
| iMIC | TILL Photonics | Obiettivo a immersione in olio (N 100X, NA1.49), camera di riscaldamento con CO2, una fotocamera per il rilevamento di fotoni singoli EMCCD (Electron Dispositivo ad accoppiamento di carica moltiplicatrice) e una soluzione | |
| poli-L-lisina | per lenti 1,5X 0,1%Sigma | P8920-100ml | Diluizione allo 0,01% in acqua |
| RPMI 1640 medio GLUTAMAX Integratore | Life technologies | 61870-010 | |
| RPMI 1640 medio, senza rosso fenolo (10 x 500 ml) | Life technologies | 11835-105 | Caldo in 37 gradi. C bagnomaria prima dell'uso |
| Globuli rossi di pecora (SRBC) | Eurobio | DSGMTN00-0Q | Conservato in tampone Alsever a 4 gradi C prima dell'uso |