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Ci sono prove crescenti che suggeriscono l'importante ruolo dell'infiammazione e, di conseguenza, dei macrofagi nello sviluppo e nella progressione della malattia renale. I macrofagi sono cellule eterogenee che sono state implicate nel danno renale. I macrofagi possono essere classificati in due diversi fenotipi: macrofagi classicamente attivati (macrofagi M1), che rilasciano citochine pro-infiammatorie e promuovono la fibrosi; e macrofagi attivati in alternativa (macrofagi M2) che sono associati a funzioni immunoregolatorie e di rimodellamento tissutale. Questi fenotipi macrofagici devono essere discriminati e analizzati per determinare il loro contributo al danno renale. Tuttavia, ci sono scarsi studi che riportano informazioni fenotipiche e funzionali coerenti sui sottotipi di macrofagi nei modelli di malattia renale infiammatoria, specialmente nei ratti. Questo fatto può essere correlato ai limitati marcatori macrofagici utilizzati nei ratti, contrariamente ai topi. Pertanto, sono necessarie nuove strategie per quantificare e caratterizzare il contenuto renale di queste cellule infiltranti in modo affidabile. Questo manoscritto descrive in dettaglio un protocollo per la digestione renale e un'ulteriore analisi fenotipica e quantitativa dei macrofagi dai reni di ratto mediante citometria a flusso. In breve, i reni sono stati incubati con collagenasi e i macrofagi totali sono stati identificati in base alla doppia presenza di CD45 (antigene comune dei leucociti) e CD68 (marcatore dei macrofagi PAN) nelle cellule vive. A ciò è seguita la colorazione superficiale di CD86 (marcatore M1) e CD163 (marcatore M2). I macrofagi peritoneali di ratto sono stati utilizzati come controllo positivo per il rilevamento dei marcatori macrofagici mediante citometria a flusso. Il nostro protocollo ha portato a una bassa mortalità cellulare e ha permesso la caratterizzazione di diversi marcatori proteici intracellulari e di superficie, limitando così la perdita di integrità cellulare osservata in altri protocolli. Inoltre, questa procedura consente l'uso di macrofagi per ulteriori tecniche, tra cui lo smistamento cellulare e gli studi di espressione di mRNA o proteine, tra gli altri.