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Articolo metodologico

Tridimensionale Super Resolution Microscopia di filamenti di F-actina da interferometrico fotoattivati ​​localizzazione Microscopy (iPALM)

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DOI:

10.3791/54774

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1 dicembre 2016

 , 

In questo articolo

Sommario

Presentiamo un protocollo di applicazione del interferometrica fotoattivati ​​localizzazione Microscopy (iPALM), un metodo di risoluzione di microscopia eccellente 3-dimensional localizzazione singola molecola, per l'imaging del citoscheletro actina in cellule di mammifero aderenti. Questo approccio permette la visualizzazione basata sulla luce delle caratteristiche strutturali nanoscala che altrimenti rimarrebbero irrisolti da convenzionale microscopia ottica di diffrazione limitata.

Abstract

Microscopia a fluorescenza permette la visualizzazione diretta di biomolecole specifici all'interno delle cellule. Tuttavia, per microscopia a fluorescenza convenzionale, la risoluzione spaziale è limitata dalla diffrazione a ~ 200 nm entro il piano dell'immagine e> 500 nm lungo l'asse ottico. Come risultato, la microscopia a fluorescenza è stata a lungo fortemente limitato nell'osservazione delle caratteristiche ultrastrutturali all'interno delle cellule. Il recente sviluppo di metodi di microscopia Super Resolution ha superato questa limitazione. In particolare, l'avvento di fluorofori photoswitchable permette al microscopio di risoluzione super di localizzazione basati, che fornisce potere di risoluzione si avvicina alla scala molecolare di lunghezza. Qui, descriviamo l'applicazione di un metodo di risoluzione di microscopia eccellente tridimensionale sulla base di singola molecola di localizzazione, microscopia ed interferometria multifase, chiamato interferometrica fotoattivati ​​localizzazione Microscopy (iPALM). Questo metodo fornisce una risoluzione quasi isotropa sulladell'ordine di 20 nm nelle tre dimensioni. Protocolli per la visualizzazione del citoscheletro actina filamentosa, compresa la preparazione del campione e il funzionamento dello strumento iPALM, sono descritte qui. Questi protocolli sono facilmente adattabili e istruttivo per lo studio di altre caratteristiche ultrastrutturali nelle cellule.

Introduzione

La visualizzazione delle strutture cellulari complesse è stata a lungo parte integrante di dati biologici e la scoperta. Sebbene microscopia a fluorescenza può celle di immagine con alta specificità molecolare, il suo potere di risoluzione è limitata dalla diffrazione a ~ 200 nm nel piano immagine (x, y, o dimensione laterale) e> 500 nm lungo l'asse ottico (z, o dimensione assiale) 1,2. Pertanto, l'osservazione delle caratteristiche ultrastrutturali è stato storicamente limitato a microscopia elettronica (EM). Fortunatamente, il recente sviluppo della microscopia super-risoluzione ha aggirato questo limite, consentendo la risoluzione spaziale nel 1....

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Protocollo

1. Imaging Preparazione dei campioni

  1. Dal momento che i segnali fluorescenza di fondo interferiscono con fluorescenza dalle etichette fluoroforo, pulire i vetrini dal primo risciacquo in acqua deionizzata (DDH 2 O) e quindi aria di essiccazione utilizzando aria compressa. Successivamente, eseguire attacco in plasma e un detersivo plasma per 15 secondi, o più, se necessario.
  2. Per abilitare la correzione della deriva e la calibrazione iPALM, usare # 1.5 rotondo (diametro 22 mm) vetrini pre-puliti integrati con nanoparticelle fluorescenti come punti di riferimento, che servono fiducials come altamente fotostabili per la calibrazione affidab....

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Risultati

requisiti critici per iPALM sono l'allineamento, la registrazione e la calibrazione dei sistemi ottici. Queste sono necessarie per garantire una corretta interferenza all'interno del 3-way beam splitter requisito per l'estrazione coordinata z. Per attivare il monitoraggio continuo, costante punto di fonti di fluorescenza sono necessari. Ciò può essere ottenuto mediante fluorescenza Au o nanoparticelle bimetalliche 23 la cui fotoluminescenza derivare da localizzata .......

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Discussione

Il sistema ottico di iPALM si basa su un disegno obiettivo 4 π dual-opposti, come illustrato nella Figura 1A. La configurazione è costruito utilizzando parti sia custom-lavorati e commerciali opto-meccanici, come descritto in precedenza 23 ed elencati nella tabella 1. In aggiunta al nostro setup, l'Howard Hughes Medical Institute (HHMI) ospita un sistema che è accessibile alla comunità scientifica presso l'Advanced Imaging Center presso il Campus Jane.......

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Dichiarazioni

Gli autori non hanno nulla da rivelare.

Ringraziamenti

YW e PK ringraziano sostegno finanziario della Fondazione Nazionale delle Ricerche di Singapore, assegnato a PK (NRF-NRFF-2011-04 e NRF2012NRF-CRP001-084). Ringraziamo anche il laboratorio e il nucleo di microscopia aperte strutture MBI per il supporto delle infrastrutture.

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Materiali

Elenco dei materiali utilizzati in questo articolo
NomeAziendaNumero di catalogoCommenti
tavolo otticoNewport, CARS4000iPALM, installato su 4 Newport Stabilizer isolatori di vibrazioni isolatore
di vibrazioni per tavolo otticoNewport, CAS-2000
laser-642Newport, CA1185055potenza di uscita = 100 mw
laser-561Newport, CA1168931potenza di uscita = 200 mw
laser-488Newport, CA1137970potenza di uscita=200 mw
laser-405Newport, CA1142279potenza di uscita=100 mw
di specchi dielettrici a banda largaThorlabs, NJBB1-E02combinatore laser
dicroico beamsplitterSemrock, NYLM01-427-25
filtro sintonizzabile acusto-otticoAA Opto-Electronic, FranceAOTFnC-VIS-TN
Linear polarizzatoreNewport, CA05LP-VIS-B
piastra di baseofficina localespecchio
(22,5 gradi)Reynard Corpporation, CAmotorizzati aspecchio personalizzati da 22,5 gradi
New Focus, CA8816
stadio di traslazione XYZ motorizzatoThorlabs, NJMT3/M-Z6portacampioni
T-Cube DC servomotore controller Thorlabs, NJTDC001
Piezo Phase ShifterPhysik Instrumente, GermaniaS-303.CD
obiettivoNikon, GiapponeMRD01691obiettivo. Apo TIRF 60X/1.49
stadio di traslazioneNew Focus, CA9062-COM-M
Pico Motor ActuatorNew Focus, CA8301
rotante solenoide/otturatoreDACO Instruments, CT5423-458
divisore di fascio a 3 vieRocky Mountain Instruments, CObeamsplitterpersonalizzato
Piezo Z/Tip/Tilt scannerPhysik Instrumente, GermaniaS-316.10
allineatore di inclinazione motorizzato a cinque assiNew Focus, CA8081
Picmotor controller ethernetNew Focus, CA8752
Piezo controller/amplificatore/modulo di funzionamento digitalePhysik Instrumente, GermaniaE-509/E-503/E-517
filtro passa-bandaSemrock, NYFF01-523/20filtri
filtro passa-bandaSemrock, NYFF01-588/21
filtro passa-bandaSemrock, NYFF01-607/30
filtro passa-bandaSemrock, NYFF01-676/37
filtro notchSemrock, NYNF01-405/488/561/635
ruota portafiltri motorizzata con controllterThorlabs, NJFW103H
EMCCDAndor, Regno UnitoDU-897U-CSO-#BV3 set
di computer desktop per il controllo delle telecamere e la sincronizzazioneDellPrecision T3500PC, 4 set
di vetrini coprioggetti con fiducialHestzig, VA600-100AuFpreparazione del campione. segni fiduciali con varie densità e spettri disponibili
fibronectinaMillipore, MTFC010
paraformaldeideElettrone Scienze della microscopia, fissazione PA15710. 16%
glutaraldeideMicroscopia elettronica Sciences, PA1622025%
triton X-100Sigma aldrich, MOT8787
cellule HUVECLife Technologies, CAC-015-10C
Medium 200Life Technologies, CAM-200-500
Fattoriendoteliali dei grandi vasiLife Technologies, CAA14608-01
salinadi
pennicillina/streptomicina15140122
tripsina/EDTALife Technologies, CA25200056
PIPESSigma aldrich, MOP1851PHEM
HEPES1a base, MalesiaBIO-1825
EGTASigma aldrich, MOE3889
MgCl2Millipore, MT5985
Alexa Fluor 647 PhalloidinInvitrogen, CAA22287colorazione
boroidruro di sodio (NaBH4)Sigma aldrich, MO480886estinzione
glucosio1a base, MalesiaBIO-1101tampone di imaging
glucosio ossidasiSigma aldrich, MOG2133
catalasiSigma aldrich, MOC9322
cisteaminaSigma aldrich, MO30070
EpoxyThorlabs, NJG14250
vaselinaSigma aldrich, MO16415lanolina sigillante per campioni
Sigma aldrich, MOL7387
cera parapinnaSigma aldrich, MO327204
Olio da immersioneMicroscopia elettronica Sciences, PA16915-04imaging. Cargille Tipo HF
girevole personalizzato supporti ottici ad olio Soluzione tamponata con fosfato Dulbecco 14190367 del

Riferimenti

  1. Kanchanawong, P., Waterman, C. M. Localization-based super-resolution imaging of cellular structures. Methods Mol Biol. 1046, 59-84 (2013).
  2. Bertocchi, C., Goh, W. I., Zhang, Z., Kanchanawong, P. Nanoscale imaging by super reso....

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