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Research Article
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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
Qui, vi presentiamo un protocollo per preparare e visualizzare le strutture secondarie (ad esempio, le fibre, le architetture toroidali, e nano-sfere) derivati da policarbodiimidi elicoidali. La morfologia caratterizzata da microscopia a forza atomica (AFM) e microscopia elettronica a scansione (SEM) è stato mostrato dipendere struttura molecolare, concentrazione, ed il solvente di scelta.
Metodo facile per la preparazione di strutture secondarie policarbodiimide-based (ad esempio, nano-ring ", crateri," fibre, avvolto fibre, reti fibrose, nastri, aggregati vermiformi, strutture toroidali e particelle sferiche) è descritto. Questi aggregati sono morfologicamente influenzati da ampi interazioni idrofobiche catena laterale catena laterale dei fili policarbodiimmide singolari, come dedotto mediante microscopia a forza atomica (AFM) e tecniche di microscopia elettronica a scansione (SEM). Polycarbodiimide- copolimeri g -polystyrene (PS-PCD) sono stati preparati da una combinazione di metodi di sintesi, tra cui la polimerizzazione coordinamento-inserimento, rame (I) -catalyzed azide cicloaddizione alkyne (CuAAC) "click" la chimica, e il trasferimento atomo di polimerizzazione radicale (ATRP ). PS-PCD sono stati trovati per formare architetture toroidali specifici a basse concentrazioni in CHCl 3. Per determinare l'influenza di un mezzo solvente più polare (cioè,
L'elica è un motivo chirale onnipresente osservato in natura. sistemi biologici complessi e loro componenti, come le proteine, polipeptidi, e DNA, tutte utilizzano la struttura elicoidale come mezzo per svolgere compiti complessi per applicazioni come immagazzinamento di informazioni, supporto trasporto molecolare tessuti e trasformazioni chimiche localizzate.
Elicoidali macromolecole polimeriche 1 sono un bersaglio per la progettazione di materiali funzionali e compositi possiedono interessanti proprietà che hanno permesso loro utilizzo pratico in molte zone 2, 3, 4, 5. Finora, numerosi t ponteggi elicoidali 6, 7, 8, 9, e anche loro motivi di struttura secondaria, sono stati sfruttati successoo conseguire risultati promettenti, sia nel campo dell'ingegneria fisica 10, 11, 12 e in applicazioni biologiche 13, 14. Gli studi attuali rappresentano una logica estensione delle nostre precedenti sforzi per sintetizzare otticamente policarbodiimidi alchini attivi recanti una o due porzioni alchini modificabili per unità di ripetizione 15, 16, 17.
Recentemente, abbiamo riportato 22 la omo e copolimerizzazione di monomeri carbodiimmide che portano a macromolecole elicoidali chirali - una famiglia di (R) - e (S) -polycarbodiimides con gruppi pendenti modificabili che offrono ulteriore funzionalizzazione attraverso un CuAAC "click" protocollo. policarbodiimmidi Br-terminato ottenuti dai rispettivi precursori etinil erano shown di agire come macroinitiators ATRP a innesto -polymerization con stirene 23.
L'obiettivo specifico di questo manoscritto è quello di fornire una guida pratica per caratterizzazioni morfologiche (misure AFM e di ispezione SEM) delle strutture secondarie formate da PS-PCD sintetizzati dai loro precursori etinil corrispondenti utilizzando un noto protocollo di scatto 21. In particolare, dettagli sperimentali, come il solvente preferito, la temperatura, il metodo di deposizione, il substrato scelto per la deposizione e la struttura polimerica, hanno dimostrato di essere molto importante per ottenere morfologie specifici (ad esempio, fibre, tra destra e sensi mancino elicoidali; nano-sfere, e nano-ring). Essi possono anche essere utili per lo sviluppo di materiali con proprietà sintonizzabili basato su policarbodiimmidi con architettura chirale controllata con precisione.
NOTA: Tutte le reazioni sono state eseguite in un vano portaoggetti (o cappa aspirante, quando ha notato) con fiale di scintillazione standard.
1. Sintesi della (R) - e (S) -serie di Ethynylpolycarbodiimides
2. Sintesi della (R) - e il protocollo (S) -serie di triazolo policarbodiimidi sotto un "click"
3. Sintesi del (R) - E (S) -serie di Polycarbodiimide- g -polystyrene copolimeri
Figura 1 (pannello superiore) illustra BINOL (R) - o (S) -titanio (IV) polimerizzazione coordinamento-inserimento catalizzatore mediata porta alla (R) - e (S) -serie di ethynylpolycarbodiimides con un rapporto alterazione della ripetizione unità (ossia, aril- e alchino arilici). Monomeri e catalizzatori sono stati ottenuti come descritto altrove 18. Entrambi (R) - e (S) -Family copolimeri random alchini sono stati selezionati per il "click" -coupling con N - (3-azidopropyl) ammide -2-bromo-2-metilpropano 22. Il pannello inferiore mostra la sintesi dei policarbodiimmidi triazolo utilizzati come macroinitiators nella reazione ATRP produrre polycarbodiimide- g -polystyrenes (PS-PCD) 22, 23.
Figura 2 illustrates un modello del backbone policarbodiimmide, raffigurata come una filatura spirale rosa attorno all'asse gialla. Brown e sostituenti verdi formano un motivo elicoidale "secondario" rispetto al rosa catena principale amidine. Macromolecole possono auto-assemblano in un film sottile in modo da formare una grande varietà di architetture supramolecolari complessi, come le fibre, fibre loop, superhelices, reti fibrose, nastri, aggregati vermiformi, strutture toroidali, e crateri. Un modello molecolare del macroinitiator triazolo La Figura 3 (segmento 35-mer di una catena polimerica con terminali atomi Br rappresentati in rosso).
Le figure 4 e 5 mostrano le immagini rappresentative AFM di PCD alchini, confermando la formazione di morfologie come fibra e le rispettive dimensioni diametro (ad esempio, la Figura 5: ~ 76 nm (pannello b), 38-60 nm (pannello c), 30 -40 nm (pannello e), e ~ 12-20 nm (riquadroLF)). In generale, le soluzioni madre diluizione determinato diminuendo la dimensione delle morfologie aggregati formati (ad esempio, "spessore" reti in fibra simile a concentrazioni relativamente elevate tendono a trasformare in fibre sottili separate sulla diluizione).
Anche mostrato sono le morfologie formate da polycarbodiimide- g -polystyrenes spin-rivestito da CHCl 3 stock (Figura 6). A differenza di comportamenti di aggregazione policarbodiimide alchini in CHCl 3, esaminando PS-PCD rivelato entrambi i gruppi cratere-like e nano-dimensioni architetture toroidali come motivi predominanti. La formazione riproducibile di quei morfologie è pensato per essere guidato da variazioni di concentrazione.
Le figure 7 e 8 illustrano due immagini rappresentative AFM di polycarbodiimide- g -polystyrenes indicativa della formazione di DISCRete nanosfere quando si applica una THF o binario THF / EtOH (25%, v) sistema solvente per la deposizione campione con granulometrie concentrazione-dipendente. Figura 8 mostra il montaggio dei singoli macromolecole in sferiche nano-particelle di ~ 84 nm a dimensione corrispondente fino morfologie strettamente SEM-misurati (~ 100 nm, panel e). Sorprendentemente, gli aggregati maggiore micron dimensioni indicate nella pubblicità pannelli possono essere costituiti da singoli nano-particelle agglomerate insieme.

Figura 1. Sintesi di policarbodiimidi alchini e la loro "innesto da" trasformazione a PS-PCD. (R) - e (S) -serie di ethynylpolycarbodiimides sono stati generati alterando il rapporto di precursori carbodiimmide (vale a dire, N -phenyl- monomero -hexylcarbodiimide N '(pH) e N - (3-ethynylphenyl) --hexylcarbodiimide N '(ET)), con composizioni di ripetizione variabili nel range: 0: 100 (100-Ph), 15:85 (15-ET-85-Ph), 30:70 (30-ET-70- Ph), 50:50 (50-ET-50-Ph), 70:30 (70-ET-30-Ph), 85:15 (85-ET-15-Ph), e 100: 0 (100-ET ). Il protocollo "click" è stato utilizzato per sintetizzare i loro derivati triazolici, che sono stati ulteriormente impiegati come macroinitiators Br-terminati per la reazione ATRP con stirene (50 o 100 eq.) In modo da formare polycarbodiimide- g -polystyrenes. Ristampato con il permesso 22. Clicca qui per vedere una versione più grande di questa figura.

Figura 2. Rappresentazione schematicadi policarbodiimidi auto-assemblaggio in motivi fibrillari. I pannelli mostrano le strutture rappresentative macromolecola elicoidale e di auto-assemblaggio di singoli macromolecole in modo da formare in bundle identificabili mediante l'analisi AFM. Ristampato con il permesso 22. Clicca qui per vedere una versione più grande di questa figura.

Figura 3. Modello molecolare di policarbodiimide triazolo. La struttura policarbodiimide triazoli mostra il motivo elicoidale introdotto da orientamenti specifici delle catene laterali Br-terminati. codici colore Atom: carbonio (verde), azoto (blu), ossigeno (rosso), e bromo (rosso). Clicca qui per visualizzare questo video. (Tasto destro del mouseScaricare.)

Figura 4. La prova per la formazione di fibre alkyne policarbodiimide da AFM. aggregati fibrosi sembrava essere una tendenza comune per tutti i compositi alchini. Micrografie AFM Rappresentante sono presi per (S) -85-ET-15-Ph-PCD (pannelli ac) e (S) -100-ET-PCD (pannelli d-f) polimeri depositati da CHCl 3. Ristampato con il permesso 22. Clicca qui per vedere una versione più grande di questa figura.

Figura 5. Controllo della dimensione / spessore delle fibre attraverso la variazione di concentrazione. aggregati fibrosi vengono generati from (S) -100-ET-PCD a diverse concentrazioni: 5,0 mg / mL (pannello a); 2,5 mg / ml (pannello B); 1,25 mg / mL (pannello c); 0,625 mg / mL (pannello d); 0,313 mg / mL (pannello e); e 0,156 mg / ml (pannello f), depositato da CHCl 3. formato di scansione = 5.0 x 5.0 micron. Clicca qui per vedere una versione più grande di questa figura.

Figura 6. Lo sviluppo di modelli di nano-ring PS-PCD nel film sottile. Serie concentrazione rappresentante per (R) -30-TRZ-70-Ph-STYR (1: 100) -PCD polimero: 10,0 mg / mL (pannello a); 5.0 mg / mL (pannello B); 2,5 mg / mL (pannello c); 1,25 mg / mL (pannello d); 0.625 mg / mL (pannello e); 0,313 mg / mL (pannello F); e 0,156 mg / mL (pannelli g ed h). formato di scansione = 5.0 x 5.0 micron. Ristampato con il permesso 23. Clicca qui per vedere una versione più grande di questa figura.

Figura 7. Polycarbodiimide- g -polystyrene nano-particelle assemblate nel film sottile. Altezza e fase rappresentativi diagrammi per (S) -50-TRZ-50-Ph-STYR (1:50) -PCD polimero in solventi diversi: THF (pannelli a, b) e sistema binario THF / EtOH (pannelli c, d) . È importante sottolineare che, aggiungendo PS-segmenti per la spina dorsale policarbodiimide ha un effetto notevole sulle proprietà autoassemblanti; pertanto, macromolecole tendono ad aggregarsi in "cassaRS "e nano-ring piuttosto che fibre, un motivo predominante trovato per tutti i PCD alchini. Ristampato con il permesso 23. Cliccate qui per vedere una versione più grande di questa figura.

Figura 8. Rappresentazione schematica di polycarbodiimide- g -polystyrene nano-sfere come evidenziato dal SEM-analisi. I singoli nano-particelle (pannello E) e grandi aggregati (ad pannelli assemblati) da (S) -70-TRZ-30-Ph-STYR (1: 100) e -PCD (R) -50-TRZ-50-Ph- STYR (1: 100) polimeri -PCD rispettivamente. Proposto modello di auto-assemblaggio per le singole macromolecole g -polystyrene polycarbodiimide- con backbone policarbodiimide rigide (verde-giallo) dispersi nell'ambiente e formate dacatene di polistirene laterali (azzurro). Ristampato con il permesso 23. Clicca qui per vedere una versione più grande di questa figura.
Gli autori non hanno nulla da rivelare.
Qui, vi presentiamo un protocollo per preparare e visualizzare le strutture secondarie (ad esempio, le fibre, le architetture toroidali, e nano-sfere) derivati da policarbodiimidi elicoidali. La morfologia caratterizzata da microscopia a forza atomica (AFM) e microscopia elettronica a scansione (SEM) è stato mostrato dipendere struttura molecolare, concentrazione, ed il solvente di scelta.
Si ringrazia la concessione NSF-MRI (CHE-1.126.177) utilizzata per l'acquisto dello strumento Bruker Advance III 500 NMR.
| stirene | Sigma-Aldrich | S4972-1L | reagente |
| N,N,N′,N′ ′,N′ ′ - Pentametildietilentriammina (PMDETA) | Reagente Sigma-Aldrich | 369497-250ML | |
| Ioduro di rame(I) | Reagente | Sigma-Aldrich | 215554-5G |
| Cloruro di rame(I) | Alfa-Aesar | 14644, reagente 5G | |
| 1,8-Diazabiciclo[5.4.0]undec-7-ene (DBU) | Reagente Sigma-Aldrich | 139009-100G | |
| N,N- dimetilformammide (DMF) | Solvente Sigma-Aldrich | 227056-100mL | |
| Tetraidrofurano (THF) | Acros-Organics | B0320346 | solvente |
| Cloroformio | Solvente Sigma-Aldrich | 372978-100mL | |
| Metanolo | Fisher-Chemical | A411-20 | solvente |
| 20 mL fiale di vetro a scintillazione | Cole-Palmer | UX-08918-03 | vetreria |
| Fiale da 1 Dram (15 x 45 mm) | Kimble-Chase | KIM-60965D-1 | filtro |
| per siringa da 13 mm in vetreria con 0,45 &; micro; m Membrana in PTFE | VWR International | 28145-493 | Filtro a membrana |
| Dischi wafer in silicone (25,4 & 0,5 mm) | Wafer World, Inc | S076453 | Substrato AFM |
| Agitatore per corning/piastra riscaldante | Piastra riscaldante | PC-420 | dispositivo di riscaldamento |
| monostadio Unilab mBraun scatola a guanti Unilab | 12-109 | ||
| Nanoscope IV-Multimode Veeco AFM-macchina | Veeco | 3100 Dimensione V Microscopio a sonda atomica Strumento | AFM |