È ormai noto che i linfociti T svolgono un ruolo critico nello sviluppo di diverse malattie cardiovascolari1,2,3,4,5. Ad esempio, gli studi del nostro gruppo hanno dimostrato che l'ipertensione è associata a un eccessivo accumulo di cellule T nei vasi e nei reni durante lo sviluppo dell'ipertensione sperimentale6. Una volta in questi tessuti, le cellule T producono diverse citochine che influenzano sia la funzione vascolare che quella renale, portando a vasocostrizione e ritenzione di sodio e acqua1,2. Per comprendere appieno come le cellule T causano malattie cardiovascolari e renali, è importante essere in grado di identificare e quantificare i sottogruppi specifici di cellule T presenti in questi tessuti. I sottogruppi di cellule T sono definiti da una combinazione di marcatori di superficie, le citochine che secernono e i fattori di trascrizione che esprimono. La complessità della popolazione di cellule T rende la citometria a flusso e la colorazione intracellulare una tecnica inestimabile per sezionare i fenotipi dei linfociti presenti nei tessuti. Qui, forniamo un protocollo dettagliato per identificare i marcatori di superficie e intracellulari (citochine e fattori di trascrizione) nelle cellule T isolate da rene murino, aorta e linfonodi drenanti dell'aorta in un modello di ipertensione indotta da angiotensina II. Vengono descritte in dettaglio le seguenti fasi: isolamento dei tessuti, generazione delle sospensioni di singole cellule, stimolazione ex vivo, fissazione, permeabilizzazione e colorazione. Inoltre, vengono discussi diversi principi fondamentali delle analisi citofluorimetriche, tra cui la scelta dei controlli appropriati e le strategie di gating appropriate.