Questa analisi di verde malachite con pT è stata usata per misurare l'attività di PP2Ac perché è più facile da eseguire rispetto al metodo classico che utilizza 32P-etichettati substrati. Un altro vantaggio di questo test su saggi radioattivi è che radioisotopi comportano qualche rischio e possono essere costosi, soprattutto 32P-etichettati molecole che hanno emivita breve, che limita il numero di test si può eseguire prima che scadano i reagenti. Utilizzando verde malachite anziché radioattività Elimina anche la necessità di disporre di 32P rifiuti. Saggi di verde malachite sono anche molto sensibili quando si misura l'attività della fosfatasi della serina/treonina rispetto ad un altro saggio colorimetrico che utilizza il substrato p-nitrophenylphosphate (pNPP), che è non-selettivi, come può essere defosforilata da un vasto numero di enzimi32.
Verde malachite commerciale kit per misurare l'attività di PP2A sono stati disponibili per un certo tempo e in precedenza erano utilizzate in laboratorio. Tuttavia, quando si fa molti saggi di verde malachite, tale kit è diventato proibitivo. Inoltre, kit commerciali per attività di PP2A è stabile solo per un anno, mentre avendo reagenti disponibili in polvere forma e con una corretta conservazione, forniscono componenti di analisi prontamente disponibili che sono strutturalmente stabili per lunghi periodi di tempo.
Prima del test bSyn e gSyn, aSyn è stato utilizzato come controllo positivo per stimolare l'attività PP2Ac e per determinare la quantità di PP2Ac necessaria per le analisi e anche per confermare che i dati risultanti rimangono sulla scala con la curva standard (150-2400 pmol di PO4 ). È interessante nota che se aSyn stimola PP2Ac troppo fortemente, anche se la reazione è in genere lineare, dati andrà fuori scala e prodotti chimici nella soluzione MGT precipitano, rendendo impossibile per misurare gli importi precisi di rilasciato gratis-PO4 con una piastra lettore.
Dato che contribuisce aSyn PP2Ac attività in vivo e in vitro12,19,21,23,25, e che tutte le synucleins hanno una notevole omologia, era stato supposto che tutti i membri della famiglia synuclein possono essere in grado di stimolare PP2Ac nelle analisi gratuita delle cellule. Utilizzando il saggio colorimetrico descritto qui, è stato trovato che, infatti, tutti i tre synucleins ricombinante (aSyn, bSyn, gSyn) ha stimolato attività PP2Ac, sollevando la possibilità che tutti i tre synucleins possono svolgere funzioni simili nel sistema nervoso. Tuttavia, del cervello dal morbo di Parkinson o demenza con corpi di Lewy casi hanno meno attività PP2Ac in tessuti che contengono altamente aggregate aSyn23. Tessuti di topo che harboring Lewy corpo-come patologia presentano anche ridotto PP2Ac attività25. Questo, e nuovi dati nella Figura 3 nonché dati precedente da aSyn KO topi12, suggeriscono fortemente che né bSyn né gSyn in genere può compensare la perdita di aSyn solubile nel cervello, o in alternativa che quelli omologhi synuclein potrebbero non associare a PP2Ac fortemente quanto aSyn come mostrato (Figura 3). L'Atlante del cervello di Allen Mostra colocalizzazione di tutti tre synuclein mRNAs in molte aree del cervello, e però topi knockout synuclein triple sono stati generati9,33, PP2Ac attività non è stata valutata in quel modello. Interessante, aSyn che è fosforilata su Ser129 di Polo-like chinasi 2, è meno in grado di attivare PP2Ac12, ma prova qui indicata per bSyn suggeriscono che la fosforilazione bSyn è improbabile che impatto attività PP2Ac, come bSyn molto poco è venuto giù con PP2Ac nel cervello del topo (Figura 3). Presi insieme, i dati suggeriscono che i modulatori endogeni di attività PP2Ac, come aSyn, probabile contribuiscano al benessere e alla malattia.
Il protocollo descritto qui è una semplice ma potente tecnica per determinare la capacità di PP2Ac a dephosphorylate un substrato phosphopeptide in risposta ai vari trattamenti. Per esempio, questa stessa metodologia può essere utilizzata per testare altri attivatori PP2Ac, come i ceramidi, nonché potenziali approcci terapeutici34, o per valutare l'impatto di PP2Ac inibitori in vitro. È anche importante sottolineare che simili analisi possono misurare l'attività di PP2Ac che è stato isolato dai 1 6 immunoprecipitazione da estratti di cellule o tessuti del corpo, come precedentemente descritti da autori12,19, 25. esistono applicazioni di futuro per il dosaggio di verde malachite oltre misura PP2Ac attività, come attività di ATP può anche essere determinata usando un'analisi di tali.
Si noti che una curva standard deve essere generata ogni volta per ogni dosaggio PP2Ac indipendente. È obbligatorio per assicurare che tutti i reagenti utilizzati sono fosfati, come fosfati gratis artificialmente aumentano il segnale di fondo e producono risultati errati. Il giorno del test è essenziale per preparare la soluzione MGT abbastanza fresco per tutti i campioni da saggiare. Inoltre, MGT è buono solo il giorno in cui è fatto e tende a precipitare dopo poche ore. PP2Ac acquistato da un fornitore deve essere aliquotato e conservati congelati subito dopo viene ricevuto per evitare cicli di scongelamento freeze che riducono la sua attività. Come altri fosfatasi possono dephosphorylate pT substrato (ad es. PP1 e PP535), quando si analizzano gli estratti delle cellule o del tessuto in cui PP2Ac non è stato isolato mediante immunoprecipitazione, campioni devono essere passati sopra le colonne per rimuovere i fosfati gratis e specifici inibitori delle fosfatasi devono essere utilizzati per confermare la specificità della fosfatasi, come descritto in precedenza18.