Tutti i punti in questo protocollo conformi alle linee guida uso animale Mayo Clinic (Rochester, MN).
1. allevamento di volare
- Vola di rilancio e insieme traverse secondo standard allevamento29.
Nota: Espressione di reporter fluorescente dal sistema GAL4/UAS è proporzionale alla temperatura e quindi allevamento temperatura può essere regolata per modificare il livello di espressione. Mentre i livelli di espressione alta conducono spesso ad un migliore rapporto segnale-rumore questa circostanza inoltre è associata con aumentati citosolici e organellari aggregati quando usando GFP per fusione proteina fluorescente rosso (RFP) costruisce come Bud10, 30,31. Se l'aggregazione è inevitabile, la quantificazione è ancora possibile eseguendo punto calibrazioni in ogni esperimento e normalizzare i dati tale che un rapporto di fluorescenza di 1.0 corrisponde al pHho 7.0 (vedere il punto 7.4 Nota sulla calibrazione qui sotto).
- Insieme traverse di omozigoti Carosso-GAL432 maschi omozigoti UAS-Bud10 femmine vergini e omozigotica c724-GAL42 maschi per le femmine omozigoti Vergine di UAS-Bud per consentire la formazione immagine del pH in cellule principali e le cellule stellate della MT, rispettivamente. Posto 6 UAS-Bud femmine con 3 maschi GAL4 nei flaconi di freschi di cibo e lasciare ad accoppiarsi a 28 ° C.
Nota: Le larve devono essere evidenti all'interno 4D e adulti inizierà a eclose intorno giorno 10.
- Raccogliere femminile mosche su eclosion e mettere da parte per età per 10 d a 28 ° C.
Nota: I tempi di sperimentazione possono essere regolato per corrispondere a qualsiasi analisi comportamentale restrittive (ad esempio il Ramsay secrezione dosaggio17,19) che saranno correlate a imaging pH intracellulare dal vivo. Mosche maschi possono essere utilizzati ma tubuli dalle femmine sono spesso più grandi e più robusto.
2. preparazione dei vetrini di poli-L-lisina.
- Disegnare un bordo di 40 x 20 mm con una penna PAP idrofobica intorno alla parte superiore di diapositive standard 75 x 25 mm e mettere da parte ad per asciugare per 15 min a RT. uso grandi coprioggetti se le diapositive non sono compatibili con ottica di imaging.
- Trasferire 2 mL di soluzione madre di poli-L-lisina (PLL) 0,01% in ogni diapositiva e mettere da parte per 1 h a TA.
- Rimuovere l'eccesso PLL con una pipetta. Salvare la soluzione in un flaconcino di 50 mL conica per un utilizzo futuro. Conservare a 4 ° C.
- Aspirare eventuali residui di soluzione con una linea del vuoto. Eseguire la linea del vuoto sopra la superficie intera diapositiva per garantire che nessuna soluzione rimanga sugli scivoli.
- Impostare le diapositive da parte per altre 1 h prima del RT uso. Archiviare le diapositive asciutto a temperatura ambiente per 1 mese in un libro di diapositiva standard.
3. preparazione della dissezione del piatto e bacchette di vetro
- Aggiungere 0,5 mL di agente indurente elastomero a 4,5 mL di elastomero base in polistirolo un 35 x 10 mm di Petri a RT per produrre una profondità di 5 mm. Mix con una pipetta monouso. Consentire l'elastomero curare O/N a TA.
Nota: Elastomero deve essere limpida e priva di bolle. Schiarimento di bolle può essere facilitato mantenendo lastre in elastomeri in un barattolo vuoto per 10-15 min dopo la colata.
- Tenere una bacchetta di vetro del diametro di 5 mm tra le mani e sciogliere il centro dell'asta sopra un bruciatore di Bunsen illuminato mentre tirando le estremità a pezzi. Come il vetro si scioglie tirare più rapidamente di produrre una sottile (0,1 mm) e albero conico (Figura 1).
Nota: Un angolo di 45 ° alla tibia è spesso utile nella gestione dei tubuli. Ciò può essere ottenuto abbassando una mano come la tibia è tirata (Vedi Figura 1).
- Rottura dell'albero sottile nel mezzo, con il lato smussato di una lama di rasoio taglio singolo in acciaio al carbonio. Ispezionare l'estremità sottile dell'asta in un ambito di dissezione per garantire che l'interruzione è pulito.

Figura 1: Fabbricazione di bacchette di vetro per la movimentazione di tubuli malpighiani.
A - E. Processo di riscaldamento e tirando una bacchetta di vetro per produrre una conicità e angolo adatto per la movimentazione MTS. frecce indicano la direzione e l'entità della forza da applicare. F. fotografia di uno strumento di vetro opportunamente fabbricato. Barra della scala = 10 mm. per favore clicca qui per visualizzare una versione più grande di questa figura.
4. preparazione di soluzioni e sistema di perfusione
Nota: Aspersione sistemi differiscono dal produttore. Questo protocollo è basato intorno un serbatoio aperto 8 canali gravità con un regolatore di flusso in ingresso e un deflusso di vuoto-driven, ma il metodo di montaggio che MTS come descritto qui può essere adattato per funzionare con qualsiasi sistema di perfusione.
-
Preparare le seguenti soluzioni:
- Di aliquotare Schneider mezzo (40 mL in fiale conica 50 mL) e conservare a 4 ° C.
- Preparare soluzioni (cioè insetto Phosphate-Buffered Saline (iPBS) e iPBS con NH4Cl) presso RT come necessario secondo la tabella 1). Soluzioni caldi a RT prima dell'uso il giorno dell'esperimento.
Nota: iPBS e iPBS con 40 mM NH4Cl può essere preparato in grandi volumi (1 L o più) e conservato a 4 ° C.
- Preparare 8 soluzioni di calibrazione in volumi di 500 mL a pH = 5.0, 6.0, 6.5, 7.0, 7.3, 7.6, 8.0 e 9.0, come indicato nella tabella 1 e conservare a 4 ° C. Regolare il pH di ogni soluzione mediante titolazione con N-metil-D-glucamine (NMDG) e HCl.
- Il giorno di esperimenti, caldo aliquote di 5 mL delle soluzioni di taratura a RT e aggiungere soluzione stock Nigericina (20 mM di solfossido dimetilico (DMSO)) per produrre una concentrazione finale di 10 µM.
Attenzione: Maneggiare Nigericina con i guanti. Trattare tutte le apparecchiature che viene a contatto con la Nigericina come USA e getta. Nigericina rimane sul vetro e plastica e comprometterà biologico preparazioni se attrezzature sono stata riutilizzata.
-
Sistema di perfusione:
- Preparare il sistema di perfusione compilando tutti i serbatoi con ddH2O (Figura 2). Aprire i canali uno alla volta per consentire prossimale per il regolatore di portata per riempire tutte le linee.
Nota: Potrebbe essere necessario deselezionare aria nelle linee aprendo il canale in fase di stallo e utilizzando un pistone per unità di flusso dal serbatoio.
- 2 canali aperti e consentire ddH2O di scarico. Una volta che i serbatoi sono quasi vuoti, riempire il serbatoio primo con iPBS e il secondo serbatoio con NH4iPBS Cl-pulsato. Impostare la portata al massimo con il regolatore di portata e lasciare che ogni soluzione di fluire per 1 min riempire le linee distale, quindi arrestare il flusso (Figura 2).
- Posizione 2 set di morsetti "helping hands" di saldatura sul palco microscopio imaging. Mettere un morsetto su ciascun lato della piattaforma imaging.
- Riscaldare con attenzione i distale 0,5 pollici di un pezzo di vetro capillare (diametro 1,5 mm, diametro esterno 0,86 mm, lunghezza 100 mm) sopra un bruciatore di Bunsen. Creare una curva a 45 ° consentendo l'estremità distale di piegare dalla forza di gravità e rimozione del vetro dalla fiamma una volta raggiunto l'angolo desiderato. Ripetere questo processo con un secondo pezzo di vetro capillare.
- Inserire i capillari di vetro curvato nella linea di flusso e deflusso vuoto-collegato rispettivamente e montarli in "helping hands" per allinearli con la tappa di formazione immagine del microscopio (Figura 3).

Figura 2: Sistema di perfusione e configurazione di Imaging.
Componenti necessari per la valutazione fisiologica della funzione di trasporto MT basolaterale tramite simultanea vivono scambio di soluzione di imaging e rapido di fluorescenza. Linee di gas indicati sono facoltativi e consentono l'espansione di esperimenti per la valutazione del trasporto HCO3– . Clicca qui per visualizzare una versione più grande di questa figura.

Figura 3: Schema di flusso dell'apparato di perfusione per NH4Cl Pulse esperimenti.
Le frecce rappresentano percorso di flusso e valvola punti di commutazione. Soluzione si trasferisce dal serbatoio a esemplare di flusso a gravità ed è attirata dalla camera di esemplare la beuta rifiuta di aspirazione di vuoto. Clicca qui per visualizzare una versione più grande di questa figura.
5. dissezione dei tubuli malpighiani anteriore adulto della drosofila .
- Raccogliere il piatto di dissezione e tirato una diapositiva rivestite con PLL dalla sezione 2, un divisore di aspersione-pozzo adesivo, grasso per vuoto, bacchetta di vetro dalla sezione 3, una striscia di 4 x 2" di film di sigillo, 2 paia di #5 fine, forcipe, le aliquote di 40 mL di medium RT iPBS e ghiacciata di Schneider.
- Spalmare grasso vuoto sul nastro sigillante e premere il divisore di aspersione-pozzo adesivo sul nastro per rivestire il fondo con grasso. Staccare l'adesivo divisore di aspersione-pozzo e posizionarlo grasso-side-down sulla cima di una diapositiva rivestita di PLL. Rimuovere il separatore di aspersione-pozzo per lasciare individuali di campione pozzi tracciate nel grasso idrorepellente.
- Posto 200 µ l di RT iPBS in grasso-accerchiato bene sulla diapositiva rivestita PLL e spostare il vetrino sotto lo stereoscopio.
- Posto UAS-Bud/carosso-GAL4 mosche in una Mosca vuota fiala e li anestetizzare il ghiaccio per 10 min.
Nota: Questo metodo di anestesia, a differenza di CO2, assicura che le mosche non disidratare.
- Versare mezzo ghiacciato di Schneider nel piatto per dissezione e utilizzare una pinzetta per trasferire una singola Mosca femmina anestetizzata nel piatto sotto uno stereoscopio per dissezione.
- Afferrare al volo il torace con un set di pinze e utilizzare l'altro per afferrare delicatamente la parte posteriore dell'addome. Aprite la parte posteriore al volo utilizzando le pinze in breve, movimenti intenzionali. Una volta visibile del hindgut, afferrare l'estremità distale e libera l'intestino e MTs dal tracheoles sottostante tirando il hindgut lontano dal corpo attraverso rimorchiatori ripetitivi, brevi.
Nota: Il MTs anteriore e posteriore sarà visibile dove si incontra la giunzione del midgut e del hindgut attraverso l'uretere. La prima coppia di MTs a essere libero arbitrio probabile essere tubuli posteriore come circondano il hindgut. Questi possono essere ignorati (Figura 4A).
- Pizzico fuori il MTs anteriore all'uretere con una pinzetta, una volta che la seconda serie di MTs è gratuita dell'addome. Consente di separare il MTs anteriore dall'intestino e chiudere l'uretere.
- Prelevamento gratuito MTs anteriore con la bacchetta di vetro tirato facendo scorrere l'asta sotto l'uretere tale che i tubuli si iscrivono su entrambi i lati. Consente di estrarre la soluzione MTs verso l'alto.
- Girare la bacchetta di vetro in modo che la MTs e dell'uretere sono aderiti alla parte inferiore dell'asta e abbassare l'uretere verso il basso nella diapositiva. Appone l'uretere e sigillare le estremità distali del MTs premendo l'uretere giù su vetrino (Figura 4B). Non manipolare il MTs più del necessario. La MTs dovrebbe essere galleggiavano nella soluzione con l'uretere ancorato alla diapositiva.
- Utilizzare la fine fine della bacchetta di vetro delicatamente spazzare ogni tubulo su tutta la superficie di scorrimento. Brace l'asta contro la diapositiva per evitare di schiacciare il tubulo e far scorrere l'asta sopra la parte superiore del tubulo, movimento distale prossimale, per attaccare l'intera lunghezza di ogni tubulo alla superficie della diapositiva rivestite con PLL (Figura 4).
- Posto il divisore di aspersione-pozzo adesivo indietro sulla diapositiva per formare un piccolo fluido-riempita oltre il tubulo montato.
- Posizionare il campione sul tavolino del microscopio. Posizionare l'afflusso e deflusso capillari sopra l'ingresso e l'apertura di uscita della perfusione ben, rispettivamente.
Nota: Se non si desidera una camera aperta di aspersione, il divisore ben può essere lasciato. In questo caso i capillari di afflusso e deflusso possono essere allineati ai lati opposti di un imaging bene.
6. validazione del protocollo e del tubulo Health Imaging
Nota: Il presente protocollo viene eseguito su un microscopio invertito grandangolari epifluorescente con GFP (SEpH) e set di filtri RFP (mCherry) (eccitazione nm 470/40 (ex), 515 nm longpass emissione (em), 500 nm dicroici e 546/10 nm ex, 590 nm longpass em, 565 nm dicroici), un 10 X / 0.45 aria obiettivo, una telecamera monocromatica per la cattura di immagine live e software di imaging. Il protocollo può essere adattato per qualsiasi montante o microscopio invertito con filtro automatico di commutazione tra software GFP e RFP ottica e immagine acquisizione, sebbene possano variare parametri binning, intensità della luce e tempi di esposizione ottimale. In tutte le analisi, l'intensità della fluorescenza deve essere analizzato come intensità di pixel medi della regione di interesse (ROI), dopo sottrazione di sfondo in ogni canale utilizzando un ROI con non contiene alcuna fluorescenza adiacente al segnale ROI.
- Accendere il microscopio, una sorgente luminosa e un sistema di imaging.
- Open software di imaging associato.
- Guardare attraverso l'oculare e regolare manualmente la messa a fuoco fino a quando il lume della MT è chiaramente visibile sotto la luce trasmessa.
- Fare clic sulla scheda "Acquisizione" nel software di analisi di immagine e selezionare "2 x 2" nel menu pull-down "Binning" nella sezione "Modalità di acquisizione".
- Inserire un filtro di densità neutra 5% nel percorso della luce per illuminazione luce di ridurre e minimizzare photobleaching.
- Il canale GFP (SEpH) nel menu "Canali", scegliere "Live" per osservare il segnale fluorescente tramite la fotocamera.
- Regolare il dispositivo di scorrimento per impostare il tempo di esposizione, tale che i valori dei pixel più luminosi nell'istogramma intensità sono circa il 40% del valore massimo di "Tempo", quindi fare clic su "Stop" per interrompere l'illuminazione.
- Ripetere i passaggi 6.6-6.7 nella RFP (mCherry) canale e confermano la presenza del segmento iniziale dilatata della MT anteriore e l'assenza di mCherry citosolico aggrega (indicativo di danno tissutale o sovraespressione) (Figura 4).
Nota: Il segmento dilatato dovrebbe essere chiaramente evidente, come è il segmento più prossimale del tubulo e il diametro del lume interno di questo segmento è superiore a quella del segmento adiacente transitorio di ~ 20 µm. 2 x 2 pixel binning è spesso sufficiente ma può essere aumentata per ridurre ulteriormente l'intensità di illuminazione richiesto. Tempi tipici di esposizione sono tra 150 e 800 ms/canale. Utilizzare come poca luce possibile per ridurre al minimo photobleaching. Ridurre al minimo photobleaching è essenziale per l'uso di indicatori di dual-fluorophore come Bud come i due fluorofori possono candeggina in modo indipendente, invalidando pertanto alcuna operazione di taratura del rapporto.
- Abilitare un protocollo di imaging time-lapse cliccando la casella di controllo "Time Series".
- Regolare la "durata" nel menu a discesa nella sezione "Time Series" per 10 min e il dispositivo di scorrimento di "Intervallo" a 0 per impostare il tempo di acquisizione totale con un tasso di acquisizione massima dell'immagine. Una frequenza di acquisizione totale di 0,2 Hz è spesso sufficiente.
- Controllare entrambe le caselle RFP (mCherry) nella sezione "Canali" e GFP (SEpH).
- Aprire la riga di iPBS del sistema aspersione attivando il posizionatore appropriato e avviare il protocollo di formazione immagine facendo clic su "Start esperimento." Dopo 1 min, passare al NH4Cl soluzione di impulso per 20 s aprendo l'apposita valvola e chiudendo la linea iPBS, quindi tornare alla iPBS NH4Cl linea di chiudere e riaprire la valvola iPBS. Consentire il protocollo completo di imaging completare prima di arrestare il sistema di perfusione.
Nota: Time-lapse analisi dovrebbero rivelare un segnale stabile mCherry e un segnale di SEpH che aumenta in presenza di NH4Cl, disseta al dilavamento e recupera gradualmente.
- Eseguire una calibrazione a 2 punti.
- Rimuovere il divisore ben da peeling lontano la diapositiva sottostante e rimuovere i capillari di aspersione ed i morsetti dall'imaging bene.
- Applicare l'imaging bene con una pipetta 200 µ l 200 µ l calibrazione iPBS (pH 7.4, 10 µM Nigericina). Rimuovere la soluzione da imaging bene con la pipetta, quindi sostituire con un altro 200 µ l di soluzione di taratura. Ripetere questa operazione 4 volte per garantire lo scambio di soluzione completa.
- Incubare la preparazione in soluzione di calibrazione per 30 min prima di formazione immagine. Ripetere il protocollo imaging utilizzando gli stessi parametri determinati in passaggi 6.6-6.11, con la modifica di solo 1 min di image capture.
Nota: Il sistema di perfusione e capillari non sono necessari in questo passaggio e non devono essere allegati all'imaging bene per evitare di esporre i vasi capillari a Nigericina.
- Aggiungere 200 µ l calibrazione iPBS (pH 9.0, 10 µM Nigericina) per l'imaging bene con una pipetta 200 µ l. Rimuovere la soluzione da imaging bene con la pipetta, quindi sostituire con un altro 200 µ l di soluzione di taratura. Ripetere questa operazione 4 volte per garantire lo scambio di soluzione completa.
- Incubare la preparazione della seconda soluzione di calibrazione per 10 min prima di formazione immagine. Ripetere il protocollo imaging come passaggio 6.13.3.
- Esaminare lo stack di immagine catturata nel software di analisi di immagine per confermare che nessun pixel a o canale sono saturi cliccando "Significa ROI" e lo scorrimento anche se lo stack di immagine con il cursore di "Frame" osservando che nessun valori segnalati nell'istogramma intensità raggiungere il massimo valore rilevabile. Se qualsiasi frame contengono pixel che raggiungono la massima intensità rilevabile, ridurre l'intensità di tempo o illuminazione di esposizione e la sezione di ripetizione 6.
Nota: Una volta stabilita non modificare parametri di imaging tra esperimenti o calibrazione senza punto tarature devono essere utilizzati in ogni preparazione (Vedi punto 8.3).
- Analizzare lo stack di immagine per tracciare l'intensità di fluorescenza e rapporto di fluorescenza (SEpH/mCherry) come funzione del tempo.
- Fare clic su "Significa ROI" e selezionare lo strumento forma libera. Tenere premuto il tasto sinistro del mouse per tracciare un ~ 50 µm di lunghezza di MT. Fare clic con il pulsante destro per finire di disegnare il ROI, quindi ripetere in un'area adiacente alla MT per definire uno sfondo ROI (Figura 5A).
- Fare clic su "Media intensità" sotto "Misure." Creare una tabella di valori di intensità facendo clic su "Esporta > tabella dati > creazione."
- Fare clic sull'icona della ruota dentata di configurazione e de-selezionare tutti i parametri ad eccezione di "Time" e "Significa intensità". Pulsante destro del mouse la scheda per la tabella di dati appena creato, selezionare "Salva con nome" ed esportare i dati come file CSV.
Nota: Simile può anche essere misurati utilizzando software libero come ImageJ.
- Aprire una tabella di foglio di calcolo e importare la tabella di dati selezionando la scheda "Dati" seguita da "Da testo".
- Utilizzare le funzioni del foglio di calcolo per sottrarre intensitá del Background di SEpH dall'intensità del segnale di SEpH in ogni momento. Ripetere questo processo per il segnale di mCherry.
- Tracciare ogni intensità di canale in funzione del tempo selezionando le colonne contenenti il tempo e dati di intensità sfondo-corretti e quindi facendo clic su "Inserisci > Scatter (grafici) > dispersione con linee dritte" (figura 5B).
- Utilizzare le funzioni di foglio di calcolo per calcolare il rapporto di fluorescenza di SEpH/mCherry in ogni momento.
- Trama di un rapporto di fluorescenza in funzione del tempo selezionando le colonne contenenti i dati di tempo e rapporto e quindi facendo clic su "Inserisci > Scatter (grafici) > dispersione con linee dritte" (Figura 5).
7. pieno calibrazione di Bud in tubuli malpighiani Ex Vivo.
- Sezionare e montare un set fresco di MTs anteriore come descritto nella sezione 5.
- Come descritto nel passaggio 6.13.2 di scambio iPBS per calibrazione iPBS (pH 7.4, Nigericina 10 µM). Incubare per 30 min.
- Individuare il MTs e raccogliere le coppie di immagini di SEpH/mCherry come descritto ai punti 6.1-6.11. Sostituire la soluzione con un altro stock di calibrazione iPBS come descritto nel passaggio 6.13.4, attendere 10 minuti e ancora l'immagine. Ripetere questo processo fino a quando il rapporto di SEpH/mCherry è stato ripreso in tutte le soluzioni. Ottenere pH 9,0 immagini ultimo appena l'esemplare raramente riprende dal pH elevato.
- Stampa rapporto di fluorescenza di SEpH su mCherry da tarature in otto esemplari in funzione del pH impostoio come descritto nel passaggio 6.14.9. Adattare i dati di calibrazione con una curva di Boltzmann per ottenere la funzione di calibrazione completa secondo l'equazione 1 (Figura 5). Se i dati non sono coerenti, trama set di calibrazione da ogni campione normalizzato tale che un rapporto di fluorescenza di 1.0 corrisponde al pHi 7.0 e rianalizzare (Figura 5E).
Nota: Se il processo di quest'ultimo è necessario singoli esperimenti saranno necessario proprio punto interno calibrazioni33 (vedi procedura di quantificazione qui sotto (punto 8.3)).
-
Equazione 1

Dove R = rapporto di SEpH/mCherry e un1,2, xoe dx è curva raccordo parametri che rappresenta il rapporto minimo di fluorescenza, fluorescenza massima ratio, pKune larghezza della funzione rispettivamente. xo = apparente pKuna di Bud, che può variare da 7.1 a 7.4 a seconda del tipo di cella e condizioni di taratura esatta.
8. quantificazione dell'acido Basolateral estrusione dal Epithelia anatomista Ex Vivo .
- Le cellule stellate esprimendo la Bud immagine e principal Bud-esprimendo cellule simultaneamente.
- Sezionare anteriore MTs da una Mosca UAS-Bud/carosso-GAL4 come descritto nella sezione 5, ma non trasferire MTs da mezzo di Schneider dissezione per l'imaging bene.
- Sezionare anteriore MTs da una Mosca UAS-Bud/c724-GAL4 nello stesso piatto per dissezione utilizzando la procedura descritta nella sezione 5.
- Trasferire il 2 set di MTs nell'imaging stesso così come descritto nei passaggi 5.8-5.11.
Nota: Quando spazzare le braccia del MTs giù per la diapositiva, posizionare il MTs di UAS-Bud/c724-GAL4 e i tubuli UAS-Bud/carosso-GAL4 vicino a vicenda così Bud-esprimendo le cellule principali e stellari possono essere visualizzate nel campo stesso ( Figura 6A).
- Applicare il NH4Cl prepulse come descritto nel passaggio 6.12.
Nota: Se coerenza taratura (Figura 4B) non poteva essere raggiunti, eseguire una calibrazione a punto impostando pHi a 7.0 alla fine di ogni esperimento con calibrazione iPBS (pH 7.0, 10 µM Nigericina, incubazione di 30 min) dopo l'adesivo divisore di aspersione-pozzo e l'apparecchiatura di perfusione sono stati rimossi.
- Calibrare le tracce da cellule stellate e principale dei diversi segmenti di MT (usando il rapporto assoluto o normalizzato a seconda dei casi) con 2 equazione e analizzare la fase di recupero dopo NH4Cl ritiro applicando funzioni di decadimento esponenziale utilizzando software di analisi statistica e notando la costante di decadimento (τ) (Figura 6B).
Equazione 2

Dove R = rapporto di SEpH/mCherry e un1,2, xoe dx è curva raccordo parametri determinati dalla taratura al punto 7.4 (equazione 1).
- Calcolare il tasso di acido estrusione (JH +, Vedi equazione 3) in funzione del pH per tener conto delle variazioni nel pHio e caricamento tra preparazioni34acido di riposo. Utilizzare le funzioni esponenziali derivate nel passaggio 8.3 per calcolare la derivata del pH per quanto riguarda il tempo in ogni intervallo di tempo.
Equazione 3
- Calcolare la capacità intrinseca di tampone (βi; Equazione 4) del citosol al pHho fin dall'inizio di ogni intervallo nel passaggio 8.3.1 basata sulla letteratura precedente (Vedi equazione 4).
Nota: In Drosophila, la più approfondita caratterizzazione del β proviene da larvale del nervo motore terminali35 e questi dati possono essere presupposti per tenere per le celle di MT in assenza di altri dati disponibili.
Equazione 4
- Calcolare il prodotto di βT (dal punto 8.3.2)e dpHho/dt (dal punto 8.3.1) per determinare JH + (equazione 3).
Nota: Nelle soluzioni di dimensioni nominali privo di bicarbonato come quelli descritti nel presente protocollo, capacità tampone bicarbonato-derivato (βb) è considerato ~ 0 mM. Totale tampone (βT) è la somma del βio eβbe quindi βio = βT in assenza di HCO3–Co236.
- Trama JH + in funzione del pH all'inizio di ogni intervallo di tempo, come illustrato nel passaggio 6.14.9.
- Applicare le funzioni di decadimento esponenziale alla porzione di tutti i set di dati che si sovrappongono in pHho utilizzando software di analisi statistica. Confronta i tassi di variazione delle funzioni risultante per confrontare i tassi di acido estrusione tra cellule e segmenti di MT (Figura 6).
Nota: La funzione più appropriata utilizzata per adattamento della curva non può essere sempre un singolo esponenziale. Altre funzioni possono essere sostituiti se migliorano la qualità della misura.
- Acido di calcolare in funzione del pH per tener conto delle variazioni in forma e dimensioni della cella di flusso (Vedi equazione 5).
Equazione 5

Nota: Dimensioni della cella possono essere misurate direttamente in immagini o approssimate. Cellule principali possono essere rappresentate come metà di un tubo cavo con le seguenti dimensioni: diametro interno 24 µm; diametro esterno 48 µm; altezza 50 µm. transitorio cellule stellate sono variabili, ma possono essere rappresentate approssimativamente come cilindri con altezze di 50 µm e diametri di 10 µm. Si veda il paragrafo finale di Rappresentante risultati qui sotto.
- Applicare le funzioni di decadimento esponenziale alla porzione di tutti i set di dati che si sovrappongono al pHho utilizzando software di analisi statistica. Confronta i tassi di variazione delle funzioni risultante da confrontare acidi flussi tra le cellule e segmenti di MT (Figura 6).