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Research Article
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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
Questo lavoro presenta un nuovo protocollo di elaborazione e di imaging per un'analisi trasversale di tessuto tridimensionale che consente di sfruttare appieno le modalità di imaging confocale. Questo protocollo conserva l'antigenicità e rappresenta un sistema robusto per analizzare l'istologia cutanea e potenzialmente altri tipi di tessuti.
L'elaborazione di un tessuto di interesse per generare un'immagine microscopica che supporta un argomento scientifico può essere impegnativa. L'acquisizione di immagini microscopiche di alta qualità non dipende interamente dalla qualità del microscopio, ma anche dai metodi di elaborazione dei tessuti, che spesso comportano azioni o passi multipli. Inoltre, i tipi di cellule mesenchimali nella pelle e negli altri tessuti rappresentano una nuova sfida per la preparazione e l'imaging dei tessuti. Qui presentiamo un processo completo, dalla raccolta dei tessuti alla microscopia. La nostra tecnica, chiamata "montatura orizzontale", è quella che i novizi possono rapidamente diventare competenti e che consente la conservazione e la rilevazione di antigeni in sezioni di spessore di 60-300 μm tagliate con un criostato. Le sezioni di questo spessore forniscono una migliore visualizzazione della microarchitettura del tessuto in un ambiente tridimensionale. Inoltre, il protocollo conserva le cellule mesenchimali in modo da migliorare la qualità dell'immagine quandoRispetto alle sezioni di criostato o paraffina standard, aumentando così l'efficacia e l'affidabilità dell'immunodellazione. Crediamo che questo protocollo beneficerà di tutti i laboratori che visualizzano la pelle e possibilmente altri tessuti e organi.
La rivoluzione dell'apparecchiatura di imaging microscopica prevede sofisticati strumenti di imaging ad alta risoluzione. Tuttavia, quando acquisisce un'immagine microscopica di una sezione trasversale del tessuto tridimensionale (3D) completa, la preparazione del campione presenta notevoli sfide e può essere il fattore limitante nella definizione della qualità dell'immagine. Ogni passo separato merita una considerazione attenta per preservare la morfologia del tessuto e l'antigenicità delle proteine bersaglio, per ridurre al minimo gli artefatti derivanti dalla trasformazione e per massimizzare la qualità dell'immagine finale. Ad esempio, l'analisi tradizionale della pelle richiede un'immagine in vista dell'epidermide e del derma, con follicoli piliferi che sono correttamente orientati, consentendo l'analisi anatomica dei contributi del compartimento delle cellule staminali all'omeostasi cutanea 1 , 2 . Ciò richiede una concentrazione approfondita su come la pelle sia incorporata e sezionata. Importante, i follicoli piliferi possono essere più spessoDi 100 μm, che supera notevolmente lo spessore della paraffina o dello spessore congelato, determinando uno standard inferiore di analisi rispetto ai montanti interi o alle sezioni trasversali 3 , 4 , 5 .
Considerati insieme, ogni fase di preparazione del campione per l'analisi microscopica è un determinante critico che influenzerà l'analisi delle immagini. Qui viene presentato un nuovo protocollo di elaborazione per l'analisi trasversale del tessuto 3D, che noi chiamiamo "montaggio orizzontale intero". Il protocollo altamente conserva l'antigenicità e consente il pieno sfruttamento di spessori della pelle usando apparecchiature standard per la formazione di immagini confocali. Questa è una guida completa per l'utilizzo della pelle per la lavorazione e l'imaging della sezione trasversale del tessuto spesso, inclusa la criopreservazione assistita da paraformaldehide (PFA) (fase 1), la generazione di sezioni trasversali di 100 μm con un criostato (passo 2) E l'etichettatura e il montaggio immunofluorescenti (punti 3 e 4). I risultati rappresentativi confrontano le immagini confocali di due distinte tecniche di preparazione istologica: la criocondazione classica e la sezione trasversale di tessuto 3D, spesso evidenziando i vantaggi di "montanti interni orizzontali" per il potenziale utente di questo protocollo.
Tutti gli esperimenti su animali sono stati sottoposti all'approvazione etica locale e sono stati eseguiti in base a una licenza Home Office del governo del Regno Unito.
1. Raccolta della pelle e criopreservazione

Figura 1. Raccolta e fissazione della pelle del mouse. (A) tessuto cutaneo è stato raccolto dalla regione dorsomediale del cadavere dell'animale. I follicoli dei capelli in questa regione sono uniformemente distanziati e allineati e quindi consentono un orientamento ottimale durante la sezione, come indicato dalle frecce. B ) Dopo aver tagliato quadrati di una dimensione appropriata che si inserisce nel criomolo, il tessuto cutaneo è stato fissato in PFA al 4% per 15 minuti e lavato due volte in PBS per 5 minuti ciascuno. Clicca qui per visualizzare una versione più grande di questa figura.
2. Sezione trasversale del tessuto spessore

Figura 2. Embedding, cryopreservation e sectioning.
(A) La marcatura della direzione del follicolo pilifero (HF) sul criomodello, indicata dalle frecce nere, è importante per un corretto orientamento durante la criocondensazione. ( B ) Il piano di sezione deve essere allineato con l'orientamento del follicolo pilifero per generare sezioni in cui la lunghezza totale dei follicoli piliferi rimane intatta ( c ) Le sezioni sono state tagliate per orientamento del follicolo pilifero indicato dalle frecce nere sul cryomold. ( D ) Le sezioni trasversali del tessuto sono state raccolte con pinze metalliche e ( e ) trasferite in un piatto di coltura da 100 mm contenente 1x PBS. ( F ) A temperatura ambiente, il PBS si dissolve l'OC.T. Composto che circonda le sezioni trasversali del tessuto spesso, come indicato dalle frecce bianche. Le sezioni poi galleggiano liberamente nel PBS. Clicca qui per visualizzare una versione più grande di questa figura.
3. Etichettatura immunofluorescenti.
4. Montaggio per la visualizzazione microscopica 
Figura 3. ImmunofluorescL'etichettatura e il montaggio.
(A) Le sezioni di tessuto galleggiante possono essere memorizzati in piastre da 12 pozzetti per almeno due giorni a 4 ° C. Prima dell'etichettatura immunofluorescenti (IF), trasferire le sezioni tissutali di interesse interessate in 1,5 mL di microcentrifuga contenenti tampone PB per il blocco, come indicato dalla freccia 1. Per l'etichettatura IF, attenersi alla procedura a più fasi elaborata al punto 3. Ogni Parte del passaggio 3 richiede l'attento trasferimento delle sezioni di tessuto in tubi di microcentrifuga appena preparati contenenti soluzione anticorpale primaria, soluzione anticorpale secondaria o tampone di lavaggio indicata dalla freccia 2. b ) Dopo l'etichettatura IF, Le sezioni vengono distrutte e appiattite in una gocciolina di glicerolo, utilizzando l'assistenza di un microscopio di dissezione. ( C ) Una volta che la sezione trasversale del tessuto è interamente appiattita sul fondo di una sfoglia di copertura, viene utilizzata una scorrevole normale del microscopio per montare la sezione.
NOTA: quando la fetta galleggia nell'aggCerolo, può essere incastrato dal coassificare la naturale propensione del tessuto per ritornare alla sua forma normale. Non forzare il raddrizzamento innaturale della fetta, in quanto ciò potrebbe causare danni al tessuto.
NOTA: Evitare l'entrapimento dell'aria ( Figura 3c ).
NOTA: L'archiviazione prolungata influenzerà negativamente la qualità del tessuto e dell'immagine. In questo esempio, tutte le immagini sono state acquisite con un microscopio confocale verticale usando un obiettivo di 20x.
Per sottolineare i vantaggi della nostra tecnica, abbiamo confrontato la nostra tecnica di crociatura 3D, "montatura orizzontale intera", a sezioni classiche congelate. Le sezioni congelate classiche sono state tagliate come descritto in precedenza 5 . Per fornire una struttura visiva per l'epidermide in immagini microscopiche, abbiamo immaginato per l'integrin alfa-6 (Itga6), che è un componente che ancora le cellule epidermiche alla membrana basale sottostante 6 . Abbiamo anche etichettato l'arretro pili muscle (APM), che è responsabile della piloerection (conosciuta anche come "goosebumps"), con integrin alpha-8 7 . Nelle sezioni congelate classiche, la maggior parte dei follicoli piliferi visualizzati con Itga6 non sono stati tagliati lungo tutta la lunghezza, generando follicoli piliferi prevalentemente incompleti per sezione, rispetto ai montanti interni orizzontali ( Figura 4a- 4d Figura 4a- 4d ). Inoltre, l'integrità tissutale del compartimento ipodermico è conservata in montanti orizzontali, rispetto alla distruzione degli adipociti, quando le criose sono collegate a vetrate calde, che è un noto artefatto di congelamento e scongelamento ( Figura 4a- b , confronta ipodermica Regioni) 8 .

Figura 4. Mou orizzontale interoNt rispetto ad una crisi classica.
(A) rivestimento classico ottenuto criosezioni 10 um (b) 100 um di spessore del tessuto 3D sezioni sono state marcate con integrina alfa-6 (Itga6) e integrina alfa-8 (Itga8) per visualizzare le vano epidermica e arrector muscoli spessi e Pili , Rispettivamente. Le immagini delle sezioni trasversali del tessuto spesso sono rappresentate come proiezioni massime di un grande stack Z. I fotogrammi bianchi indicano le aree ingrandite, visualizzate in ( c ) le sezioni di montaggio classiche e ( d ) orizzontali. ( E ) i follicoli dei capelli intatti e ( f ) i muscoli intestinali del pili sono stati quantificati sia nelle sezioni classiche che orizzontali. Le barre di scala indicano 100 μm. I dati sono rappresentati come Medio ± errore standard del valore medio (SEM). Una sezione per replicazione biologica ( n = 3) è stata quantificata. T-test non accoppiato * P <0,05, *** P <0,0005. Clicca qui per visualizzare una versione più grande di questa figura.
Gli autori vorrebbero rivelare che la pubblicazione di questo manoscritto è stata finanziata da Thermo-Fisher Scientific Inc.
Questo lavoro presenta un nuovo protocollo di elaborazione e di imaging per un'analisi trasversale di tessuto tridimensionale che consente di sfruttare appieno le modalità di imaging confocale. Questo protocollo conserva l'antigenicità e rappresenta un sistema robusto per analizzare l'istologia cutanea e potenzialmente altri tipi di tessuti.
Gli autori riconoscono la sponsorizzazione da Thermo-Fisher Scientific e ringraziano il Centro Imaging Nikon di Kings College London per il supporto durante l'acquisizione di immagini confocali.
| PBS Gelatina | fatta in casa | ||
| , da pelle di pesce d'acqua fredda | Sigma | G7765 | 250ML |
| Glicerolo | BDH Forniture da laboratorio | 444482V | |
| O.C.T. composto | VWR prodotti chimici | 361603E | |
| Peel-A-Way stampi per inclusione Sigma | E6032-1CS | Square S-22 | |
| Latte in polvere senza grassi | Bio Base Inc. | NB0669 | |
| Triton X-100 | Sigma | T9284 | 500ML |
| 4′,6-Diamidino-2-fenilidolo, dilattato (DAPI) | Invitrogen | D3571 | |
| FITC Rat Anti-Human CD49f | BD Pharmingen | 555735 | |
| Mouse/Rat Integrin alpha 8 Antibody | R& D Systems | AF4076 | |
| Alexa Fluor 488 asino anti-ratto IgG | Life Technologies | A21208 | |
| Alexa Fluor 555 asino anti-capra IgG | Life Technologies | A21432 | |
| CryoStar NX70 | Thermo Fisher Scientific | ||
| 100mm Piatti | di coltura | ||
| Bisturi monouso | Swann-Morton | Ref 0501 | |
| metalliche appuntite | |||
| provette per microcentrifuga da 1,5 ml | VWR | 211-2130 | |
| piastre a 12 pozzetti | Sigma | CLS3513 | |
| Microscopio da dissezione | Nikon | ||
| 20 ul e 1000 ul Pipetta | Gilson | ||
| 1000µ l Punta graduata XLun puntale filtrante (sterile) | Star Lab | S1122-1830 | |
| 20µ l Puntale filtrante TipOne smussato (sterile) | Star Lab | S1120-1810 | |
| Piastra | shaker oscillante | ||
| Vetrini per microscopio, menzel Glaeser | Thermos Scientific | 631-9483 | Occhiali di coperturaSuperfrost Plus |
| , Menzel Glaeser | Thermos Scientific | MENZBB024060AB | 24 x 60 mm |
| Microscopio confocale | Nikon |