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Research Article
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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
Un protocollo per accuratamente identificare e analizzare le sinapsi nelle fette hippocampal mediante immunofluorescenza è descritto in questo articolo.
Nel cervello, le sinapsi sono specializzate giunzioni tra neuroni, determinare la forza e la diffusione della segnalazione di un neurone. Il numero delle sinapsi è strettamente regolato durante lo sviluppo e la maturazione neuronale. D'importanza, i deficit nel numero di sinapsi possono portare a disfunzione conoscitiva. Pertanto, la valutazione del numero di sinapsi è parte integrante della neurobiologia. Tuttavia, come le sinapsi sono piccole e molto compatto nel cervello intatto, la valutazione del numero assoluto è impegnativa. Questo protocollo descrive un metodo per identificare e valutare le sinapsi nelle fette hippocampal del roditore, usando la microscopia di immunofluorescenza facilmente. Esso comprende una procedura a tre fasi per valutare le sinapsi in immagini di alta qualità di microscopia confocale analizzando la co-localizzazione di proteine pre- e postsinaptici nelle fette hippocampal. Viene inoltre spiegato come l'analisi viene eseguita e dà esempi rappresentativi da sinapsi sia eccitatori che inibitori. Questo protocollo fornisce una solida base per l'analisi delle sinapsi e può essere applicato a qualsiasi ricerca che studia la struttura e la funzione del cervello.
Il cervello umano è composto di circa 1014 sinapsi. Numero di sinapsi è strettamente regolato durante lo sviluppo e la maturazione del sistema nervoso centrale (CNS). Durante lo sviluppo, il numero di sinapsi è modulata da sinaptogenesi e potatura per formare reti di un neurone funzionali. Apprendimento e memoria sono supportati dal regolamento del numero di sinapsi e forza, un processo conosciuto come potenziamento sinaptico e depressione1. D'importanza, la stabilizzazione delle sinapsi mature è essenziale per il mantenimento di connessioni di rete neuronale. Inoltre, i deficit nella densità sinaptica sono stati segnalati nelle fasi iniziali di malattie neurodegenerative come il morbo di Alzheimer (annuncio)2. Pertanto, la capacità di identificare accuratamente e valutare il numero di sinapsi è fondamentale ai fini della valutazione della patologia e fisiologia del cervello.
La massima densità e natura compatta delle sinapsi rendono difficile per stimare il loro numero preciso nelle aree del cervello intatto. Sinapsi chimiche nel SNC sono costituite da due neuroni nell'apposizione vicina, separati da un cleft sinaptico3. Il terminale pre-sinaptica, o bouton sinaptico, emerge da un assone e consiste di vescicole accumulate, che contengono i neurotrasmettitori che definiscono la specificità di una sinapsi — vale a dire, glutammato e acido gamma - aminobutirrico (GABA) per eccitanti e inibitorio sinapsi, rispettivamente. Le membrane delle vescicole contengono vescicolari trasportatori specifici per ogni neurotrasmettitore: trasportatore vescicolare glutammato (vGlut) per il glutammato e il trasportatore vescicolare di GABA (vGAT) per GABA. Il terminale post-sinaptico è una struttura molto densa composta da diverse proteine, tra cui i recettori, molecole di adesione e proteine impalcatura. In sinapsi eccitatorie, proteina di densità-95 post-sinaptica (PSD-95) è il più abbondante dell'impalcatura proteina4, modulante eccitanti N-methyl-D-aspartate(NMDA-) e recettore di acido α-amino-3-hydroxy-5-methyl-4-isoxazolepropionic (AMPA) funzione, considerando che gephyrin ancore recettori inibitori al terminale post-sinaptico inibitorio5. Nel complesso, la specificità delle proteine ai compartimenti pre- e post-sinaptici aiuti la differenziazione e identificazione di sottotipi di sinapsi.
La valutazione del numero di sinapsi può essere eseguita con diverse tecniche. Il più comune è l'uso di microscopia elettronica (EM), che consente l'analisi della sinapsi in aree cerebrali compatta e intatta con alto ingrandimento e risoluzione. Tuttavia, questa tecnica è molto costosa, richiede preparazione del campione complicato e richiede molto tempo. Altre tecniche includono l'uso della matrice tomografia6, che ha un grande svantaggio in quanto richiede attrezzature specializzate e costose per eseguire l'analisi. Inoltre, linee transgeniche che esprimono specifici marcatori sinaptici sono utili a valutare la sinapsi numero7, ma la generazione di nuove linee può essere restrittiva e costoso, e la sovraespressione di proteine può causare indesiderato fuori bersaglio fenotipi.
A causa di queste limitazioni e per semplicità, molti ricercatori valutano numero di sinapsi esaminando i livelli della proteina sinaptica totale. Tuttavia, la perdita di sinapsi può essere osservato prima di cambiamenti sostanziali nella proteina, come risultati rimodellamento sinaptici strutturali nella dispersione di apposizione pre- o post-sinaptica, con Nessuna degradazione di proteine sinaptiche. Inoltre, in annuncio, i livelli della proteina sinaptica sono ridotti seguente sinapsi degenerazione o morte di un neurone8,9. La quantificazione dei livelli totali non consente questa distinzione. Così, c'è la necessità di sviluppare un metodo affidabile, accessibile e accurato per la valutazione del numero di sinapsi nel cervello.
In questo articolo, descriviamo come accuratamente identificare e determinare il numero delle sinapsi usando la microscopia di immunofluorescenza nelle fette hippocampal del cervello del roditore. Le sinapsi sono definite dalla colocalizzazione di marker pre- e post-sinaptico che appaiono in una distribuzione punctata. Dimostriamo la validità di questa tecnica attraverso lo studio di Wnt segnalazione nel cervello. WNT sono proteine secrete importanti per la formazione, la eliminazione e la manutenzione delle sinapsi. L'induzione in vivo di un antagonista secreto della cascata della Wnt, Dickkopf-1 (Dkk1), porta alla perdita sinaptica eccitatoria preservando sinapsi inibitorie nell' ippocampo10. Illustriamo l'identificazione e il conteggio delle sinapsi eccitatorie ed inibitorie nelle fette hippocampal da un topo adulto esprimendo Dkk1 ed evidenziare la trasferibilità di questa tecnica ad altri tipi di preparazioni di coltura di tessuti.
tutti gli esperimenti con topi e ratti sono stati approvati e condotti utilizzando le procedure di pianificazione 1 coperti sotto l'atto di casa ufficio animali (procedure scientifiche) 1986. La ricetta di liquido cerebrospinale artificiale (ACSF) può essere trovata nella tabella 1.
1. acuta Hippocampal Fetta preparazione
2. Immunofluorescenza per marcatori sinaptiche
Nota: le ricette di tutti i buffer utilizzati possono essere trovate nella tabella 2.
3. Analisi e acquisizione di immagini confocal
Figura 1: analisi dei puncta sinaptica utilizzando l'analisi dell'immagine software. (A) Screenshot della personalizzazione di protocollo soglia di intensità. L'esempio fornito è per PSD-95, in cui i puncta selezionato hanno una dimensione definita di > 0,1 µm 3 e < 0,8 µm 3 e presenti oggetti sovrapposti ridotta a icona. Si noti che l'immagine mostrata è per un aereo confocale abilitare la visualizzazione più facile dei puncta sinaptica e selezione dei parametri precisi. (B) Screenshot dell'analisi uscita dal software (dopo la selezione del protocollo ottimizzato). Un esempio di crudo puncta sinaptica numeri misurazioni basate sul volume. Questi valori vengono poi esportati ad un software di foglio di calcolo. Clicca qui per visualizzare una versione più grande di questa figura.
Figura 2: controllo di qualità delle impostazioni fetta e parametro per puncta sinaptica. Immagini confocal (A) rappresentative (obiettivo 40x) della regione di interesse: il CA1 strato radiato (sr) e strato oriens (così) di una fetta hippocampal sono identificati dalla macchiatura MAP2. Barra della scala = immagini Confocal di 2 µm. (B) (60 x obiettivo e un'ulteriore 1.3 X ingrandimento del software di acquisizione) del CA1 strato radiato, con eccitanti marcatori-vGlut1 (verde) e PSD-95 (rosso)-da fette hippocampal. Nota l'identificazione dei puncta chiaro pre- e post-sinaptico. Puncta superiore a 0,8 µm 3 sono esclusi dalla quantificazione (frecce bianche). Barra della scala = 2 µm (C) confocale immagini (60 x obiettivo e un'ulteriore 1.3 X ingrandimento del software di acquisizione) del CA1 strato radiato, con eccitanti marcatori-vGlut1 (verde)-dal criostato-taglio sezioni hippocampal dai cervelli intero risolto in PFA. Si noti la presenza di fori grandi e irregolari, ragruppata vGlut1 colorazione. Barra della scala = 2 µm. Clicca qui per visualizzare una versione più grande di questa figura.
Perdita di sinapsi si presenta presto nella malattie neurodegenerative come l'annuncio e la malattia del Parkinson2,11,12. Tuttavia, i meccanismi molecolari alla base di questi deficit rimangono capiti male. Le carenze nella segnalazione Wnt sono state associate AD13,14,15,16,17. WNT sono glicoproteine secrete e svolgono un ruolo essenziale nella formazione della sinapsi e la modulazione della trasmissione sinaptica18,19,20,21. Recentemente, abbiamo identificato Wnt come regolatori chiave di manutenzione sinaptica nel sistema nervoso maturo10,22. Per studiare con precisione l'impatto di segnalazione Wnt su sinapsi nell'ippocampo dei topi geneticamente modificati, abbiamo approfittato di una preparazione di fetta di cervello e microscopia confocale per valutare i cambiamenti nel numero di sinapsi. Abbiamo identificato fette sani in cui la struttura era ben conservato (Figura 2A). Inoltre, la selezione dei puncta sinaptica è stata definita con cura, con l'esclusione di grandi oggetti macchiati probabilmente rappresentano aggregati proteici (Figura 2B). Questo criterio è stato applicato a tutte le immagini, con gli stessi parametri di analisi rigoroso.
Abbiamo usato un sistema di modello transgenico che induce l'espressione dell'antagonista Wnt secreta Dkk1 in adulto di topi (iDkk1) sotto tetraciclina controllano (Vedi la Tabella materiali)10,22. Abbiamo dimostrato che il blocco di segnalazione Wnt nell'ippocampo adulto provoca perdita di sinapsi eccitatoria in particolare della regione CA1 strato radiato (Figura 3). Figura 3A illustra immagini rappresentative confocal di marker pre- e post-sinaptico eccitatorio (vGlut1 e PSD-95, rispettivamente) ha acquisito da fette hippocampal di iDkk1 topi esprimenti Dkk1 per due settimane, così come i rispettivi controlli. Abbiamo analizzato queste immagini utilizzando il software Volocity ed ha dimostrato una riduzione significativa del numero di sinapsi eccitatorie, quantificato mediante la co-localizzazione dei puncta vGlut1 e PSD-95-etichettato nella regione CA1 dell'ippocampo dei topi di iDkk1 che seguono la induzione di Dkk1 per due settimane (Figura 3B, * p < 0.05; Test di Kruskal-Wallis; 6 topi per genotipo). Nel CA1 strato radiato, il numero di sinapsi eccitatoria puncta per 1.000 µm3 è stata ridotta da 500 a topi di controllo a 300 in topi iDkk1. Al contrario, espressione di Dkk1 indotta non ha colpito il numero delle sinapsi inibitorie (identificato con la co-localizzazione tra il pre- e post-sinaptico marcatori vGAT e gephyrin, rispettivamente), come mostrato nella Figura 4A-B (p > 0.05; Test di Kruskal-Wallis; 3 topi per genotipo).
D'importanza, abbiamo effettuato un'analisi di potenza statistica per stimare il numero di animali necessari per generare questi risultati robusti e fette appropriato. Utilizzando R, abbiamo calcolato che sono stati necessari circa 35 fette per condizione (animali fette x 6 3 immagini x 3 = 36) per rilevare una dimensione di grande effetto (f = 0,4) con confidenza dell'80% (potenza = 0,8) in un one-way ANOVA con blocco e la replica, come descritto in passaggio 3.2.6.

Figura 3: perdita di sinapsi eccitatorie nelle fette hippocampal da topi iDkk1. (A) immagini confocal rappresentative dei CA1 strato radiato Visualizza sinapsi eccitatorie, identificati da co-localizzazione tra vGlut1 e PSD-95 (frecce bianche). Il pannello inferiore rappresenta un maggiore ingrandimento del rettangolo evidenziato. Scala bar = 2 µm. (B) la percentuale di sinapsi eccitatorie tra controllo e iDkk1 è stata quantificata utilizzando software menzionati nella Tabella materiali (* p < 0.05; Test di Kruskal-Wallis; 6 topi per genotipo). I dati sono rappresentati ± SEM Questa figura è stata modificata da riferimento10. Clicca qui per visualizzare una versione più grande di questa figura.

Figura 4: sinapsi inibitorie sono invariate nelle fette hippocampal da topi iDkk1. (A) immagini confocal rappresentative del CA1 strato radiato delle sinapsi inibitorie identificate tramite la co-localizzazione tra vGAT e gephyrin (frecce bianche). Il pannello inferiore rappresenta un maggiore ingrandimento del rettangolo evidenziato. Scala bar = 2 µm. (B) percentuale delle sinapsi inibitorie tra topi di controllo e iDkk1, come quantificato utilizzando il software Volocity (p > 0.05; Test di Kruskal-Wallis; 3 topi per genotipo). I dati sono rappresentati ± SEM Questa figura è stata modificata da riferimento10. Clicca qui per visualizzare una versione più grande di questa figura.
| Alta saccarosio ACSF componenti | Concentrazione | Note |
| NaCl | 75 mM | |
| NaHCO3 | 25 mM | |
| KCl | 2,5 mM | |
| NaH2PO4, 2 H2O | 1,25 mM | |
| Acido chinurenico | 1,25 mM | |
| Acido piruvico | 2 mM | |
| EDTA | 0,1 mM | |
| CaCl2 | 1 mM | Aggiungere dopo ossigenazione della soluzione |
| MgCl2 | 4 mM | Aggiungere dopo ossigenazione della soluzione |
| D-glucosio | 25 mM | |
| Saccarosio | 100 mM | |
| Camera sommersa ACSF componenti | ||
| NaCl | 125 mM | |
| NaHCO3 | 25 mM | |
| KCl | 2,5 mM | |
| NaH2PO4, 2 H2O | 1,25 mM | |
| CaCl2 | 1 mM | Aggiungere dopo ossigenazione della soluzione |
| MgCl2 |
Tabella 1: Composizione ACSF.
| Blocco/permeabilizing Buffer | Concentrazione | Note |
| Siero di asino | 10% | |
| Triton-X | 0,50% | |
| PBS | 1 x | |
| 10 x PBS | pH 7.4 | |
| NaCl | 1,37 M | |
| KCl | 27 mM | |
| NaH2PO4 | 100 mM | |
| KH2PO4 | 18 mM | |
| 4% PFA/4% saccarosio | pH 7.4 | |
| PBS | 1 x | Diluire da 10x |
| PFA | 1.33 M | |
| Saccarosio | 117 mM |
Tabella 2: Buffer utilizzati per la macchiatura immunofluorescente.
Gli autori non hanno nulla a rivelare.
Un protocollo per accuratamente identificare e analizzare le sinapsi nelle fette hippocampal mediante immunofluorescenza è descritto in questo articolo.
Questo lavoro è stato supportato da MRC, EU FP7, lolla, Wellcome Trust e Parkinson UK. Vorremmo anche ringraziare la signora Johanna Buchler per il suo contributo delle immagini confocal e i membri del laboratorio per il loro contributo costruttivo sul manoscritto e metodologia.
| Vibratomo | Leica | VT1000S | |
| Anticorpo primario | Millipore | AB5905 | vGlut1 (1:2000) |
| Anticorpo primario | Thermo Scientific | MA1-046 | PSD-95 (1:500) |
| Anticorpo primario | Synaptic Systems | 131 004 | vGAT (1:500) |
| Anticorpo primario | Synaptic Systems | 147011 | Gephyrin (1:500) |
| Anticorpo primario | Abcam | ab5392 | MAP2 (1:10000) |
| Anticorpo secondario | Jackson Laboratories | 706-545-148 | Donkey Anti-Guinea Pig Alexa Fluor 488 (1:600) |
| Anticorpo secondario | Abcam | ab175470 | Donkey Anti-Rabbit Alexa Fluor 568 (1:600) |
| Mezzo di montaggio | SouthernBiotech | 00-4958-02 | Fluoromount-G |
| Confocal Microscopio | Microscopio confocaleOlympus | NA | FV1000 che utilizza un obiettivo a olio ad apertura numerica (NA) 60x 1,35. Per vGlut1, utilizzare un laser 488 con una percentuale di potenza del 14%. Per PSD-95 utilizzare un laser 559 con una percentuale di potenza del 20%. |
| Software di analisi | PerkinElmer | NA | Volocity |
| Scalpel | Swann-Morton | 203 | No 11 |
| Super Glue | Loctite | 1446875 | |
| 95% O2, 5% CO2 | BOC | NA | Cilindro Piastra |
| a 24 pozzetti | Corning | 3524 | |
| Vetrini | Thermo | 7107 | Piastra di Petrispessa 08-1,0 mm |
| Corning | 430167 | ||
| topi iDkk1 | N/A | N/A | I topi sono stati ottenuti incrociando topi transgenici tetO Dkk1 con topi transgenici CaMKIIα rtTA2. Topi transgenici TetO Dkk1 e CaMKII&alfa; rtTA2 sono stati incrociati in uno stato eterozigote. Entrambe le linee di topi sono state allevate in uno sfondo C57BL/6J. Come controlli sono stati utilizzati singoli transgenici e WT Littermate. |
| Name | Azienda | Numero di catalogo | Comments |
| Reagenti per soluzioni: | |||
| NaCl | Sigma | V800372 | |
| KCl | Sigma | P9333 | |
| Na2HPO< sub>4 | Sigma | 255793 | |
| KH2PO4 | Sigma | P9791 | |
| Ca2Cl | Sigma | 223506 | |
| Mg2Cl | Sigma | M9272 | |
| NaH2PO4 | Sigma | 71505 | |
| Acido chinurenico | Sigma | K3375 | |
| NaHCO3 | Sigma | S5761 | |
| Acido piruvico | Sigma | 107360 | |
| EDTA | Sigma | E6758 | |
| D-glucosio | Sigma | G5767 | |
| Saccarosio | Sigma | S8501 | |
| Triton-X | Sigma | T8787 | |
| Siero d'Asino | Millipore | S30-100ml | |
| PFA | Sigma | P6148 |