L'epitelio intestinale è caratterizzata da un tasso di turnover estremamente rapida. Nei mammiferi, l'intero rivestimento epiteliale si rinnova entro 4-5 giorni. Le cellule staminali adulte intestinale risiedono nella parte inferiore delle cripte di Lieberkühn, sono state stanziate dall'espressione del gene Lgr5 e preservare l'omeostasi attraverso loro caratteristico alto tasso proliferativo1. In tutto l'intestino tenue, Lgr5+ cellule staminali sono mescolareate con le cellule secretorie specializzate chiamate cellule di Paneth. Cellule di Paneth secernono composti antibatterici (cioè, il lisozima e cryptdins/defensine) ed esercitano un ruolo di controllo sulla flora intestinale. Più recentemente, una funzione di romanzo è stato scoperto per cellule di Paneth, vale a dire la loro capacità di fornire supporto di nicchia di cellule staminali Lgr5+ attraverso diversi ligandi chiave come Wnt3, EGF e Dll12.
Quando isolato ex vivo e coltivate in presenza di specifici fattori di crescita e di componenti della matrice extracellulare, cripte intestinali intero danno luogo a longevo e autorinnovanti strutture 3D chiamato organoids che ricordano molto il cripta-villo architettura epiteliale del piccolo intestino adulto3. Organoid culture, quando stabilito da tutta cripte, consentono lo studio di auto-rinnovamento e differenziazione della nicchia staminale intestinale, senza però affrontare il contributo dei suoi singoli componenti, vale a dire la Lgr5+ e Cellule di Paneth.
Qui, descriviamo un nuovo approccio per il dosaggio di organoid che sfrutta la capacità di Paneth e Lgr5+ cellule per associare e formare organoids quando co-coltivate. Questo approccio, definito come "dosaggio di ricostituzione organoid" (ORA), consente la modifica genetica e biochimica di Paneth o Lgr5+ cellule staminali, seguite da ricostituzione in organoids. Come tale, consente l'analisi funzionale dei due principali componenti della nicchia staminale intestinale.