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Articolo metodologico

Ingegneria genetica degli organiidi intestinali dei topi primari utilizzando vettori virali magnetici di trasduzione nanoparticella per la sezionamento congelato

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DOI:

10.3791/57040

10 maggio 2019

In questo articolo

Sommario

Descriviamo istruzioni passo-passo a: 1) ingegnerizzare in modo efficiente gli organoidi intestinali utilizzando nanoparticelle magnetiche per la trasduzione lentile o retrovirale e, 2) generare sezioni congelate da organoidi ingegnerizzati. Questo approccio fornisce un potente strumento per modificare in modo efficiente l'espressione genica negli organoidi per lo studio degli effetti a valle.

Abstract

Le colture organoidi intestinali offrono un'opportunità unica per studiare la biologia delle cellule staminali intestinali e della crittografia in vitro, anche se approcci efficienti per manipolare l'espressione genica negli organoidi hanno fatto progressi limitati in questo campo. Mentre la tecnologia CRISPR/Cas9 consente una precisa modifica del genoma delle cellule per la generazione di organiidi, questa strategia richiede un'ampia selezione e screening per analisi di sequenza, che richiede tempo e denaro. Qui, forniamo un protocollo dettagliato per una trasduzione virale efficiente degli organoidi intestinali. Questo approccio è rapido e altamente efficiente, riducendo così il tempo e le spese inerenti alla tecnologia CRISPR/Cas9. Presentiamo anche un protocollo per generare sezioni congelate da colture organoidi intatte per ulteriori analisi con colorazione immunohistochimica o immunofluorescente, che può essere utilizzata per confermare l'espressione genica o il silenziamento. Dopo aver raggiunto una trasduzione di vettori virali per l'espressione genica o il silenziamento, la funzione delle cellule staminali intestinali e della cripta può essere rapidamente valutata. Anche se la maggior parte degli studi organoidi impiega saggi in vitro, gli organoidi possono anche essere consegnati ai topi per analisi funzionali in vivo. Inoltre, i nostri approcci sono vantaggiosi per prevedere le risposte terapeutiche ai farmaci perché le terapie attualmente disponibili generalmente funzionano modulando l'espressione genica o la funzione proteica piuttosto che alterando il genoma.

Introduzione

La capacità di coltura delle cellule di certera umana o di topo come organoidi tridimensionali (3D) dall'intestino tenue o dal colon per periodi di tempo prolungati ha fornito un importante passo avanti perché queste culture mostrano caratteristiche distintive dell'epitelio intestinale in vivo 1 : il nome del , 2 Il nome del sistema , 3. Gli organidi derivati dalle cripte primarie sono in grado di auto-rinnovamento e di auto-organizzazione, che esibiscono funzioni cellulari simili ai loro tessuti di origine. Infatti, gli organoidi riassumono non solo l'organizzazione struttur....

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Protocollo

Questo protocollo è stato approvato dal Johns Hopkins Medical Institutions Animal Care and Use Committee (IACUC Committee). Questo protocollo viene modificato da un metodo pubblicato in precedenza10,11,12,13.

1. Preparazione dei reagenti

  1. Preparare il mezzo fresco 293T con diverse ore di anticipo e riscaldare a 37 gradi centigradi in un bagno d'acqua per almeno 10 minuti prima dell'uso (Tabella 1).
  2. Preparare il DNA plasmide2,1....

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Risultati

Qui, descriviamo una tecnica di trasduzione rapida e altamente efficiente che sfrutta le nanoparticelle magnetiche esposte a un campo magnetico per fornire lentivirus alle cellule di interesse. Con gli strumenti prontamente disponibili, abbiamo applicato questo approccio non solo per trasdurre le celle di cripta appena isolate (Figura 1A), ma anche per gli organoidi (Figura 2) e altre cellule che sono refrattarie ad approcci di t.......

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Discussione

La coltura primaria dell'epitelio intestinale adulto come organoidi fornisce un potente strumento per studiare i meccanismi molecolari coinvolti nella funzione delle cellule staminali, l'omeostasi epiteliale intestinale e la patologia1,2,3, 4. Anche se la tecnologia CRISPR/Cas9 può essere utilizzata per ingegnerizzare geneticamente gli organoidi9, è limitata dalla neces.......

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Dichiarazioni

Gli autori non hanno nulla da rivelare

Ringraziamenti

Questo lavoro è stato sostenuto da sovvenzioni del National Institute of Health (R01DK102943, R03CA182679, R03CA191621), del Maryland Stem Cell Research Fund (2015-MSCRFE-1759, 2017-MSCRFD-3934), dell'American Lung Association, della Allegheny Health Network - Johns Hopkins Research Fund e il Centro di Ricerca di Base sulle Malattie Digestive Hopkins.

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Materiali

Elenco dei materiali utilizzati in questo articolo
NomeAziendaNumero di catalogoCommenti
DMEMThermo Fisher Scientific11965092Terreno base per cellule 293T
DMEM/F12+Thermo Fisher Scientific 12634010Terreno base per terreno di coltura di organoidi e tampone di digestione per organoidi
OPTI-MEMThermo Fisher Scientific 11058021Terreno di trasfezione di plasmidi virali
Siero fetale bovinoCorning35-011-CVComponente del terreno di raccolta del virus e del terreno 293T
Pen/StrepThermo Fisher Scientific15140122Componente del terreno di coltura di organoidi e del tampone di dissociazione della cripta
PBS (senza Ca2+, Mg2+)Thermo Fisher Scientific10010049Un tampone di lavaggio e un componente del tampone di dissociazione della cripta
Mem-NEAAThermo Fisher Scientific11140050Componente del terreno di coltura di organoidi
GlutamaxIIThermo Fisher Scientific 35050061Componente del terreno di coltura di organoidi
HEPESThermo Fisher Scientific 15630080Componente del terreno di coltura di organoidi
EGFMillipore SigmaE9644Componente del terreno di coltura di organoidi
NogginPeprotech250-38 BComponente del terreno di coltura di organoidi
R-spondinaR& D7150-RS-025/CFComponente del terreno di coltura dell'organoide
Insulina ricombinante umanaMillipore SigmaI9278-5mlComponente del terreno di coltura dell'organoide
NicotinamideMillipore SigmaN3376-100GComponente del terreno di trasduzione
Wnt3AR& D5036-WN-010Componente del mezzo di trasduzione
Y27632Millipore SigmaY0503-1MGComponente del mezzo di trasduzione
0,5 M EDTA ThermoFisher Scientific15575020Componente del tampone di dissociazione Crypts
DTT (ditiotreitolo)Thermo Fisher ScientificR0861Componente del tampone di dissociazione
Crypts Dispase IMillipore SigmaD4818-2MGComponente del tampone per la digestione degli organoidi
DNasi IMillipore Sigma11284932001Componente del tampone per la digestione degli organoidi
matrigel (fattore di crescita ridotto)Corning356231Utilizzato come matrice per incorporare organoidi
Opti-MEMThermo Fisher Scientific31985070Medium per la trasfezione nella produzione virale
ViralMag R/LOz BiosiencesRL40200Particelle magnetiche di trasduzione virale
Piastramagnetica Oz BiosiencesMF10000Piastra magnetica per facilitare la trasduzione virale
Lipofectamine 2000Thermo Fisher Scientific11668019Agente di trasfezione nella produzione virale
Poly-D-LisineMillipore SigmaA-003-ERivestimento per piastre prima della semina delle cellule 293T
Soluzione di formaldeide al 4%BosterAR1068Soluzione per fissare organoidi
O.C.TThermo Fisher Scientific4583SPer l'inclusione degli organoidi
5 mL Provette Falcon in polistireneCorning352054
50 mL Falcon TubesSarstedt62.547.100
Orbitron rotator II Rocker ShakerBoekel Scientific260250
Olympus Microscop invertito CK30OlympusCK30per la scansione e il conteggio delle cripte
Zeiss Axiovert 200 a fluorescenza invertitaNikonAxiovert 200per la visualizzazione della fluorescenza nelle cripte
Amicon Ultra-15 Unità di filtro centrifugo con membrana Ultracel-100Milipore SigmaUFC910024Per la concentrazione di virus
pluriFiltro 20 µ m (Cell Strainer)pluriSelectSKU 43-50020Per la preparazione di frammenti di organoidi
Falcon Cell StrainerFisher Scientific352340Per la preparazione di cyrpt di dimensioni simili dopo l'isolamento della cripta
Greiner CELLSTAR  piastre di coltura multipozzetto 48 pozzetti (TC trattato con coperchio)Millipore SigmaM8937-100EAForD2:D37+D16:D37g frammenti di organoidi
Ceppo animale: C57BL/6JJackson Lab#000664Per la coltura di organoidi
composto incorporante

Riferimenti

  1. Cheung, E. C., et al. TIGAR is required for efficient intestinal regeneration and tumorigenesis. Dev Cell. 25 (5), 463-477 (2013).
  2. Xian, L., et al. HMGA1 amplifies Wnt signalling and expands the intestinal stem cell compartment an....

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Ristampe e permessi

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Trasduzione con vettori viralicoltura di organoidi intestinaliingegneria genetica di organoidiprotocollo di criosezionamentopreparazione di sezioni congelatecolorazione immunofluorescentetrasduzione con vettori lentiviralimatrice di membrana basalecrioconservazione di organoidi