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Research Article
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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
Abbiamo sviluppato un protocollo semplice ed efficiente per la preparazione di grandi quantità di protoplasti di soia studiare i complessi meccanismi di regolamentazione e di segnalazione in cellule vive.
Soia (Glycine max (L.) Merr.) è una specie di coltura importante ed è diventato un modello di legumi per gli studi delle vie genetiche e biochimiche. Pertanto, è importante stabilire un sistema di espressione genica transitoria efficiente in soia. Qui, segnaliamo un semplice protocollo per la preparazione dei protoplasti di soia e la sua applicazione per l'analisi funzionale transitorie. Abbiamo trovato che le foglie giovani unifoliate da piantine di soia ha provocato grandi quantità di protoplasti di alta qualità. Grazie all'ottimizzazione di un metodo di trasformazione PEG-calcio-mediata, abbiamo raggiunto l'efficienza di trasformazione alta utilizzando protoplasti unifoliate soia. Questo sistema fornisce un modello efficiente e versatile per l'esame dei complessi meccanismi di regolamentazione e di segnalazione in cellule di soia dal vivo e può aiutare per meglio comprendere diversi processi cellulari, inerente allo sviluppo e fisiologici dei legumi.
Protoplasti sono cellule vegetali che hanno rimosse le pareti cellulari. Come mantengono la maggior parte delle caratteristiche e attività di cellule vegetali, protoplasti sono un sistema di buon modello di osservare e valutare diversi eventi cellulari e sono strumenti preziosi per studiare ibridazione somatica1 e impianto di rigenerazione2. Protoplasti sono stati anche ampiamente utilizzati per impianto trasformazione3,4,5, poiché le pareti cellulari altrimenti bloccherebbe il passaggio del DNA nella cellula. Protoplasti possiedono alcune delle risposte fisiologiche e processi cellulari di piante intatte, offrendo quindi un valore fondamentale nella ricerca di base per lo studio di proteine sottocellulari localizzazione6,7,8, interazioni proteina-proteina9,10e promotore attività11,12,13 in cellule vive.
L'isolamento di protoplasti di pianta in primo luogo è stato segnalato nel 196014 e i protocolli per l'isolamento e la trasformazione dei protoplasti sono stati sviluppati e ottimizzati. Una procedura standard di isolamento del protoplasto comporta il taglio delle foglie e la digestione enzimatica delle pareti cellulari, seguita dalla separazione dei protoplasti rilasciati da detriti del tessuto non digerito. Strategie di trasformazione include elettroporazione15,16, microinjection17,18e base di polietilenglicole (PEG)4,5,19 metodi. Una vasta gamma di specie sono stati segnalati successo per l'isolamento di protoplasti, compresi agrumi20, Brassica21, Solanaceae22 e altre piante ornamentali famiglie23,24. Mentre i tipi di tessuti diversi sono utilizzati in varie specie, un sistema di espressione transiente in protoplasti di Arabidopsis mesofillo (TEAMP) isolato dalle foglie della pianta modello Arabidopsis thaliana è stato affermata25 e ampiamente adottato per diverse applicazioni.
Soia (Glycine max (L.) Merr.) è una delle proteine più importanti e olio colture26. A differenza di Arabidopsis e riso, ottenimento di piante di soia transgenica è noto per essere piuttosto difficile e basso rendimento. Agrobacterium tumefaciens-mediata infiltrazione è stato popolarmente utilizzato per studi di espressione transiente in cellule epidermiche in tabacco27 e piantine in Arabidopsis28,29, considerando che Agrobacterium rhizogenes è stato utilizzato per la trasformazione delle radici pelosi in soia30. Approcci di silenziamento genica indotta da virus sono stati utilizzati per downregulation di destinazione geni31,32 e transitori espressione33 in maniera sistematica. Protoplasti forniscono una preziosa e versatile alternativa a questi approcci. Protoplasti possono essere ottenuti da materiali aboveground di soia e consentono l'espressione del transgene rapido e sincronizzato. Tuttavia, poiché l'isolamento iniziale successo dei protoplasti di soia nel 198334, ci sono stati rapporti limitati sull'applicazione dei protoplasti in soia35,36,37, 38, principalmente a causa della relativamente basse rese dei protoplasti di soia.
Qui, descriviamo un protocollo semplice ed efficiente per l'isolamento di protoplasti di soia e la sua applicazione per studi di espressione genica transitoria. Utilizzando foglie giovani unifoliate da piantine di soia, siamo stati in grado di ottenere grandi quantità di protoplasti vitali entro poche ore. Inoltre, abbiamo ottimizzato un metodo di trasformazione di PEG-calcio-mediata che è semplice e a basso costo per trasportare DNA in protoplasti di soia con alta efficienza.
1. la crescita delle piante
2. preparazione del DNA del plasmide
3. isolamento di protoplasti
4. trasformazione di protoplasti
5. protoplasti incubazione e raccolta
Diversi organi di soia 10 - giorno-vecchio sono stati testati per la preparazione del protoplasto (Figura 1) e i rendimenti sono stati osservati al microscopio (Figura 2). Pareti cellulari da ipocotile ed epicotyl erano appena digeriti, e alcune cellule siamo stati attaccati alla vicenda (Figura 2B, 2C). Nel cotiledone (Figura 2D) e radice (Figura 2A), pareti cellulari sono stati rimossi solo in una piccola porzione delle cellule. Al contrario, un gran numero di protoplasti sono stato osservato quando unifoliate è stato utilizzato (Figura 2E-G). Unifoliate foglie alle varie fasi di sviluppo sono stati ulteriormente esaminati (Figura 2 H). Mentre le foglie di unifoliate non espansi e appena espanse ha provocato alti rendimenti dei protoplasti, la dimensione dei protoplasti da appena espansa unifoliata erano più uniforme (Figura 2F) rispetto al non espansi unifoliate (Figura 2E). Per completamente espanso unifoliate, le pareti cellulari erano ancora intatte nella maggior parte delle cellule (Figura 2). Abbiamo testato gli enzimi della parete cellulare-digestione da tre diversi produttori e ottenuto risultati comparabili come descritto sopra. Sulla base di queste osservazioni, abbiamo concluso che la selezione dei materiali vegetali era un fattore cruciale e che appena espanse unifoliate foglie da piantine giovani soia erano il miglior materiale per la preparazione del protoplasto.
Una gamma di diverse quantità di plasmide DNA (0.1 µ g, 1 µ g, 5 µ g e 20 µ g) è stata testata per l'efficienza di trasformazione ottimale dei protoplasti unifoliate soia (Figura 3A-D). 20 µ g plasmide DNA ha mostrato la massima efficienza di trasformazione con più di tasso di trasformazione del 50% (Figura 3D), mentre 0,1 µ g ha mostrato il più basso (meno dell'1%) (Figura 3A). Abbiamo ottenuto l'efficienza di trasformazione paragonabile utilizzando diversi kit di purificazione del DNA da tre produttori. Questo risultato suggerisce che grandi quantità di DNA plasmidico sarebbe di grande aiuto per aumentare l'efficienza di trasformazione.
Nella figura 4 è immagini confocal di protoplasti di soia trasformati con costrutto p2GWF7-E1, che esprime GFP fuse al legume specifico gene E1 (Glyma.06G207800), guidato da promotore CaMV 35S nel p2GWF7 di vettore 39. proteina di fusione GFP-E1 Mostra la localizzazione nucleare in protoplasti di soia, che è coerente con uno studio precedente utilizzando il sistema protoplasti di Arabidopsis40. Dato che E1 è un gene specifico di legume, il nostro risultato utilizzando il sistema di protoplasti di soia fornisce un'analisi conclusiva la localizzazione subcellulare delle proteine E1.

Figura 1. L'illustrazione Mostra gli organi di un semenzale di soia che sono testati per la preparazione del protoplasto in questo studio, tra cui radice, ipocotile, cotiledone, epicotyl e unifoliate. Dopo un paio di foglie unifoliate, piantine di soia sviluppano foglie trifogliate. Clicca qui per visualizzare una versione più grande di questa figura.

Figura 2. Cellule di protoplasti preparate da diversi organi e fasi di sviluppo delle piantine di soia. (A-D) Le cellule preparati da diversi organi di 10 - giorno-vecchio piantine di soia: radice (A), ipocotile (B), epicotyl (C), cotiledone (D). (E-G) Cellule di protoplasti preparate da foglie unifoliate a diversi stadi di sviluppo: non espansi (E), appena ampliato (F) e completamente espansi (G) unifoliate, corrispondenti per le piantine di soia in (H) a sinistra, centro e destra, rispettivamente. La barra della scala è di 25 µm (A-G) o 25 mm (H). Clicca qui per visualizzare una versione più grande di questa figura.

Figura 3. Immagini confocal mostrando efficienza di trasformazione di soia unifoliati protoplasti con diverse quantità di DNA plasmidico. Immagini di GFP (rappresentato in verde) e luminoso campo (grigio) vengono unite. Protoplasti sono stati trasformati con diverse quantità del plasmide p2GWF7-E1: 0,1 µ g (A), 1 µ g (B), 5 µ g (C) e 20 µ g (D). Segnale di fluorescenza della GFP è stato monitorato 24 ore dopo la trasformazione nell'ambito di microscopia. La barra della scala nera è 50 µm. Clicca qui per visualizzare una versione più grande di questa figura.

Figura 4. Immagini confocal mostrando la localizzazione subcellulare di E1-GFP nel nucleo di soia protoplasti unifoliati. Il plasmide p2GWF7-E1 è stato utilizzato per la trasformazione. Immagini di GFP (rappresentato in verde) e luminoso campo (grigio) vengono unite. Segnale di fluorescenza della GFP è stato monitorato 24 ore dopo la trasformazione. La barra della scala nera è 5 µm. Clicca qui per visualizzare una versione più grande di questa figura.
| Soluzione enzimatica (preparata) | |
| MES, pH 5.7 | 20mM |
| Cellulasi CELF | 2% (p/v) |
| Pectolyase Y-23 | 0,1% (p/v) |
| Mannitolo | 0,75 M |
| CaCl2 | 0,2 mM |
| BSA | 0,1% (p/v) |
| DTT | 0,5 mM |
| W5 soluzione | |
| NaCl | 154 mM |
| CaCl2 | 125 mM |
| KCl | 5 mM |
| MES, pH 5.7 | 2 mM |
| Soluzione di MMg | |
| MES, pH 5.7 | 4 mM |
| Mannitolo | 400 mM |
| MgCl2 | 15 mM |
| Soluzione di PEG (preparata) | |
| PEG4000 | 20% (p/v) |
| Mannitolo | 200 mM |
| CaCl2 | 100 mM |
| Soluzione WI | |
| MES, pH 5.7 | 4 mM |
| Mannitolo | 0,5 M |
| KCl | 20 mM |
Tabella 1. Soluzioni utilizzate per la trasformazione e l'isolamento di protoplasti di soia.
Gli autori dichiarano di non avere nessun concorrenti interessi finanziari.
Abbiamo sviluppato un protocollo semplice ed efficiente per la preparazione di grandi quantità di protoplasti di soia studiare i complessi meccanismi di regolamentazione e di segnalazione in cellule vive.
Questo lavoro è stato supportato dal programma di ricerca del genoma di pianta dalla National Science Foundation (NSF-PGRP-IOS-1339388).
| MES | Sigma Aldrich | M8250-100G | |
| Cellulasi CELF | Worthington Biological Corporation | LS002611 | |
| Pectoliasi Y-23 | BioWorld | 9033-35-6 | |
| CELLULASI "ONOZUKA" R-10 | yakult | 10g | |
| MACEROZYME R-10 | yakult | 10g | |
| Mannitolo | ICN Biomedicals | 152540 | |
| CaCl2 | Fisher | C79-500g | |
| BSA | NEB | R3535S | |
| DTT | Sigma Aldrich | D5545-5G | |
| NaCl | Sigma Aldrich | S7653-1kg | |
| KCl | Fisher | P217-500g | |
| MgCl2 | Sigma Aldrich | M8266-100g | |
| PEG4000 Fluka | 81240 | ||
| nylon mesh | carolina | 652222N | |
| Piastre per colture tissutali | USA Scientific | CC7682-7506 | |
| Lamette da barba | Fisher | 12-640 | |
| emacitometro | hausserscientific | 1483 | |
| QIAprep Spin Miniprep Kit | Qiagen | 27104 | |
| Kit miniprep plasmidico EZNA | Omega | D6942-01 | |
| Kit miniprep plasmidico GeneJET | Thermo Scientific | K0502 | |
| Centrifuga 5810 | eppendorf | 5811000827 | |
| Centrifuga 5424 | eppendorf | 22620401 | |
| Jencons Powerpette Plus Pipet Controller | Jencons | 14526-202 | |
| Microscopio confocale Zeiss 710 | Zeiss | N/A | |
| Provette per microfuge antiaderenti prive di RNasi, 1,5 mL | Ambion AM12450 | ||
| 15 mL Provette da centrifuga | Denville | C1018-P | |
| Provette da centrifuga da 50 mL | Denville | C1060-P | |
| Siero per vitelli neonati | Thermo Scientific | 16010159 | |
| Soil | Ingram's Nursery | ||
| perlite | Vigoro | 100521091 | |
| Torpedo Sabbia | JKS Ventures | ||
| LB Brodo, Lennox (Polvere) | Fisher | BP1427-500 |