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Research Article
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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
Qui presentiamo un protocollo per valutare l'organizzazione di reti astrocytic. Il metodo descritto riduce al minimo la distorsione per fornire misure descrittivi di queste reti come il conteggio delle cellule, dimensioni, area e posizione all'interno di un nucleo. Anisotropia è valutato con un'analisi vettoriale.
È diventato sempre più chiaro che gli astrociti modulano la funzione di un neurone non solo a livello sinaptico e cella singola, ma anche a livello di rete. Gli astrociti sono fortemente collegati tra loro attraverso giunzioni di gap e accoppiamento attraverso queste giunzioni è dinamico e altamente regolato. Un concetto emergente è che funzioni astrocytic sono specializzate e adattate per le funzioni del circuito neuronale a cui sono associati. Pertanto, metodi per misurare i vari parametri delle reti astrocytic sono necessari per meglio descrivere le regole che disciplinano la loro comunicazione e l'accoppiamento e per capire meglio le loro funzioni.
Qui, utilizzando il software di analisi di immagine (ad es., ImageJFIJI), descriviamo un metodo per analizzare immagini confocal di reti astrocytic rivelati da tintura-accoppiamento. Questi metodi consentono di 1) un rilevamento automatizzato e imparziale delle cellule con etichettate, 2) calcolo della dimensione della rete, 3) calcolo dell'orientamento preferenziale della tintura diffuse all'interno della rete e 4) riposizionamento della rete all'interno dell'area di interesse .
Questa analisi consente di caratterizzare astrocytic reti di una particolare area, confrontare reti di diverse aree associate a funzioni diverse o reti ottenute in condizioni diverse che hanno effetti diversi sull'accoppiamento. Queste osservazioni potrebbero portare a importanti considerazioni funzionali. Per esempio, analizziamo le reti astrocytic di un nucleo trigeminale, dove precedentemente abbiamo indicato che accoppiamento astrocytic è essenziale per la capacità dei neuroni di passare loro schemi di attivazione da tonico per rottura ritmica1. Misurando le dimensioni, confinamento e orientamento preferenziale delle reti astrocytic in questo nucleo, possiamo costruire ipotesi sui domini funzionali che circoscrivono. Parecchi studi suggeriscono che diverse altre aree cerebrali, tra cui la corteccia barile, oliva superiore laterale, glomeruli olfattivi e sensoriali nuclei nel talamo e corteccia visiva, per citarne alcuni, possono beneficiare di una simile analisi.
Molti studi hanno descritto come il dialogo di neuroni-astrociti a livello sub-cellulare o sinaptico può avere implicazioni in funzioni neuronali e trasmissione sinaptica. È affermato che gli astrociti sono sensibili ai circostanti attività neuronale; Infatti, essi hanno recettori per neurotrasmettitori molti tra cui glutammato, GABA, acetilcolina e ATP (Vedi recensioni precedentemente pubblicate2,3,4). In cambio, astrocitari elabora elementi sinaptica Sheath e attività neuronale influenza entrambe c'e presso siti extrasynaptic regolazione dell'omeostasi ionica extracellulare e rilasciando diversi fattori o trasmettitori quali glutammato, D-serina e ATP 5 , 6 , 7.
L'idea che gli astrociti possono anche modulare la funzione di un neurone a livello di rete è emerso, con evidenza che accoppiamento astrocytic spazialmente è regolata e corrisponde a un neurone segmentazione in aree caratterizzate da un chiaro anatomico compartimentazione (come le zone con le rappresentazioni sensoriali), che indica che gli astrociti saranno accoppiare ad altri astrociti che servono la stessa funzione, piuttosto che solo quelli che sono nelle vicinanze. Nell'oliva superiore laterale, ad esempio, reti più astrocytic sono orientati ortogonalmente al tonotopico asse8, considerando che nei glomeruli barile corteccia o olfactoty, è molto più forte all'interno di botti o glomeruli comunicazione tra astrociti e più debole tra adiacente quelli9,10. In entrambi i casi, le reti astrocytic sono orientate verso il centro del glomerulo o canna9,10.
Recentemente abbiamo dimostrato che attività astrocytic modula il firing neuronale diminuendo la concentrazione di Ca extracellulare2 + ([Ca2 +]e), presumibilmente attraverso il rilascio di S100β, a Ca2 +-binding proteina11. Questo effetto, che è stato dimostrato in una popolazione di neuroni trigeminali rhythmogenic nella parte dorsale della sensitiva del trigeminal principale nucleo (NVsnpr, pensato per svolgere un ruolo importante nella generazione di movimenti masticatori), deriva dal fatto che ritmica infornamento in questi neuroni dipende da un Na persistente+ attuale che è promosso da diminuzioni della [Ca2 +]t11,12. Ritmica infornamento in questi neuroni può essere suscitata "fisiologicamente" da stimolazione dei loro ingressi o artificiale diminuzione della [Ca2 +]e. Abbiamo ulteriormente dimostrato che astrocytic accoppiamento è stato richiesto per firing neuronale ritmica1. Ciò ha sollevato la possibilità che reti astrocytic possono formare circoscritte domini funzionali dove le attività di un neurone può essere sincronizzato e coordinato. Per valutare questa ipotesi, abbiamo prima bisogno di sviluppare un metodo per documentare rigorosamente l'organizzazione di queste reti all'interno di NVsnpr.
Gli studi precedenti sulle reti astrocytic sono descritti principalmente nella misura dell'accoppiamento in termini di numero delle cellule e la densità e l'area coperta. Tentativi di valutare la forma delle reti astrocytic e la direzione della tintura-accoppiamento per la maggior parte sono stati eseguiti confrontando le dimensioni delle reti lungo due assi (x e y) nella canna corteccia9, ippocampo13,14, 15, barreloid campi il talamo16, laterale superiore oliva8, glomeruli olfattivi10e corteccia14. I metodi descritti qui abilitare imparziali conteggi delle cellule con etichettate in una rete e una stima dell'area che coprono. Abbiamo inoltre sviluppato strumenti per definire l'orientamento preferito di accoppiamento all'interno di una rete e per valutare se l'orientamento preferito è verso il centro del nucleo o in una direzione diversa. Rispetto ai metodi precedenti, questo protocollo fornisce un mezzo per descrivere l'organizzazione e l'orientamento delle reti astrocytic in strutture come il nucleo sensitivo principale del trigemino dorsale che non dispongono di un conosciuto Chiara anatomico compartimentalizzazione. Negli studi di cui sopra, l'orientamento della rete è descritto come una relazione tra la forma della struttura stessa che è già documentata (ad es., strati di barreloid nel talamo, barili nella corteccia, nell'ippocampo e nella corteccia, glomeruli in il bulbo olfattivo, ecc.). Inoltre, analisi vettoriale consente comparazioni di orientamenti ha rivelati in diverse condizioni di accoppiamento. Per analizzare se questi parametri cambiati secondo la posizione della rete all'interno del nucleo, abbiamo anche sviluppato un metodo per sostituire ogni rete in riferimento i confini del nucleo. Questi strumenti possono essere facilmente adattati ad altre aree per le reti d'istruttore delle cellule accoppiate.
Tutte le procedure di dimora secondo le regole di ricerca canadese istituti di salute e sono state approvate dal comitato di uso e cura degli animali University di Montreal.
1. preparazione di fettine di cervello di ratto
2. solforodamina 101 (SR-101) etichettatura degli astrociti
3. astrocyte Patching e biocitina riempimento
4. biocitina rivelazione
5. rete Imaging
6. image Analysis
come le coordinate per una determinata cella;
come le coordinate della cella con patch (o il punto referenziale della rete); e
come le coordinate per una determinata cella nel nuovo referenziale.
) come le coordinate del vettore principale di orientamento preferenziale; e
come le coordinate di ogni cella della rete ottenuta con la patch cell come referenziale.
e
.
sono le coordinate di cella con il 4x referenziale;
sono le coordinate di cella con 20 X referenziale (quadrato arancione nella Figura 5); e
sono le coordinate del 20 X punto referenziale nell'immagine X 4 (20XR).
sono la cella coordinate nel rettangolo di delimitazione referenziale;
sono le coordinate di cella in 4 X referenziale; e
sono le coordinate del rettangolo di delimitazione referenziale nell'immagine X 4.
sono la cella coordinate nella percentuale della larghezza e altezza del rettangolo di delimitazione;
sono la cella coordinate nel rettangolo di delimitazione referenziale;
è la larghezza del rettangolo di delimitazione, misurata di sopra del protocollo; e
è l'altezza del rettangolo di delimitazione misurata di sopra del protocollo.
è la coordinata x sul lato destro della sezione; e
è la nuova coordinata x espressa nel referenziale sul lato sinistro della fetta.
e
, rispettivamente, nel rettangolo di delimitazione referenziale (calcolato in precedenza).
Accoppiamento tra le cellule del cervello non è statico ma piuttosto dinamicamente regolato da molti fattori. I metodi descritti sono stati sviluppati per analizzare reti astrocytic ha rivelati in condizioni diverse e a capire la loro organizzazione in NVsnpr. Questi risultati sono stati già pubblicati1. Abbiamo effettuato biocitina riempimento dei astrocytes singolo nella parte dorsale del NVsnpr in tre diverse condizioni: a riposo (in condizioni di controllo in assenza di qualsiasi stimolo), a Ca2 +-senza condizioni e dopo la stimolazione elettrica di fibre sensoriali che proiettano al nucleo. Le impostazioni sperimentali per il riempimento di biocitina degli astrociti per ogni condizione sono illustrate nel lato sinistro della Figura 6A- C.
Reti di cellule biocitina-identificati sono stati osservati in condizioni di controllo e confermato una condizione basale della cellula accoppiamento tra astrociti NVsnpr a riposo. In 11 casi testati, biocitina diffusione ha mostrato reti composto di 11 ± 3 celle (pannello centrale in Figura 6A, Figura 6) che si estende su una superficie di 34737 ± 13254 µm2 (Figura 6E). Carbenoxolone (CBX, 20 μM), un bloccante aspecifico di giunzioni di gap, è stato utilizzato in un insieme indipendente di esperimenti per garantire che l'etichettatura osservata era un risultato della diffusione di biocitina attraverso giunzioni di gap e non l'assorbimento da parte delle cellule di biocitina, che potrebbe fuoriuscire nello spazio extracellulare dalla pressione positiva applicata per la pipetta patch prima dell'applicazione di patch. Applicazione di vasca di CBX ha ridotto il numero delle cellule con etichettate alle 2 ± 0,5 cellule (pannello di destra in Figura 6A, Figura 6; Metodo di Iman-Conover, P = 0,016; Prova di Holm-Sidak, P = 0,010) e la zona di biocitina sparsa a 2297 ± 1726 µm2 (Figura 6E; Metodo di Iman-Conover, P = 0,0009; Prova di Holm-Sidak, P = 0,025).
L'effetto di rimozione di calcio dal mezzo su NVsnpr astrocytic reti è stato testato perché concentrazione bassa del calcio extracellulare è conosciuta per aprire connexins e divario giunzioni20,21,22e può essere utilizzato come uno stimolo enorme e uniforme per aprirsi il sincizio e massimizzare la diffusione dell'elemento tracciante attraverso giunzioni gap. Le reti astrocitari che sono state rivelate in Ca2 +-gratis condizioni (n = 10) ha mostrato un numero maggiore di celle rispetto le reti hanno rivelato in condizioni di controllo, con 37 ± 10 etichettati cellule (pannello centrale in Figura 6, Figura 6; Metodo di Iman-Conover, P = 0,016; Prova di Holm-Sidak, P < 0,001) che copre un'area di 108123 ± 27450 μm2 (pannello centrale in Figura 6, Figura 6E; Metodo di Iman-Conover, P = 0,009; Prova di Holm-Sidak, P = 0,001).
Rispetto per la rimozione completa di calcio dal mezzo, la stimolazione elettrica di input afferente al nucleo di interesse è uno stimolo più fisiologico che coinvolge direttamente i circuiti neuronali di interesse. Di conseguenza, i risultati da questo tipo di manipolazione possono fornire informazioni significative per quanto riguarda le implicazioni funzionali delle reti astrocytic osservate. Per esempio, ingresso da due vie differenti può portare a diversi effetti sullo stato basale delle cellule in una determinata area di accoppiamento, o esso può suscitare accoppiamento tra astrociti in suddivisioni distinte del nucleo. Nel nostro circuito, la stimolazione elettrica delle fibre sensoriali che il progetto per la NVsnpr utilizzando i treni 2 secondi di 0,2 ms impulsi a 40-60 Hz (n = 11) ha prodotto un aumento dell'accoppiamento tra astrociti NVsnpr, relativa alle condizioni non stimolate, con 23 ± 6 celle (pannello centrale in Figura 6B, Figura 6; Metodo di Iman-Conover, P = 0,016; Prova di Holm-Sidak, P = 0,012) esteso su una superficie di 814174 ± 15270 μm2 (pannello centrale in Figura 6B, Figura 6E; Metodo di Iman-Conover, P = 0,009; Prova di Holm-Sidak, P = 0,004).
Tutti gli effetti di questi due tipi di stimolazione, la rimozione di calcio dal mezzo e la stimolazione elettrica di input afferente, sono interrotte da CBX. Le reti astrocytic in questa condizione comprende solo 5 ± 1 celle in Ca2 +-aCSF gratis (pannello di destra in Figura 6, Figura 6; n = 4; Metodo di Iman-Conover, P = 0,016; Prova di Holm-Sidak, P < 0,001) e 9 ± 2 celle con stimolazione fibre sensoriali (pannello di destra in Figura 6B, Figura 6; n = 6; Metodo di Iman-Conover, P = 0,016; Prova di Holm-Sidak, P = 0,023). La rete di superficie aree inoltre sono stati ridotti a 17987 ± 9843 µm2 con Ca2 +-aCSF gratis (Figura 6E; n = 4; Metodo di Iman-Conover, P = 0,009; Prova di Holm-Sidak, P = 0,004) e 39379 ± 11014 µm2 con stimolazione fibre sensoriali (Figura 6E; n = 6; Metodo di Iman-Conover, P = 0,009; Prova di Holm-Sidak, P = 0.055).
Analisi anatomica è stata eseguita solo in casi dove i confini di NVsnpr potrebbero essere chiaramente definiti su 4 X imaging, che è stato ottenuto nel caso di 9 su 10 reti con Ca2 +-aCSF gratis e 8 su 11 reti ottengono con stimolazione elettrica. Stampa di tutte le reti astrocytic analizzate su un teorico NVnspr dimostra che la maggior parte delle cellule comprende nelle reti furono confinata entro i confini di nucleo (figure 7A e 7B, pannelli di sinistro e centrali). Nell'ambito di Ca2 +-gratuito aCSF, 4 su 9 reti astrocytic diffondere fuori la NVsnpr in direzione del nucleo motore situato medialmente per il NVsnpr. In questi 4 casi, la maggior parte delle cellule con etichettate furono confinata nel nucleo. Le reti di cellule con etichettate ottenute con stimolazione elettrica delle fibre sensoriali erano più ristrette. Solo 2 reti estese oltre i confini del nucleo, in cui uno si sviluppa oltre il confine di mediodorsal nella zona laterale supratrigeminal (rete verde scuro in figura 7B, pannelli di sinistro e centrali). Nel secondo caso, 2 astrociti nella rete rosso (figura 7B, pannelli di sinistro e centrali) attraversò la parte ventrale della NVsnpr.
L'analisi vettoriale per l'orientamento preferenziale di reti astrocitari (pannello di destra in figura 7A e 7B) prodotto risultati diversi a seconda dello stimolo utilizzato. Infatti, per le reti astrocytic osservate con Ca2 +-aCSF gratis, tutti tranne uno dei vettori di orientamento preferenziale sono stati orientati verso il centro della NVsnpr. Tuttavia, per le reti astrocytic osservate con stimolazione elettrica, i vettori di orientamento preferenziale erano per lo più orientati verso i confini del nucleo. Questo si riflette le differenze angolare computate in orientamento preferenziale tra le reti astrocytic ottenuti con Ca2 +-free aCSF e quelli ottenuti con la stimolazione elettrica delle fibre sensoriali. Nell'ambito di Ca2 +-libero aCSF, i grafici a barre verticali della distribuzione della differenza angolare ha mostrato che la maggior parte delle reti di cellule con etichettate hanno una differenza angolare tra 0 e 40 gradi, con una media di differenza angolare di 39,5 ± 12,7 gradi ( Figura 7). Con stimolazione elettrica delle fibre sensoriali, la distribuzione è più uniforme, e la differenza angolare media (99,5 ± 17 gradi) è significativamente diversa (Figura 7; test t di student, P = 0,012).
Questi dati mostrano che biocitina etichettatura analisi ci permette di distinguere gli effetti di differenti stimoli astrocytic accoppiamento di modulazione. Inoltre, la mappatura delle reti astrocytic in un nucleo normalizzato seguita da analisi vettoriale fornisce preziose informazioni sulla dimensione e sull'organizzazione anatomica di queste reti.

Figura 1: cellule intere patch-clamp di Astrocita. (A) gli astrociti etichettati con un carico del marcatore solforodamina 101 (SR-101) in NVsnpr. Una soma di SR-101-labeled Astrocita si rivolge con la pipetta di patch (linea tratteggiata bianca). Scala bar = 100 μm. (B) un protocollo di rampa depolarizzazione è eseguito in tensione-clamp (da -120 a 110mV) per valutare le caratteristiche di passivo di astrociti. (C) valutazione della mancanza di potenziale di azione di infornamento nell'Astrocita tramite l'iniezione di impulsi di corrente in modalità di corrente-morsetto. Questa figura è adattata da Carlo et al. (2018) 1. per favore clicca qui per visualizzare una versione più grande di questa figura.

Figura 2: trattamento e analisi di reti astrocitari con software ImageJFIJI. (A) creazione di Z-Stack dall'imaging confocale di una rete astrocytic. La finestra di Z-stack alto-sinistra, in ImageJFIJI. (B) processo di sottrazione del background. In alto a sinistra, sottrarre finestra di sfondo in ImageJFIJI. Il cerchio tratteggiato enfatizza l'area dell'immagine dove l'effetto del comando Sottrai sfondo è la più evidente quando rispetto all'immagine nel processo di A. (C) Remove outlier. Questo processo rimuove le piccole macchie a causa di depositi non specifici di streptavidine accoppiato a un Alexa 594. Le frecce bianche indicano il deposito prima (Figura 2B) e dopo (Figura 2) è stato elaborato il comando. In alto a sinistra, rimuovere finestra outlier in ImageJFIJI. (D) esempio dell'effetto sfuocato che può essere prodotto da un'insufficiente regolazione dei parametri valori erratici Rimuovi. Frecce gialle mostrano alcune cellule offuscate. (E) regolare processo di soglia. In alto a sinistra, regolare finestra soglia in ImageJFIJI. Le barre di scorrimento agiscono per la regolazione del segnale di soglia. (F) fare passo binario. L'immagine viene convertita in un file binario in ImageJFIJI. Scala bar = 100 μm. Clicca qui per visualizzare una versione più grande di questa figura.

Figura 3: rilevazione delle cellule nelle reti astrocitari con ImageJFIJI. (A) esempio di un'immagine binaria di una rete di astrociti ottenuta in ImageJFIJI. Scala bar = 100 μm. (B) illustra il "file di rilevamento" ottenuto dopo l'applicazione il processo di particelle analizza il file binario. Le forme corrispondono a tutte le cellule rilevate con loro numero associato in rosso. (C) parte di sinistra: analizzare finestra di particelle in ImageJFIJI. Questa funzione rileva le celle della rete nell'immagine binaria. La dimensione delle cellule rilevate e loro circolarità può essere regolata. Numeri da utilizzare devono essere impostati per tentativi ed errori fino a quando si ottiene un risultato soddisfacente. Parte a destra: tabella di rilevamento generato dal processo di analisi particelle. X e Y colonne riportate le coordinate di ogni cella rilevato nell'immagine. Clicca qui per visualizzare una versione più grande di questa figura.

Figura 4: rete area analisi e determinazione della cella con patch in ImageJFIJI. (A) utilizzando di che lo strumento poligono in ImageJFIJI, un ROI viene fatta risalire intorno all'ammasso ha rilevato le cellule (linea rossa) che verranno utilizzate per determinare l'area della superficie della rete. (B) il ROI viene aggiunto il gestore di ROI. (C) esempio di una rete astrocytic in cui la cella con patch (freccia bianca) è facilmente identificabile a causa della notevole intensità di relativa etichettatura biocitina. (D) esempio di una rete astrocytic dove la cella con patch non potrebbe essere identificata, ma dove una superficie di più denso etichettatura chiaramente indica biocitina depositi. Un ROI è disegnato intorno a questa zona e aggiunto al gestore di ROI. Il centroide viene calcolato e considerato come la posizione della cella con patch da utilizzare per analisi vettoriale. Scala bar = 100 μm. Clicca qui per visualizzare una versione più grande di questa figura.

Figura 5: diagramma dei referenziali differenti utilizzati per l'analisi di reti astrocytic. Il quadrato grigio è l'immagine di X 4 con il referenziale 4XR punto per essere allineato con l'angolo in basso a sinistra del documento Adobe Illustrator. Il quadrato bianco circondato in arancione è l'immagine di X 20 con il 20XR di punto referenziale. Entrambe le immagini sono allineate tra loro come descritto nel protocollo. Il rettangolo di delimitazione (blu) definisce NVsnpr (linea tratteggiata viola) e viene ridimensionato in percentuale con il punto referenziale (BR). Il centro teorico della parte dorsale del NVsnpr è schematizzato dal puntino blu scuro (C). La rete astrocytic è schematizzata dalla cella patchata (puntino nero, P) e il principale vettore della direzione preferenziale (linea rossa). Ogni linea nera tratteggiata è il vettore di ogni cella della rete astrocytic. La differenza angolare della rete astrocitario (α) è l'angolo tra l'orientamento preferenziale principale della rete (linea rossa) e la linea nera che collega l'Astrocita patchato al centro teorico del nucleo. Inserto è uno zoom dell'immagine X 20 mostrando il triangolo PCD formata dal centro teorico della NVsnpr (C), la cella con patch e il principale vettore di direzione preferenziale (D). Clicca qui per visualizzare una versione più grande di questa figura.

Figura 6: reti Astrocytic etichettati con biocitina in NVsnpr in condizioni diverse, mostrando diverse dimensioni. (A-C) A sinistra, un disegno schematico del condizione sperimentale. In tutte le condizioni, un singolo astrocyte etichettati da SR-101 è stato mirato per la registrazione di cellule intere e riempito con biocitina (0,2%). Colonna centrale: microfotografie illustrando le reti astrocytic ottenute sotto controllo le condizioni (A), dopo la stimolazione elettrica del tratto Vth (2 treni s, 40-60 Hz, 10-300 µA, impulsi di 0,2 ms) (B); e dopo perfusione con Ca2 +-aCSF gratis (C). Colonna destra: microfotografie illustrando le reti astrocytic ottenuti nelle stesse condizioni, ma in presenza di CBX (20 μM) nella prima vasca. Scala bar = 100 μm. (D ed E) Grafico a barre verticali che rappresenta il numero di accoppiato le cellule e l'area della superficie, rispettivamente, delle reti piene di biocitina degli astrociti sotto le tre condizioni sperimentali presentati sopra (A, B e C) in presenza (tratteggiata) e in assenza (solido) di CBX (20 ΜM). I dati sono rappresentati come media ± SEM. Multiple confronti (Holm-Sidak test): * = P < 0,05; * * = P < 0,001. Questa figura è adattata da Carlo et al. (2018) 1. per favore clicca qui per visualizzare una versione più grande di questa figura.

Figura 7: Caratterizzazione delle reti in NVsnpr sotto Ca2 +-aCSF gratis e con stimolazione elettrica del tratto Vth . (A e B) Sinistra: Tutte le cellule identificate in 9 reti riempita sotto aspersione con Ca2 +-free aCSF (A) o a 8 reti riempiti stimolando il tratto Vth (B) vengono tracciate secondo la loro posizione in un nucleo teorico di NVsnpr (rettangolo grigio). Ogni rete (e le cellule che lo compongono) sono rappresentate da un colore diverso. Centrale: i confini di ciascuna rete. Il punto in ciascuna area rappresenta la cella con patch. Diritto: rappresentazione di vettore principale di orientamento preferenziale di ciascuna rete. Il punto rappresenta la cella con patch e la freccia del vettore di direzione preferenziale. (C e D) Distribuzione delle differenze angolari tra il vettore principale dell'orientamento preferenziale e una linea retta che collega la cella con patch al centro della parte dorsale del NVsnpr (che si trova al 25% sull'asse dorsoventral e al 50% sull'asse mediolateral) sotto la due condizioni studiate. La differenza angolare media era 39,5 ± 12,7 gradi in Ca2 +-aCSF gratuito, che indica un orientamento preferenziale verso il centro del nucleo e 99,5 ± 17 gradi con stimolazione elettrica, che indica un orientamento preferenziale verso il periferia (test t di student, P = 0,012). Questa figura è adattata da Carlo et al. (2018) 1. per favore clicca qui per visualizzare una versione più grande di questa figura.
| saccarosio-aCSF* | mMol |
| Saccarosio | 219 |
| KCl | 3 |
| KH2PO4 | 1.25 |
| MgSO4 | 4 |
| NaHCO3 | 26 |
| Destrosio | 10 |
| CaCl2 | 0.2 |
Tabella 1: composizione della soluzione di saccarosio-basato usato per affettare cervello. (*) = pH e osmolarità erano regolato a 7,3-7,4 e 300-320 mosmol/kg, rispettivamente.
| aCSF* | mMol |
| NaCl | 124 |
| KCL | 3 |
| KH2PO4 | 1.25 |
| MgSO4 | 1.3 |
| NaHCO3 | 26 |
| Destrosio | 10 |
| CaCl2 | 1.6 |
Tabella 2: composizione della soluzione aCSF utilizzata per la registrazione di cellule intere e fetta deposito. (*) = pH e osmolarità erano regolati individualmente 7.3-7.4 e 290-300 mosmol/kg, rispettivamente.
| Soluzione interna patch* | mMol |
| K-gluconato | 140 |
| NaCl | 5 |
| HEPES | 10 |
| EGTA | 0,5 |
| Sale di tris ATP | 2 |
| Sale di tris GTP | 0.4 |
Tabella 3: composizione della soluzione interna utilizzata per la registrazione di cellule intere. (*) = pH e osmolarità erano regolati individualmente 7.2-7.3 e 280-300 mosmol/kg, rispettivamente.
Gli autori non hanno nulla a rivelare.
Qui presentiamo un protocollo per valutare l'organizzazione di reti astrocytic. Il metodo descritto riduce al minimo la distorsione per fornire misure descrittivi di queste reti come il conteggio delle cellule, dimensioni, area e posizione all'interno di un nucleo. Anisotropia è valutato con un'analisi vettoriale.
Questo lavoro è finanziato da istituti canadesi di ricerca sanitaria, Grant/premio numero: 14392.
| NaCl | Fisher Chemicals | S671-3 | |
| KCl | Fisher Chemicals | P217-500 | |
| KH2PO4 | Fisher Chemicals | P285-500 | |
| MgSO4 | Fisher Chemicals | M65-500 | |
| NaHCO3 | Fisher Chemicals | S233-500 | |
| C6H12O6 Destrosio anidro | Fisher Chemicals | D16-500 | |
| CaCl2 disidratato | Sigma | C70-500 | |
| Saccarosio | Sigma | S9378 | |
| Acido D-gluconico sale di potassio | Sigma | G45001 | |
| MgCl2 anidro | Sigma | M8266 | |
| HEPES | Sigma | H3375 | |
| EGTA | Sigma | E4378 | |
| ATPTris Sale | Sigma | A9062 | |
| GTPTris Sale | Sigma | G9002 | |
| Biocitina | Sigma | B4261 | |
| Carbenoxolone sale disodico | Sigma | C4790 | |
| complesso avidina-biotina : Kit ABC | Vestor laboratories | PK-4000 | |
| Streptavidina-alexa 594 | Sonde molecolari | S11227 | |
| Triton | Fisher Chemicals | BP151-500 | |
| Xylene | Fisher Chemicals | X5-1 | |
| Mezzo di montaggio acquoso 1 : Fluoromount-G | SouthernBiotech | 0100-01 | |
| Terreno di montaggio in resina sintetica a base di toluen : Permount | Fisher Chemicals | SP15-100 | |
| Banco di essiccazione per vetrini | Fisherbrand | 11-474-470 | |
| Vibratomo | Leica | VT 1000S | |
| Vetro di copertura per microscopio | Fisherbrand | 12-544A | |
| Vetrino per microscopio ColorFrost | Fisherbrand | 12-550-413 | |
| PFA | Fisherchemicals | 04042-500 | |
| Microscopio confocale Olympus FluoView FV 1000 | Lente ad immersione in acquaOlympus | ||
| 40X Lente ad immersione in acqua | Olympus | LUMPLFLN40XW | |
| 20X Lente ad immersione in acqua | Olympus | XLUMPLFL20XW | |
| 4X | XLFLUOR4X | ||
| Micropipetta estrattore | Sutter Instrument | P97 | |
| Micromanipolatore | Sutter Instrument | MP 225 | |
| Camera CCD | Sony | CX-ST50 | |
| Monitor in bianco e nero | Sony | SSM-125 | |
| Digidata | Molecular devices | 1322A | |
| Patch Clamp amplificatore | Axon instrument | Mulitclamp 700A | |
| Software di acquisizione elettrofisiologica | Dispositivi molecolari | pClamp 8 | |
| Software di analisi elettrofisiologica | Dispositivi molecolari | Clampfit 8 | |
| Software di analisi di imaging | ImageJFIJI | Software open source. Versione FIJI con pacchetto plug-in. | |
| Editor di immagini vettoriali | Adobe | Illustrator CS4 | |
| Applicazione per fogli di calcolo | Microsoft Office | Excel 2010 |