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La capacità di registrare misura OCR di alta qualità si basa sul centraggio testa nel mezzo la rete (Figura 1). Questo è importante per la macchina di XF24, che ha un sensore di ossigeno piuttosto piccola chiazza rispetto alle macchine della XFe24 più recenti in cui il sensore è grande. Come precedentemente indicato, centraggio le teste visualizzare un OCR costante per almeno 20 misurazioni consecutive in mosche giovani13.
Un aspetto critico dell'utilizzo delle macchine è quello di applicare l'analisi corretta. Si raccomanda di controllare i livelli di ossigeno durante gli esperimenti. Ogni misurazione 2 min è suddiviso in 10 sotto-misurazioni (zecche). Un pozzo con 16 teste sane Mostra in genere una pressione parziale di ossigeno (pO2) di 140-170 (mmHg) per il primo segno di spunta. Nel primo esempio, abbiamo confrontato il giovane vs midlife teste volare (Figura 2A e 2B). Mentre i livelli di ossigeno scendono più rapidamente nelle testine di mezza età, la differenza osservata è piccola (Figura 2A). Inoltre, la gamma dei livelli di ossigeno è simile tra le condizioni, con 165 durante il primo segno di spunta a 120 durante l'ultimo segno di spunta. In tal caso, è preferibile utilizzare l'algoritmo AKOS per generare automaticamente l'OCR (pmol/min)2, che rispecchia in modo affidabile la goccia livello di ossigeno tra giovani contro teste di mezza età (Figura 2B). Da notare, il programma di analisi dalla macchina sceglie automaticamente l'algoritmo AKOS.
Tuttavia, in base alle nostre osservazioni, automaticamente utilizzando l'algoritmo AKOS può dare fuorvianti, se non opposto risultati per l'OCR corretta. Tali manufatti possono essere generati in condizioni di un campione altamente richiede che raggiunge anossia13,22. Ad esempio, l'aggiunta del butirrato del sodio (SB), un inibitore KDAC, transitoriamente cambia la dinamica dei livelli di ossigeno (Figura 3A). Considerando che i comandi del veicolo visualizzano livelli costanti di ossigeno durante il prime e l'ultima zecche, SB aggiunta provoca un calo considerevole e transitorio dei livelli di ossigeno in questi segni di graduazione (Figura 3A). SB di per sé non altera i livelli di ossigeno nei pozzetti sfondo, dove nessun teste vengono aggiunti (dati non mostrati). I dati sostegno la nozione che SB aumenta il consumo di ossigeno. Come la raccolta del primo tick è ritardata (12 secondi fino a quando il primo segno di spunta viene registrato in fase di misurazione) il primo punto di dati è già inferiore nei pozzetti SB trattati. Di conseguenza, è difficile catturare i primi cambiamenti nel consumo di ossigeno dopo l'aggiunta di questo inibitore HDAC. Inoltre, i livelli di ossigeno nei campioni trattati SB sono ridotti ai livelli già bassi (anossia) come indicato dall'insieme dei segni di graduazione ultimi. All'anossia, le teste di rallentano il consumo di ossigeno nell'ultimo Tick (Figura 3A). Poiché il calcolo di AKOS prende in considerazione tutte le zecche e ignora uno stato anossico, genera un OCR fuorviante. Infatti, il AKOS non normalizzato basato Visualizza livelli OCR piccolo cambiamento al momento dell'iniezione (linea tratteggiata) della porta (Veh/SB) (Figura 3B).
Normalizzazione dei livelli di OCR per la misurazione di pre-iniezione basato sul AKOS rivela livelli molto simili di OCR prima e dopo l'iniezione del Porto A, che non supporta le modifiche del livello di ossigeno (Figura 3A). In queste circostanze, l'algoritmo fisso, che modelli/assomiglia più da vicino i cambiamenti di livello OCR e ossigeno è consigliato (Figura 3). Di conseguenza, l'algoritmo fisso basata normalizzata rivela misura un OCR aumentato previo trattamento di SB (Figura 3).
Un inconveniente con la nuova macchina è l'assenza dell'algoritmo fisso. Pertanto, negli esperimenti dove viene utilizzato il altamente consumando campione per trattamenti e massaggi, si raccomanda di calcolare manualmente le misurazioni di OCR, e calcolare la diminuzione di ossigeno livello a tempo per i primi 3-5 zecche in ogni misurazione.

Figura 1 . Un esempio di un pozzo contenente una - settimana-vecchie 16 teste di mosche maschi. Le teste sono centrato sotto una rete e galleggianti nei media. Clicca qui per visualizzare una versione più grande di questa figura.

Figura 2 . Un esempio rappresentativo di OCR di misurazione comparazione tra 1 settimana di vita volare teste (giovane) e quattro - settimana-vecchie volare teste (Evo). (A) i livelli di ossigeno sono indicati per tre misurazioni separate; ogni misurazione 2 min è suddiviso in dieci sotto-misurazioni (zecche). (B) una quantificazione di (A). I livelli delle zecche prime e l'ultimo sono simili, anche se i livelli del Medioevo campione sono leggermente inferiori. Una quantificazione del versante della diminuzione del livello di ossigeno è utilizzata per generare i livelli di OCR. Come descritto in precedenza22, l'OCR di mosche invecchiati centrale è 10% - 15% superiore al giovane mosche. Clicca qui per visualizzare una versione più grande di questa figura.

Figura 3 . Un esempio di alterazione dell'OCR di butirrato del sodio (SB) in giovani teste volare. (A) ossigeno livelli registrati da sette misure dopo l'aggiunta di 15 mM SB. La linea tratteggiata segna l'iniezione del farmaco (o veicoli) da Porto A. Di nota, mentre i livelli dell'ossigeno di segni di graduazione 1 e 10 rimangano stabili nel gruppo di controllo (blu), i livelli di ossigeno durante queste zecche sono transitoriamente (sei misurazioni dopo l'iniezione) ridotto nei campioni trattati SB (arancione). Inoltre, la diminuzione nei livelli di ossigeno è notevolmente ridotto durante l'ultima zecche di SB trattati campioni. N = 3 per gruppo (B) [sinistra] Non-normalizzato OCR livelli calcolati dall'algoritmo AKOS. Il calcolo Mostra livelli analoghi di OCR in modo errato prima e dopo l'iniezione di SB da Porto a. [destra] normalizzazione di OCR per la misurazione prima dell'iniezione di porta A. (C) [sinistra] 'Fixed' algoritmo calcolo di (A) mostrare l'OCR non normalizzato . Qui, l'OCR strettamente rappresenta l'aumento transitorio nell'uso di ossigeno delle teste previo trattamento di SB; [Destra] Normalizzazione di OCR per la misurazione prima dell'iniezione di porta barre di errore r. indicare lo s.e.m. in tutti i grafici. Clicca qui per visualizzare una versione più grande di questa figura.