Qui, presentiamo i metodi per lo studio di alto-rendimento di una serie della caverna messicano comportamenti e colorazione vitale di un sistema che mechanosensory. Questi metodi utilizzano script software libero e su misura, che forniscono un metodo pratico ed economico per gli studi dei comportamenti.
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Articolo metodologico
Rilevamento comportamentale e formazione immagine di Neuromast della caverna messicano
In questo articolo
Sommario
Abstract
Caverna-dimora animali hanno evoluto una serie di tratti morfologici e comportamentali per adattarsi ai loro ambienti perennemente buio e cibo di tipo sparse. Tra questi tratti, comportamento di foraggiamento è una delle finestre utili in vantaggi funzionali dell'evoluzione caratteristica comportamentale. Sono presentati qui metodi aggiornati per analizzare il comportamento di attrazione di vibrazione (VAB: un comportamento di foraggiamento adattivo) e formazione immagine di mechanosensors associato della grotta-adattato tetra, Astyanax mexicanus. Inoltre, i metodi sono presentati per l'inseguimento ad alta velocità di una serie di comportamenti di caverna aggiuntive tra cui iperattività e perdita di sonno. Caverna Mostra anche maggiore ansia, comportamento ripetitivo e socievolezza. Di conseguenza, caverna serve come modello animale per comportamenti evoluti. Questi metodi utilizzano gli script di software libero e su misura che possono essere applicati ad altri tipi di comportamento. Questi metodi forniscono alternative pratiche ed economicamente vantaggiose per il software di monitoraggio disponibili in commercio.
Introduzione
Il tetra messicano, Astyanax mexicanus (Teleostei: Characidae), è l'unico fra i pesci per avere due radicalmente alternativo morfismo - un morph avvistato, Superficie-abitazione e un morph cieco, caverne, composto da diversi distinti popolazioni1. Sebbene diversi per morfologia e fisiologia, essi sono ancora interfertile2,3. Questi morphs interfertile sembrano sono evolute rapidamente (~ 20.000 anni)4, che li rende un sistema modello ideale per lo studio di rapido adattamento. Caverna è noti per avere una suite di divergenti tratti morfologici e comporta....
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Protocollo
Tutte le procedure sono eseguite seguendo le istruzioni riportate in "Principi di laboratorio Animal Care" (National Institute of Health pubblicazione n. 85-23, rivisto 1985) e approvato da Università delle Hawaii a Manoa istituzionale Animal Care e uso Protocollo animale Comitato 17-2560-3.
1. test di vibrazione attrazione comportamento (VAB) (≤ 10 min per intera registrazione procedura)
Nota: Utilizzare una termocamera ad infrarossi sensibile o costruire una termocamera ad infrarossi modificando una webcam USB. Per modificare una webcam USB, vedere una descrizione dettagliata presentata da laboratorio Keene in qu....
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Risultati
I risultati presentati qui sono esempi rappresentativi di ciò che può essere acquisito con i metodi presentati. Di conseguenza, risultati possono deviare leggermente da quelli presentati qui per superficie pesce a seconda delle condizioni sperimentali e caverna.
Comportamento di attrazione di vibrazione
Risultati rappresentativi per VAB possono essere .......
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Discussione
Questi metodi presentati sono di facile accesso, ma possono essere complicati da eseguire a causa della natura delle sue origini di freeware. Pertanto, si consiglia di eseguire analisi di prova e analisi prima di qualsiasi sperimentazione reale.
Il tasso di generazione di dati può essere rapido, una volta stabiliti il quadro sperimentale e analitico. Una volta stabilita, è possibile registrare due pesci in 7 min per il dosaggio di VAB, 30 pesci in 24 ore per il dosaggio di attività/sonno e uno.......
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Dichiarazioni
Gli autori non hanno nulla a rivelare.
Ringraziamenti
Ringraziamo tutti i membri del laboratorio Yoshizawa tra cui Cetraro N., N. Simon, Valdez C., C. Macapac, J. Choi, L. Lu, J. Nguyen, S. Podhorzer, H. Hernandes, J. Fong, J. Kato e I. Signore per la cura del pesce sul pesce sperimentale utilizzato in questo manoscritto. Ringraziamo anche i membri del laboratorio r. Keene tra cui P. Masek per addestrare MY da montare telecamera CCD IR. Infine, vorremmo ringraziare il Media Lab - facoltà di scienze sociali - scuola di comunicazione presso l'Università delle Hawaii Manoa per il loro prezioso aiuto con rendendo il video, soprattutto B. Smith, J. Lam e S. bianco. Questo lavoro è stato supportato dalla Fondazione di comunità....
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Materiali
| Nome | Azienda | Numero di catalogo | Commenti |
|---|---|---|---|
| 4-Di-1-ASP (4-(4-(dimetilamminostiril)-1-metilpiridinio ioduro) | MilliporeSigma | D3418 | |
| 880 nm lunghezza d'onda luce nera | Illuminazione avanzata | BL41192-880 | |
| avfs | freeware | Versione 1.0.0.6 | http://turtlewar.org/avfs/ |
| Avisynth | freeware | Versione 2.6.0 | http://avisynth.nl/index.php/Main_Page |
| Cygwin | freeware | Versione 2.11.0 | https://www.cygwin.com/ |
| Camera di analisi cilindrica (piatto di vetro Pyrex 325 ml) | Corning | 3140-100 | 10 cm diametro 5 cm di altezza |
| Ethovision XT | Noldus Informazioni Tecnologia, Wageningen, Paesi Bassi | Versione 14 | https://www.noldus.com/animal-behavior-research/products/ethovision-xt |
| Cilindro per acquario per pesci Filtro per acqua in spugna morbida, Black | Jardin (attraverso Amazon.com) | NA | Filtro in spugna per il sistema di registrazione del sonno/iperattività |
| Grado A Uova di artemia salina | Gamberetti in salamoia diretta | BSEA16Z | |
| ImageJ freeware | Versione 1.52e | https://imagej.nih.gov/ij/ | |
| macro 1.8/12.5-75mm Obiettivo zoom C-mount | Toyo | NA | Collegamento alla webcam USB utilizzando c-mount, che viene stampato in stampante 3D |
| Regolatore neutro | Seachem | NA | |
| Filtro IR passa-lungo in plastica ottica | Edmund | 43-948 | Taglio in un piccolo pezzo per adattarsi al CCD della webcam USB |
| pfmap freeware | Build 178 | http://pismotec.com/download/ (a " Scarica l'archivio" link in fondo) | |
| Reef Crystals Reef Salt | Instant Ocean | RC15-10 | |
| SwisTrack | freeware | Versione 4 | https://en.wikibooks.org/wiki/SwisTrack |
| webcam USB (LifeCam Studio 1080p HD Webcam) | Microsoft | Q2F-00013 | Taglio 2-2,5 cm della parte anteriore |
| WinAutomation | freeware | Versione 8 | https://www.winautomation.com/ (free-alone app per questa procedura) |
| Sistema operativo Windows | Microsoft | 7, 8 o 10 | https://www.microsoft.com/en-us/windows |
| x264vfw | freeware | NA | https://sourceforge.net/projects/x264vfw/ |
Riferimenti
- Keene, A. C., Yoshizawa, M., McGaugh, S. E. Biology and Evolution of the Mexican Cavefish. Biology and Evolution of the Mexican Cavefish. , Elsevier Inc. Amsterdam. (2015).
- Mitchell, R. W., Russell, W. H., Elliott, W. R.
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Ristampe e permessi
