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Research Article
Alessandro Cresci1, Rosario De Rosa2,3, Claudio Agnisola4
1Rosenstiel School of Marine and Atmospheric Science, Department of Ocean Sciences,University of Miami, 2Department of Physics, Monte S. Angelo (MSA) Campus,University of Naples Federico II, 3Istituto Nazionale di Fisica Nucleare (INFN), 4Department of Biology, MSA Campus,University of Naples Federico II
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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
Descriviamo un protocollo comportamentale progettato per valutare come personalità di zebrafish influenza la loro risposta ai cambiamenti delle acque correnti e campi magnetici deboli. Pesci con la stessa personalità vengono separati in base al loro comportamento esplorativo. Quindi, si osserva il loro comportamento di orientamento rheotactic in un tunnel con un tasso di flusso debole e condizioni magnetiche diverse.
Per orientarsi nel loro ambiente, gli animali integrano una vasta gamma di indicazioni esterne, che interagiscono con diversi fattori interni, quali personalità. Qui, descriviamo un protocollo comportamentale progettato per lo studio dell'influenza della personalità di zebrafish per la loro risposta di orientamento a più stimoli ambientali esterni, in particolare correnti d'acqua e campi magnetici. Questo protocollo ha lo scopo di capire se proattivo o reattivo zebrafish visualizzare le soglie di rheotactic diverse (cioè, la velocità di flusso in cui il pesce inizia a nuotare a Monte) quando il campo magnetico circostante cambia la sua direzione. Per identificare zebrafish con la stessa personalità, pesce vengono introdotti al buio la metà di un serbatoio collegata con una stretta apertura per una metà luminosa. Solo proattivo pesce esplorare il romanzo, ambiente luminoso. Pesce reattive non uscire la metà oscura del serbatoio. Un tunnel con basse portate viene utilizzato per determinare la soglia di rheotactic. Descriviamo due configurazioni per controllare il campo magnetico nel tunnel, nel range di intensità del campo magnetico della terra: uno che controlla il campo magnetico lungo la direzione del flusso (una dimensione) e uno che permette un controllo tri-assiale del campo magnetico. Pesci sono filmati mentre vivendo un aumento graduale della velocità di flusso nel tunnel sotto diversi campi magnetici. Dati sul comportamento di orientamento sono raccolti attraverso una procedura di video-monitoraggio e applicati a un modello logistico per consentire la determinazione della soglia rheotactic. Segnaliamo i risultati rappresentativi raccolti da shoaling zebrafish. In particolare, questi dimostrano che solo reattive, prudente pesce mostrano variazioni della soglia rheotactic quando il campo magnetico varia nella sua direzione, mentre pesce proattive non rispondono alle variazioni di campo magnetico. Questa metodologia può essere applicata per lo studio della sensibilità magnetica e comportamento rheotactic di molte specie acquatiche, sia visualizzati da solitario o shoaling piscina strategie.
Nello studio presente, descriviamo un protocollo comportamentale basato su laboratorio che ha lo scopo di investigare il ruolo della personalità di pesce sulla risposta orientamento di shoaling pesce a segnali di orientamento esterno, ad esempio correnti d'acqua e campi magnetici.
Le decisioni di orientamento degli animali dovute a varie informazioni sensoriali di pesatura. Il processo di decisione è influenzato dalla capacità dell'animale di navigare (ad esempio, la capacità di selezionare e mantenere una direzione), stato interno (ad es., esigenze di alimentazione o riproduttive), la capacità di movimento (ad es., biomeccanica di locomozione) e diversi ulteriori fattori esterni (ad es., ora del giorno, interazione con i conspecifici)1.
Il ruolo dello stato interno o animale personalità del comportamento di orientamento è spesso poco conosciuto o non esplorato2. Ulteriori sfide derivano nello studio dell'orientamento delle specie acquatiche sociale, che spesso eseguire coordinato e polarizzati gruppo movimento comportamento3.
Correnti d'acqua giocano un ruolo chiave nel processo di orientamento del pesce. Pesce orientano per acqua correnti attraverso una risposta di unconditioned chiamato rheotaxis4, che può essere positivo (cioè, a Monte orientato) o negativo (cioè a valle orientata) e viene utilizzati per diverse attività, che vanno dal foraggiamento alla minimizzazione degli dispendio energetico5,6. Inoltre, un corpo crescente di letteratura segnala che molte specie di pesci utilizzare il campo geomagnetico per orientamento e navigazione7,8,9.
Lo studio delle prestazioni rheotaxis e nuoto nel pesce si svolge generalmente in alloggiamenti di flusso (canale), dove pesci sono esposti all'aumento graduale della velocità del flusso, da bassa ad alta velocità, spesso fino ad esaurimento (chiamato velocità critica)10, 11. D'altra parte, gli studi precedenti studiato il ruolo del campo magnetico nell'orientamento attraverso l'osservazione del comportamento nuoto degli animali nelle arene con ancora acqua12,13. Qui, descriviamo una tecnica di laboratorio che permette ai ricercatori di studiare il comportamento del pesce durante la manipolazione sia le correnti di acqua ed il campo magnetico. Questo metodo è stato utilizzato per la prima volta su shoaling zebrafish (Danio rerio) nel nostro studio precedente, portando alla conclusione che la manipolazione del campo magnetico circostante determina la soglia di rheotactic (cioè, la velocità minima d'acqua presso quale shoaling pesce orient a Monte)14. Questo metodo si basa sull'uso di una camera di flume con lenti flussi combinati con un programma di installazione progettato per controllare il campo magnetico nel canale, all'interno della gamma di intensità del campo magnetico della terra.
Il tunnel di nuoto utilizzato per osservare il comportamento di zebrafish è descritto nella Figura 1. Il tunnel (costituito da un cilindro di acrilico nonreflecting con un diametro di 7 cm e 15 cm di lunghezza) è collegato a una configurazione per il controllo del flusso tasso14. Con questa configurazione, la gamma di velocità di flusso nel tunnel varia tra 0 e 9 cm/s.
Per manipolare il campo magnetico nella galleria del nuoto, usiamo due approcci metodologici: il primo è unidimensionale e il secondo è tridimensionale. Per qualsiasi applicazione, questi metodi modificano il campo geomagnetico per ottenere condizioni specifiche magnetiche in un volume definito di acqua — così, tutti i valori di intensità di campo magnetico riferiti in questo studio includono il campo geomagnetico.
Per quanto riguarda l'unidimensionale approccio15, il campo magnetico viene manipolato lungo la direzione del flusso dell'acqua (definita come l'asse x) utilizzando un solenoide avvolto attorno al tunnel di nuoto. Questo è collegato a un'unità di alimentazione, e che genera campi magnetici statici uniformi (Figura 2A). Allo stesso modo, nel caso l'approccio tridimensionale, viene modificato il campo geomagnetico del volume contenente il tunnel di nuoto usando le bobine di fili elettrici. Tuttavia, per controllare il campo magnetico in tre dimensioni, le bobine sono la progettazione di tre paia di Helmholtz ortogonale (Figura 2B). Ogni coppia di Helmholtz è composto da due bobine circolari orientati lungo le tre direzioni ortogonali spazio (x, ye z) e dotato di un magnetometro tri-assiale lavorando in condizioni di circuito chiuso. Il magnetometro funziona con le intensità di campo paragonabile con campo naturale della terra, e si trova vicino al centro geometrico del set di bobine (dove si trova il tunnel di nuoto).
Implementiamo le tecniche sopra descritte per testare l'ipotesi che i tratti di personalità del pesce che compongono una secca influenzano il modo che rispondono a campi magnetici16. Verifichiamo l'ipotesi che gli individui con personalità proattiva e reattiva17,18 rispondono in modo diverso quando esposti ai flussi di acqua e campi magnetici. Per eseguire questo test, abbiamo innanzitutto ordinare zebrafish utilizzando una metodologia consolidata per assegnare e gli individui del gruppo che sono proattivo o reattivo17,19,20,21. Quindi, valutiamo il comportamento rheotactic di zebrafish nuotare in branchi composti da solo reattivi individui o composto solo proattivi individui nel serbatoio magnetica flume, che presentiamo come dati di esempio.
Il metodo di ordinamento si basa sulla diversa tendenza degli individui proattivi e reattivi per esplorare nuovi ambienti21. In particolare, usiamo un serbatoio diviso in un brillante e un lato oscuro17,19,20,21 (Figura 3). Gli animali sono acclimatati al lato oscuro. Quando l'accesso al lato luminoso è aperta e proattiva gli individui tendono ad abbandonare la metà oscura del serbatoio per esplorare il nuovo ambiente, mentre il pesce reattivo non lasciare il serbatoio scuro.
Il seguente protocollo è stato approvato dal comitato di uso dell'Università di Napoli Federico II, Napoli, Italia (2015) e istituzionali Animal Care.
1. animale manutenzione
2. la personalità selezione in Zebrafish
3. messa a punto del campo magnetico con la manipolazione di campo magnetico unidimensionali27
4. impostazione del campo magnetico con il campo magnetico tridimensionale manipolazione27
5. test del Rheotaxis di Zebrafish nella camera di flusso
6. video Tracking
Come dati di esempio presentiamo risultati ottenuti controllando il campo magnetico lungo la direzione del flusso dell'acqua su proattivi e reattivi shoaling zebrafish16 utilizzando la configurazione mostrata in Figura 2A (vedere la sezione 3 del protocollo). Questi risultati mostrano come il protocollo descritto può evidenziare le differenze nelle risposte al campo magnetico nei pesci con diverse personalità. Il concetto generale di questi studi si basa sulla constatazione che la direzione del campo magnetico rispetto al flusso di acqua influenza la soglia rheotactic in shoaling zebrafish14. Così, come cambiamenti nel campo magnetico modulare il rheotaxis, questo protocollo può essere usato per valutare se la risposta di zebrafish ai campi magnetici differiscono secondo la loro personalità proattivo o reattivo28.
In un primo momento, utilizzando il serbatoio/scura, come mostrato nella Figura 3, zebrafish sono stati suddivisi in diversi gruppi secondo la loro personalità proattiva/reattiva. A seguito di tale prova, banchi di cinque pesci con la stessa personalità quindi sono stati testati nella Galleria di nuoto del solenoide (Figura 1 e Figura 2A). Sono stati testati un totale di 20 pesci: due banchi composto di cinque pesci reattive (ogni 10 pesci reattive) e due banchi è composto da cinque pesci proattive (ogni 10 pesci proattive).
Uno shoal alla volta è stato video registrato mentre si nuota nel tunnel e l'acqua corrente è stata accelerata con un aumento graduale della portata come schematicamente mostrato in Figura 4. I pesci sono stati permessi di acclimatare per 1 h nel tunnel. Dopo di che, abbiamo applicato il protocollo per la quantificazione del comportamento rheotactic, con un aumento graduale della portata secondo il classico Brett protocollo25. In particolare, la portata aumentata di 0,4 BL/s ogni 10 min per un totale di sette passaggi consecutivi (Figura 4). Il comportamento di zebrafish è stato registrato tutta la durata della corsa nel tunnel (70 min), e il valore di RI ad ogni passo è stato calcolato (Vedi protocollo punto 6.8).
Durante l'esecuzione nella galleria del nuoto, il campo magnetico è stato fissato a una delle due condizioni seguenti: 50 μT a valle (cioè, la componente orizzontale [lungo l'asse x] del campo magnetico aveva la stessa direzione del flusso d'acqua) e 50 μT a Monte (cioè, il componente orizzontale del campo magnetico ha avuto una direzione opposta rispetto al flusso di acqua)16. L'intensità lungo gli assi y e z non sono stati colpiti, come pure l'intensità totale e l'inclinazione del vettore campo magnetico. Ogni banco di cinque pesci è stato esposto a una sola delle due condizioni magnetiche. Ad esempio, considerando proattiva pesce, uno shoal proattiva aveva il campo magnetico diretto a valle e altri Sika proattiva aveva campo magnetico diretto a Monte.
I video sono stati poi analizzati con il software di video-monitoraggio (sezione 6 del protocollo). I pesci erano dei video registrati per tutta la durata della corsa nel tunnel del nuoto. Tuttavia, sono stati registrati solo gli ultimi 5 minuti di ogni 10 min-lungo graduale aumento del tasso di flusso (Figura 4). Durante l'ora di revisione, sono stati evidenziati i giri di ogni pesce ad ogni portata (Figura 5, punti dati rosso e blu). Questi sono stati poi utilizzati come riferimenti per calcolare l'indice di rifrazione di ogni pesce e ogni velocità di flusso (Figura 5). L'indice di RI è compreso tra 0% e 100%. Quando sotto il 50%, l'indice di RI indica che il pesce visualizzato negativo rheotaxis (prevalenza di nuoto a valle); Quando il RI è superiore al 50%, Mostra che l'animale ha avuto una risposta positiva di rheotactic (prevalenza di nuoto a Monte). Un RI non significativamente differente da 50% indica un'assenza di risposta rheotactic. I valori di RI % di tutti i cinque pesci in una secca erano fatte la media poi ad ogni portata. Questi dati medi erano arcoseno trasformato e utilizzato per adattare le curve visualizzate in Figura 6A. Quindi, l'indice rheotactic sigmoidally aumenta quando la velocità dell'acqua aumenta, permettendo la quantificazione della rheotaxis con un semplice metodo matematico. Il rapporto tra il RI e la portata può essere montato al seguente modello logistico sigmoidale.
Tre parametri e la loro variabilità può essere derivati dalla curva. L'altopiano di RI misura la tendenza di massima degli animali per orientare a Monte nella gamma di velocità di flusso utilizzato nell'esperimento. RIbasso è il valore di RI in assenza di flusso d'acqua e, ipoteticamente, non dovrebbe differire da 50%. Rtr è la è la portata in cui si verifica la massima pendenza della curva, e può essere utilizzato come una misura della soglia rheotactic6.
I risultati indicano che la soglia di rheotactic (Rtr) di zebrafish è molto bassa, nell'intervallo di pochi centimetri al secondo. Variazioni del campo magnetico non influenzano la Rtr di pesce proattiva (nessun effetto del campo magnetico, t-test, P > 0.05). In modo opposto, cambiamenti di campo magnetico hanno un marcato effetto sul comportamento rheotactic di zebrafish reattiva. Quando la componente del campo magnetico lungo il tunnel di nuoto è stato diretto a valle, Rtr è molto bassa e simile a quello del pesce proattiva. La soglia era significativamente più alta quando il campo magnetico è stato diretto a Monte (t-test, P < 0.01).
Il valore delplateau di RI di animali reattivi era significativamente più basso quando il campo magnetico è stato diretto a Monte (t-test, P < 0.01). Questo risultato indica che con queste condizioni, reattiva pesce avrebbe raggiunto la risposta completa positiva rheotactic (RI = 100%) solo a portate molto elevate. Così, questo risultato evidenzia che, rispetto a Rtr, RIaltopiano fornisce meno informazioni sul comportamento di nuoto del pesce. In realtà, basata sulla forte differenza nel reattivo RIaltopiano fra le due circostanze magnetiche, possiamo affermare che, sotto il campo magnetico a Monte-oriented, gli animali reattivi probabilmente visualizzerà una risposta completa rheotactic a un'acqua superiore flusso.
I valori difondo di RI tendono ad essere più alto (anche se non significativamente) oltre il 50% negli animali proattivi e reattivi animali esposti ad un campo magnetico a valle-oriented. Ciò potrebbe indicare un bias nel protocollo poiché gli animali caratterizzati da una soglia molto bassa possono ricordare la direzione del flusso con esperienza durante l'acclimatazione. Un protocollo adeguato potrebbe essere messo a punto per verificare questa possibilità.

Figura 1: Rappresentazione semplificata di nuoto del tunnel apparato utilizzato nel presente studio. Clicca qui per visualizzare una versione più grande di questa figura.

Figura 2: Programma di installazione per il controllo del campo magnetico. (A) Rendering del traforo del nuoto con un solenoide per l'induzione di un campo magnetico statico, orizzontale all'interno del tunnel. Il solenoide (0.83 giri/cm) è collegato a un'unità di alimentazione e genera campi nel range di ± 250 µT (gamma di intensità che include intervallo di campo magnetico terrestre). Sul lato destro, viene visualizzata una foto del tunnel solenoide collegato all'apparato di nuoto. Il tunnel è fatta di acrilico e ha due lastre acriliche perforati collocati presso l'ingresso dell'acqua, che garantiscono il flusso per essere vicino a laminare. (B) diagramma e foto delle tre coppie di Helmholtz ortogonale impostato per il controllo del campo magnetico nel campo geomagnetico di intensità. La sonda di campo magnetico, la CPU, il convertitore digitale-analogico e i driver della bobina utilizzati per chiudere il ciclo vengono anche visualizzati. Ogni accoppiamento delle bobine è composto da due bobine di circolare con un raggio (r) di 30 cm e N = 50 giri di AWG-14 fili in rame. Un magnetometro a tre assi (sensore) con scala selezionabile (± 88 µT a ± 810 µT) è posizionato vicino al centro del set della bobina. Gamma del sensore è impostata su valori che vanno a ±130 µT. Questi valori sono stati utilizzati anche per le misure descritte nei risultati rappresentativi (in queste condizioni, la risoluzione del sensore nominale è circa 0,1 µT). L'intensità e la direzione del campo magnetico sono controllati con un sistema di feedback digitale. Il sensore misura le tre componenti del vettore del campo magnetico (i tre assi), e i segnali di errore corrispondenti vengono estratti. Quindi, i segnali di correzione vengono generati da un semplice integratore del filtro. I segnali di correzione digitale vengono convertiti in tensione da un convertitore digitale-analogico e amplificati da un driver adatto della bobina. Questi ultimi segnali sono utilizzati per guidare le coppie di Helmholtz. La frequenza di campionamento è fissata a 5 Hz e la frequenza di guadagno di unità delle Anse è circa 0,16 Hz. Una volta impostate le correnti nelle coppie delle bobine di Helmholtz, il campo magnetico totale varia meno del 2% rispetto al valore di intensità media del volume cubico centrale (con bordo [L] = 10cm) delle bobine. Durante le misurazioni, il campo magnetico rms è inferiore a 0,2 µT. In entrambe le configurazioni (pannelli A e B) un campo elettrico statico è generato dalla corrente nelle bobine produce il campo magnetico16. L'intensità del campo elettrico è circa 0,4 V/m quando viene applicata la corrente massima; Questo valore è trascurabile rispetto ai campi statici naturali o artificiali presenti nell'ambiente in cui l'intensità è dell'ordine di 1 kV/m17. Clicca qui per visualizzare una versione più grande di questa figura.

Figura 3: Rappresentazione schematica del serbatoio (40 x 40 cm x 40 cm) utilizzata per separare proattiva da individui di zebrafish reattive (non in scala), secondo Rey et al.21. Il volume del serbatoio di selezione di personalità è 50 che l. metà del serbatoio era occupata da una casella scura con un foro di 5 cm di diametro sul lato della scatola rivolto verso la metà luminosa del serbatoio. Il foro era coperto da una porta scorrevole (non mostrata), cui apertura firmato all'inizio di un processo di selezionando. Il lato oscuro del serbatoio ha bisogno di una copertura rimovibile per consentire l'accesso delle reti di mano. Questo facilita l'immissione o cattura pesce prima e dopo le prove comportamentali. Clicca qui per visualizzare una versione più grande di questa figura.

Figura 4: Diagramma delle portate utilizzate durante le prove per determinare la soglia di rheotactic di zebrafish. Il flusso durante il periodo di acclimatazione di 1h era sufficiente a garantire un apporto di ossigeno adeguato agli animali. Si può presumere che, con questo disegno, rifornimento di ossigeno è mai un limite, anche nel primo passaggio 10 min con flusso 0. Infatti, con un tenore di ossigeno dell'acqua a 27 ° C di circa 7,9 mg/L e un consumo di ossigeno animale di 1 mg/h.g (un'approssimazione in eccesso per zebrafish consumo di ossigeno a bassa velocità nuoto sia in condizioni di routine [Uliano et al.29] [Palstra et altri30]), è possibile calcolare che, in assenza di flusso, il Po2 e il flume non diminuirà più del 2% per animale, rimanendo ben di sopra della critica Po2 (circa 40 torr per zebrafish). Questa figura è stata modificata da Cresci et al.14. Clicca qui per visualizzare una versione più grande di questa figura.

Figura 5: Comportamento animale in tunnel e il calcolo del RI. I grafici presentano la posizione di un singolo animale lungo l'asse x durante un record s 300 a tre valori di portata. I punti rossi rappresentano le curve a valle-di-upstream, il blu punti le curve di tipo padre-figlio. Il corrispondente tempo gli intervalli spesi dagli animali a valle o a Monte sono anche riportati, e i tempi totali di upstream e downstream sono segnalati, da cui può essere calcolato un valore di RI. Si può osservare che quando si aumenta la portata, il tempo a Monte e aumentano i valori di RI. Clicca qui per visualizzare una versione più grande di questa figura.

Figura 6: Risultati rappresentativi. (A) rapporto tra valori di RI arcoseno-trasformate (RI è la percentuale del tempo totale orientato che pesce trascorrere rivolto verso Monte) e la portata per zebrafish shoaling proattivi e reattivi in due condizioni di campo magnetico lungo il flusso direzione del tasso (uno-dimensione controllo). Ogni punto di dati è la media dei valori di RI del cinque pesce che compongono la secca, ad ogni portata. Differenze significative tra le curve sono stata analizzate tramite una somma di quadrati F-prova (alfa = 0,05)14. Assi di campo magnetico (B) e la direzione dell'acqua il flusso nel tunnel. Viene mostrata anche una rappresentazione tridimensionale dei vettori magnetici nelle condizioni due campo magnetico utilizzate in questo studio. Il campo magnetico in laboratorio (40 ° N, 14 ° E) è: F = 62 μT; Io = 64°; D = 44°. Questa figura è stata modificata da Cresci et al.16. Clicca qui per visualizzare una versione più grande di questa figura.
Gli autori non hanno nulla a rivelare.
Descriviamo un protocollo comportamentale progettato per valutare come personalità di zebrafish influenza la loro risposta ai cambiamenti delle acque correnti e campi magnetici deboli. Pesci con la stessa personalità vengono separati in base al loro comportamento esplorativo. Quindi, si osserva il loro comportamento di orientamento rheotactic in un tunnel con un tasso di flusso debole e condizioni magnetiche diverse.
Lo studio è stato sostenuto da Fondazione ricerca base del dipartimento di fisica e il dipartimento di biologia dell'Università Napoli Federico II. Gli autori ringraziano il Dr. Claudia Angelini (Istituto di applicata calcolo, Consiglio Nazionale delle Ricerche [CNR], Italia) per il supporto statistico. Gli autori ringraziano Martina Scanu e Silvia Frassinet per il loro aiuto tecnico con la raccolta dei dati e i tecnici dipartimentali F. Cassese, Passeggio di G. e R. Rocco per la loro assistenza abile nella progettazione e realizzazione dell'apparato sperimentale. Ringraziamo Laura Gentile per aiutare a condurre l'esperimento durante le riprese video. Ringraziamo Diana Rose Udel presso l'Università di Miami per le riprese le dichiarazioni di intervista di Alessandro Cresci.
| 9500 G meter | FWBell | N/A | Gaussmeter, DC-10 kHz; risoluzione della sonda: 0,01 μ T |
| AD5755-1 | Analog Devices | Convertitore digitale/analogicoEVAL-AD5755SDZ | aquattro canali, 16 bit, |
| ALR3003D | Alimentatore ELC | 3760244880031 | CC a doppia regolazione |
| BeagleBone Black | Beagleboard.org | Driver perbobina per computer a scheda singola | |
| Amplificatore | N/A | fattoin casa | basato su OP commerciale (OPA544 by TI) |
| Coppie di Helmholtz | BobineN/A | fatte in casa | realizzate con filo standard AWG-14 |
| HMC588L | Honeywell | 900405 Rev E | Magnetometro digitale a tre assi |
| MO99-2506 | FWBell | 129966 | Sonda magnetica monoassiale |
| Apparecchio per il nuoto | M2M Engineering Custom Scientific Equipment | N/A | Apparecchio per il nuoto composto da pompa peristaltica e flussostato SMC Flussometro con feedback digitale |
| TECO 278 | TECO | N/A | Termocriostato |