Questo metodo con precisione e riproducibilità permette di misurare la vitalità dagli embrioni agli adulti emersi quando accoppiati ad analisi quadrate del chi.
Negli studi iniziali, dopo aver contato gli embrioni e le larve, l'agar dell'uva è stato posizionato all'interno della fiala in posizione verticale sul lato della fiala. Purtroppo, quando l'agar è stato posto sul lato della fiala molti degli embrioni e delle larve non sono maturati agli adulti. Ciò era probabilmente dovuto all'essiccazione del disco di uva gar (Figura 3). Questo posizionamento ha introdotto una variabile ambientale (idratazione del disco di agar) che potrebbe confondere i risultati. Circa il 39% della progenie è stata persa tra gli embrioni per adulti, dato che solo il 61% degli adulti è emerso. Le perdite maggiori si sono verificate tra le larve L1 (contate sulla superficie delle piastre di uva agar) e le pupe (contate sulle pareti delle fiale di cibo) conta. Tuttavia, quando l'agar dell'uva è stato posto rivolto verso il basso all'interno della fiala a diretto contatto con la superficie alimentare, meno del 6% della progenie è stato perso (Figura 2). L'agar è rimasto idratato poiché l'intero disco di uva agar è rimasto in contatto con l'umidità del cibo istantaneo all'interno della fiala (Figura 7, Figura 8). Questi risultati indicano che la posizione dell'agar all'interno della fiala è importante per ottenere dati affidabili e ridurre al minimo il contributo delle variabili ambientali. Ulteriori dati a sostegno dell'efficacia del metodo sono stati raccolti confrontando la progenie di tipo selvatico utilizzata nella convalida iniziale del metodo e la progenie prodotta incrociando le femmine di tipo selvaggio vergine con i maschi da uno stock di mutanti Dm ime4 bilanciato ( Figurasupplementare 2 , ime4 - null/TM3sb). Circa il 91% della progenie è maturato in età adulta rispetto al 94% della progenie di tipo selvatico (Figura 4). Questa differenza non era statisticamente significativa.
Homozygous Dm ime4 mutanti maschi5 sono stati utilizzati anche per fornire un'ulteriore convalida del metodo. Tuttavia, i mutanti omozionali erano troppo malati per riprodursi e morirono prima che gli embrioni fossero depositati. Pertanto, una limitazione dell'esperimento è che i maschi devono essere abbastanza sani da riprodursi per generare una popolazione embrionale iniziale da monitorare.

Figura 1 : Le scorte mutanti Dm ime4 emergono a livelli sub-mendeliani. Vengono mostrati gli stock in cui sono state mutate parti del dominio catalitico o del dominio di binding Ado-Met (fare riferimento alla figura supplementare 1 per i dettagli). Alcuni stock avevano porzioni di entrambi i domini sostituite con Ala (mutagenesi alanina-scansione), mentre altri stock hanno avuto uno o entrambi i domini cancellati. Il rapporto tra il numero osservato di omozigoti e i numeri previsti è rappresentato in percentuali (rispetto ai controlli di pari livello eteroziggoti, si riferisce alla figura supplementare 3 per lo schema di ordinamento e l'analisi del chi quadrato). Sono state eseguite analisi quadrate del chi per determinare se la differenza tra osservato e previsto fosse statisticamente significativa e non dovuta al solo casuale (p-values < 0.01). Le barre di errore rappresentano l'errore standard della media (minimo tre prove per croce indicate). Un foglio di calcolo con tutti i dati è disponibile in Materialisupplementari . Fare clic qui per visualizzare una versione più grande di questa figura.

Figura 2 : La posizione di gar all'interno della fiala può introdurre variabili ambientali non intenzionali. Istogramma del numero di individui in diverse fasi di sviluppo contato da uva agar disco embrione lato verso il basso in cibo fiala o agar sul lato della fiala alimentare. Collocando l'embrione del disco di agar nella fiala ha provocato il 94% degli embrioni iniziali sopravvissuti fino all'età adulta. Collocare l'agar sul lato della fiala alimentare ha comportato solo il 61% (SD - 0,07) degli embrioni originariamente conteggiati che raggiungono l'età adulta. Un foglio di calcolo con tutti i dati è disponibile nel campo Materialisupplementari . I numeri attesi in ogni fase sono fissati come il numero iniziale di embrioni/L1 contati sul disco di agar dell'uva prima del trasferimento al cibo (si sviluppano ipotesi nulla: si sviluppa il 100% degli embrioni covati). I numeri osservati sono il numero effettivo di individui contati per la fase di sviluppo indicata. Pertanto, ogni fase viene confrontata con il numero iniziale di embrioni schiuse contato sulla piastra di uva agar. Le analisi quadrate del chi sono state eseguite per determinare se la differenza tra osservato e previsto fosse statisticamente significativa e non dovuta al solo caso utilizzando una soglia di valore p pari a 0,05. La differenza era significativa per gli embrioni coltivati con agar sul lato della fiala alimentare, ma non per quelli coltivati in un lato embrione di disco verso il basso. Le barre degli errori rappresentano un errore standard (minimo tre prove per croce indicate). Fare clic qui per visualizzare una versione più grande di questa figura.

Figura 3 : Cartone animato che mostra due modi in cui i dischi di uvaa che trasportano embrioni/L1 possono essere collocati all'interno della fiala alimentare. C'era una differenza significativa tra il numero totale di embrioni e la progenie adulta in base alla posizione dell'agar nella fiala alimentare. La differenza deriva da una variabile ambientale (idratazione) creata dalla differenza nel posizionamento del disco all'interno della fiala alimentare: c'è una differenza statisticamente significativa tra i numeri attesi e osservati nelle larve e nelle pupe conta quando l'agar conta quando l'agar disco è stato posizionato sul lato della fiala rispetto a nessuna differenza significativa nei numeri attesi rispetto a quelli osservati quando il disco di agar era in contatto con il cibo. Fare clic qui per visualizzare una versione più grande di questa figura.

Figura 4 : istogramma che mostra il numero di individui in diverse fasi di sviluppo da maschi di tipo selvaggio contro maschi da uno stock bilanciato mutante Dm ime4. I maschi equilibrati hanno attraversato le femmine di tipo selvatico vergine come descritto in 2.1. Agar è stato trasferito a lato embrionale in fiale di cibo. Il rapporto medio tra gli adulti che emergono dagli embrioni originali conteggiati nei dischi di agar d'uva da wild-type X selvatici è stato del 94%, SD - 0,02, mentre tale rapporto per Dm ime4 mutant/X wild-type era del 91%, SD - 0,01. L'analisi statistica è stata eseguita come descritto nella figura 2; differenze non erano significative per entrambi i gruppi. Fare clic qui per visualizzare una versione più grande di questa figura.

Figura 5 : Configurazione sperimentale. (A) Collezione di embrioni mini-gabbia e piatti mini-Petri di uva-agar. Le piastre sono collocate all'interno di una camera umida (piatto Petri standard con disco di carta assorbente saturo d'acqua) per prevenire la disidratazione. Una piccola quantità di pasta di lievito è stata posta al centro di ogni piatto di uva-agar. (B) Staccare il coperchio del portapunitore della piastra embrionale (rosso) e posizionare una piastra preparata, lato lievito verso l'alto. (C) Trasferire la croce nella gabbia embrionale e mettere immediatamente un coperchio del piatto Petri per contenere le mosche all'interno. (D) Rimuovere rapidamente il coperchio e capovolgere la gabbia embrionale in modo che l'apertura contatti piastra di uva-agar. Incubare per 24-48 h, ispezionando ogni giorno. Fare clic qui per visualizzare una versione più grande di questa figura.

Figura 6 : Sviluppo dell'embrione su piatti di uvagar. (A) Gli embrioni wildtype depositati sui piatti mini-Petri dell'uva-agar sono conteggiati al microscopio sezionato. Tenere i piatti all'interno della camera umida quando non si visualizza ed evitare la luce diretta per prevenire la disidratazione. (B) Le piastre di uva da gofa sono conservate in una camera umida e vengono registrati embrioni di tipo selvatico nati. Questa foto mostra tre larve L1 di tipo selvatico che si sono sviluppate da embrioni mostrati in A. (C) Esempio di numero registrato di embrioni (giorno 1) e larve L1 (giorno 2) per le due placche indicate nella figura 5. Il "numero previsto" per l'ipotesi nulla è determinato dal numero di embrioni che si sono schiusi e sono diventati larve L1 al momento del trasferimento alla fiala alimentare (tabella seguente). Per le mosche wildtype, quasi tutti gli embrioni si schiudono e si sviluppano in larve L1. Questo potrebbe non essere il caso per altri background genetici e questo metodo viene utilizzato per determinare queste differenze di vitalità. Fare clic qui per visualizzare una versione più grande di questa figura.

Figura 7 : Trasferimento delle larve. (A) Dopo la registrazione dei conteggi L1, i dischi di uva-agar vengono accuratamente rimossi dalla parabola Petri utilizzando una spatola pulita (pulita) (B,C) e trasferiti L1 lateralmente verso il basso per contattare il cibo nelle fiale come mostrato nella D. (E) La parabola Petri vuota viene attentamente ispezionata per rilevare eventuali larve lasciate indietro. Se le larve lasciate sono vive e possono essere trasferite alla fiala alimentare, fatelo con attenzione e immediatamente (F). Se le larve lasciate sono morte o non possono essere trasferite, registrare questo fatto per correggere il "numero previsto" per i calcoli successivi. Fare clic qui per visualizzare una versione più grande di questa figura.

Figura 8 : Le larve L2 si fanno strada nelcibo. Vedere fessure e scanalature tra il disco di uva-agar e il cibo blu. Impostare un programma per osservare le fiale ogni giorno, preferibilmente alla stessa ora del giorno. Fare clic qui per visualizzare una versione più grande di questa figura.

Figura 9 : apparizione degli adulti. (A) Le larve L3 escono dal cibo per diventare pupe. (B) Gli adulti iniziano ad emergere il giorno 11. Impostare un programma per osservare le fiale ogni giorno, preferibilmente alla stessa ora del giorno e registrare con attenzione le vostre osservazioni. Smettere di contare quando tutte le pupe sono emerse (conta noto casi di pupe vuote) ed evitare di contare la prossima generazione di mosche fermando l'esperimento il giorno 15 e contare pupe morte se presenti (pupe nere / secche). I mutanti con cicli di vita più lunghi possono aver bisogno di periodi di tempo più lunghi, che devono essere determinati empiricamente. Fare clic qui per visualizzare una versione più grande di questa figura.
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