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Research Article
Tânia Martins Garcia1, Marit Navis1, Manon E. Wildenberg1, Ruurd M. van Elburg2, Vanesa Muncan1
1Department of Gastroenterology and Hepatology, Tytgat Institute for Intestinal and Liver Research, Amsterdam UMC, AG&M,University of Amsterdam, 2Department of Pediatrics, Amsterdam UMC,University of Amsterdam
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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
Questo protocollo descrive come imitare la transizione da solcatura allo svezzo in vitro usando organoidi intestinali fetali tardi del topo coltivati per 30 giorni.
Alla fine del periodo di allattamento, molte specie di mammiferi subiscono importanti cambiamenti nell'epitelio intestinale che sono associati alla capacità di digerire il cibo solido. Questo processo è chiamato transizione succhiare-svezzamento e si traduce nella sostituzione dell'epitelio neootoale con l'epitelio adulto che va di pari passo con aggiustamenti metabolici e morfologici. Questi complessi cambiamenti dello sviluppo sono il risultato di un programma genetico che è intrinseco alle cellule epiteliali intestinali ma può, in una certa misura, essere modulato da fattori estrinseci. Coltura prolungata di cellule epiteliali intestinali primarie del tardo periodo fetale, riassume la transizione alla svelazione in vitro. Qui, descriviamo un protocollo dettagliato per la coltura organoide intestinale fetale del topo più adatto per modellare questo processo in vitro. Descriviamo diversi saggi utili progettati per monitorare il cambiamento delle funzioni intestinali associate alla transizione da allattamento allo svasamento nel tempo. Inoltre, includiamo un esempio di fattore estrinseco che è in grado di influenzare la transizione in corso di succhiare lo svezzamento, come rappresentazione della modulazione dei tempi di transizione da succhiare in svezzamento in vitro. Questo approccio in vitro può essere utilizzato per studiare i meccanismi molecolari della transizione da allattamento allo svezzo e i modulatori di questo processo. È importante sottolineare che, per quanto riguarda l'etica animale nella ricerca, la sostituzione dei modelli in vivo con questo modello in vitro contribuisce al perfezionamento degli esperimenti sugli animali e, eventualmente, a una riduzione dell'uso degli animali per studiare i processi di maturazione intestinale.
In molte specie di mammiferi, tra cui topi e uomini, l'intestino neonato ha diverse caratteristiche che si distinguono dall'epitelio intestinale completamente maturo. Queste caratteristiche facilitano gli enterociti neocicliali per digerire e assorbire il latte, che contiene grassi elevati e carboidrati bassi, con il lattosio come carboidrato principale. Il bordo del pennello delle cellule epiteliali intestinali neo-onacali esprime l'idrolasi lattalasi lattasino-phlorizin (Lct)1 per digerire il lattosio disacardio del latte. Dopo il periodo di allattamento, gli enterociti si adattano al digerire il cibo solido che è ricco di carboidrati complessi e povero di grassi. Ciò si manifesta con un interruttore in pennello bordo disaccharidase espressione da laactase a sucrasio-isomalsi (Sis) e trehalase (Treh), che può digerire carboidrati più complessi presenti nel cibo solido2. Un altro interruttore metabolico è legato alla bassa concentrazione di arginina nel latte. Per prevedere la necessità di arginina, enterociti neonatali esprimono il tasso di limitazione dell'enzima nella biosintesi dell'arginina, argininosuccinate synthase-1 (Ass1), per sintetizzare l'arginina3. Al contrario, enterociti adulti esprimono arginasi 2 (Arg2), un enzima in grado di catabolizzare l'arginina che è abbondante negli alimenti solidi. Inoltre, l'epitelio intestinale neoatale esprime il recettore Fc neo-nanato per le immunoglobuine (FcRn), che media l'assorbimento dell'IgG materno dal latte alla circolazione/flusso sanguigno4. L'espressione di FcRn diminuisce significativamente durante la transizione di rilassamento-svezzo5. Nei topi, la maturazione delle cellule di Paneth avviene postnatalmente, in modo coincidente con la formazione e la maturazione delle cripte, ed è caratterizzata dall'espressione di peptidi antimicrobici lisosoma (Lyz) e defensins6.
Tutti questi cambiamenti fanno parte della transizione da succhiare-svezzamento, un processo che si verifica gradualmente dopo la nascita a un mese di età nei topi, quando l'epitelio intestinale raggiunge il suo stato adulto maturo. La transizione Suckling-to-weaning è intrinsecamente regolata e impostata nello sviluppo nel tubo intestinale. Il fattore di trascrizione B della maturazione indotta da detesto proteina-1 (Blimp-1) svolge un ruolo chiave in questo processo di maturazione intrinseca7. Blimp-1 è altamente espresso nell'epitelio neonaale, mentre la sua espressione diminuisce e si perde durante la transizione suckling-to-weaning e quindi può servire come un marcatore affidabile di epitelio intestinale neonatale. Nonostante sia un processo intrinseco, la transizione da succhiare allo svasamento può essere modulata da fattori esterni. Ad esempio, l'analogo sintetico del cortisolo, dexamethasone, è noto per accelerare la maturazione intestinale in vivo8,9.
Gli attuali modelli in vitro utilizzati per studiare la maturazione epiteliale intestinale, compresa la transizione da allattamento allo svezzamento, utilizzano linee cellulari epiteliali adulte e/o organoidi adulti che portano caratteristiche dell'epitelio intestinale adulto. Recentemente abbiamo dimostrato che le cellule epiteliali intestinali primarie isolate dall'intestino tardo fetale maturano e ricapitolano la transizione da allattamento allo svezzamento quando crescono in vitro come organoidi10. Abbiamo inoltre dimostrato che questo processo di maturazione intestinale in vitro si verifica allo stesso ritmo di in vivo. Infine, abbiamo usato dexamethasone per accelerare il processo di maturazione nello stesso modo descritto per gli studi in vivo.
Qui, illustreremo un protocollo preciso per l'isolamento e la coltura degli organoidi intestinali fetali tardivi del topo. Descriviamo il modo preferito di raccogliere campioni per una coltura organoide prolungata e metodi per monitorare la transizione da latte a svezzo in vitro. Questo protocollo può essere utilizzato per studi in vitro di maturazione epiteliale intestinale e modulatori di questo processo e si traduce in una maggiore produttività, una maggiore qualità e valore traslazionale dei dati e una riduzione dell'uso animale.
Questo studio è stato condotto in conformità con le linee guida istituzionali per la cura e l'uso di animali da laboratorio stabiliti dal Comitato Etico per la sperimentazione animale dell'Università di Amsterdam nel pieno rispetto della legislazione nazionale sulla ricerca animale a seguito della direttiva europea 2010/63/EU per l'uso degli animali per scopi scientifici (ALC312).
1. Isolamento di piccoli organoidi intestinali fetali
2. Coltura di organoidi fetali
3. Analisi della maturazione a livello di RNA e proteina
4. Effetto del fattore estrinseco (dexamethasone come esempio) sul processo di maturazione organoide
Coltura prolungata di cellule epiteliali intestinali fetali
Il protocollo per imitare la transizione da allattamento allo svezzamento in vitro dipende dalla corretta gestione degli organoidi fetali durante la coltura prolungata. L'intestino prossimale e quello distale isolato dai feti di topo E18-E20 sono separati come presentato nellaFigura 1). Dopo l'isolamento, le cellule epiteliali vengono semiate in cupole di gel a matrice extracellulare (Figura 2). In genere ci vogliono quattro passaggi e circa 28-30 giorni di cultura per gli organoidi fetali a maturare allo stato adulto. Durante questo periodo, le cellule in varie fasi della maturazione possono essere raccolte (Figura 3).
Rappresentante analisi a valle della transizione da succhiare a svelare in vitro
Per confermare che gli organoidi fetali isolati sono nettamente procrossici o distali, confrontare il livello di espressione dei marcatori prossimali Un taglio del gruppo membro della famiglia 2 (Onecut2) e della proteina legante GATA 4 (Gata4) e dei marcatori distale Proteina legante acidi grassi 6 (Fabp6) e Guanylate Cyclase Activator 2A (Guca2a) tra le colture organoide proximale e disloche (Figura 4A,B). La transizione suckling-to-weaning in vitro può essere monitorata da due serie di geni: fetale (Figura 4C) e marcatori adulti (Figura 4D). I marcatori fetali dovrebbero diminuire gradualmente nel corso della coltura, mentre l'espressione dei marcatori per adulti dovrebbe aumentare gradualmente (Figura 4C,D).
Utilizzo del fattore estrinseco come modificatore della transizione di svezzamento in vitro succhiare-a-
In questo protocollo dexamethasone un glucocorticoide sintetico, è stato utilizzato come un esempio di fattore estrinseco in grado di modificare la transizione suckling-to-weaning in vitro. I dati rappresentativi nella Figura 5 suggeriscono che gli effetti di fattori estrinseci sono meglio essere determinati da molteplici saggi, in quanto non necessariamente dovrebbero essere genomici. Ad esempio, nel caso della sucrasi-isocasia, sia l'espressione dell'RNA che della proteina sono indotte con dexamethasone (Figura 5A), mentre l'espressione del treslasi viene modificata solo a livello proteico. (Figura 5B).

Figura 1: Isolamento dell'intestino tenue del feto del topo. (A) Fotografia dell'intestino fetale sezionato e allungato, tra cui stomaco, intestino tenue e distale, appendice e colon. Linea nera indica dove l'intestino deve essere tagliato per dividere il procsimale e l'intestino tenue dislocante. Fare clic qui per visualizzare una versione più grande di questa figura.

Figura 2: Immagini microscopiche rappresentative della coltura organoide fetale prossimale e distale al terzo giorno, giorno 17 e giorno 28 della cultura. Tutte le immagini sono state ottenute il giorno 3 dopo il passaggio e mostrano la diminuzione del numero di sferoidi straordinari. Barra della scala: 500 m. Fare clic qui per visualizzare una versione più grande di questa figura.
Film 1: Video rappresentativo che mostra le dinamiche della cultura organoide fetale, dal quarto al sesto giorno della cultura. Clicca qui per vedere questo video. (Fare clic con il pulsante destro del mouse per scaricare.)

Figura 3: Rappresentazione schematica della raccolta organoide per l'analisi della maturazione intestinale nel tempo. Le colture organoidica fetale prossimale e distale dovrebbero essere coltivate per un mese e passare ogni settimana. I campioni per l'analisi della maturazione devono essere raccolti 3 giorni dopo l'isolamento e ogni 3 giorni dopo ogni passaggio. Si prega di fare clic qui per visualizzare una versione più grande di questa figura.

Figura 4: QRTRTR rappresentativi dei marcatori di maturazione intestinale in organoidi fetali prossimali e distali. (A) I marcatori prossimali Onecut2 e Gata4 sono espressi principalmente nella coltura degli organoidi prossimali, mentre i marcatori distale(B), Fabp6 e Guca2a sono per lo più espressi nella coltura organoide distale. (C) Marcatori fetali Lct, Ass1, Blimp-1 e FcRn diminuiscono e (D)marcatori adulti Sis, Arg2, Treh e Lyz aumentano nel tempo in entrambe le colture organoidi proximali e distale. Le barre di errore rappresentano SEM. Fare clic qui per visualizzare una versione più grande di questa figura.

Figura 5: Fattore esterno dexamethasone può modulare la maturazione degli organoidi fetali. (A) L'espressione genica del marcatore fetale Blimp-1 è diminuita al giorno 12 della coltura negli organoidi trattati nel dexamethasone rispetto ai organoidi di controllo, mentre sia l'espressione genica (B) che l'attività enzimatica (C) del marcatore adulto sucrasi-isomaltasi (Sis) sono aumentate. Fare clic qui per visualizzare una versione più grande di questa figura.
Gli autori non dichiarano nulla da divulgare.
Questo protocollo descrive come imitare la transizione da solcatura allo svezzo in vitro usando organoidi intestinali fetali tardi del topo coltivati per 30 giorni.
Nessuno.
| avanzato per il dosaggio dell'attività dell'arginasi DMEM/F12 1:1 | Invitrogen | 12634-028 | |
| Sigma-Aldrich | MAK112-1KT | ||
| B27 | Kit per il dosaggio delle proteineInvitrogen | 17504-044 | 100x |
| dosaggio delle proteine BCA | Fisher | 10741395 | |
| Tampone per lisi cellulare | Tecnologia di segnalazione cellulare | 9803S | |
| Cell Soluzione di recupero | Corning B.V. | 354253 | |
| Filtro cellulare 70µ M | BD/VWR | 734-0003 | |
| Desametasone | Sigma-Aldrich | D4902 | |
| EDTA | Merck | 10,84,18,250 | EDTA Titriplex III |
| EGF | Invitrogen | PMG8045 | |
| Etanolo | Merck | 1,00,98,31,000 | |
| Soluzione di glucosio | Sigma-Aldrich | G6918 | |
| Glutamax | Invitrogen | 35050-038 | 100x |
| Hepes | Invitrogen | 15630-056 | 1M |
| Isolato II RNA Mini Kit | Bioline | BIO-52073 | |
| Lattosio | Sigma-Aldrich | L3625 | A-Lattosio monoidrato |
| Tampone maleico | Sigma-Aldrich | M0375 | Acido maleico |
| Maltosio | Sigma-Aldrich | M5885 | D-(+)-Maltosio monoidrato >99% |
| Matrigel | Corning B.V. | 356231 | fattore di crescita ridotto matrice della membrana basale |
| Acqua di millipori | N.A. | ||
| Integratore di N2 | Invitrogen | 17502-048 | 100x |
| n-acetilcisteina | Sigma-Aldrich | A9165 | |
| Terreni condizionati con noggina | O-dianisidinafatta in casa | ||
| Sigma-Aldrich | 191248 | ||
| PBS | Penicillina/streptomicinafatta in casa | ||
| Invitrogen | 15140-122 | 0,2 U/mL | |
| Preparato di enzimi PGO | Sigma-Aldrich | P-7119-10CAP | capsule con perossidasi/ glucosio ossidasi |
| p-idrossimercuribenzoato sodico | Sigma-Aldrich | 55540 | |
| Terreni condizionati con rispondina | Saccarosio fatto in casa | ||
| Sigma-Aldrich | 84097 | ||
| Trealosio | Sigma-Aldrich | T5251 | D-trealosio diidrato |
| Tris-HCl tampone | fatto in | casa | |
| β-mercaptoetanolo | Sigma-Aldrich | M3148 |