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Articolo metodologico

Separazione dell'involucro cellulare per i batteri Gram-negativi in frazioni di membrana interne ed esterne con regolazioni tecniche per Acinetobacter baumannii

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DOI:

10.3791/60517

10 aprile 2020

* These authors contributed equally

In questo articolo

Sommario

I batteri Gram-negativi producono due membrane selvadenti spazialmente. La membrana esterna è partizionata dalla membrana interna da un periplasma e da uno strato peptidoglycan. La capacità di isolare i doppi bistrati di questi microbi è stata fondamentale per comprendere la loro fisiologia e patogenesi.

Abstract

Questo metodo funziona partizionando l'involucro di batteri Gram-negativi in frazioni di membrana totale, interna ed esterna (OM) e si conclude con saggi per valutare la purezza dei bistrati. L'OM ha una densità complessiva aumentata rispetto alla membrana interna, in gran parte a causa della presenza di lipooligosaccori (LOS) e lipopolysaccharides (LPS) all'interno del volantino esterno. Le molecole LOS e LPS sono glicolipidi anfipatici che hanno una struttura simile, che consiste in un lipidico-Asaccharolipid e nucleo-oligosaccharide substituente. Tuttavia, solo le molecole LPS sono decorate con una terza sottounità nota come O-polysaccharide, o O-antigen. Il tipo e la quantità di glicolididi presenti influiranno sulla densità OM di un organismo. Pertanto, abbiamo testato se le membrane di batteri con contenuto glicolico vario potrebbero essere isolate in modo simile utilizzando la nostra tecnica. Per gli organismi che producono LPS, Salmonella enterica serovar Typhimurium e Escherichia coli, le membrane erano facilmente isolate e la moiety LPS O-antigene non ha influenzato il partizionamento del bistrato. Acinetobacter baumannii produce molecole LOS, che hanno una massa simile alle molecole LPS carenti di O-antigen; tuttavia, le membrane di questi microbi non potevano inizialmente essere separate. Abbiamo ragionato sul fatto che l'OM di A. baumannii era meno denso di quello di Enterobacteriaceae, quindi il gradiente di saccarosio è stato regolato e le membrane sono state isolate. La tecnica può quindi essere adattata e modificata per l'uso con altri organismi.

Introduzione

I batteri Gram-negativi producono due membrane separate da uno spazio periplasmico e da una parete cellulare peptidoglycan1. La membrana interna (IM) racchiude il citosol ed è un bistrato simmetrico di fosfolipidi. Peptidoglycan protegge dalla pressione del turgor e fornisce al batterio una forma cellulare, ed è attaccato alla membrana esterna (OM) da lipoproteine2,3. L'OM circonda il periplasma ed è prevalentemente asimmetrico. Il volantino interno è costituito da fosfolipidi e il volantino esterno è costituito da glicolipidi noti come lipooligosaccori (LOS) o lipopoliosaccori (LPS)

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Protocollo

1. Reagenti generali e preparazione dei supporti per l'estrazione delle membrane

  1. Supporti di crescita batterica: Preparare e sterilizzare 1 L di supporti di brodo in un flacone completamente pulito e autoclaved 2 L.
  2. Buffer di sospensione generale (1 M Tris Buffer pH 7.5; 50 mL): Dissolvere 6,05 g di base Tris in 30 mL di H2O. Regolare il pH a 7,5 con 5 M HCl. Regolare il volume finale a 50 mL con ultrapure H2O.
  3. Stock master della soluzione di chelazione cation divalent (0,5 M EDTA pH 8; 100 mL): Aggiungere 18,6 g di disonidio tetraacetate-2H2O a 80 mL di H2O. Stir vigorosamente e regolare il pH ....

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Risultati

Questa tecnica fornisce un mezzo efficace per isolare gli IM e oM per i batteri Gram-negativi. Viene illustrato un quadro dell'intera procedura (Figura 1). In generale, la normalizzazione delle colture a un OD600 di 0,6-0,8 in 1 L di supporti, o la raccolta tra 6,0 e 8,0 x 1011 cellule batteriche garantirà che la quantità appropriata di materiale della membrana venga raccolta per la successiva separazione.

Al momento della lisciviatura dei ba.......

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Discussione

Questo metodo continuerà ad aiutare i ricercatori a comprendere il ruolo dell'involucro cellulare nella fisiologia batterica e nella patogenesi. Seguendo i passaggi di ultracentrifugazione sequenziali si può ottenere un totale purificato, interno e una frazione OM. Queste membrane possono essere scansionate in isolamento per testare ipotesi relative alla localizzazione e alla funzione delle proteine della membrana, al trasporto e al traffico attraverso il periplasm e alla composizione dei singoli bistrati in varie condiz.......

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Dichiarazioni

Nessun conflitto di interessi dichiarato.

Ringraziamenti

Questo lavoro è stato finanziato da P20GM10344 e R01AI139248 assegnato a D. Dalebroux.

....

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Materiali

Elenco dei materiali utilizzati in questo articolo
NomeAziendaNumero di catalogoCommenti
Flaconi da centrifuga da 1 L, PC/PPCO, super velocità, con tappo di chiusura, NalgeneVWR525-0466
Flacone per la conservazione dei terreni in Pyrex da 1 L con tappo per alte temperatureVWR10416-312
Pallone di Erlenmeyer da 2.000 mL, bocca strettaVWR10545-844
4-20% mini PROTEAN Protein Gels, 12 pozzettiBIORAD4561095
4x Campione di Laemmli Tampone 10 mLBIORAD1610747
50 mL provette sterili in polipropileneVWR89049-174
mL Dounce Omogeneizzatore tissutale con due pestelli in vetroVWR71000-518
70 mL assemblaggio flacone in policarbonatoBeckman Coulter Life Sciences355622
Agar PowderVWRA10752
B10P Benchtop Misuratore di pH con sonda di pHVWR89231-664
Barnstead GenPure xCAD Plus UV/UF - TOC (versione da banco)ThermoFisher Scientific50136146
Benzonasi nucleasiMilliporoSigma70746-3
EDTA sale disodico diidrato 99,0-101,0%, cristalli, ultrapuro Bioreagente Grado di biologia molecolare, J.T. BakerVWR4040-01
EmulsiFlex-C3Avestin, Inc.
Fiberlite F13-14 x 50cy Rotore ad angolo fissoThermoFisher Scientific75006526
Acido cloridrico 6.0 NVWRBDH7204
IBI Scientific Agitatore per piattaforma orbitaleFischer Scientific15-453-211
LB Brodo MillerVWR214906
lisozima, albume d'uovo, grado ultra puroVWR VWRV0063
Cloruro di magnesio esaidratoSigma AldrichM2670
NADHSigma Aldrich 10107735001
Optima XPN-80 - IVDBeckman Coulter Life SciencesA99839
Pharmco Products  ALCOOL PURO 200 PROOF GL 4/CS Fischer ScientificNC1624582
Soluzione di fenolo, Bilanciato con 10 mM di Tris HCl, pH 8.0, 1 mM EDTA, BioReagente, per biologia molecolareSigma - MilliporeP4557
Kit di test Pierce Coomassie Plus (Bradford)Thermofisher23238
Pro-Q emerald 300 Kit di colorazione in gel lipopolisaccaridicoThermofisherP20495
Proteacesi -50, senza EDTAG Biosciences786-334
Proteinasi K, grado di biologia molecolareNew England BiolabsP8107S
Idrossido di sodio ≥ 99,99%VWRAA45780-22
Sorval RC 6 Plus CentrifugaThermoFisher Scientific36-101-0816
SaccarosioMilliporoSigmaSX1075-3
SW 41 Ti Rotore a secchio oscillanteBeckman Coulter Life Sciences331362
Tris(idrossimetil)amminometano (TRIS, Trometamol) ≥ 99,9% (base essiccata), bioreagente ultrapuro Grado di biologia molecolare, J.T. BakerVWRJT4109-6
Tipo 45 Ti Rotore in titanio ad angolo fissoBeckman Coulter Life Sciences339160
Tubo ultratrasparente, 14 x 89 mmBeckman Coulter Life Sciences344059
Vortex-Genie 2VWR102091-234
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Riferimenti

  1. Silhavy, T. J., Kahne, D., Walker, S. The bacterial cell envelope. Cold Spring Harbor Perspectives in Biology. 2, 000414(2010).
  2. Egan, A. J., Vollmer, W. The physiology of bacterial cell division. Annals of the New York Academy of Sciences. 1277, 8-28 (2013).<....

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Ristampe e permessi

Tag

Membrana internaGradiente di densità di saccarosioFrazionamento delle membraneUltracentrifugazioneLipooligosaccaridiSaggio della NADH deidrogenasiPurezza della membrana