Il contributo dei mitocondri alla trasformazione oncogenica è oggetto di ampio interesse e studio attivo. Man mano che il campo del metabolismo del cancro diventa più complesso, l'obiettivo di colpire i mitocondri usando vari composti che infliggono danni mitocondriali (i cosiddetti mitocani) sta diventando abbastanza popolare. Sfortunatamente, molti saggi di citotossicità esistenti, come quelli a base di sali di tetrazolio o resazurina richiedono enzimi mitocondriali funzionali per le loro prestazioni. Il danno inflitto dai composti che prendono di mira i mitocondri spesso compromette l'accuratezza di questi saggi. Qui descriviamo un protocollo modificato basato sulla colorazione differenziale con due coloranti fluorescenti, uno dei quali è permeante alle cellule (Hoechst 33342) e l'altro non lo è (ioduro di propidio). La differenza di colorazione consente di discriminare le cellule vive e morte. Il saggio è suscettibile alla microscopia automatizzata e all'analisi delle immagini, che aumenta la produttività e riduce la distorsione. Ciò consente anche di utilizzare il saggio in modo ad alta produttività utilizzando piastre a 96 pozzi, rendendolo un'opzione praticabile per gli sforzi di scoperta di farmaci, in particolare quando i farmaci in questione hanno un certo livello di mitotossicità. È importante sottolineare che i risultati ottenuti dal saggio di colorazione Hoechst/PI mostrano una maggiore consistenza, sia con i risultati dell'esclusione blu del tripano che tra le repliche biologiche quando il saggio viene confrontato con altri metodi.