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Research Article
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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
Questo protocollo descrive l'approccio tecnico per isolare sottopopolazioni di cellule stromali adipogeniche e fibro-infiammatorie da depositi di tessuto adiposo bianco (WAT) murino intra-addominale mediante smistamento cellulare attivato dalla fluorescenza o separazione di microsfere immunomagnetiche.
La frazione stromale-vascolare (SVF) del tessuto adiposo bianco (WAT) è notevolmente eterogenea ed è costituita da numerosi tipi cellulari che contribuiscono funzionalmente all'espansione e al rimodellamento del WAT in età adulta. Un enorme ostacolo allo studio delle implicazioni di questa eterogeneità cellulare è l'incapacità di isolare facilmente sottopopolazioni cellulari funzionalmente distinte da WAT SVF per analisi in vitro e in vivo. La tecnologia di sequenziamento a singola cellula ha recentemente identificato sottopopolazioni di cellule perivascolari PDGFRβ+ fibro-infiammatorie e adipogeniche funzionalmente distinte in depositi di WAT intra-addominali di topi adulti. I progenitori fibro-infiammatori (denominati "FIP") sono cellule produttrici di collagene non adipogenico che possono esercitare un fenotipo pro-infiammatorio. Le cellule precursori degli adipociti (APC) PDGFRβ+ sono altamente adipogeniche sia in vitro che in vivo dopo il trapianto di cellule. Qui, descriviamo diversi metodi per l'isolamento di queste sottopopolazioni di cellule stromali da depositi murini di WAT intra-addominali. FIP e APC possono essere isolati mediante smistamento cellulare attivato da fluorescenza (FACS) o sfruttando la tecnologia delle microsfere immunomagnetiche basate su anticorpi biotinilati. Le cellule isolate possono essere utilizzate per l'analisi molecolare e funzionale. Lo studio delle proprietà funzionali della sottopopolazione di cellule stromali in isolamento amplierà le nostre attuali conoscenze sul rimodellamento del tessuto adiposo in condizioni fisiologiche o patologiche a livello cellulare.
Il tessuto adiposo bianco (WAT) rappresenta il sito principale per l'accumulo di energia nei mammiferi. All'interno di questo tessuto, gli adipociti, o "cellule adipose", immagazzinano le calorie in eccesso sotto forma di trigliceridi, impacchettati in grandi goccioline lipidiche uniloculare. Inoltre, gli adipociti secernono una moltitudine di fattori che regolano vari aspetti dell'omeostasi energetica 1,2,3. Gli adipociti costituiscono la maggior parte del volume di WAT; tuttavia, gli adipociti rappresentano solo meno del 50% del totale delle cellule presenti in WAT 4,5. Il compartimento non adipocitario della WAT, o frazione stromale-vascolare (SVF), è piuttosto eterogeneo e contiene cellule endoteliali vascolari, cellule immunitarie residenti nei tessuti, fibroblasti e popolazioni di cellule precursori degli adipociti (APC).
WAT è eccezionale nella sua notevole capacità di espandersi in termini di dimensioni con l'aumento della domanda di accumulo di energia. Il mantenimento di questa plasticità tissutale è essenziale in quanto un'adeguata conservazione dei lipidi nel WAT protegge dalla deposizione deleteria di lipidi ectopici nei tessuti non adiposi6. Il modo in cui i singoli depositi WAT subiscono questa espansione in risposta all'eccesso calorico è un determinante critico della sensibilità all'insulina nel contesto dell'obesità7. L'espansione patologica del WAT, osservata in individui obesi con sindrome metabolica, è caratterizzata da un'espansione preferenziale dei depositi viscerali di WAT a scapito del tessuto adiposo sottocutaneo metabolicamente favorevole. Inoltre, l'insulino-resistenza nell'obesità è associata al rimodellamento patologico del WAT. Questo è caratterizzato da crescita ipertrofica degli adipociti esistenti (aumento delle dimensioni), angiogenesi inadeguata, infiammazione metabolica cronica, accumulo di componenti della matrice extracellulare (fibrosi) e ipossia tissutale 8,9. Questi fenotipi WAT dell'obesità sono associati alla steatosi epatica e all'insulino-resistenza, in modo simile a quanto osservato nella condizione di lipodistrofia (assenza di WAT funzionale). Al contrario, l'espansione sana del WAT si osserva nella popolazione obesa metabolicamente sana ed è caratterizzata da un'espansione preferenziale del WAT sottocutaneo protettivo e dall'espansione del deposito attraverso l'iperplasia degli adipociti10. Il reclutamento di nuovi adipociti è mediato dalla differenziazione de novo degli adipociti dalle cellule precursori degli adipociti (APC) (definita "adipogenesi"). L'iperplasia degli adipociti coincide con gradi relativamente più bassi di fibrosi WAT e infiammazione metabolica 6,11. Una moltitudine di tipi di cellule all'interno del microambiente WAT influenza direttamente la salute e l'espandibilità del WAT nell'obesità12. Pertanto, la definizione della funzione dei vari tipi di cellule presenti nel WAT rimane una priorità assoluta per il campo.
Nell'ultimo decennio, sono state impiegate diverse strategie per definire e isolare APC native da WAT SVF13 umano e murino. Tali strategie isolano le APC in base all'espressione sulla superficie cellulare di comuni marcatori di cellule mesenchimali/cellule progenitrici utilizzando tecniche di separazione cellulare basate su anticorpi. Questi approcci includono la selezione cellulare attivata dalla fluorescenza (FACS), utilizzando anticorpi marcati con fluorofori o la separazione immunomagnetica delle microsfere (cioè anticorpi chimicamente modificati). Le proteine della superficie cellulare bersaglio per l'isolamento delle APC includono PDGFRα, PDGFRβ, CD34 e SCA-1. Questi approcci hanno contribuito ad arricchire le APC; Tuttavia, le popolazioni cellulari isolate sulla base di questi marcatori sono piuttosto eterogenee. Recentissimi studi di sequenziamento dell'RNA a singola cellula (scRNA-seq) hanno evidenziato l'eterogeneità molecolare e funzionale delle cellule stromali all'interno della frazione stromale-vascolare isolata (SVF) del WAT murino 14,15,16,17. Dalle nostre analisi funzionali e scRNA-seq, abbiamo identificato e caratterizzato sottopopolazioni di cellule perivascolari PDGFRβ+ adipogeniche immunomodulanti e adipogeniche funzionalmente distinte nel compartimento stromale del WAT intra-addominale in topi adulti15. I precursori fibro-infiammatori, o FIP, rappresentano una sottopopolazione importante di cellule PDGFRβ+ e possono essere isolati in base all'espressione di LY6C (cellule LY6C+ PDGFRβ+)15. Le FIP mancano di capacità adipogenica, esercitano una forte risposta pro-infiammatoria a vari stimoli, producono collagene e secernono fattori anti-adipogenici15. L'attività pro-infiammatoria e fibrogenica di queste cellule aumenta in associazione con l'obesità nei topi, implicando queste cellule come regolatori del rimodellamento del WAT. La sottopopolazione LY6C- CD9- PDGFRβ+ rappresenta le cellule precursori degli adipociti (APC). Queste APC sono arricchite nell'espressione di Pparg e di altri geni pro-adipogenici e si differenziano facilmente in adipociti maturi in vitro e in vivo15. Qui, forniamo un protocollo dettagliato per l'isolamento di queste distinte popolazioni cellulari da depositi WAT intra-addominali di topi adulti utilizzando FACS e separazione immunomagnetica delle microsfere con anticorpi biotinilati. Questo protocollo può essere utilizzato per isolare sottopopolazioni progenitrici adipose funzionalmente distinte da più depositi WAT intra-addominali di topi adulti maschi e femmine15. Lo studio di queste popolazioni cellulari funzionalmente distinte in isolamento può contribuire notevolmente alla nostra attuale comprensione dei meccanismi molecolari che regolano l'adipogenesi e il rimodellamento del tessuto adiposo intra-addominale in salute e malattia.
Il protocollo seguente descrive in dettaglio l'isolamento dei progenitori adiposi dal WAT dell'epididimo murino; tuttavia, la stessa procedura può essere utilizzata per isolare le cellule corrispondenti dai depositi WAT mesenterico e retroperitoneale di topi maschi e femmine15. Un protocollo dettagliato su come identificare e isolare questi depositi nei topi può essere trovato in Bagchi et al.18. Questo protocollo è stato ottimizzato per l'uso di topi di 6-8 settimane di età. La frequenza e la capacità di differenziazione delle APC possono diminuire in associazione con l'invecchiamento.
Tutti i protocolli e le procedure per gli animali sono stati approvati dal Comitato istituzionale per l'uso e la cura degli animali del Southwestern Medical Center dell'Università del Texas.
1. Isolamento della frazione vascolare stromale (SVF) dal tessuto adiposo bianco gonadico
2. Isolamento di APC e FIP mediante FACS
3. Separazione immunomagnetica delle frazioni adipogeniche e non adipogeniche
4. Valutare la purezza delle frazioni adipogeniche e non adipogeniche mediante citometria a flusso
5. Analisi dell'espressione genica mediante PCR quantitativa per valutare la purezza di FIP e APC
6. Colture cellulari e differenziamento
Questo protocollo descrive due strategie che consentono l'isolamento di popolazioni di cellule stromali distinte da depositi WAT intra-addominali di topi adulti. Le APC e le FIP possono essere isolate mediante FACS (Figura 1) o separazione immunomagnetica delle microsfere con anticorpi biotinilati (Figura 2). Entrambi gli approcci utilizzano reagenti e anticorpi tutti disponibili in commercio. La separazione immunomagnetica delle microsfere porta alla separazione delle cellule adipogeniche da quelle non adipogeniche dalla gWAT SVF. L'analisi della citometria a flusso ha mostrato che il 75% delle cellule all'interno della frazione adipogenica rappresentava APC LY6C-CD9-. >Il 75% della frazione non adipogenica rappresentava FIP (cellule LY6C+).

Figura 1: Isolamento di sottopopolazioni di PDGFR β + cellule stromali da WAT gonadiche mediante FACS. (A) Panoramica schematica della procedura: La frazione vascolare stromale (cellule non adipocitali) è stata separata dagli adipociti maturi mediante digestione enzimatica del tessuto e centrifugazione. La selezione cellulare attivata dalla fluorescenza (FACS) è stata quindi utilizzata per rimuovere le cellule di linea endoteliali (CD31+) ed ematopoietiche (CD45+) e isolare le cellule LY6C+ PDGFRβ+ (FIP) e le cellule LY6C-CD9- PDGFRβ+ (APC). (B) Cancelli di raccolta FACS rappresentativi. Il pannello A è riprodotto da ref.11 con il permesso. Clicca qui per visualizzare una versione più grande di questa figura.

Figura 2: Separazione di cellule stromali adipogeniche e non adipogeniche mediante separazione immunomagnetica delle sfere. (A) Panoramica schematica della procedura: Fase 1: le cellule CD31+ e CD45+ si legano al magnete. Questo rimuove sia le cellule endoteliali che quelle ematopoietiche. L'eluato contenente cellule CD31 e CD45 è stato raccolto e quindi incubato con anticorpi che riconoscono rispettivamente LY6C e CD9. Passaggio 2: le cellule CD9+ e LY6C+ si legano al magnete. Fase 3: Il surnatante (frazione non legata) contenente le cellule CD9 e LY6C è stato raccolto in quanto rappresentava la frazione adipogenica (APC). Le cellule CD9+ e LY6C+ non adipogeniche legate alle nanosfere sono state eluite come frazione non APC contenente FIP. (B) Analisi di citometria a flusso per valutare la frequenza di APCs (LY6C- CD9-) e FIPs (LY6C+) all'interno di frazioni adipogeniche e non adipogeniche, rispettivamente. Clicca qui per visualizzare una versione più grande di questa figura.
La microscopia ottica e l'analisi dell'espressione genica dimostrano che le APC isolate mediante FAC o attraverso la separazione di biglie magnetiche da gWAT di topi di 6-8 settimane si sono differenziate in adipociti contenenti lipidi ad un grado elevato entro 7-10 giorni dalla placcatura iniziale delle cellule in terreni di coltura APC gonadici (Figura 3). Al contrario, i precursori non adipogenici (come i precursori fibro-infiammatori o FIP) sono rimasti simili ai fibroblastie non diventano adipociti se mantenuti nello stesso terreno di coltura (Gonadal APC Culture Media) (Figura 3). Va notato che poche cellule nelle colture non-APCs hanno mostrato un certo accumulo di lipidi (Figura 3D). Questi probabilmente derivano dalla contaminazione da APC durante l'isolamento cellulare. Ulteriori lavaggi potrebbero migliorare la purezza di questa frazione.

Figura 3: Differenziazione in vitro di PDGFR β + popolazioni di cellule stromali isolate da gWAT di topi adulti. (A-D) Immagini rappresentative in campo chiaro di sottopopolazioni di cellule stromali differenziate isolate mediante separazione di microsfere immunomagnetiche (AB) o FACS (CD) da gWAT SVF di topo di 6-8 settimane. Le immagini sono state scattate sette giorni dopo la pianura delle cellule in Gonadal APC Culture Media. Entro 7-10 giorni dalla piastra, le APC vanno incontro a una differenziazione spontanea degli adipociti. Ingrandimento 10X. Scala = 250 μM. (E-F) Livelli di mRNA di geni selettivi per gli adipociti in colture differenziate mostrate in A-D. I grafici a barre rappresentano media + SEM. Clicca qui per visualizzare una versione più grande di questa figura.
| Fips | Geni arricchiti (vs. APC) | Innesco in avanti 5'-3' | Innesco inverso 5'-3' |
| Ly6c1 | ACTGTGCCTGCAACCTTGTCT | GGCCACAAGAAGAATGAGCAC | |
| CD9 | GCGGGAAACACTCAAAGCCAT | AAAGCTGTTTCTTGGGGCAGG | |
| Nov | GTTCCAAGAGCTGTGGAATGG | CTCTTGTTCACAAGGCCGAAC | |
| Efhd1 | GGCCGCTCTAAGGTCTTCAAT | GTCAATAAAGCCGTCCCTTCC | |
| STMN4 | ACCTGAACTGGTGCGTCATCT | CTTGGGAGGGAGGCATTAAAC | |
| Dact2 | AGCCCCCTAAAGGAAGAAACC | GGTCCTTGGCCACAGTCATTA | |
| IL33 | ATTTCCCCGGCAAAGTTCAG | AACGGAGTCTCATGCAGTAGA | |
| Ccl2 | CCACAACCACCTCAAGCACTTC | AAGGCATCACAGTCCGAGTCAC | |
| Tgfb2 | GGTGTTGTTCCACAGGGGTTA | CGGTCCTTCAGATCCTCCTTT | |
| Fn1 | GAGAGCACACCCGTTTTCATC | GGGTCCACATGATGGTGACTT | |
| DPP4 | TGGTGGATGCTGGTGTGGATT | AAGGGGCCTCTCTTCTCTTCCT | |
| Thy1 | TCTTCTTTCCCTTGCCCCTCTG | AGGTTGCAAGACTCTCGCTGT | |
| APC | Geni arricchiti (vs. FIP) | Innesco in avanti 5'-3' | Innesco inverso 5'-3' |
| Agt | GTTCTGGGCAAAACTCAGTGC | GAGGCTGCTGCTCATCATT | |
| Cxcl14 | TGGACGGGTCCAAGTGTAAGT | TCCTCGCAGTGTGGGTACTTT | |
| Mmd2 | ATCTGGGAGCTGATGACAGGA | AGTGGGTACCAGCACCAAATG | |
| PDE11a | CGAGCTTGTCAGGAAAGGAGA | TTCAGCCACCTGTCTGGAGAT | |
| Lrn1 | CAACATGGGAGAGCTGGTTTC | GCACACTACGGAAAGCCAAAC | |
| Pparg | GCATGGTGCCTTCGCTGA | TGGCATCTCTGTGTCAACCATG | |
| Fabp4 | ACTGGGCGTGGAATTCGATGA | ACCAGCTTGTCACCATCTCGT | |
| Lpl | CATCGAGAGAGGATCCGAGTGAA | TGCTGAGTCCTTTCCCTTCTG | |
| Cd36 | GAGTTGGCGAGAAAACCAGTG | GAGAATGCCTCCAAACACAGC |
Tabella 1: sequenze di primer qPCR utilizzate per convalidare l'isolamento di FIP e APC
T.A.P. è un dipendente e azionista di Novo Nordisk A/S
Questo protocollo descrive l'approccio tecnico per isolare sottopopolazioni di cellule stromali adipogeniche e fibro-infiammatorie da depositi di tessuto adiposo bianco (WAT) murino intra-addominale mediante smistamento cellulare attivato dalla fluorescenza o separazione di microsfere immunomagnetiche.
Gli autori sono grati a Lisa Hansen e Kirsten Vestergaard per l'eccellente assistenza tecnica, e a P. Scherer, N. Joffin e C. Crewe per la lettura critica del manoscritto. Gli autori ringraziano l'UTSW Flow Cytometry Core per l'eccellente guida e assistenza nello sviluppo dei protocolli qui descritti. R.K.G. è supportato da NIH NIDDK R01 DK104789, NIDDK RC2 DK118620 e NIDDK R01 DK119163. J.P. è sponsorizzato da un premio pre-dottorato del Fondo per l'innovazione della Danimarca.
| Preparazione meccanica dei tessuti e isolamento SVF | |||
| 40 e 100 µ filtri per cellule m | Fisher Scientific | 352340/352360 | |
| 1X Soluzione salina tamponata con fosfato (PBS) | Fisher Scientific | 21040CV | |
| Provette in polipropilene da 5 ml | Fisher Scientific | 352053 | |
| Digest Buffer (per 10mL) | |||
| 10 ml HBSS | Sigma | H8264 | |
| 10 mg Collagenasi D (1 mg/ml cc finale) | Roche | 11088882001 | |
| 0,15 g BSA (1,5 % cc finale) | Fisher Scientific | BP1605-100< | |
| strong>Separazione immunomagnetica di APC e non-APC | |||
| 5X MojoSort Buffer (tampone MS) | BioLegend | 480017 | |
| 5 ml MojoSort Magnet (MS magnete) | BioLegend | 480019 | |
| 100 &; L MojoSort Streptavidina Nanosfere BioLegend | 480015 | ||
| Purity Check e FACS | |||
| 10X Tampone per lisi di globuli rossi | eBioscience | 00-4300-54 | |
| Blocco Fc (Topo CD16/CD32) | eBioscience | 553141 | |
| Anticorpi | |||
| Biotina CD45 | BioLegend | 103103 | Concentrazione: ≤ 0,25 µ g per 10^6 cellule Specie: Topo Clone: 30-F11 |
| Biotina CD31 | BioLegend | 102503 | Concentrazione: ≤ 0,25 µ g per 10^6 cellule Specie: Topo Clone: MEC13.3 |
| Biotina CD9 | BioLegend | 124803 | Concentrazione: ≤ 0.25 µ g per 10^6 cellule Specie: Topo Clone: MZ3 |
| Biotina LY6C | BioLegend | 128003 | Concentrazione: ≤ 0.25 µ g per 10^6 cellule Specie: Topo Clone: HK1.4 |
| CD31-PerCP/Cy5.5 | BioLegend | 102419 | Concentrazione: Diluizione 1:400 Specie: Topo Clone: 390 |
| CD45-PerCP/Cy5.5 | BioLegend | 103131 | Concentrazione: Diluizione 1:400 Specie: Topo Clone: 30-F11 |
| CD140b PDGFRβ-PE | BioLegend | 136006 | Concentrazione: Diluizione 1:50 Specie: Topo Clone: APB5 |
| LY6C-APC | BioLegend | 128016 | Concentrazione: Diluizione 1:400 Specie: Topo Clone: HK1.4 |
| CD9-FITC | BioLegend | 124808 | Concentrazione: Diluizione 1:400 Specie: Topo Clone: MZ3 |
| Cell Culture e Terreno di coltura APC | |||
| 288 ml di DMEM con 1 g/L di glucosio | Corning | 10-014-CV | |
| 192 mL MCDB201 | Sigma | M6770 | |
| 10 ml di siero fetale bovino (FBS)** lotto#14E024 | Sigma | 12303C | |
| 5 ml 100% ITS premiscela | BD Bioscience | 354352 | |
| 5 mL 10 mM Acido L-ascorbico-2-2fosfato | Sigma | A8960-5G | |
| 50 &; L 100 g/ml FGF-base | R& D systems | 3139-FB-025/CF | |
| 5 mL Pen/Strep | Corning | 30-001-CI | |
| 500 &; L Gentamycin | Gibco | 15750-060 | |
| **NOTA: La capacità adipogenica degli APC primari può variare da lotto a lotto di FBS commerciali. Dovrebbero essere testati più lotti/fonti di FBS. |