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L'obiettivo di questo protocollo è quello di descrivere un metodo per quantificare le cellule indotte simili ai cardiomiociti (iCM), che vengono direttamente riprogrammate in vitro mediante una tecnica di riprogrammazione. La riprogrammazione cardiaca fornisce una strategia per generare nuovi cardiomiociti. Introducendo fattori di trascrizione cardiogeni core nei fibroblasti; i fibroblasti possono essere convertiti in iCM senza transizione attraverso lo stato di cellula staminale pluripotente. Tuttavia, il tasso di conversione dei fibroblasti in iCM rimane ancora basso. Di conseguenza, sono stati adottati numerosi approcci aggiuntivi per migliorare l'efficienza della riprogrammazione cardiaca. La maggior parte di questi studi ha valutato l'efficienza della riprogrammazione cardiaca utilizzando la citometria a flusso, mentre allo stesso tempo ha eseguito l'immunocitochimica per visualizzare le iCM. Pertanto, sono necessari almeno due set separati di esperimenti di riprogrammazione per dimostrare il successo della riprogrammazione iCM. Al contrario, l'analisi automatizzata dell'imaging ad alto contenuto fornirà sia la quantificazione che la qualificazione della riprogrammazione iCM con un numero relativamente piccolo di cellule. Con questo metodo, è possibile valutare direttamente la quantità e la qualità degli iCM con un unico esperimento di riprogrammazione. Questo approccio sarà in grado di facilitare futuri studi di riprogrammazione cardiaca che richiedono esperimenti di riprogrammazione su larga scala come lo screening di fattori genetici o farmacologici per migliorare l'efficienza della riprogrammazione. Inoltre, l'applicazione del protocollo di analisi dell'imaging ad alto contenuto non si limita alla riprogrammazione cardiaca. Può essere applicato alla riprogrammazione di altre linee cellulari e a qualsiasi esperimento di immunocolorazione che richieda sia la quantificazione che la visualizzazione di cellule immunocolorate.