Caratterizzazione e predizione funzionale dei batteri nei tessuti ovarici

Summary

La colorazione immunoistochimica e il sequenziamento del gene dell'RNA ribosomiale 16S (gene rRNA 16S) sono stati eseguiti al fine di scoprire e distinguere i batteri nei tessuti ovarici cancerosi e non cancerosi in situ. Le differenze compositiva e funzionale dei batteri sono state previste utilizzando BugBase e Phylogenetic Investigation of Communities by Reconstruction of Unobserved States (PICRUSt).

Abstract

La teoria di un tratto riproduttivo superiore femminile "sterile" ha incontrato una crescente opposizione a causa dei progressi nel rilevamento batterico. Tuttavia, se le ovaie contengono batteri non è stato ancora confermato. Qui è stato introdotto un esperimento per rilevare i batteri nei tessuti ovarici. Abbiamo scelto pazienti con cancro ovarico nel gruppo oncologico e pazienti non cancerose nel gruppo di controllo. Il sequenziamento del gene rRNA 16S è stato utilizzato per differenziare i batteri nei tessuti ovarici dal cancro e dai gruppi di controllo. Inoltre, abbiamo previsto la composizione funzionale dei batteri identificati utilizzando BugBase e PICRUSt. Questo metodo può essere utilizzato anche in altri visceri e tessuti poiché molti organi hanno dimostrato di ospitare batteri negli ultimi anni. La presenza di batteri nei visceri e nei tessuti può aiutare gli scienziati a valutare i tessuti cancerosi e normali e può essere di aiuto nel trattamento del cancro.

Introduction

Recentemente, è stato pubblicato un numero crescente di articoli che dimostrano l'esistenza di batteri nei visceri solidi addominali, come il rene, la milza, il fegato e l'ovaio^1,2. Geller et al. hanno trovato batteri nei tumori pancreatici e questi batteri erano resistenti alla gemcitabina, un farmaco chemioterapico^2. S. Manfredo Vieira et al. hanno concluso che Enterococcus gallinarum era portatile ai linfonodi, al fegato e alla milza e poteva guidare l'autoimmunità³.

Poiché la cervice svolge un ruolo di di....

Protocol

Questo studio è stato approvato dal Comitato Etico Medico Istituzionale del Primo Ospedale Affiliato dell'Università di Xi'an Jiaotong (No. XJTUIAF2018LSK-139). Il consenso informato è stato ottenuto da tutti i pazienti arruolati.

1. Criteri per l'ingresso nel gruppo oncologico e nel gruppo di controllo

1. Per il gruppo di cancro, arruolare pazienti a cui viene diagnosticato principalmente il cancro ovarico e, dopo laparotomia, è dimostrato che hanno un cancro ovarico sieroso da reperti patologici.
2. Per il gruppo di controllo, arruolare pazienti a cui viene diagnosticato principalmente un mioma uterino o un'....

Results

Pazienti
Un totale di 16 pazienti qualificati sono stati inclusi nello studio. Il gruppo di controllo comprendeva 10 donne con una diagnosi di tumore uterino benigno (tra queste, a 3 pazienti è stato diagnosticato un mioma uterino e a 7 pazienti è stata diagnosticata l'adenomiosi uterina). Nel frattempo, il gruppo oncologico conteneva 6 donne con una diagnosi di carcinoma ovarico sieroso (tra queste, a 2 pazienti è stato diagnosticato lo stadio II e a 2 di loro è stato diagnosticato lo stadio III). Le.......

Discussion

Il cancro ovarico ha una notevole influenza sulla fertilità delle donne²⁵. La maggior parte delle pazienti con cancro ovarico viene diagnosticata in fasi avanzate e il tasso di sopravvivenza a 5 anni è inferiore al 30%¹⁸. È stata pubblicata la conferma dei batteri nei visceri solidi addominali, tra cui fegato, pancreas e milza. L'esistenza di batteri nel tratto riproduttivo femminile superiore si verifica perché la cervice non è racchiusa^2,

Materials

List of materials used in this article

Name	Company	Catalog Number	Comments
2200 TapeStation Software	Agilgent Stati Uniti
AmpliSeq per Illumina Preparazione della libreria, indici e accessori	Illumina
Image-pro plus 7	Media Cybernetics
Leica ASP 300S	Leica Biosystems Division di Leica Microsystems
Leica EG 1150	Leica Biosystems Division of Leica Microsystems
Leica RM2235	Leica Biosystems Divisione di Leica Microsystems
LPS Core anticorpo monoclonale, clone WN1 222-5	Hycult Biotech
Mag-Bind RxnPure Plus perle magnetiche	Omega Biotek	M1386-00
Mag-Bind Universal Pathogen 96 Kit	Omega Biotek	M4029-01
MiSeq	Illumina	SY-410-1003
Banca dati Silva	Max Planck Institute for Marine Microbiology e Jacobs University
il QuantiFluor dsDNA System	Promega	E2670
Trimmomatic	Bjö rn Usadel
ZytoChem Plus (HRP) Kit Anti-Coniglio (DAB)	Sistemi Zytomed	HRP008DAB-RB