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Articolo metodologico

Saggio delle idrolasi nucleosidiche trifosfato in Toxoplasm gondii e Neospora caninum per lo screening ad alto rendimento utilizzando un braccio robotico

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DOI:

10.3791/62874

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22 luglio 2022

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* These authors contributed equally

In questo articolo

Sommario

Le infezioni da Toxoplasma gondii e Neospora caninum si riscontrano nell'uomo e negli animali e portano a gravi problemi di salute. I due parassiti condividono nucleosidi trifosfato idrolasi simili e svolgono un ruolo importante nella propagazione e nella sopravvivenza. Abbiamo stabilito un test di alto livello degli enzimi che richiedono l'uso di un braccio robotico.

Abstract

I parassiti protozoi infettano gli esseri umani e molti animali a sangue caldo. Il Toxoplasma gondii, un importante parassita protozoo, si trova comunemente nei pazienti sieropositivi, nei riceventi di trapianto di organi e nelle donne in gravidanza, causando la grave condizione di salute della toxoplasmosi. Un altro importante protozoo, Neospora caninum, che ha molte somiglianze con il Toxoplasma gondii, causa gravi malattie negli animali, così come l'encefalomielite e la miosite-poliradicolite nei cani e nelle mucche, con conseguente nascita di vitelli morti. Tutti questi presentavano nucleosidi trifosfato idrolasi (NTPasi) simili. Neospora caninum ha una NcNTPasi, mentre Toxoplasma gondii ha una TgNTPasi-I. Si ritiene che gli enzimi svolgano un ruolo cruciale nella propagazione e nella sopravvivenza. Al fine di stabilire composti e/o estratti che prevengano l'infezione da protozoi, abbiamo preso di mira questi enzimi per la scoperta di farmaci. Il passo successivo è stato quello di stabilire un nuovo test, altamente sensibile e altamente accurato, combinando un test enzimatico biochimico convenzionale con un test fluorescente per determinare il contenuto di ADP. Abbiamo anche convalidato che il nuovo test soddisfa i criteri per eseguire lo screening ad alto rendimento (HTS) nei due enzimi protozoari. Abbiamo eseguito l'HTS, identificato 19 composti e sei estratti da due librerie di composti sintetici e una libreria di estratti derivati da batteri marini, rispettivamente. In questo studio, è stata introdotta una spiegazione dettagliata su come eseguire l'HTS, comprese le informazioni sulla preparazione di reagenti, dispositivi, braccio robotico, ecc.

Introduzione

La robotica si è affermata come strumenti sofisticati e potenti per ottenere scoperte significative in vari campi oltre all'industria e all'ingegneria di fabbricazione, come la biochimica, la biologia molecolare e la ricerca clinica, e in particolare HTS 1,2,3. Il Toxoplasma gondii è un importante parassita e un eucariote parassita unicellulare4 che causa seri problemi di salute nell'uomo5 e in molti animali omeotermi4, con conseguenti infezioni che portano alla ....

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Protocollo

1. Espressione e purificazione di TgNTPasi-I e NcNTPasi ricombinanti

  1. Preparare il plasmide di espressione e introdurlo nell'E. coli. ceppo BL21.
    NOTA: Informazioni dettagliate su costrutti e procedure sono riportate in un precedente rapporto14. In questo studio, sia i mutanti costitutivamente attivi della TgNTPasi-I che quelli costitutivamente attivi sono stati gentilmente donati dal Prof. Asai e dal Prof. Harada.

2. Preparazione e posizionamento della soluzione di reazione biofluorescente sulla piastra

  1. Prep....

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Risultati

Un principio del saggio è riassunto nella Figura 1 supplementare e basato su un precedente rapporto12,18. Il test è stato progettato in un formato a 384 pozzetti, come mostrato nella Figura 1. Le linee di estrema destra e sinistra sono state evitate sulla targa. Le due linee accanto alle linee all'estrema sinistra e destra sono state quindi utilizzate rispettivamente come controllo negativo e controllo positivo con o.......

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Discussione

Siamo riusciti a stabilire un nuovo test ad alta gamma dinamica e accuratezza con una combinazione di un saggio enzimatico classico e un test fluorescente per ADP, che è il prodotto finale attraverso l'ATPasi, tra cui Tg e Nc ATPasi22. Per eseguire l'HTS, è importante che il test abbia valori migliori di fattore S/B, S/N e Z' rispetto a un classico test enzimatico15,22. Inoltre, omettendo il passaggio di a.......

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Dichiarazioni

Gli autori non hanno alcun interesse finanziario in questo studio.

Ringraziamenti

Questo lavoro è stato in parte sostenuto dalla Piattaforma per la scoperta di farmaci, l'informatica e le scienze strutturali della vita, una sovvenzione per la ricerca scientifica (C) della Japan Society for Promotion of Science (JSPS-21K06566). Gli autori ringraziano sinceramente Asai (Keio University School of medicine) e Harada (Kyoto Institute of Technology) e Stephen Stratton per aver donato rispettivamente due mutanti attivi NTPasi ricombinanti e il suo contributo nella preparazione di questo manoscritto.

....

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Materiali

Elenco dei materiali utilizzati in questo articolo
NomeAziendaNumero di catalogoCommenti
12 stadi per postazione di lavoro EDR-384 SXBiotec Co., Ltd.EDR-384SXBraccio robotico Sistema di pippatura
384 punte per pozziBiotech Co., Ltd.Fornitore verificato - Custom made
ADP-hexokinaseAsahi Kasei Pharma Co., Ltd.Lievito orientale T-92
ATP, Co, Ltd.45140000
BSAWako Pure Chemical Industries, Ltd.011-15144
Diaphorasi-IUnitika Ltd.Di-1
DMSONacalai Tesch, Inc.13406-55
G6P deidrogenasiOriental Yeast, Co, Ltd.306-50143
GlucosioWako Pure Chemical Industries, Ltd.049-31165
Greiner 384 pozzetti micro-piastra non vincolante pozzetto poco profondo Nero#784900
HEPESWako Pure Chemical Industries, Ltd.342-01375
mg(CH3COO)2Wako Pure Chemical Industries, Ltd.130-00095
NADPLievito Orientale, Co, Ltd.44332000
N-etilmaleimmideWako Pure Chemical Industries, Ltd.056-02062
PHERAstar FSBMG LABTECH GIAPPONE L.t.d.PHERAstar FSLettore di micropiastre multimodale
ResazurinWako Pure Chemical Industries, Ltd.191-07581
Seahorse Labware 384 Well SerbatoiS30022 25/CS
TrisHClWako Pure Chemical Industries, Ltd.W01COBQE-4120
Triton X-100Nacalai Tesch, Inc.Codice 35501-02
a basso profilo

Riferimenti

  1. Bianca, C. B., et al. A robotic platform to screen aqueous two-phase systems for overcoming inhibition in enzymatic reactions. Bioresource Technology. 280, 37-50 (2019).
  2. Aliaksei, V., Jan, D. B. Robot-sci....

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